Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1357 |
179.3 |
9500450 |
96.1% |
9129932 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,718,074 |
T→C |
S59P (TCC→CCC) |
slyB → |
putative outer membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,718,074 | 0 | T | C | 99.4%
| 514.1
/ ‑4.7
| 160 | S59P (TCC→CCC) | slyB | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (62/97); total (62/98) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.75e-01 |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
TATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT > NC_000913/1717984‑1718163
|
tataCCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATccc < 2:1801623/93‑1 (MQ=255)
taCCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGGTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCaa < 1:2707920/93‑1 (MQ=255)
ccGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACg > 1:971631/1‑93 (MQ=255)
ccGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACg > 1:670174/1‑93 (MQ=255)
ccGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACg < 1:2075485/93‑1 (MQ=255)
gCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGtt < 1:4405451/93‑1 (MQ=255)
gCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGtt > 1:2198552/1‑93 (MQ=255)
ttCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTAt < 1:89937/93‑1 (MQ=255)
tccgAAGAGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATc > 2:4653875/4‑93 (MQ=255)
tCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATc < 2:4542829/93‑1 (MQ=255)
tGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCgg < 1:194664/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGt < 1:3204706/93‑1 (MQ=255)
gCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCa > 1:1626531/1‑93 (MQ=255)
gAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCGTCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAt < 1:4234535/93‑1 (MQ=255)
gAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAt > 2:1477802/1‑93 (MQ=255)
gAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGACGTTCCCAACGTTATCGGTGCAAt < 1:3928577/93‑1 (MQ=255)
gAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGAACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCCAt > 1:414326/1‑93 (MQ=255)
aaaCAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAtt < 1:3513407/93‑1 (MQ=255)
aaaCAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAtt < 2:1266794/93‑1 (MQ=255)
aaCAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTg > 1:4157093/1‑93 (MQ=255)
cAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGc < 1:3137182/93‑1 (MQ=255)
aaGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCg < 2:4668349/93‑1 (MQ=255)
aaGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCg < 1:657159/93‑1 (MQ=255)
aGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCgg > 2:3720090/1‑93 (MQ=255)
gTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCggg > 2:4467938/1‑92 (MQ=255)
tACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTg < 2:551064/93‑1 (MQ=255)
aCAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGc < 2:1928571/93‑1 (MQ=255)
aCAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGc < 1:1514220/93‑1 (MQ=255)
aCAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGATACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGc < 1:1981259/93‑1 (MQ=255)
aCAGAATGTCAGCTATGGCACCATCCTTAACGTTCGTCCGGTTCAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTTTCGGTGCAATTGGCGGTGc < 2:835283/93‑1 (MQ=255)
cAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCt < 1:1727403/93‑1 (MQ=255)
aGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTg < 2:2422454/93‑1 (MQ=255)
aTGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTc < 2:1295273/93‑1 (MQ=255)
aTGTCAGCTATGGCACCATCGTTAAAGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTc < 2:3318149/93‑1 (MQ=255)
gTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCtt < 1:3039561/93‑1 (MQ=255)
tCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtg < 2:1236701/93‑1 (MQ=255)
aGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGCCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtggt < 2:1290594/93‑1 (MQ=255)
gCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtggtg < 2:1343716/93‑1 (MQ=255)
gCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtggtg < 1:2442828/93‑1 (MQ=255)
gCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtggtg > 2:2548585/1‑93 (MQ=255)
gCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtggtg > 1:3529817/1‑93 (MQ=255)
gCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGGACAGATTCAAGGCGGTGATGATACCAACGGTATCGGTGCGATTGGCGGTGCTGGTTTtggtg > 2:1458299/1‑93 (MQ=255)
tATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTggtggt < 1:3823514/93‑1 (MQ=255)
tATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTggtggt < 1:4392354/93‑1 (MQ=255)
aTGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtggtgggt > 2:1754444/1‑91 (MQ=255)
aTGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGtt > 1:1985486/1‑93 (MQ=255)
tGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGttt < 1:1203958/93‑1 (MQ=255)
tGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGttt > 2:103976/1‑93 (MQ=255)
ggCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTc < 2:1453854/93‑1 (MQ=255)
gCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTcc < 2:4389441/93‑1 (MQ=255)
aCCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTg < 1:1192020/93‑1 (MQ=255)
ccATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTgg > 2:1899800/1‑93 (MQ=255)
ccATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTgg < 2:2268123/93‑1 (MQ=255)
ccATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTgg < 1:1331018/93‑1 (MQ=255)
cATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTggg > 1:1103067/1‑93 (MQ=255)
gTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAt < 2:505814/93‑1 (MQ=255)
gTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAt > 2:4303483/1‑93 (MQ=255)
aaCGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACt > 1:3592423/1‑93 (MQ=255)
acgtacgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTg > 1:3121379/1‑93 (MQ=255)
tacgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtg < 1:4001987/93‑1 (MQ=255)
tacgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtg < 1:3958210/93‑1 (MQ=255)
tacgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtg > 1:3891311/1‑93 (MQ=255)
tacgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtg > 1:2784493/1‑93 (MQ=255)
tcgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtgg < 2:1000963/92‑1 (MQ=255)
acgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtgg < 1:2313655/93‑1 (MQ=255)
acgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtgg < 2:2158299/93‑1 (MQ=255)
cgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggt < 2:1164902/93‑1 (MQ=255)
gtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggtg < 2:2625258/93‑1 (MQ=255)
gtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggtg < 1:1115011/93‑1 (MQ=255)
gtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggtg < 2:1115934/93‑1 (MQ=255)
tCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggtgg > 1:60728/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGGGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggtgg > 1:1488571/1‑93 (MQ=255)
cGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCg > 1:716445/1‑93 (MQ=255)
gTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCACCGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGa < 1:257971/93‑1 (MQ=255)
gTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGa < 2:1022812/93‑1 (MQ=255)
gTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGa > 1:616495/1‑93 (MQ=255)
gTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGa > 1:4479329/1‑93 (MQ=255)
tACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGTGGaa > 1:2814405/1‑93 (MQ=255)
aCAGATTCAGGGCGGTGATGTTCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAc < 1:2919026/93‑1 (MQ=255)
aCAGATTCAGGGCGGTGATGTTCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAc < 1:2919027/93‑1 (MQ=255)
aCAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAc < 2:2013517/93‑1 (MQ=255)
aCAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAc < 1:2109501/93‑1 (MQ=255)
aCAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAc < 1:4161816/93‑1 (MQ=255)
cAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAcc < 2:3695223/93‑1 (MQ=255)
aGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCg > 1:3244744/1‑93 (MQ=255)
aGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCg < 1:1147556/93‑1 (MQ=255)
gATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCgg < 2:3431550/93‑1 (MQ=255)
gATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCgg < 2:387588/93‑1 (MQ=255)
gATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCgg > 2:3252637/1‑93 (MQ=255)
gATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCgg < 2:2819657/93‑1 (MQ=255)
gggCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtc > 2:3347926/1‑93 (MQ=255)
gggCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtc < 2:2357160/93‑1 (MQ=255)
gCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtctc < 1:2544164/93‑1 (MQ=255)
gCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtctc < 2:693036/93‑1 (MQ=255)
ggTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTg < 2:3888622/93‑1 (MQ=255)
ggTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTg < 2:4080319/93‑1 (MQ=255)
gTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTgg < 1:3842021/93‑1 (MQ=255)
gatgatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCt > 2:4574326/1‑93 (MQ=255)
atgatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTa > 2:3060588/1‑93 (MQ=255)
atgatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTa > 2:2722034/1‑93 (MQ=255)
|
TATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT > NC_000913/1717984‑1718163
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > NC_000913/1717982‑1718167
|
TTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCC < SRR4302544.3721197/94‑1 (MQ=60)
TACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCGCCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAAC < SRR4302544.1711432/94‑1 (MQ=60)
TACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGGTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAAC < SRR4302544.2733956/94‑1 (MQ=60)
ACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACG > SRR4302544.981163/1‑94 (MQ=60)
ACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACG > SRR4302544.676796/1‑94 (MQ=60)
CCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGT < SRR4302544.2095430/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTT > SRR4302544.2219274/1‑94 (MQ=60)
GCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTA < SRR4302544.4449948/94‑1 (MQ=60)
GCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTA > SRR4302544.4016627/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTAT < SRR4302544.2956908/94‑1 (MQ=60)
TTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATC < SRR4302544.90782/94‑1 (MQ=60)
GTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATC < SRR4302544.290300/94‑1 (MQ=60)
TGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGT < SRR4302544.196628/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTG < SRR4302544.3235263/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTG > SRR4302544.4496394/1‑94 (MQ=60)
AGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCA > SRR4302544.1642555/1‑94 (MQ=60)
AGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCA > SRR4302544.4121997/1‑94 (MQ=60)
CGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAT < SRR4302544.3274305/94‑1 (MQ=60)
CGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGAACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCCAT > SRR4302544.418554/1‑94 (MQ=60)
GAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCGTCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATT < SRR4302544.4277694/94‑1 (MQ=60)
GAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCACAACGTTATCGGTGCAATT < SRR4302544.4205196/94‑1 (MQ=60)
GAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGACGTTCCCAACGTTATCGGTGCAATT < SRR4302544.3967592/94‑1 (MQ=60)
GAAACAACGACAGAATGTCAACTATGGCCCCATCGTTAACTCACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGACTTTCCCAACGTTATCGGTGCAATT < SRR4302544.3967591/94‑1 (MQ=44)
AAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTG < SRR4302544.3546932/94‑1 (MQ=60)
AAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTG > SRR4302544.4198267/1‑94 (MQ=60)
CAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCG < SRR4302544.3166994/94‑1 (MQ=60)
AAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGG < SRR4302544.663663/94‑1 (MQ=60)
AAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGG > SRR4302544.3594567/1‑94 (MQ=60)
ACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCT < SRR4302544.1529234/94‑1 (MQ=60)
ACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCT < SRR4302544.2000504/94‑1 (MQ=60)
ACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGATACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCT < SRR4302544.2000503/94‑1 (MQ=60)
CAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTG < SRR4302544.1744344/94‑1 (MQ=60)
GAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTT < SRR4302544.687383/94‑1 (MQ=60)
ATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCT < SRR4302544.1176841/94‑1 (MQ=60)
tctcagacatggcaacaaCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTT < SRR4302544.2602992/76‑1 (MQ=60)
TGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTT < SRR4302544.1842894/94‑1 (MQ=60)
TGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTT < SRR4302544.2602991/94‑1 (MQ=60)
GTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTG < SRR4302544.3068652/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGG < SRR4302544.25265/94‑1 (MQ=60)
AGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTG > SRR4302544.3563568/1‑94 (MQ=60)
GCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGG < SRR4302544.2466117/94‑1 (MQ=60)
CTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGT > SRR4302544.3746539/1‑94 (MQ=60)
CTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGT > SRR4302544.220320/1‑94 (MQ=60)
TATGGCCCCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTT < SRR4302544.4383882/94‑1 (MQ=60)
TATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTT < SRR4302544.3861421/94‑1 (MQ=60)
TATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTT < SRR4302544.4436785/94‑1 (MQ=60)
TATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTT > SRR4302544.2004764/1‑94 (MQ=60)
TGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTC < SRR4302544.1215886/94‑1 (MQ=60)
TGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCC < SRR4302544.1547772/94‑1 (MQ=60)
ACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGG < SRR4302544.1203843/94‑1 (MQ=60)
CCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGG > SRR4302544.1114054/1‑94 (MQ=60)
CCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGG < SRR4302544.1344117/94‑1 (MQ=60)
CATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGG < SRR4302544.1001010/94‑1 (MQ=60)
ATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGA > SRR4302544.916210/1‑94 (MQ=60)
CGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAT > SRR4302544.673254/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATA > SRR4302544.3906919/1‑94 (MQ=60)
TAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACT > SRR4302544.3626925/1‑94 (MQ=60)
AACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTG > SRR4302544.3151049/1‑94 (MQ=60)
GTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTG < SRR4302544.4196940/94‑1 (MQ=60)
GTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTG > SRR4302544.3929965/1‑94 (MQ=60)
GTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTG > SRR4302544.2811288/1‑94 (MQ=60)
TACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGG > SRR4302544.644278/1‑94 (MQ=60)
TACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGG < SRR4302544.3997565/94‑1 (MQ=60)
TACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGG < SRR4302544.3085463/94‑1 (MQ=60)
TACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGG < SRR4302544.4041815/94‑1 (MQ=60)
ACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGT < SRR4302544.2335543/94‑1 (MQ=60)
GTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGG > SRR4302544.61346/1‑94 (MQ=60)
GTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGG < SRR4302544.1126138/94‑1 (MQ=60)
GTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGG > SRR4302544.2605954/1‑94 (MQ=60)
GTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGGGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGG > SRR4302544.1503287/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGC > SRR4302544.4532611/1‑94 (MQ=60)
CCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCG > SRR4302544.723523/1‑94 (MQ=60)
GGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGA > SRR4302544.1136710/1‑94 (MQ=60)
GGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGA > SRR4302544.622547/1‑94 (MQ=60)
GGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGA > SRR4302544.4524359/1‑94 (MQ=60)
GTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCACCGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAA < SRR4302544.260706/94‑1 (MQ=60)
GTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGTGGAA > SRR4302544.2841567/1‑94 (MQ=60)
GTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAA > SRR4302544.3421035/1‑94 (MQ=60)
ACAGATTCAGGGCGGTGATGTTCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACC < SRR4302544.2947095/94‑1 (MQ=60)
ACAGATTCAGGGCGGTGATGTTCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACC < SRR4302544.2947094/94‑1 (MQ=60)
ACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACC < SRR4302544.4203044/94‑1 (MQ=60)
ACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACC < SRR4302544.2129790/94‑1 (MQ=60)
CAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCG > SRR4302544.3275810/1‑94 (MQ=60)
AGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGG < SRR4302544.1158969/94‑1 (MQ=60)
GATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGG > SRR4302544.2322946/1‑94 (MQ=60)
AGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTC > SRR4302544.323566/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGTGATGATCCCAACGTTATTGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCT > SRR4302544.1354700/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCT < SRR4302544.2813911/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCT < SRR4302544.2568589/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGCGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGTATACTGTTGGTGGCGGAACCGTGCGCTCCCTG > SRR4302544.1230036/1‑94 (MQ=60)
GTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGC < SRR4302544.3880137/94‑1 (MQ=60)
GATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGACCCGGGCGTTCTCTGGCTACTG < SRR4302544.2028326/94‑1 (MQ=60)
CCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > SRR4302544.4326317/1‑94 (MQ=60)
CCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG < SRR4302544.154593/94‑1 (MQ=60)
CCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > SRR4302544.1693774/1‑94 (MQ=60)
CCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG < SRR4302544.2699714/94‑1 (MQ=60)
|
TTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > NC_000913/1717982‑1718167
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
