Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A24 F60 I1 R1
|
17 |
198.2 |
6851676 |
99.0% |
6783159 |
139.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,931,171 |
IS4 (+) +12 bp |
intergenic (‑78/‑134) |
ravA ← / → kup |
regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
3931171 = | 0 (0.000) | 238 (1.190) |
101/274 |
0.1 |
100% |
intergenic (‑78/‑145) |
ravA/kup |
regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
| ? | NC_000913 |
4502090 = |
NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) |
IS4 |
repeat region |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3931182 | 0 (0.000) | 256 (1.270) |
101/276 |
0.1 |
100% |
intergenic (‑89/‑134) |
ravA/kup |
regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
| ? | NC_000913 |
= 4503515 |
NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) |
IS4 |
repeat region |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
AGTCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3931310‑3931171
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGAT > NC_000913/4502090‑4502227
AGTCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAG > 2:3235863/1‑140
AGTCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAG < 1:2571751/140‑1
GTCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGT > 2:2636818/1‑140
GTCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGT > 2:2940067/1‑140
GTCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGT > 2:309606/1‑140
TCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTA > 2:3399077/1‑140
TCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGACTCGAAAAAAAATACCCCCCCTTTGAGTA > 1:1321041/1‑140
TTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATG < 1:624039/140‑1
CGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTATTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAGCCTCGCTAAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCC > 2:1328662/1‑140
GTTGAAATATGAAATTTGTGCTCAGCCCCGTGGCCCAAAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCA < 1:1495164/140‑1
GTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTA < 2:54600/134‑1
TGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGT < 2:1780378/140‑1
GAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTC < 2:227273/140‑1
GAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTC < 1:1702698/140‑1
GAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTC < 2:1981943/140‑1
GAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACACCCCCTTTGAGTAATGCCA > 1:1759/1‑137
ATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGT > 2:272101/1‑140
TATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTT < 1:2412803/140‑1
ATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGATTAATGCCAGTCAGTTAAGCAA < 1:2801438/140‑1
TGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCACTTTGAGTGATGCAAGTCAGTTAAGCAATTG > 2:1402123/1‑140
GTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCCCAGTATGCACGATTAAGGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCACCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGA < 2:1083685/140‑1
TGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGAC < 2:559843/140‑1
TGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGAC > 2:2197217/1‑140
GCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACT > 1:693424/1‑140
CTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACACCCGCTTTGAGTAATGACAGTTAGTTAAGCAACTGACTG > 2:924617/1‑140
TTAGTCCCTTGGCCCCCAAAAACGCTCACAGTATGCACGTTTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGG < 1:899126/140‑1
AGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCT > 1:253494/1‑140
GTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTC > 1:647681/1‑140
CCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTT < 1:2852762/140‑1
TGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGAC < 2:2092365/128‑1
GGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCG < 1:353081/140‑1
GGCCCACAAAAAAGCCCACAGTCTGCACGGTTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCG < 1:1233049/140‑1
AAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGT < 1:2319836/140‑1
AAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGT > 1:547846/1‑140
AAAAGCGCACAGTATGCACGATGAATGGCCAAATCGTTCTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑‑CCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGG < 1:1417292/140‑1
AGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGT < 1:522721/140‑1
GCGCACAGCATGCACGTTTAACTGCAAAATTCTGCACCTTAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATGCCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTA < 2:1679183/140‑1
ACAGTATGCACGATTGACGGCATAAGCGTTCTCCTAACTGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTC < 1:1612460/140‑1
ACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTC > 1:3128346/1‑140
CAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCC < 1:130348/140‑1
CAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCC < 2:2849900/140‑1
TGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGC < 2:2447004/140‑1
GCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCC < 2:669930/140‑1
GCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCC < 1:2059585/140‑1
ACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTC < 1:2717323/140‑1
ACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTC < 1:3134209/140‑1
ACGATTAACGGCAAAACCGTACCCCTAAATGCGGCTACATTAACCTGGTTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTC < 2:1557830/140‑1
GATTAACGGCAAAATGGTACTCTTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTC < 1:1205296/140‑1
ATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCACTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCC > 1:2984819/1‑140
TAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTT > 1:1956270/1‑140
TAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTT > 2:1705347/1‑140
TAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGC > 2:3160860/1‑132
TAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTCCCAGGGCCTCTCCTT > 1:1556517/1‑140
TAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAAATGACTGGCACTTATTCGGGGCTGTGGGGTACTTCCAGGGCCTCTCCTT > 2:1136489/1‑140
ACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGAATTTCCAGGGCCTCTCCTTTA > 1:2447322/1‑140
CGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAC < 1:84927/140‑1
CGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAC > 2:477366/1‑140
CGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAC < 2:500446/140‑1
CGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAC < 2:710883/140‑1
GGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACC > 1:2894205/1‑140
GCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCA > 1:2702582/1‑140
AAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCGCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACT > 2:2040304/1‑140
AAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTAGGGGCAGCGGGGTATTACCAGCCCCTCTCCTTTACCACT > 2:1536109/1‑140
AATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGAGGCAGTGGGGTATTTCGAGGGGCTCTCCTTTACCACTCT > 2:946640/1‑140
TACTCCTAAATGCGGTCACATTTACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGA < 1:1136489/140‑1
TACTCCTAAATGCGGACACATTCACTTGGATCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGA < 1:1328662/140‑1
CCTAAATGCGGCCACATTAACCAGGCTCACAGAAAAAAACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGC < 1:1424095/140‑1
CTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGCGCTGTGGGGTATGTCCGGGGCCTCTACTTTGCCACTCTCGGGAAGGCC > 2:864304/1‑140
AAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCT < 1:492550/140‑1
GGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGAGCCTCTCATTTACCACTCTCGTGAAGGCCCTTTCCCT > 1:965084/1‑140
GCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTT > 1:1890937/1‑140
CCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGG > 1:2951271/1‑124
CCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGAATTTCCAGGGCCTCTCGTTTACCACCCTCGTGAAGGCCCTTTCCCTgt > 2:1434845/1‑138
TGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAAT < 1:2208092/140‑1
GGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCATTCTGGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATT > 2:1142572/1‑140
GCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACACTCGGGAAGGCCATTTCCCTTCTTGTCGGTAATTT > 2:1212638/1‑140
CTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCAGTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTACTTGTCGGTAATTTC > 1:1013874/1‑140
CTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTC > 1:814205/1‑140
CTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTC > 2:1900245/1‑140
CTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTC > 1:3264672/1‑140
CTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTACTTGTCGGTAATTTC > 1:1667523/1‑140
CTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGACCGTTCCCTACTTGTCGGTAATTTC > 1:1636216/1‑140
CTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTACAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTC < 1:2653074/140‑1
CAAAGAAGAATTCCGCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGCCTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGCGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCGCTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCAC < 2:2547660/140‑1
AAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACA > 1:1830959/1‑140
AAGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTTGGGAAGGCCCTTTCAATTCTTGTCGGTAATTTCACAA > 1:1348641/1‑140
AGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAG < 1:2269171/140‑1
AGAAAAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGGTAAGCAACTGACAGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAG < 2:1361776/140‑1
GAAAAATCTCCCCCCTAAGAGTCATGCCAGTTATTTAAGAAACTGACTTGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGT < 2:1625056/140‑1
AAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGT > 2:2926169/1‑140
AAATACCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGT > 1:759612/1‑140
AATACCCCTCCTTTGAACAATGCCAGTCAGGCATGCAACTGACTGGCTTTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTC < 2:1667523/140‑1
CCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCAT < 1:2180790/140‑1
CCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCAT < 1:3235863/140‑1
CCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCAT < 2:2702582/140‑1
CCCCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCAT < 2:2319119/140‑1
CCCCCTTTGAGTAATGCCAGTCGGTTAAGCAACTGTCTGTCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATAC < 2:1265432/140‑1
CCCCTTTGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACT > 1:3173089/1‑140
TGAGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAG > 2:3068487/1‑140
AGTAATGCCAGTCAGTTAAGCACCTGACTGGGTCTTTTTGGGGGCTGTTGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGAT < 2:1306594/140‑1
AGTCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCTTTGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3931310‑3931171
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGAT > NC_000913/4502090‑4502227
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
