Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A27 F60 I1 R1
|
21 |
93.6 |
3197140 |
99.1% |
3168365 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,288,091 |
C→T |
P110S (CCG→TCG) |
nrfA → |
cytochrome c552 nitrite reductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,288,091 | 0 | C | T | 100.0%
| 419.7
/ NA
| 122 | P110S (CCG→TCG) | nrfA | cytochrome c552 nitrite reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (59/63); total (59/63) |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AGCGTGTTGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGCCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCACGGTAAATGGGCGCGCGGCGGTCCGGAAATCG > NC_000913/4287954‑4288226
|
agCGTGTTGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCg > 2:1377270/1‑140 (MQ=255)
gCGTGTTGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGa > 2:985536/1‑140 (MQ=255)
tgtTGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGaaaa > 1:1099814/1‑140 (MQ=255)
tgtTGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGaaaa < 1:1100213/140‑1 (MQ=255)
gtTGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGaaaaa > 1:1541790/1‑140 (MQ=255)
ttGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGaaaa < 2:267663/138‑1 (MQ=255)
ttGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAAc > 1:911406/1‑140 (MQ=255)
ttGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAAc < 1:418245/140‑1 (MQ=255)
ttGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAAc > 2:539219/1‑140 (MQ=255)
ttGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAAc < 1:15477/140‑1 (MQ=255)
ttGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAAc > 1:743846/1‑140 (MQ=255)
gACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGc < 2:706049/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGa < 2:1345259/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGa < 2:1314218/140‑1 (MQ=255)
ggCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATg > 1:573674/1‑140 (MQ=255)
aaGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCg < 1:1428320/140‑1 (MQ=255)
aaGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCg < 2:649551/140‑1 (MQ=255)
cACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCg > 1:1350806/1‑140 (MQ=255)
cACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCg > 2:1457771/1‑140 (MQ=255)
gCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATgg < 1:1289914/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATgg < 1:196944/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATgg > 2:460468/1‑140 (MQ=255)
gTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATg > 2:80857/1‑140 (MQ=255)
gTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATg > 2:1536571/1‑140 (MQ=255)
tGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGc < 1:626360/140‑1 (MQ=255)
aTCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTg < 1:390601/140‑1 (MQ=255)
tCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTgg < 1:1108749/140‑1 (MQ=255)
ccTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATg > 1:895815/1‑130 (MQ=255)
ccTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATg < 2:895815/130‑1 (MQ=255)
ggCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATg < 1:309562/124‑1 (MQ=255)
ggCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCt < 2:257843/131‑1 (MQ=255)
ggCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCt > 1:257843/1‑131 (MQ=255)
ggCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTa < 2:599447/140‑1 (MQ=255)
ggCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTa > 1:1016463/1‑140 (MQ=255)
gCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTaa < 2:233148/140‑1 (MQ=255)
gCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTaa < 1:192660/140‑1 (MQ=255)
gCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTaa < 1:1214999/140‑1 (MQ=255)
ggTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGc > 1:581572/1‑140 (MQ=255)
ggTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGc > 2:870144/1‑140 (MQ=255)
cccTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGa < 2:162956/140‑1 (MQ=255)
ctcGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTgg > 1:1065886/1‑140 (MQ=255)
ctcGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTgg > 1:603259/1‑140 (MQ=255)
ctcGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTgg > 1:338728/1‑140 (MQ=255)
tcGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGgc < 1:870144/140‑1 (MQ=255)
tcGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGgc < 2:603259/140‑1 (MQ=255)
tcGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGgc < 1:996770/140‑1 (MQ=255)
cgcgATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTaa > 1:41340/1‑122 (MQ=255)
cgcgATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTaa < 2:41340/122‑1 (MQ=255)
cgcgATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGgc > 1:750784/1‑137 (MQ=255)
gcgATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGt < 2:573674/140‑1 (MQ=255)
gcgATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGt < 1:425567/140‑1 (MQ=255)
gcgATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGt < 1:480733/140‑1 (MQ=255)
gcgATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGt < 2:581572/140‑1 (MQ=255)
gATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCt < 2:743846/140‑1 (MQ=255)
gATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCt < 1:1340156/140‑1 (MQ=255)
aTTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTg < 1:1457771/140‑1 (MQ=255)
ttACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGa < 2:1350806/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGaa < 1:80857/140‑1 (MQ=255)
aGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGaaa > 1:1566243/1‑140 (MQ=255)
gCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGaa < 2:193526/138‑1 (MQ=255)
gCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGaa > 1:193526/1‑138 (MQ=255)
gCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGaa < 2:374157/138‑1 (MQ=255)
gCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGaa > 1:374157/1‑138 (MQ=255)
ccGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGa > 2:1576611/1‑140 (MQ=255)
ccGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTATGATCCAGAAAGa > 1:425794/1‑140 (MQ=255)
cgcgTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGTCCGGATGTGGCGCGTc > 1:1420204/1‑126 (MQ=255)
cgcgTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGTCCGGATGTGGCGCGTc < 2:1420204/126‑1 (MQ=255)
cgTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACgg < 1:985536/140‑1 (MQ=255)
cgTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACgg < 2:44048/140‑1 (MQ=255)
cgTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACgg > 2:732568/1‑140 (MQ=255)
gTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTc > 2:840055/1‑123 (MQ=255)
gTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTc < 1:840055/123‑1 (MQ=255)
gTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGc > 2:420321/1‑140 (MQ=255)
tGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGacgacg < 1:1377270/140‑1 (MQ=255)
tGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTACGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCg < 1:776563/140‑1 (MQ=255)
aCATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAg < 2:335031/140‑1 (MQ=255)
aCATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAg < 2:1108953/140‑1 (MQ=255)
aCATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGAACCAGAAAGACGGCGAAg < 2:1573432/140‑1 (MQ=255)
cTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGc < 2:913182/140‑1 (MQ=255)
cTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGc < 1:732568/140‑1 (MQ=255)
cTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGc < 1:460468/140‑1 (MQ=255)
cTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGc < 2:1016463/140‑1 (MQ=255)
tgtgACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTcc > 2:943185/1‑140 (MQ=255)
gtgACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCa < 2:1541790/140‑1 (MQ=255)
gtgACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCa < 2:1065886/140‑1 (MQ=255)
gtgACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCa < 2:1566243/140‑1 (MQ=255)
tgACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGc > 2:1170766/1‑131 (MQ=255)
tgACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGc < 1:1170766/131‑1 (MQ=255)
tgACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCAc > 2:125258/1‑140 (MQ=255)
aCCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCACgg > 1:1117318/1‑140 (MQ=255)
gTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTc < 1:325258/125‑1 (MQ=255)
gTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTc > 2:325258/1‑125 (MQ=255)
gTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCACGGTAAATGGgcg > 1:895767/1‑140 (MQ=255)
gAAACCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCACGGTAAATGGgcgcg > 2:402600/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCACGGTAAATGGGCGCgcgg < 1:943185/140‑1 (MQ=255)
ccTGCGTACCGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCACGGTAAATGGGCGCgcggcg > 2:628826/1‑140 (MQ=255)
cGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCACGGTAAATGGGCGCGCGGCGGTCCGGaaa > 2:782420/1‑140 (MQ=255)
cGGTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCACGGTAAATGGGCGCGCGGCGGTCCGGaaa > 2:1291792/1‑140 (MQ=255)
gTGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCACGGTAAATGGGCGCGCGGCGGTCCGGAAATc < 1:782420/140‑1 (MQ=255)
tGCGTCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCACGGTAAATGGGCGCGCGGCGGTCCGGAAATCg > 2:1325597/1‑140 (MQ=255)
|
AGCGTGTTGACGCCCTGGCGGAAGATCCACGGCTGGTGATCCTGTGGGCGGGGTATCCCTTCTCGCGCGATTACAACAAGCCGCGTGGACATGCTTTTGCTGTGACCGATGTGCGTGAAACCCTGCGTACCGGTGCGCCGAAAAACGCTGAAGATGGTCCGCTACCGATGGCATGCTGGAGTTGTAAAAGCCCGGATGTGGCGCGTCTGATCCAGAAAGACGGCGAAGATGGCTACTTCCACGGTAAATGGGCGCGCGGCGGTCCGGAAATCG > NC_000913/4287954‑4288226
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
