Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F48 I1 R1
|
76 |
74.1 |
2532288 |
99.0% |
2506965 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
987,380 |
G→T |
intergenic (‑398/+205) |
ompF ← / ← asnS |
outer membrane porin F/asparagine‑‑tRNA ligase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 987,380 | 0 | G | T | 98.8%
| 286.7
/ ‑6.0
| 81 | intergenic (‑398/+205) | ompF/asnS | outer membrane porin F/asparagine‑‑tRNA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (36/44); total (37/44) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATTTACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTT > NC_000913/987243‑987515
|
atTTACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTaa > 1:862847/1‑140 (MQ=255)
ttACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTaaaa > 2:788658/1‑140 (MQ=255)
ttACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTaaaa < 2:520175/140‑1 (MQ=255)
aCAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAAtt > 1:251000/1‑140 (MQ=255)
aCAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAAtt > 1:657739/1‑140 (MQ=255)
cAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAAttt > 2:713576/1‑139 (MQ=255)
cAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATtg < 2:637490/140‑1 (MQ=255)
aGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGTCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATtgt > 2:101535/1‑140 (MQ=255)
aGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATtgt > 2:815928/1‑140 (MQ=255)
cAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGc > 1:1106840/1‑140 (MQ=255)
cAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGc > 2:786334/1‑140 (MQ=255)
ttttAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTAt < 1:943568/140‑1 (MQ=255)
ttttAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATAGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTAt < 1:857873/140‑1 (MQ=255)
aTCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCt < 2:178922/140‑1 (MQ=255)
tttATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTGTTAGCTAAGaa > 2:698452/1‑140 (MQ=255)
ttATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGaaa > 1:603758/1‑140 (MQ=255)
aTTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTaa < 2:949866/140‑1 (MQ=255)
aTTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTaa < 2:889800/140‑1 (MQ=255)
ttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATc > 2:765854/1‑140 (MQ=255)
ttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATc < 2:610542/140‑1 (MQ=255)
ttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATc > 1:285749/1‑140 (MQ=255)
ttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATc > 1:278221/1‑140 (MQ=255)
ttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATc > 1:1063032/1‑140 (MQ=255)
ttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATc > 1:48035/1‑140 (MQ=255)
ttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATc > 1:119602/1‑140 (MQ=255)
ttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATAGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATc > 2:522424/1‑140 (MQ=255)
ttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTGTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATc > 1:21871/1‑140 (MQ=255)
tataTTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCaa > 2:697716/1‑140 (MQ=255)
atatTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAAt < 1:600435/140‑1 (MQ=255)
atacTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAAt < 1:786334/140‑1 (MQ=255)
aaaTTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAAt < 1:815928/140‑1 (MQ=255)
aaTTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATg > 1:1226073/1‑140 (MQ=255)
cTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGAtt > 2:501127/1‑140 (MQ=255)
cGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCAC‑AAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGtttt > 1:659820/1‑140 (MQ=255)
gAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGttttt < 1:101535/140‑1 (MQ=255)
gAAATATTGTTTCTGATGGAAACTTTATAGACCTGGCACAAAATCTTCTATAAGACATCCAGAATGACAAAAAATAGTATTAAAAATGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGttttt < 2:1194800/140‑1 (MQ=255)
aaaTTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTg < 1:968607/140‑1 (MQ=255)
aaTTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTgc > 2:1024333/1‑140 (MQ=255)
ttGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGt < 2:1118973/140‑1 (MQ=255)
tGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTa > 1:470891/1‑140 (MQ=255)
gTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTaa < 2:470891/140‑1 (MQ=255)
tCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATg > 1:949038/1‑140 (MQ=255)
tCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATg < 2:799712/140‑1 (MQ=255)
tCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATg < 2:657739/140‑1 (MQ=255)
gATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAGTAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTg < 2:1136042/140‑1 (MQ=255)
aTGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGc > 2:1232363/1‑140 (MQ=255)
aTGGAAACTTTATCGACCTGGCAC‑AAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGct < 2:659820/140‑2 (MQ=255)
tGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCa < 2:651434/140‑1 (MQ=255)
tGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCa < 1:697716/140‑1 (MQ=255)
atttATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTaa < 2:379417/139‑1 (MQ=255)
tATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAatat > 1:966750/1‑140 (MQ=255)
tATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGCTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAatat > 1:483434/1‑140 (MQ=255)
aTCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATAtt > 1:1251784/1‑140 (MQ=255)
aTCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATAtt < 2:119602/140‑1 (MQ=255)
aCCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGt < 2:1251784/140‑1 (MQ=255)
aCCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGt < 1:522424/140‑1 (MQ=255)
aCCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACAACCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGt < 1:788658/140‑1 (MQ=255)
ccTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTa < 1:579203/140‑1 (MQ=255)
cTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTaa < 1:976836/140‑1 (MQ=255)
cTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTaa < 1:581926/140‑1 (MQ=255)
tGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTGTTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAAc < 1:698452/140‑1 (MQ=255)
gCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAg > 1:66579/1‑140 (MQ=255)
gCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAg > 1:836676/1‑140 (MQ=255)
gCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGGGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAg > 1:390283/1‑140 (MQ=255)
caAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGgat < 2:603758/140‑1 (MQ=255)
aaaTCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGgatga < 2:483434/140‑1 (MQ=255)
aaTCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGgatgat > 2:541992/1‑140 (MQ=255)
aaTCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGgatgat > 1:986551/1‑140 (MQ=255)
cttcttTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGt < 1:1232363/140‑1 (MQ=255)
ttCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATgg < 2:836676/140‑1 (MQ=255)
cAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCg < 2:251000/140‑1 (MQ=255)
cAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCg < 2:1226073/140‑1 (MQ=255)
cAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCg < 1:45925/140‑1 (MQ=255)
gACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTATTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCggg < 1:1024333/140‑1 (MQ=255)
cATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGt < 1:765854/140‑1 (MQ=255)
cATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGt < 1:1135790/140‑1 (MQ=255)
aaTCCAGAATGCCAAAAAATAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGt < 2:251854/139‑1 (MQ=255)
aaaaaaTAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGaaaaaaaatt > 2:808474/1‑133 (MQ=255)
aaaaaaTAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAATAGaatt > 1:981757/1‑137 (MQ=255)
aaaaTAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCt < 1:881327/140‑1 (MQ=255)
aaaaTAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCt < 1:713576/140‑1 (MQ=255)
gTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACtt < 1:541992/140‑1 (MQ=255)
|
ATTTACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTT > NC_000913/987243‑987515
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
