Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A13 F48 I1 R1
|
62 |
147.6 |
5031800 |
99.1% |
4986513 |
139.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
871,236 |
G→T |
E90D (GAG→GAT) |
gsiC → |
glutathione ABC transporter membrane subunit GsiC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 871,236 | 0 | G | T | 99.4%
| 626.9
/ ‑3.5
| 176 | E90D (GAG→GAT) | gsiC | glutathione ABC transporter membrane subunit GsiC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (81/94); total (82/94) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.98e-01 |
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
CAGGTTATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTG > NC_000913/871102‑871372
|
cAGGTTATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGc > 2:1704482/1‑140 (MQ=255)
gTTATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAg < 1:2274122/140‑1 (MQ=255)
ttATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGc < 2:992374/140‑1 (MQ=255)
ttATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGc < 1:635807/140‑1 (MQ=255)
ttATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGc < 1:980072/140‑1 (MQ=255)
gAAATGGTGCGTCAGGAGGTGGGGTTGGATTAGGCGCTGTAACGCCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCtt < 2:1470094/140‑1 (MQ=255)
tGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATg > 2:2308750/1‑140 (MQ=255)
tGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATg > 2:2456281/1‑140 (MQ=255)
tGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATg > 2:1017117/1‑140 (MQ=255)
tGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCATGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATg > 2:2362299/1‑140 (MQ=255)
tGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTAGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATg > 1:744330/1‑140 (MQ=255)
tGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTAAATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATg > 2:1195437/1‑140 (MQ=255)
tGGGGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATg > 2:1859167/1‑140 (MQ=255)
ggTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGc > 2:540612/1‑140 (MQ=255)
ggTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGc > 1:2052639/1‑140 (MQ=255)
gTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGcc < 2:1954635/140‑1 (MQ=255)
gTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGcc < 1:1340010/140‑1 (MQ=255)
gTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGcc > 1:1633714/1‑140 (MQ=255)
gTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGcc > 2:221462/1‑140 (MQ=255)
gTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGcc > 2:644980/1‑140 (MQ=255)
gTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGcc > 1:2493723/1‑140 (MQ=255)
gTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGcc > 1:1915298/1‑140 (MQ=255)
gTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGcc < 2:637904/140‑1 (MQ=255)
gTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGcc < 2:1107631/140‑1 (MQ=255)
gCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCaa < 2:2483679/140‑1 (MQ=255)
gTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACg < 2:256215/140‑1 (MQ=255)
gTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACg < 2:1164890/140‑1 (MQ=255)
agcagcTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCtg < 2:840000/140‑1 (MQ=255)
agcTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTgg < 1:1672293/140‑1 (MQ=255)
gcTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGc < 2:742296/140‑1 (MQ=255)
gcTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGc < 1:1017117/140‑1 (MQ=255)
gcTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGAGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGc < 2:2442250/140‑1 (MQ=255)
gcTGGGGATGGATCAGGCGCTGTATCACCAGTTCAGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGc < 2:1431373/140‑1 (MQ=255)
tGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTg < 2:2435177/140‑1 (MQ=255)
ggTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGAcc < 1:2456281/140‑1 (MQ=255)
ttGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCAt < 2:2052639/140‑1 (MQ=255)
ttGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTAAATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCAt < 1:1195437/140‑1 (MQ=255)
ggATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATaa < 2:1853070/140‑1 (MQ=255)
ggATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATaa < 2:228502/140‑1 (MQ=255)
ggATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATaa < 1:221462/140‑1 (MQ=255)
gATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAAc < 2:1243696/140‑1 (MQ=255)
gATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAAc < 1:2308750/140‑1 (MQ=255)
aTCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAAcc > 2:2060949/1‑140 (MQ=255)
aGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGt < 1:1395961/140‑1 (MQ=255)
gTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCt > 1:1719257/1‑140 (MQ=255)
tATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTg < 1:940592/140‑1 (MQ=255)
aTCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTgg < 2:83090/140‑1 (MQ=255)
tCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCATGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTggg < 1:540612/140‑1 (MQ=255)
ccAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCgg < 2:1323021/140‑1 (MQ=255)
ccAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCgg < 1:1354213/140‑1 (MQ=255)
aGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGtt < 2:292795/140‑1 (MQ=255)
tGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCTTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATAtt < 1:1701688/140‑1 (MQ=255)
tGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATAtt < 1:194719/140‑1 (MQ=255)
tGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATAtt < 1:1705475/140‑1 (MQ=255)
agtatgTCAGCAATGCTGGGCAGGTGGATTTTGGCCTCAGGGTGGTTTCGCGTAATCCGGTTGCCGATAATATTGCCAGCCGCTTTATGCCGTCACTGTGGCAGCCCATAACCAGTATGGTCGGTTTGGTTATAATTGGt < 2:1740233/138‑1 (MQ=255)
atatCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATg > 1:301291/1‑140 (MQ=255)
aTGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGa > 1:2385627/1‑140 (MQ=255)
aTGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGa > 2:73828/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGaa > 2:316358/1‑140 (MQ=255)
gCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAAt > 1:814877/1‑140 (MQ=255)
gCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAAt > 1:67656/1‑140 (MQ=255)
gCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAAt > 2:2341286/1‑140 (MQ=255)
tgtgCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTa > 2:1632489/1‑140 (MQ=255)
tgtgCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGCGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATCCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGGCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCggggagta > 2:1058609/1‑135 (MQ=255)
cAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGTGGGAAtttttcc > 2:2604/1‑135 (MQ=255)
gggggATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATcgccg < 1:2362299/140‑1 (MQ=255)
ggggATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATcgccgc > 2:396378/1‑140 (MQ=255)
ggggATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATcgccgc > 1:1127725/1‑140 (MQ=255)
ggggATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATcgccgc > 1:1870011/1‑140 (MQ=255)
ggggATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATcgccgc > 1:2321950/1‑140 (MQ=255)
ggATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGccgccg < 1:396378/140‑1 (MQ=255)
gATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCATCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCAGt < 2:675479/140‑1 (MQ=255)
gATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGt < 1:599013/140‑1 (MQ=255)
aTTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTc < 1:1632489/140‑1 (MQ=255)
gTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAAcc < 1:1320113/140‑1 (MQ=255)
tCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCg > 1:2001275/1‑140 (MQ=255)
cGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGt > 1:2202768/1‑140 (MQ=255)
ggTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGc < 1:1058609/140‑1 (MQ=255)
ggTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGc < 1:2435571/140‑1 (MQ=255)
gtCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGGATTATCGCCGCCGGCTGGCGTAACCCTTTGCCgg > 2:38389/1‑140 (MQ=255)
gtCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGGAATATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCCGTGGccct > 2:44021/1‑138 (MQ=255)
gtCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCgg < 2:1149745/140‑1 (MQ=255)
tCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGa < 2:464104/140‑1 (MQ=255)
cgcgTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTTTTGCCGCCGCCTGGGGTAAACCCTGGcccggt > 2:2480560/1‑136 (MQ=255)
cgcgTCGTCCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGAt > 1:92585/1‑140 (MQ=255)
gtcgtcCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGa < 1:348538/140‑1 (MQ=255)
gtcgtcCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGa < 2:814877/140‑1 (MQ=255)
tcgtcCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGAt < 1:2060949/140‑1 (MQ=255)
tcgtcCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGAt < 2:1655524/140‑1 (MQ=255)
gtcCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTGTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGGttt > 1:1564305/1‑139 (MQ=255)
gtcCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTg < 2:1884327/140‑1 (MQ=255)
tcCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATTGCCGCCGGCTGGCGTAACCGTTGGCCGGGTCGAtttt > 2:698502/1‑138 (MQ=255)
tcCGGTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGa > 1:874710/1‑140 (MQ=255)
tcCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGCTCGCTTgg > 1:1547926/1‑139 (MQ=255)
gTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTAt < 2:744330/140‑1 (MQ=255)
gTTGCCGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGACGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTAt > 2:1858658/1‑140 (MQ=255)
cGATGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCa < 1:2604/140‑1 (MQ=255)
tGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAATCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTg < 1:1799737/140‑1 (MQ=255)
tGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTg < 1:2448345/140‑1 (MQ=255)
tGATATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTg < 1:837617/140‑1 (MQ=255)
|
CAGGTTATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTG > NC_000913/871102‑871372
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
