Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A14 F48 I1 R1
|
75 |
141.5 |
4784044 |
99.1% |
4740987 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
908,944 |
C→A |
A117A (GCG→GCT) |
ltaE ← |
low‑specificity L‑threonine aldolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 908,944 | 0 | C | A | 100.0%
| 233.5
/ NA
| 68 | A117A (GCG→GCT) | ltaE | low‑specificity L‑threonine aldolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (39/29); total (39/29) |
GCGCCAGATTGCGCTCGCGGGTAAATTCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATCGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTCGCCG > NC_000913/908808‑909079
|
gcgcCAGATTGCGCTCGCGGGTAAATTCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGcc > 1:2331810/1‑140 (MQ=255)
gcgcCAGATTGCGCTCGCGGGTAAATTCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGcc > 1:1273427/1‑140 (MQ=255)
gcgcCAGATTGCGCTCGCGGGTAAATTCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGcc > 1:1895158/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGATTGCGCTCGCGGGTAAATTCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCa > 1:563620/1‑140 (MQ=255)
gATTGCGCTCGCGGGTAAATTCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTa < 2:1196842/140‑1 (MQ=255)
aTTGCGCTCGCGGGTAAATTCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTAt > 1:1441786/1‑140 (MQ=255)
gggTAAATTCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGc < 2:1008187/140‑1 (MQ=255)
tCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTc > 2:1885642/1‑140 (MQ=255)
aTGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGGGCCGTCGGCa > 1:835938/1‑140 (MQ=255)
cttcttTCAGTTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGTTGCTGGCGAAATTGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGcc < 2:1082139/140‑1 (MQ=255)
cttcttTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGcc < 2:1764051/140‑1 (MQ=255)
aTTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGt < 2:1441786/140‑1 (MQ=255)
ttCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGtt > 1:2224477/1‑140 (MQ=255)
tCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTg < 2:691602/140‑1 (MQ=255)
tCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTg < 2:1273427/140‑1 (MQ=255)
tCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTg < 2:2331810/140‑1 (MQ=255)
cccGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGc > 1:1347429/1‑140 (MQ=255)
cgGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGtt < 2:663965/140‑1 (MQ=255)
acacTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATa < 2:1001587/140‑1 (MQ=255)
ccGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGGTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAg > 2:1010715/1‑140 (MQ=255)
ttGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCAc < 2:669650/140‑1 (MQ=255)
tgtgGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCAcc > 1:2164975/1‑140 (MQ=255)
tgGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCAccgc > 1:682882/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCAccgccg > 1:1273561/1‑140 (MQ=255)
gtTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCgcgc < 2:2164975/140‑1 (MQ=255)
ttCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCAc < 2:2224477/140‑1 (MQ=255)
aGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGc > 1:743323/1‑140 (MQ=255)
gACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCt > 1:978078/1‑140 (MQ=255)
aCTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCtt > 1:1140533/1‑140 (MQ=255)
tGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGGAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCa > 2:2115246/1‑140 (MQ=255)
gAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCaa < 2:696728/140‑1 (MQ=255)
aaGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGTTTTGATTTTCATAGCCCCTTTATCCAGCGGTAGTGTGCCTTCGGCAGCCGCGTCTATGGTTTGCGGTTGAATACTTCCCGGTTCCGCCGCGCTCCCGGCTTCaa < 2:1877630/139‑1 (MQ=255)
aaGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTACCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCaa < 2:1866043/139‑1 (MQ=255)
aGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCcgcg < 2:1555768/126‑1 (MQ=255)
aGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCcgcg > 1:1555768/1‑126 (MQ=255)
aGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCaaa > 2:1625747/1‑140 (MQ=255)
aGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCaaa > 2:2115225/1‑140 (MQ=255)
aGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCaaa > 1:1991297/1‑140 (MQ=255)
aGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCaaa > 1:2041759/1‑140 (MQ=255)
aGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCaaa > 1:1043165/1‑140 (MQ=255)
gTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCGGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAAc < 2:313074/140‑1 (MQ=255)
gTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCaaaa > 1:1607302/1‑139 (MQ=255)
gTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAAc > 2:1392694/1‑140 (MQ=255)
tGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATATTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTa > 1:922008/1‑140 (MQ=255)
tGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGa > 1:1358663/1‑134 (MQ=255)
tGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGa < 2:1358663/134‑1 (MQ=255)
tGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTa > 1:1247897/1‑140 (MQ=255)
tGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTa > 2:243904/1‑140 (MQ=255)
tGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTa > 1:1027057/1‑140 (MQ=255)
tGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTa > 1:2243565/1‑140 (MQ=255)
tGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTa > 1:1813418/1‑140 (MQ=255)
ggCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATgcg < 2:682882/140‑1 (MQ=255)
ggCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATgcg < 2:1027057/140‑1 (MQ=255)
gCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATgcgc > 1:58894/1‑140 (MQ=255)
gATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTCTCAAGCGATAGAGAGCCGTAGGCAGCCGCGTCTTTGGGTTCAGGTTAAATAATGTCAAGCCCAGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGAc < 2:1595847/140‑1 (MQ=255)
gATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGAc < 1:1392694/140‑1 (MQ=255)
gATATCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGAc < 2:1043165/140‑1 (MQ=255)
tatCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGAc < 2:1793942/138‑1 (MQ=255)
tatCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGAc > 1:1793942/1‑138 (MQ=255)
atCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGa < 1:1559955/140‑1 (MQ=255)
atCGTCGGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGa < 2:563620/140‑1 (MQ=255)
tcgtcgGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGAc < 2:2041759/140‑1 (MQ=255)
tcgtcgGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGAc < 2:1991297/140‑1 (MQ=255)
tcgGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAat > 1:1040455/1‑140 (MQ=255)
cgGGTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAata > 1:2217215/1‑140 (MQ=255)
ggTTTGATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAAtata > 1:1234310/1‑140 (MQ=255)
gATTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCtt > 1:2253055/1‑140 (MQ=255)
aTTTTCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTc > 2:1275470/1‑140 (MQ=255)
tttCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTcgc < 2:1347429/140‑1 (MQ=255)
tCATAGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTcgccg < 2:1247897/140‑1 (MQ=255)
|
GCGCCAGATTGCGCTCGCGGGTAAATTCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGCGGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATCGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTCGCCG > NC_000913/908808‑909079
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
