Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F28 I1 R1
|
116 |
98.7 |
3298914 |
99.2% |
3272522 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,509,233 |
A→G |
pseudogene (225/471 nt) |
insO → |
KpLE2 phage‑like element; IS911B regulator fragment |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,509,233 | 0 | A | G | 100.0%
| 450.4
/ NA
| 119 | pseudogene (225/471 nt) | insO | KpLE2 phage‑like element; IS911B regulator fragment |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (52/67); total (52/67) |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GCAAGAAGCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAACATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTGTTCGCAA > NC_000913/4509099‑4509369
|
cAAGAAGCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGtt < 2:1343696/140‑1 (MQ=255)
aagaagCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTg < 2:106101/140‑1 (MQ=255)
aagaagCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTg < 2:1061445/140‑1 (MQ=255)
aagaagCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTg < 2:1267659/140‑1 (MQ=255)
aagaagCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTg < 2:69076/140‑1 (MQ=255)
aagaagCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTg < 1:384680/140‑1 (MQ=255)
agaagCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGc < 2:225809/140‑1 (MQ=255)
gaagCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCt < 2:622167/140‑1 (MQ=255)
aagCATCGCCACAATGGCGACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTa < 2:377625/140‑1 (MQ=255)
aagCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTa < 2:472880/140‑1 (MQ=255)
aagCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTa < 2:1638066/140‑1 (MQ=255)
aagCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTa < 1:1126558/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATccc > 1:1506507/1‑140 (MQ=255)
gCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTaa < 2:620179/140‑1 (MQ=255)
gCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTaa < 2:631363/140‑1 (MQ=255)
gCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTaa < 2:700735/140‑1 (MQ=255)
gCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTaa < 2:1064747/140‑1 (MQ=255)
gCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTaa < 1:517284/140‑1 (MQ=255)
cGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCa > 1:1236055/1‑140 (MQ=255)
cGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCa > 2:582113/1‑140 (MQ=255)
cGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCa > 2:748236/1‑140 (MQ=255)
ggAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAg < 1:338765/140‑1 (MQ=255)
ggAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAg < 1:172238/140‑1 (MQ=255)
gagaGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGt > 1:89175/1‑140 (MQ=255)
gagGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTc > 2:939254/1‑140 (MQ=255)
cTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCg > 1:967881/1‑140 (MQ=255)
aCCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTg > 2:1437596/1‑140 (MQ=255)
gggACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGc < 1:1579636/140‑1 (MQ=255)
gggACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGc < 1:224555/140‑1 (MQ=255)
gggACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGc < 1:304741/140‑1 (MQ=255)
ggACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGATCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGcc < 1:32630/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTGCGCCGTGACCGAGCCaa < 2:69411/140‑1 (MQ=255)
gCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAAt > 1:978589/1‑140 (MQ=255)
gCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCACCGTGACCGAGCCAAAt > 1:1288358/1‑140 (MQ=255)
ggCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAg < 1:1044957/140‑1 (MQ=255)
cTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAggg > 2:1055910/1‑139 (MQ=255)
cTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGgt < 1:1164332/140‑1 (MQ=255)
ttGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGgtg < 1:1206001/140‑1 (MQ=255)
tGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGgtgt > 1:1040847/1‑140 (MQ=255)
cTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTgtgg > 2:1436512/1‑140 (MQ=255)
ggCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTgtggtg > 2:1282168/1‑140 (MQ=255)
cAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGTATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCg < 1:477481/140‑1 (MQ=255)
cAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCg < 2:1310471/140‑1 (MQ=255)
cAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCg < 1:748236/140‑1 (MQ=255)
cAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCg < 2:1482824/140‑1 (MQ=255)
gCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTg < 2:1094652/140‑1 (MQ=255)
gCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTg > 2:1390360/1‑140 (MQ=255)
tCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGAt < 2:1040847/140‑1 (MQ=255)
tCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGAt < 1:1269615/140‑1 (MQ=255)
cATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTGCCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGAtg < 2:781602/140‑1 (MQ=255)
cATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGAtg < 1:333470/140‑1 (MQ=255)
cATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGAtg < 2:640228/140‑1 (MQ=255)
cATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGAtg < 1:448112/140‑1 (MQ=255)
tGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGTCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGAtgtg < 1:1431214/140‑1 (MQ=255)
tGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGAtgtg < 2:318785/140‑1 (MQ=255)
gAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACTGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGa < 1:1483127/140‑1 (MQ=255)
gAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAAC‑ACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc < 1:163207/140‑1 (MQ=255)
aaaGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc < 1:1539089/140‑1 (MQ=255)
aaaGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc < 2:370125/140‑1 (MQ=255)
aaaGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc < 1:892064/140‑1 (MQ=255)
aaaGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc < 2:967881/140‑1 (MQ=255)
aaGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc < 1:906610/140‑1 (MQ=255)
aaGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc < 2:723520/140‑1 (MQ=255)
agCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCtat > 1:1180563/1‑140 (MQ=255)
tGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATc > 1:1495356/1‑140 (MQ=255)
gggCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTg > 2:1254095/1‑140 (MQ=255)
gCTGGTCAGCTGTCAGTAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGa < 1:719174/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGa > 2:424968/1‑140 (MQ=255)
gCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGa < 1:258987/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGa < 1:582113/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCACGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGa < 2:1189069/140‑1 (MQ=255)
gTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACggg > 2:11294/1‑140 (MQ=255)
gTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACggg > 1:672359/1‑140 (MQ=255)
gTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACggg > 1:1083268/1‑140 (MQ=255)
gTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACggg > 2:460977/1‑140 (MQ=255)
gTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACggg > 2:413308/1‑140 (MQ=255)
gTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGCGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACggg > 1:1259887/1‑140 (MQ=255)
tCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGt > 2:1202213/1‑140 (MQ=255)
tCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGt < 1:811158/140‑1 (MQ=255)
tGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAgcg < 1:1191303/140‑1 (MQ=255)
gTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAgcgc < 1:1436512/140‑1 (MQ=255)
agcagcCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTgg > 2:1424278/1‑140 (MQ=255)
agcagcCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTgg > 2:16694/1‑140 (MQ=255)
ccGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTa > 2:1258092/1‑140 (MQ=255)
cGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTAc < 2:917244/140‑1 (MQ=255)
aCTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCt < 1:1248927/140‑1 (MQ=255)
gTATAAACGTGGTGGTCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCgttg < 2:646943/140‑1 (MQ=255)
ggtggtCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCt > 2:424175/1‑140 (MQ=255)
gtggtCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTg > 2:170256/1‑140 (MQ=255)
gtggtCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTg > 1:688635/1‑140 (MQ=255)
gtggtCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTg > 1:10884/1‑140 (MQ=255)
gtggtCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTg > 1:1074429/1‑140 (MQ=255)
gtggtCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTg > 2:376627/1‑140 (MQ=255)
gtggtCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTg > 1:1061921/1‑140 (MQ=255)
gtggtCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTg > 2:1197906/1‑140 (MQ=255)
gtCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTGTTc < 1:1254095/140‑1 (MQ=255)
tCATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTGTTCg > 2:267400/1‑140 (MQ=255)
cATGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTGTTCGc > 1:419518/1‑140 (MQ=255)
tGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTGTTCGCaa > 2:208335/1‑140 (MQ=255)
tGAGCATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTGTTCGCaa > 2:687952/1‑140 (MQ=255)
|
GCAAGAAGCATCGCCACAATGGCAACCCGGAGAGGCTACCAGATGGGACGCTGGCTTGCTGGCAGGCTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGCTGTCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAACGTGGTGGTCATGAACATGTTGCTATCCCTAACTACCTTGAAAGGCAGTTCGCCGTGACCGAGCCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATATCTGGACGGGTAAGCGCTGGGCGTACCTCGCCGTTGTTCTCGACCTGTTCGCAA > NC_000913/4509099‑4509369
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
