Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A15 F48 I1 R1
|
115 |
87.5 |
3003888 |
99.1% |
2976853 |
139.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
260,845 |
C→A |
S153Y (TCT→TAT) |
proB → |
glutamate 5‑kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 260,845 | 0 | C | A | 100.0%
| 254.6
/ NA
| 72 | S153Y (TCT→TAT) | proB | glutamate 5‑kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (36/36); total (36/36) |
AAGACCGTGAACGCTTCCTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTCTGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTAAAGATGTTTACGGCATTGATGACGCA > NC_000913/260713‑260978
|
aaGACCGTGAACGCTTCCTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTg > 2:973107/1‑140 (MQ=255)
aCCGTGAACGCTTCCTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTggcg > 2:525228/1‑140 (MQ=255)
ccGTGAACGCTTCCTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTggcgg > 2:926148/1‑140 (MQ=255)
ccGTGAACGCTTCCTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTggcgg > 2:1498858/1‑140 (MQ=255)
ccGTGAACGCTTCCTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTggcgg > 1:779621/1‑140 (MQ=255)
ccGTGAACGCTTCCTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTAGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTggcgg < 1:659557/140‑1 (MQ=255)
tGAACGCTTCCTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGgcggcgt > 2:1325278/1‑139 (MQ=255)
tCCTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCg > 2:232326/1‑140 (MQ=255)
tCCTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCg > 1:804892/1‑140 (MQ=255)
ccTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCgg > 2:272399/1‑140 (MQ=255)
ccTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCgg > 2:1033465/1‑140 (MQ=255)
cgcgACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATaa > 1:1051514/1‑140 (MQ=255)
cgcgACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATaa > 2:485142/1‑140 (MQ=255)
cgACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAAc < 2:1239199/140‑1 (MQ=255)
cgACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAAc > 1:449899/1‑140 (MQ=255)
cTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTtgct > 1:10441/1‑140 (MQ=255)
ttGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGa > 1:330798/1‑140 (MQ=255)
gCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATc > 1:298016/1‑140 (MQ=255)
gCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATc > 1:1078722/1‑140 (MQ=255)
cGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCaaa < 1:1033465/140‑1 (MQ=255)
cGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCaaa < 1:1253221/140‑1 (MQ=255)
aTAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCaaaaa < 2:46418/140‑1 (MQ=255)
aTAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCaaaaa < 2:1274073/140‑1 (MQ=255)
aTAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCaaaaa < 2:1196956/140‑1 (MQ=255)
aTAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCaaaaa < 2:1051514/140‑1 (MQ=255)
aTAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCaaaaa < 2:10441/140‑1 (MQ=255)
aCAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGt < 1:1427148/140‑1 (MQ=255)
atCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGTCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGta < 1:973107/140‑1 (MQ=255)
atCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGta < 2:449899/140‑1 (MQ=255)
atCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGta < 2:716557/140‑1 (MQ=255)
atCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGta < 2:779621/140‑1 (MQ=255)
atCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGta < 2:804892/140‑1 (MQ=255)
atCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGta < 1:272399/140‑1 (MQ=255)
tCGTTCCGGTAATCAATGATAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGtat > 2:280695/1‑140 (MQ=255)
gTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATAc > 2:393078/1‑140 (MQ=255)
gTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATAc > 2:576013/1‑140 (MQ=255)
ttCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATAcc > 1:1137269/1‑140 (MQ=255)
ttCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATAcc > 1:1199704/1‑140 (MQ=255)
tCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCg > 2:388491/1‑140 (MQ=255)
cGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGt < 2:597247/128‑1 (MQ=255)
cGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGt > 1:597247/1‑128 (MQ=255)
cGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCt > 2:385826/1‑140 (MQ=255)
tAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGAc < 2:1137269/140‑1 (MQ=255)
tAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGAc < 2:298016/140‑1 (MQ=255)
tAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGAc < 1:525228/140‑1 (MQ=255)
tCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCcg < 2:1078722/140‑1 (MQ=255)
aaTGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCcgcg < 2:913923/140‑1 (MQ=255)
cGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATc > 1:1282664/1‑140 (MQ=255)
cGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATc > 2:286756/1‑140 (MQ=255)
cGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATc > 2:557367/1‑140 (MQ=255)
aTGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCg < 1:1163222/140‑1 (MQ=255)
tGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCgcagg < 1:286756/140‑1 (MQ=255)
tCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCgcaggca > 2:476829/1‑140 (MQ=255)
tCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCgcaggca > 1:824885/1‑140 (MQ=255)
cTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGaa < 1:385826/140‑1 (MQ=255)
cTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGaa < 1:576013/140‑1 (MQ=255)
cTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGaa < 1:926148/140‑1 (MQ=255)
cTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGaa < 1:85229/140‑1 (MQ=255)
atACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGaa < 2:393998/139‑1 (MQ=255)
ggCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGa < 1:280695/140‑1 (MQ=255)
agaTTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTaaa < 1:485142/140‑1 (MQ=255)
agaTTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTaaa > 2:1379536/1‑140 (MQ=255)
agaTTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTaaa > 2:133154/1‑140 (MQ=255)
agaTTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTaaa > 1:1309831/1‑140 (MQ=255)
aaTTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTAAAg < 2:1199704/139‑1 (MQ=255)
cGGCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTAAAGATGTTTACg < 1:935441/140‑1 (MQ=255)
gCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTAAAGATGTTTACGGc > 2:854913/1‑140 (MQ=255)
gCGATAACGATAACCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGGTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTAAAGATGTTTACGGc > 1:887188/1‑140 (MQ=255)
gataacgataacCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTAAAGATGTTTACGGCAt < 2:24518/140‑1 (MQ=255)
acgataacCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTAAAGATGTTTACGGCATtgat > 2:831862/1‑140 (MQ=255)
acCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTAAAGATGTTTACGGCATTGATGACGCa < 1:133154/140‑1 (MQ=255)
acCTTTATGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTAAAGATGTTTACGGCATTGATGACGCa < 1:1379536/140‑1 (MQ=255)
|
AAGACCGTGAACGCTTCCTGAACGCCCGCGACACCCTGCGAGCGTTGCTCGATAACAATATCGTTCCGGTAATCAATGAGAACGATGCTGTCGCTACGGCAGAGATTAAGGTCGGCGATAACGATAACCTTTCTGCGCTGGCGGCGATTCTTGCGGGTGCCGATAAACTGTTGCTGCTGACCGATCAAAAAGGTTTGTATACCGCTGACCCGCGCAGCAATCCGCAGGCAGAACTGATTAAAGATGTTTACGGCATTGATGACGCA > NC_000913/260713‑260978
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
