Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,718,074 |
T→C |
S59P (TCC→CCC) |
slyB → |
putative outer membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,718,074 | 0 | T | C | 99.6%
| 722.4
/ ‑4.6
| 224 | S59P (TCC→CCC) | slyB | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (90/133); total (91/133) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.06e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.39e-01 |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
TATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT > NC_000913/1717984‑1718163
|
tataCCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATccc < 2:2458913/93‑1 (MQ=255)
taCCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCaa > 2:1352592/1‑93 (MQ=255)
taCCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGGGATGATCCCaa > 1:861678/1‑93 (MQ=255)
aCCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAAc < 1:5227013/93‑1 (MQ=255)
ccGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACg < 1:4055779/93‑1 (MQ=255)
cGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGt > 2:495226/1‑93 (MQ=255)
cGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGt < 1:4723891/93‑1 (MQ=255)
gCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGtt > 2:3670253/1‑93 (MQ=255)
cTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTa < 2:218929/93‑1 (MQ=255)
ttCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTAt < 1:5538592/93‑1 (MQ=255)
ttCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGC‑GTGATGATGCCAACGTTaac > 2:5160343/1‑91 (MQ=255)
tCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCCGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATc < 1:173288/93‑1 (MQ=255)
cTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAGCGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCg < 1:5799311/93‑1 (MQ=255)
tGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCgg < 2:3114622/93‑1 (MQ=255)
aaGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTg > 2:146296/1‑93 (MQ=255)
aaGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTg > 2:5692911/1‑93 (MQ=255)
aaGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTg > 1:4638940/1‑93 (MQ=255)
aaGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTg < 1:6098020/93‑1 (MQ=255)
aGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGc < 1:4495129/93‑1 (MQ=255)
cGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCaa < 2:1881166/93‑1 (MQ=255)
gAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAt < 1:308638/93‑1 (MQ=255)
gAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAt < 1:4216859/93‑1 (MQ=255)
aaaCAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAtt < 2:5493505/93‑1 (MQ=255)
aaaCAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAtt < 1:1306943/93‑1 (MQ=255)
aaCAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTg > 1:6481575/1‑93 (MQ=255)
aCAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTgg > 1:3685247/1‑93 (MQ=255)
aCAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTgg < 2:2984693/93‑1 (MQ=255)
aGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCgg < 1:6622614/93‑1 (MQ=255)
aGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCgg < 1:3387498/93‑1 (MQ=255)
aGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCgg < 2:4826728/93‑1 (MQ=255)
gTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGt > 1:4316984/1‑93 (MQ=255)
gTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGt < 2:3625809/93‑1 (MQ=255)
tACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTg > 1:6069326/1‑93 (MQ=255)
tACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTg > 2:322696/1‑93 (MQ=255)
aGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTg > 2:5431157/1‑93 (MQ=255)
gAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGt < 1:839019/93‑1 (MQ=255)
gAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGt > 1:2560327/1‑93 (MQ=255)
aaTGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGtt < 2:6558795/93‑1 (MQ=255)
aaTGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGtt < 2:3337037/93‑1 (MQ=255)
aaTGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGtt < 1:213765/93‑1 (MQ=255)
aaTGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGtt < 1:5546554/93‑1 (MQ=255)
aaTGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGtt < 1:2745193/93‑1 (MQ=255)
aaTGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGCTGCAATTGGCGGTGCTGtt > 1:721737/1‑93 (MQ=255)
aTGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTc > 1:779902/1‑93 (MQ=255)
tGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCt < 2:479076/93‑1 (MQ=255)
tGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCt < 1:2681711/93‑1 (MQ=255)
gTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCtt < 2:5797126/93‑1 (MQ=255)
tCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtg > 2:2725677/1‑93 (MQ=255)
tCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtg < 1:4446420/93‑1 (MQ=255)
cAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtgg < 2:4621338/93‑1 (MQ=255)
gCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtggtg > 2:624521/1‑93 (MQ=255)
gCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtggtg > 2:4116223/1‑93 (MQ=255)
tATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTggtggt > 1:3154889/1‑93 (MQ=255)
aTGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGtt > 2:1154903/1‑93 (MQ=255)
ggCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTc > 1:1391292/1‑93 (MQ=255)
gCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTcc < 2:1689436/93‑1 (MQ=255)
cACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCt > 2:3152811/1‑93 (MQ=255)
ccATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTgg < 2:1210885/93‑1 (MQ=255)
cATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTggg > 1:367440/1‑93 (MQ=255)
cATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTggg < 1:2237824/93‑1 (MQ=255)
aTCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTgggg > 2:4300465/1‑93 (MQ=255)
aTCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTgggg > 2:1401813/1‑93 (MQ=255)
tCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTggggg > 1:5860807/1‑92 (MQ=255)
tCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGa > 1:4944921/1‑93 (MQ=255)
gTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAt > 1:105491/1‑93 (MQ=255)
gTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAt > 1:1829760/1‑93 (MQ=255)
gTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAt < 1:3769259/93‑1 (MQ=255)
ttAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATa < 1:1510872/93‑1 (MQ=255)
tAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATAc < 2:3494684/93‑1 (MQ=255)
aaCGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACt > 1:677404/1‑93 (MQ=255)
gtacgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGtt < 1:153638/93‑1 (MQ=255)
tacgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtg < 2:5719029/93‑1 (MQ=255)
gtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggtg < 1:914959/93‑1 (MQ=255)
ggTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCgg > 2:4060086/1‑93 (MQ=255)
aCAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAc < 1:5259073/93‑1 (MQ=255)
aCAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAc < 1:6211750/93‑1 (MQ=255)
cAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAcc < 2:2866136/93‑1 (MQ=255)
cAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAcc < 2:2290304/93‑1 (MQ=255)
cAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAcc > 2:3080847/1‑93 (MQ=255)
aGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCg > 2:5961516/1‑93 (MQ=255)
aGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCg < 1:2365496/93‑1 (MQ=255)
gATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCgg > 2:5855241/1‑93 (MQ=255)
gATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCgg > 2:737521/1‑93 (MQ=255)
gATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCgg < 1:3266934/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCggg < 2:2022673/93‑1 (MQ=255)
aTTAAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCggg < 1:1655122/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGGACCGGGc > 1:5680611/1‑93 (MQ=255)
tCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCg > 1:6033848/1‑93 (MQ=255)
cAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGt < 1:107287/93‑1 (MQ=255)
cAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGt < 1:4806859/93‑1 (MQ=255)
gggCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtc > 1:5061712/1‑93 (MQ=255)
gggCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtc < 2:6270800/93‑1 (MQ=255)
ggCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtct < 1:6245157/93‑1 (MQ=255)
gCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtctc < 1:5970872/93‑1 (MQ=255)
cGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTctct < 1:2437517/93‑1 (MQ=255)
tgatgaTCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGc > 2:1797532/1‑93 (MQ=255)
atgatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTa > 1:6313878/1‑93 (MQ=255)
tgatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTAc < 1:3197915/93‑1 (MQ=255)
tgatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTAc < 1:282232/93‑1 (MQ=255)
tgatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGGTGGTGGCCGAACCGGGCGTTCTCTGGCTAc < 1:6479523/93‑1 (MQ=255)
|
TATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT > NC_000913/1717984‑1718163
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > NC_000913/1717981‑1718167
|
TTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATC < SRR4302536.1234136/94‑1 (MQ=60)
GTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATC < SRR4302536.3658573/94‑1 (MQ=60)
GTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATC < SRR4302536.668517/94‑1 (MQ=60)
TTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCC > SRR4302536.444572/1‑94 (MQ=60)
TTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGGGATGATCC > SRR4302536.4682604/1‑94 (MQ=60)
TATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCA < SRR4302536.2337496/94‑1 (MQ=60)
ATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGGGATGATCCCAA > SRR4302536.887008/1‑94 (MQ=60)
ACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACG < SRR4302536.5382760/94‑1 (MQ=60)
CCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGT < SRR4302536.4176003/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTT < SRR4302536.6085657/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTT < SRR4302536.4866021/94‑1 (MQ=60)
GCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTA > SRR4302536.4552583/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGGACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTAT > SRR4302536.1560046/1‑94 (MQ=60)
TTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATC < SRR4302536.521788/94‑1 (MQ=60)
TTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATC < SRR4302536.5703653/94‑1 (MQ=60)
TTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATC < SRR4302536.6770898/94‑1 (MQ=60)
TCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCCGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCG < SRR4302536.177817/94‑1 (MQ=60)
CTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAGCGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGG < SRR4302536.5971992/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTG > SRR4302536.4778358/1‑94 (MQ=60)
AAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGC < SRR4302536.6279851/94‑1 (MQ=60)
AAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGC < SRR4302536.2447544/94‑1 (MQ=60)
AGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCA > SRR4302536.6879120/1‑94 (MQ=60)
AGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCA < SRR4302536.4630069/94‑1 (MQ=60)
AGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCA > SRR4302536.5710277/1‑94 (MQ=60)
CGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAT < SRR4302536.1724804/94‑1 (MQ=60)
GAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATT < SRR4302536.2301685/94‑1 (MQ=60)
GAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATT > SRR4302536.1089363/1‑94 (MQ=60)
GAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATT < SRR4302536.316834/94‑1 (MQ=60)
GAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATT > SRR4302536.5026653/1‑94 (MQ=60)
GAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATT < SRR4302536.4342276/94‑1 (MQ=60)
AAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTG < SRR4302536.5944803/94‑1 (MQ=60)
AAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTG > SRR4302536.6674905/1‑94 (MQ=60)
AAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTG < SRR4302536.1345964/94‑1 (MQ=60)
AAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTG < SRR4302536.3212528/94‑1 (MQ=60)
AACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGG > SRR4302536.3795420/1‑94 (MQ=60)
AACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGG < SRR4302536.661605/94‑1 (MQ=60)
AACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGG > SRR4302536.2850152/1‑94 (MQ=60)
CAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCG > SRR4302536.6226617/1‑94 (MQ=60)
AGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGT > SRR4302536.4446240/1‑94 (MQ=60)
AGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGT < SRR4302536.6819567/94‑1 (MQ=60)
AGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGT < SRR4302536.3488214/94‑1 (MQ=60)
AGTACAGAATGCCAACTATGGCATCATCGTTAACGTCCGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGT < SRR4302536.54822/94‑1 (MQ=60)
GTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTG < SRR4302536.6464850/94‑1 (MQ=60)
GTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTG > SRR4302536.6250379/1‑94 (MQ=60)
GTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTG < SRR4302536.2934364/94‑1 (MQ=60)
GTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTG < SRR4302536.6160612/94‑1 (MQ=60)
AGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGT > SRR4302536.2637382/1‑94 (MQ=60)
AGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGT > SRR4302536.4844441/1‑94 (MQ=60)
GACTGTCAACTAGGGTACCATCGTTAACGTTCGTCCGGTACAGATTCAGGGAGGAGATGATATCAACGTTATCGATGCCATTGGCGGTGCTGCT > SRR4302536.6044416/1‑94 (MQ=36)
GAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTT < SRR4302536.863691/94‑1 (MQ=60)
GAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGCTGCAATTGGCGGTGCTGTT > SRR4302536.742864/1‑94 (MQ=60)
GAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGGGTTGCTTCCAACTTTATCGTTGCAATTGGCGGgttgttt > SRR4302536.4899844/1‑87 (MQ=60)
AATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTC < SRR4302536.219430/94‑1 (MQ=60)
AATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTC < SRR4302536.2826952/94‑1 (MQ=60)
AATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTC < SRR4302536.5711815/94‑1 (MQ=60)
AATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTC > SRR4302536.802750/1‑94 (MQ=60)
ATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCT < SRR4302536.5869050/94‑1 (MQ=60)
ATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCT > SRR4302536.1017214/1‑94 (MQ=60)
TGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTT < SRR4302536.2761841/94‑1 (MQ=60)
AGTCAGCTATGACACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTT < SRR4302536.6876146/94‑1 (MQ=60)
GTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTG < SRR4302536.2252015/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGG < SRR4302536.4579937/94‑1 (MQ=60)
CAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGT < SRR4302536.256121/94‑1 (MQ=60)
CAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGT < SRR4302536.2770515/94‑1 (MQ=60)
AGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTG < SRR4302536.4418532/94‑1 (MQ=60)
AGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGCGATGATCTCAACGTTATTGGTGCAATTGGCGGTGCTGGTCTTGGCG > SRR4302536.5152264/1‑94 (MQ=60)
CTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGT > SRR4302536.5716083/1‑94 (MQ=60)
CTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGT > SRR4302536.3247282/1‑94 (MQ=60)
CTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGGGCTGTTGTTGTTGGT > SRR4302536.1431798/1‑94 (MQ=60)
TATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTT < SRR4302536.1843113/94‑1 (MQ=60)
TATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTT < SRR4302536.472535/94‑1 (MQ=60)
ATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTT < SRR4302536.4507017/94‑1 (MQ=60)
TGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTC > SRR4302536.1432720/1‑94 (MQ=60)
TGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTC < SRR4302536.6409226/94‑1 (MQ=60)
TGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGGGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTC > SRR4302536.3297169/1‑94 (MQ=60)
GGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCC < SRR4302536.5386396/94‑1 (MQ=60)
GGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCC < SRR4302536.1473171/94‑1 (MQ=60)
GCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCT < SRR4302536.3791318/94‑1 (MQ=60)
CCCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGG < SRR4302536.4152961/94‑1 (MQ=60)
ACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGG > SRR4302536.6152063/1‑94 (MQ=60)
CCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGG > SRR4302536.4893026/1‑94 (MQ=60)
CCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGG > SRR4302536.377149/1‑94 (MQ=60)
CATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGG < SRR4302536.2305527/94‑1 (MQ=60)
CATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGG < SRR4302536.3393742/94‑1 (MQ=60)
ATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGG > SRR4302536.6035413/1‑94 (MQ=60)
ATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGA > SRR4302536.3250471/1‑94 (MQ=60)
ATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGA > SRR4302536.5093513/1‑94 (MQ=60)
CGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAT > SRR4302536.108307/1‑94 (MQ=60)
CGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAT > SRR4302536.1884927/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATA > SRR4302536.4147541/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATA < SRR4302536.3881797/94‑1 (MQ=60)
TTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATAC < SRR4302536.1555381/94‑1 (MQ=60)
TAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACT < SRR4302536.2724855/94‑1 (MQ=60)
TAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACT > SRR4302536.697239/1‑94 (MQ=60)
TAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACT > SRR4302536.153176/1‑94 (MQ=60)
CGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTGCTGGGGTATACTGTT > SRR4302536.3536023/1‑94 (MQ=60)
CGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTT < SRR4302536.5695897/94‑1 (MQ=60)
GTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCTTGGGTAATACTGTTG < SRR4302536.4599914/94‑1 (MQ=60)
GTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTG < SRR4302536.157614/94‑1 (MQ=60)
TACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGG < SRR4302536.518847/94‑1 (MQ=60)
TACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGG < SRR4302536.4221513/94‑1 (MQ=60)
ACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGT < SRR4302536.4785205/94‑1 (MQ=60)
GTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGG < SRR4302536.1166094/94‑1 (MQ=60)
GTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGG < SRR4302536.941931/94‑1 (MQ=60)
TCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGC > SRR4302536.6333718/1‑94 (MQ=60)
CGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGG < SRR4302536.1893188/94‑1 (MQ=60)
TACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAC > SRR4302536.3271140/1‑94 (MQ=60)
TACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAC < SRR4302536.3800988/94‑1 (MQ=60)
ACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACC < SRR4302536.6396820/94‑1 (MQ=60)
ACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACC < SRR4302536.82208/94‑1 (MQ=60)
ACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACC < SRR4302536.5415795/94‑1 (MQ=60)
AGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGG < SRR4302536.2437190/94‑1 (MQ=60)
AGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGG < SRR4302536.6010769/94‑1 (MQ=60)
GATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGG < SRR4302536.3362836/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGGTCGATGATGATCTCATCGTGATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGC < SRR4302536.811620/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGGACCGGGC > SRR4302536.5849505/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGC < SRR4302536.1712974/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGC > SRR4302536.898911/1‑94 (MQ=60)
ATTAAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGC < SRR4302536.1703203/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCG > SRR4302536.6213776/1‑94 (MQ=60)
TTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCG < SRR4302536.801186/94‑1 (MQ=60)
TCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGT > SRR4302536.1581626/1‑94 (MQ=60)
CAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTT < SRR4302536.110138/94‑1 (MQ=60)
CAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTT < SRR4302536.4951543/94‑1 (MQ=60)
AGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTC > SRR4302536.5213323/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCT < SRR4302536.2518807/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTC < SRR4302536.882067/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTC < SRR4302536.6431201/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCT < SRR4302536.6148843/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTG < SRR4302536.3635963/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTG < SRR4302536.2511206/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTG > SRR4302536.2883454/1‑94 (MQ=60)
GTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGC > SRR4302536.6272789/1‑94 (MQ=60)
GTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGCC < SRR4302536.6626723/94‑1 (MQ=60)
GATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTA > SRR4302536.6501946/1‑94 (MQ=60)
ATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTAC > SRR4302536.6301694/1‑94 (MQ=60)
ATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTAC < SRR4302536.717976/94‑1 (MQ=60)
TGATCCCAGCGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTACTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT < SRR4302536.5843816/94‑1 (MQ=60)
TGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT < SRR4302536.3291662/94‑1 (MQ=60)
TGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT < SRR4302536.289744/94‑1 (MQ=60)
TGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT < SRR4302536.6672827/94‑1 (MQ=60)
TGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGGTGGTGGCCGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT < SRR4302536.6672826/94‑1 (MQ=60)
GATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTG > SRR4302536.3269748/1‑94 (MQ=60)
GATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTG > SRR4302536.1921275/1‑94 (MQ=60)
ATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGC > SRR4302536.3318840/1‑94 (MQ=60)
ATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGC > SRR4302536.3993341/1‑94 (MQ=60)
TCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCA > SRR4302536.2582136/1‑94 (MQ=60)
TCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCA > SRR4302536.5630803/1‑94 (MQ=60)
CCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGTCTACTGCAG < SRR4302536.6708851/94‑1 (MQ=60)
CCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > SRR4302536.437692/1‑94 (MQ=60)
CCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > SRR4302536.1011983/1‑94 (MQ=60)
|
GTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > NC_000913/1717981‑1718167
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
