Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A16 F48 I1 R1
|
61 |
131.2 |
4447032 |
99.1% |
4407008 |
139.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
170,713 |
G→T |
E47* (GAA→TAA) |
fhuD → |
iron(III) hydroxamate ABC transporter periplasmic binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 170,713 | 0 | G | T | 100.0%
| 314.1
/ NA
| 93 | E47* (GAA→TAA) | fhuD | iron(III) hydroxamate ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (46/47); total (46/47) |
GAGCGGCTTACCTCTTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGGAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTG > NC_000913/170577‑170847
|
gaGCGGCTTACCTCTTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAAt < 2:2041619/140‑1 (MQ=255)
aGCGGCTTACCTCTTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCCCGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTTGAATGGTTGCCGGTGCAAtt > 2:1895639/1‑140 (MQ=255)
aGCGGCTTACCTCTTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAAtt > 1:1068018/1‑140 (MQ=255)
aGCGGCTTACCTCTTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAAtt > 2:2059443/1‑140 (MQ=255)
cGGCTTACCTCTTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTAc > 1:1364514/1‑140 (MQ=255)
gCTTACCTCTTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTActg > 1:594812/1‑140 (MQ=255)
gCTTACCTCTTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTActg > 1:1133713/1‑140 (MQ=255)
cTTACCTCTTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTActgt > 2:1363523/1‑139 (MQ=255)
ctctTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGgcg > 2:1371390/1‑140 (MQ=255)
ctTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCt < 2:1068018/140‑1 (MQ=255)
ctTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGGGTAATTACTGCTGgcgcc > 1:235894/1‑139 (MQ=255)
tATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCg < 2:245234/140‑1 (MQ=255)
aTTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCgg > 2:324333/1‑140 (MQ=255)
aTTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCgg > 1:375082/1‑140 (MQ=255)
aTTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCgg > 1:446691/1‑140 (MQ=255)
ttCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCa < 1:2059443/140‑1 (MQ=255)
cgcgCCGTCGACTGTTAACGGCGATTGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAAACGAATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTTGCGCTCGGCATc > 2:488518/1‑140 (MQ=255)
cgcgCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACTCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATc < 2:1809480/140‑1 (MQ=255)
cgcgCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATc < 1:1371390/140‑1 (MQ=255)
cgcgCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATc < 1:1488657/140‑1 (MQ=255)
cgcgCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATc < 2:1302653/140‑1 (MQ=255)
agcgcCGTCGACTGTTAACGGCGATTGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATTCCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTTGTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATc < 2:1287721/139‑1 (MQ=255)
gcgcCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCg < 1:559170/140‑1 (MQ=255)
gcgcCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCg > 2:1065562/1‑140 (MQ=255)
cgcCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGt > 1:297980/1‑140 (MQ=255)
cGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTa < 2:1630512/140‑1 (MQ=255)
cGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTa < 2:594812/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTgg < 1:501489/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTgg < 1:122821/140‑1 (MQ=255)
ggCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCgg > 2:793414/1‑140 (MQ=255)
ggCGACGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCgg < 2:1364514/140‑1 (MQ=255)
gCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGa < 2:330969/140‑1 (MQ=255)
cGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGAt < 1:793414/140‑1 (MQ=255)
tGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCt < 2:160410/122‑1 (MQ=255)
tGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCt > 1:160410/1‑122 (MQ=255)
tGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATAcc > 2:1032547/1‑140 (MQ=255)
tGGCACTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATAcc > 2:2145939/1‑140 (MQ=255)
gcgcTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATGCCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCAt < 1:1895639/140‑1 (MQ=255)
gcgcTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCAt < 1:476824/140‑1 (MQ=255)
gcgcTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCAt < 2:1290409/140‑1 (MQ=255)
cTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATaaccttca > 2:2008371/1‑133 (MQ=255)
cTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCaa < 1:1363523/140‑1 (MQ=255)
tgttATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCtg < 1:324333/140‑1 (MQ=255)
tgttATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCtg > 2:2112979/1‑140 (MQ=255)
tATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTgg > 1:1057609/1‑140 (MQ=255)
ggCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGTGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTc < 2:1801898/140‑1 (MQ=255)
ggCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCATCTATCGCCTGTGGGTc < 1:1131656/140‑1 (MQ=255)
gaGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAg < 1:672132/139‑1 (MQ=255)
cAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAg < 2:375082/140‑1 (MQ=255)
tGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGt > 2:669224/1‑133 (MQ=255)
tGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGt < 1:669224/133‑1 (MQ=255)
tGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGaa > 2:93579/1‑140 (MQ=255)
tGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGaa > 1:344422/1‑140 (MQ=255)
tGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGCATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCAACAACTATCCCCTGTGGGTCAGCGaa > 1:2162780/1‑140 (MQ=255)
tACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAaccac > 1:409048/1‑140 (MQ=255)
tACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAaccac < 1:1032547/140‑1 (MQ=255)
tACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAaccac < 1:2008371/140‑1 (MQ=255)
tACCGCCAACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAaccac < 1:1086718/140‑1 (MQ=255)
cGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCAt > 1:762288/1‑140 (MQ=255)
cGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCAt > 1:864878/1‑140 (MQ=255)
cccACGGGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATTCCATGAAATCTTGCCTGATGGTTAGCGAACCACCAttt > 2:2101127/1‑139 (MQ=255)
cccACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATTCCATCCACTATCTCCCCTGGGTCAGCGAAcccccactt > 2:374554/1‑137 (MQ=255)
cccACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATTGCCTGTTGGTCAGCGAAACACCATTg > 1:1722814/1‑140 (MQ=255)
cccACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCAttt > 2:603927/1‑139 (MQ=255)
cccACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTg > 1:969251/1‑140 (MQ=255)
cccACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTg > 2:1310190/1‑140 (MQ=255)
cACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGcc < 1:2145950/140‑1 (MQ=255)
aCGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCg < 2:1057609/140‑1 (MQ=255)
cgcgGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCgg > 2:276535/1‑140 (MQ=255)
cTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTg < 2:31895/140‑1 (MQ=255)
aTTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGac < 1:374554/140‑2 (MQ=255)
aTTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGAt < 2:1863691/140‑1 (MQ=255)
aTCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGt < 1:1065562/140‑1 (MQ=255)
aTCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGt < 2:65848/140‑1 (MQ=255)
tCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCCTTAACTATCACCTGTTGGGTAGCGAACCACCATTTCCGGTCTCAGTGTTCTACGTCGGtt > 2:1095949/1‑140 (MQ=255)
tCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGtt > 1:1920436/1‑140 (MQ=255)
gtgGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGcac < 1:2145939/140‑1 (MQ=255)
tgGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGcaca < 1:1310190/140‑1 (MQ=255)
tgGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGcaca < 1:93579/140‑1 (MQ=255)
tgGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGcaca < 1:276535/140‑1 (MQ=255)
tgGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGcaca < 2:762288/140‑1 (MQ=255)
tgGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGGCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGcaca > 1:1085084/1‑140 (MQ=255)
gcgcTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCCGCGAACCACCCTTGCCGGCCTCAGTGATCGACGTCGGGTTGCGCACAGa > 2:1561780/1‑140 (MQ=255)
gcgcTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTTCGCACAGa > 2:910912/1‑140 (MQ=255)
cgcTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGca > 1:279360/1‑135 (MQ=255)
cgcTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGca < 2:279360/135‑1 (MQ=255)
cTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCCACTATCGCCTGTGGGTCAACGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCCGTTTGCGCACAGaacc > 2:633948/1‑140 (MQ=255)
cTGGAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGCACAGaacc < 2:969251/140‑1 (MQ=255)
gAGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGCACAGaacctaa > 2:1768483/1‑140 (MQ=255)
aGTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGCACAGaacctaac < 2:2162780/140‑1 (MQ=255)
gTGGTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGCACAGaacctaacc > 2:1672811/1‑140 (MQ=255)
gTTGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGCACAGAACCTAACCTTg > 1:472066/1‑140 (MQ=255)
tGCCGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCAACGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGCACAGAACCTAACCTTGaa < 1:1095949/140‑1 (MQ=255)
cGGTGTAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGCACAGAACCTAACCTTGAActg > 1:938409/1‑140 (MQ=255)
|
GAGCGGCTTACCTCTTATTTCGCGCCGTCGACTGTTAACGGCGATGGCGCTTTCTCCGTTGTTATGGCAGATGAATACCGCCCACGCGGCGGCTATTGATCCCAATCGTATTGTGGCGCTGGAGTGGTTGCCGGTGGAATTACTGCTGGCGCTCGGCATCGTGCCTTACGGCGTGGCGGATACCATCAACTATCGCCTGTGGGTCAGCGAACCACCATTGCCGGACTCAGTGATCGACGTCGGTTTGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTG > NC_000913/170577‑170847
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
