Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F48 I1 R1
|
70 |
151.6 |
5072932 |
98.7% |
5006983 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
453,631 |
C→A |
Q179H (CAG→CAT) |
yajG ← |
putative lipoprotein YajG |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 453,631 | 0 | C | A | 100.0%
| 428.8
/ NA
| 120 | Q179H (CAG→CAT) | yajG | putative lipoprotein YajG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (61/59); total (61/59) |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GCAATATGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCCTGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTTTGTTGCCATTCTGCG > NC_000913/453494‑453764
|
gCAATATGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATg > 1:2346722/1‑140 (MQ=255)
cAATATGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATga > 1:2275521/1‑140 (MQ=255)
cAATATGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATga > 1:325227/1‑140 (MQ=255)
cAATATGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATga > 2:480024/1‑140 (MQ=255)
cAATATGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATga > 2:180387/1‑140 (MQ=255)
atatGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATgaga < 1:1827395/140‑1 (MQ=255)
atatGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATgaga < 1:388372/140‑1 (MQ=255)
atatGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGACTACGGGCCCGGCGTGCACCGGGCAAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATgaga < 2:1922423/140‑1 (MQ=255)
atGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACa > 1:246587/1‑140 (MQ=255)
tGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACat > 2:1473504/1‑140 (MQ=255)
tGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACat > 1:2159857/1‑140 (MQ=255)
ggCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACata > 1:1499183/1‑140 (MQ=255)
cTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATc > 2:1443608/1‑140 (MQ=255)
aaCGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGc > 2:449552/1‑140 (MQ=255)
aaCGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGc < 2:2825/140‑1 (MQ=255)
cgGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGAtt > 2:1215671/1‑139 (MQ=255)
cgGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATg > 2:2106371/1‑140 (MQ=255)
ggCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATgg > 2:330428/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGt > 2:769152/1‑140 (MQ=255)
cTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTa < 1:2077409/140‑1 (MQ=255)
gAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGt < 1:1646121/140‑1 (MQ=255)
aTACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGca < 2:614849/140‑1 (MQ=255)
aTACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGca < 1:1967602/140‑1 (MQ=255)
tACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGcac < 2:325227/140‑1 (MQ=255)
tACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGcac < 1:480024/140‑1 (MQ=255)
aCGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGcaca < 2:1166287/140‑1 (MQ=255)
aCGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGcaca < 1:2106371/140‑1 (MQ=255)
aCGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGcaca < 1:1215671/140‑1 (MQ=255)
gTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACt < 1:180387/140‑1 (MQ=255)
tatTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTaa < 1:1016347/140‑1 (MQ=255)
ttGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAAcc < 2:1409844/140‑1 (MQ=255)
aCTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCa < 1:2205888/140‑1 (MQ=255)
aCTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCa > 1:244171/1‑140 (MQ=255)
aCTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCa > 1:1773670/1‑140 (MQ=255)
cTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAAGTATCGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCAt > 1:1725966/1‑140 (MQ=255)
gACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCgg > 1:1477767/1‑140 (MQ=255)
cATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCg < 1:735154/140‑1 (MQ=255)
tGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGat < 2:687298/140‑1 (MQ=255)
gggCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGata > 1:1578813/1‑140 (MQ=255)
ggCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGatat > 1:42478/1‑140 (MQ=255)
gCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATAtt < 1:981197/140‑1 (MQ=255)
cGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATAttt > 1:2171842/1‑140 (MQ=255)
tCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATAttttt > 2:2415767/1‑140 (MQ=255)
tCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATAttttt > 1:1213528/1‑140 (MQ=255)
tACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTttgt > 1:869225/1‑140 (MQ=255)
cAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTttgttg < 1:1443608/140‑1 (MQ=255)
cAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTttgttg < 2:2346722/140‑1 (MQ=255)
aaGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTttgttg < 2:1578813/139‑1 (MQ=255)
gCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAg > 2:109987/1‑140 (MQ=255)
ggCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCt < 1:2507246/140‑1 (MQ=255)
gCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTg > 2:1646134/1‑140 (MQ=255)
gCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTg > 1:840006/1‑140 (MQ=255)
gCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTg > 2:1807526/1‑140 (MQ=255)
gCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTg > 1:1853208/1‑140 (MQ=255)
gCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAATGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAAc < 1:668595/140‑1 (MQ=255)
gCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAAc < 1:1056007/140‑1 (MQ=255)
gCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAAc < 2:2119209/140‑1 (MQ=255)
gCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAAc < 1:330428/140‑1 (MQ=255)
cACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACg < 2:2171842/140‑1 (MQ=255)
cACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACg < 1:689468/140‑1 (MQ=255)
cACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACg > 1:47023/1‑140 (MQ=255)
cACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAACGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACg < 1:1473504/140‑1 (MQ=255)
cGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGTGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCAc < 1:1850691/140‑1 (MQ=255)
ggCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGc < 2:2186492/136‑1 (MQ=255)
ggCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGc > 1:2186492/1‑136 (MQ=255)
ggCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCt > 1:1760050/1‑140 (MQ=255)
ggCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCt > 1:2068167/1‑140 (MQ=255)
gCCAGAGGGCAGAAATTAGCGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCtt > 1:2288814/1‑140 (MQ=255)
gCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCtt > 1:2208474/1‑140 (MQ=255)
gCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCtt > 2:424661/1‑140 (MQ=255)
cAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCa < 2:1760050/140‑1 (MQ=255)
cAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCa < 2:1854416/140‑1 (MQ=255)
cAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCa < 2:1329697/140‑1 (MQ=255)
agagGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCaa < 2:1167862/140‑1 (MQ=255)
aGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTa > 2:1752058/1‑140 (MQ=255)
aGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTa > 2:607244/1‑140 (MQ=255)
aaaTTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGc < 1:109987/140‑1 (MQ=255)
aaTTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCt < 1:424661/140‑1 (MQ=255)
ttAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTgg < 2:829752/140‑1 (MQ=255)
ttAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTgc < 1:1807526/140‑2 (MQ=255)
tAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGc < 2:1773670/140‑1 (MQ=255)
aaCGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCa > 2:2366308/1‑140 (MQ=255)
gcgTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATa > 2:2277871/1‑140 (MQ=255)
gcgTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATa > 2:369697/1‑140 (MQ=255)
cgTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCt < 2:2268156/130‑1 (MQ=255)
gatgaATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCa > 2:2480341/1‑140 (MQ=255)
atgaATTCGTGGATGCTGGTATCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCAt > 1:1758446/1‑140 (MQ=255)
tgaATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCAtt > 2:526339/1‑140 (MQ=255)
gaATTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCAttt < 2:1116198/140‑1 (MQ=255)
aTTCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTttg > 2:1681493/1‑140 (MQ=255)
tCGTGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTttgtt > 2:1156204/1‑140 (MQ=255)
tGGATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTTTGTTGcc > 1:2266254/1‑140 (MQ=255)
gATGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTTTGTTGCCAt > 2:2512777/1‑140 (MQ=255)
tGCTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTTTGTTGCCATTc > 1:236868/1‑140 (MQ=255)
cTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTTTGTTGCCATTCTg < 1:2277871/140‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTTTGTTGCCATTCTg < 2:47023/140‑1 (MQ=255)
ggTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTTTGTTGCCATTCTgcg < 2:1853208/140‑1 (MQ=255)
ggTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTTTGTTGCCATTCTgcg < 1:526339/140‑1 (MQ=255)
ggTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTTTGTTGCCATTCTgcg < 1:607244/140‑1 (MQ=255)
ggTGTCATGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTTTGTTGCCATTCTgcg < 2:1213528/140‑1 (MQ=255)
|
GCAATATGGCTGAACGCGGCTGTTGAAAAATACGTAAATATTGACTGGACATGGGCGTCTACAGGCCCGGCTTGCACCGGGCCAGAGGGCAGAAATTAACGCGCGTTCTGCTTGATGAATTCGTGGATGCTGGTGTCCTGAGACATATCAGCGATGGTATCGGTCAGCACACTGTTAACCGCATCGGCGATATTTTTGTTGGAGGCCTGGAACGCACCTTCAACGTTGTAGCTGGCACGATAGTTTTTGGTCATTTTGTTGCCATTCTGCG > NC_000913/453494‑453764
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
