Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F60 I1 R1
|
12 |
49.9 |
1742736 |
98.3% |
1713109 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,268,627 |
T→C |
intergenic (+320/+182) |
tyrB → / ← yjbS |
tyrosine aminotransferase/uncharacterized protein YjbS |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,268,627 | 0 | T | C | 98.8%
| 323.1
/ NA
| 86 | intergenic (+320/+182) | tyrB/yjbS | tyrosine aminotransferase/uncharacterized protein YjbS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (43/42); minor base G (1/0); total (44/42) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGTATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGAATAATCACCTTTAACCTCCTCGGCAAAACAGCA > NC_000913/4268491‑4268761
|
tGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATc > 1:155215/1‑140 (MQ=255)
aGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTCGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAACTATAGCATCGtt < 1:461169/140‑1 (MQ=255)
aatTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTc < 1:453028/140‑1 (MQ=255)
tttCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTa < 2:469254/140‑1 (MQ=255)
ttCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTaa > 1:807332/1‑140 (MQ=255)
tCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAAt > 2:198790/1‑140 (MQ=255)
acaTCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTaa > 2:696109/1‑140 (MQ=255)
acaTCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGCATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTaa > 2:747080/1‑140 (MQ=255)
caTCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTaaa < 2:365602/140‑1 (MQ=255)
tAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAgaga < 1:836398/140‑1 (MQ=255)
aCCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAAc > 2:736960/1‑140 (MQ=255)
tattaAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAGATTCTAATGTTAAAGAGAACTCttt > 1:329602/1‑140 (MQ=255)
tattaAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCttt > 1:673198/1‑140 (MQ=255)
attaAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGTCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAActct < 1:56409/137‑1 (MQ=255)
attaAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGTCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAActct > 2:56409/1‑137 (MQ=255)
attaAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCtttt > 2:685625/1‑140 (MQ=255)
ttaAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGGATCATTAAATTCGAATGGTAAAGAGAACTCttttt > 2:326793/1‑140 (MQ=255)
tttAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGc > 1:445678/1‑140 (MQ=255)
ttAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCt < 2:673198/140‑1 (MQ=255)
tATCGGGTTTGTTACTATAGAATATATCTGTATCCTCGAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGtt < 1:365553/140‑1 (MQ=255)
tATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGtt < 1:94124/140‑1 (MQ=255)
tATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGtt < 1:485859/140‑1 (MQ=255)
tCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTACTGTTAAAGAGAACTCTGTTTTCAGCTTTGTGTAAGTTTa > 2:384018/1‑140 (MQ=255)
tCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGtt > 2:2744/1‑138 (MQ=255)
tCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGtt < 1:2744/138‑1 (MQ=255)
tCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTa > 2:695910/1‑140 (MQ=255)
ggTTTGTTACGATAGAATATTTGTATATCGTCAAGAAGATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAAcc < 1:384018/140‑1 (MQ=255)
ggTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAAcc > 1:151375/1‑140 (MQ=255)
ggTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAAcc > 2:52216/1‑140 (MQ=255)
ggTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAAcc < 1:695910/140‑1 (MQ=255)
gTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCt > 1:459459/1‑140 (MQ=255)
tttGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCtt < 2:459459/140‑1 (MQ=255)
ttGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTta > 1:180107/1‑140 (MQ=255)
ttGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTta < 2:445678/140‑1 (MQ=255)
gTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGACCTCCTTTTTCCGATTTGGGTAAGTTTAACCTtata > 2:308148/1‑140 (MQ=255)
gATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGAt > 1:745237/1‑140 (MQ=255)
atatTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGAt > 1:661858/1‑134 (MQ=255)
atatTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGAt < 2:661858/134‑1 (MQ=255)
tttCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAatat > 1:799129/1‑140 (MQ=255)
tatCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCaaa > 2:125131/1‑138 (MQ=255)
tatCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCaaa < 1:125131/138‑1 (MQ=255)
tCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATaaaa > 1:584005/1‑138 (MQ=255)
tCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATaaaa < 2:584005/138‑1 (MQ=255)
tCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAg < 1:52216/140‑1 (MQ=255)
tCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAACTTTAACCTTATGTTGATTACCAATATCAAATAAAAAg > 1:354675/1‑140 (MQ=255)
aaGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGt > 2:821332/1‑140 (MQ=255)
aaGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGt > 1:162507/1‑140 (MQ=255)
aaGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGt > 1:587131/1‑140 (MQ=255)
aGAATATGCTTTGCCTTTTTGCCTGTGACTTACTGTGATCCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTc < 2:354675/140‑1 (MQ=255)
tatGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGt > 2:148054/1‑140 (MQ=255)
tGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTaa > 1:838928/1‑140 (MQ=255)
gCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAAt < 1:696109/140‑1 (MQ=255)
gCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAAt < 1:747080/140‑1 (MQ=255)
tGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATgaga > 2:507175/1‑140 (MQ=255)
tGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATgaga > 1:729600/1‑140 (MQ=255)
tGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATgag > 2:63753/1‑139 (MQ=255)
tGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATgag < 1:63753/139‑1 (MQ=255)
tATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 1:148054/140‑1 (MQ=255)
tATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 1:198790/140‑1 (MQ=255)
tATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 2:799129/140‑1 (MQ=255)
tATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 1:792212/140‑1 (MQ=255)
tATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat > 1:811835/1‑140 (MQ=255)
tATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 2:180107/140‑1 (MQ=255)
tATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 2:162507/140‑1 (MQ=255)
tATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 2:155215/140‑1 (MQ=255)
aTTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCt < 2:13364/125‑1 (MQ=255)
aTTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCt > 1:13364/1‑125 (MQ=255)
tgtgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAGTATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat > 2:570463/1‑133 (MQ=255)
tgtgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 2:207850/133‑1 (MQ=255)
tgtgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat > 1:207850/1‑133 (MQ=255)
tgtgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 1:373091/133‑1 (MQ=255)
tgtgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat > 1:445185/1‑133 (MQ=255)
tgtgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat > 2:583202/1‑133 (MQ=255)
tgtgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 1:570463/133‑1 (MQ=255)
tgtgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 1:583202/133‑1 (MQ=255)
tgtgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 2:445185/133‑1 (MQ=255)
tgtgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat > 2:373091/1‑133 (MQ=255)
tgtgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGAATAATCACCttt > 2:790323/1‑140 (MQ=255)
tgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat > 2:598697/1‑131 (MQ=255)
tgACTTTCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGaataat < 1:598697/131‑1 (MQ=255)
tttCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGAATAATCACCTTTAAcctc < 2:811835/140‑1 (MQ=255)
tCTGAGATTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGAATAATCACCTTTAAcctcct > 1:110373/1‑140 (MQ=255)
gagaTTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGAATAATCACCTTTAACCTCCTCgg < 1:821332/140‑1 (MQ=255)
gaTTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGAATAATCACCTTTAACCTCCTCGGCa < 1:790323/140‑1 (MQ=255)
aTTCAATTATAGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATAGTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGAATAATCACCTTTAACCTCCTCGGCaa < 2:195391/140‑1 (MQ=255)
tataGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGAATAATCACCTTTAACCTCCTCGGCAAAACAGCa < 1:489475/140‑1 (MQ=255)
tataGCATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGAATAATCACCTTTAACCTCCTCGGCAAAACAGCa < 1:670515/140‑1 (MQ=255)
|
TGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGATTCAATTATAGTATCGTTAAATTCTAATGTTAAAGAGAACTCTTTTTTCCGCTTTGTGTAAGTTTAACCTTATATTGATTACCAATATCAAATAAAAAGGTCCTGTAATGAGAATAATCACCTTTAACCTCCTCGGCAAAACAGCA > NC_000913/4268491‑4268761
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
