Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1357 |
179.3 |
9500450 |
96.1% |
9129932 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,941,713 |
T→C |
S92S (AGT→AGC) |
yebI → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,941,713 | 0 | T | C | 97.0%
| 394.8
/ 1.7
| 133 | S92S (AGT→AGC) | yebI | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/2); new base C (58/69); total (62/71) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.46e-01 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGT > NC_000913/1941624‑1941802
|
gTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGcc < 1:1241233/93‑1 (MQ=255)
gTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGcc < 2:1192133/93‑1 (MQ=255)
ttACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGccc < 2:2342237/93‑1 (MQ=255)
tACGCTGCTGCTGGCGTGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACCCGTGATTAGGGGTTATGGCGCACAGCGCCCt > 2:80202/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCt < 1:406064/93‑1 (MQ=255)
gctgctgctGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTc < 2:4275730/93‑1 (MQ=255)
ctgctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTcc > 1:3301956/1‑92 (MQ=255)
ctgctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCg < 1:1061088/93‑1 (MQ=255)
gctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCt < 1:1752131/93‑1 (MQ=255)
gctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCt > 1:46412/1‑93 (MQ=255)
tgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTgg < 1:2703433/93‑1 (MQ=255)
tgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTgg < 1:231560/93‑1 (MQ=255)
ggcgggcgGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCt > 2:2502236/1‑93 (MQ=255)
gtgcgcTCTGTTAGGGCTGGAGAAGCTTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCtggt < 2:4123139/91‑1 (MQ=255)
gggcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCtggt < 1:2318316/93‑1 (MQ=255)
gggcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGACCTGTCGCTGGGCCtggt < 1:978182/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGAAACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGAGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCg > 1:673609/1‑93 (MQ=255)
cTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTg < 1:900600/93‑1 (MQ=255)
cTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTg > 1:3904205/1‑93 (MQ=255)
tGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTgg > 1:2574302/1‑92 (MQ=255)
ggTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAg > 1:1026465/1‑93 (MQ=255)
ggTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAg < 1:1457195/93‑1 (MQ=255)
tATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTc > 1:3902993/1‑93 (MQ=255)
tATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTc > 1:3902992/1‑93 (MQ=255)
aTGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGAGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCt > 1:734456/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTg > 2:2009363/1‑93 (MQ=255)
cTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATg < 1:4488701/93‑1 (MQ=255)
tGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGt < 2:1754050/93‑1 (MQ=255)
ggAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTc < 1:417586/93‑1 (MQ=255)
gagaAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCt < 2:2109695/93‑1 (MQ=255)
gaAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTaa > 2:3131902/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAat > 2:1381674/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAat > 1:1446667/1‑93 (MQ=255)
aGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAata < 1:825211/93‑1 (MQ=255)
gTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTc < 1:3040950/93‑1 (MQ=255)
gTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGGGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTc > 1:2238672/1‑93 (MQ=255)
tCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCg > 1:276196/1‑93 (MQ=255)
ccACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGTATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgt < 2:1697820/93‑1 (MQ=255)
ccACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgt > 1:2941877/1‑93 (MQ=255)
ccACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgt < 1:2972548/93‑1 (MQ=255)
ccACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgt > 1:280544/1‑93 (MQ=255)
cacaGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgtg < 1:2464510/93‑1 (MQ=255)
cacaGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgtg > 2:3840262/1‑93 (MQ=255)
acaGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgtgt > 2:4015634/1‑93 (MQ=255)
caGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGTGTCTGATGTCTAATATTCGTGtt > 1:770709/1‑93 (MQ=255)
caGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGtt < 2:4467747/93‑1 (MQ=255)
aGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttg > 2:4566144/1‑93 (MQ=255)
ggtGGCGGTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttga < 1:3585549/91‑1 (MQ=255)
gCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttga < 2:3452106/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttga < 1:3585548/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgat < 1:1714135/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgat < 1:155359/93‑1 (MQ=255)
tGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatt > 2:4570611/1‑93 (MQ=255)
tGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatt < 1:1510180/93‑1 (MQ=255)
tGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatt < 1:2486974/93‑1 (MQ=255)
tGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatt > 2:3740539/1‑93 (MQ=255)
tGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatt < 2:2892944/93‑1 (MQ=255)
ggCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgattt > 1:1849478/1‑93 (MQ=255)
cGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGACCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttga < 1:2550495/93‑1 (MQ=255)
gATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttgat > 1:2953641/1‑93 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg < 1:2587777/93‑1 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg < 1:3779976/93‑1 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg > 2:550865/1‑93 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg > 1:4132645/1‑93 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATACTCGTGTTGATTTGATg > 1:2341256/1‑93 (MQ=255)
tCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATgg > 1:3391411/1‑93 (MQ=255)
cGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGc < 1:3427444/93‑1 (MQ=255)
cGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGc < 1:66068/93‑1 (MQ=255)
cGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGc < 1:1447833/93‑1 (MQ=255)
gACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCt > 2:1393605/1‑93 (MQ=255)
acacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCtt > 2:740537/1‑93 (MQ=255)
cacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTa < 1:3206477/93‑1 (MQ=255)
cacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTa > 1:811404/1‑93 (MQ=255)
cacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTa > 2:3240344/1‑93 (MQ=255)
acGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAc > 1:4170683/1‑93 (MQ=255)
acGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAc > 1:4680095/1‑93 (MQ=255)
gTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCt > 2:3552648/1‑93 (MQ=255)
tattaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGt > 2:138214/1‑93 (MQ=255)
attaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGtt < 1:2222522/93‑1 (MQ=255)
ttaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTc < 1:4018489/93‑1 (MQ=255)
ttaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTc < 2:2292505/93‑1 (MQ=255)
taGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCg > 1:697985/1‑93 (MQ=255)
taGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCg < 2:1122921/93‑1 (MQ=255)
aGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCgg < 2:514426/93‑1 (MQ=255)
gggATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGt < 2:569507/93‑1 (MQ=255)
gggATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGt > 2:398955/1‑93 (MQ=255)
gATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGa < 1:927573/93‑1 (MQ=255)
aTTATGGCGCGCAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAt < 2:149726/93‑1 (MQ=255)
aTTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAt < 1:3300330/93‑1 (MQ=255)
tATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAttt < 2:205570/93‑1 (MQ=255)
tATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAttt > 2:3188577/1‑93 (MQ=255)
aTGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTg > 1:542587/1‑93 (MQ=255)
aTGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTg < 1:2444370/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGc < 1:1530166/93‑1 (MQ=255)
ggCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCt < 1:367175/93‑1 (MQ=255)
cgcACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTgg > 2:2703973/1‑93 (MQ=255)
gcACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGc > 2:3286459/1‑93 (MQ=255)
cacaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCa > 2:3624484/1‑93 (MQ=255)
cacaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCa < 1:806381/93‑1 (MQ=255)
caGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGt > 2:276227/1‑93 (MQ=255)
|
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGT > NC_000913/1941624‑1941802
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC > NC_000913/1941624‑1941805
|
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCC < SRR4302544.1253487/94‑1 (MQ=60)
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCC > SRR4302544.3451842/1‑94 (MQ=60)
TACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTG < SRR4302544.410192/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCC > SRR4302544.3333407/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGCCCCGTTGTTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGC > SRR4302544.2596045/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGC < SRR4302544.1071627/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCT > SRR4302544.46875/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTG < SRR4302544.1769281/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGG < SRR4302544.2729425/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGG < SRR4302544.233976/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCT < SRR4302544.3000532/94‑1 (MQ=60)
GCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGG < SRR4302544.2113613/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTG < SRR4302544.2340266/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGACCTGTCGCTGGGCCTGGTG < SRR4302544.987766/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGG < SRR4302544.2789917/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGAAACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGAGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCG > SRR4302544.680270/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTG > SRR4302544.3942995/1‑94 (MQ=60)
CTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGG > SRR4302544.2599031/1‑94 (MQ=60)
CTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGA < SRR4302544.909511/94‑1 (MQ=60)
TGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAG > SRR4302544.1036705/1‑94 (MQ=60)
GGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGT < SRR4302544.1471665/94‑1 (MQ=60)
GTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTC > SRR4302544.3941762/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTC > SRR4302544.3941763/1‑94 (MQ=60)
TATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGAGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCT > SRR4302544.741636/1‑94 (MQ=60)
CTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGT < SRR4302544.4533779/94‑1 (MQ=60)
TGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTC < SRR4302544.685566/94‑1 (MQ=60)
GGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCT < SRR4302544.421843/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAAT > SRR4302544.1461051/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGGTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAAT > SRR4302544.1518935/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAT < SRR4302544.833300/94‑1 (MQ=60)
CGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTC > SRR4302544.2259737/1‑94 (MQ=60)
CGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTC < SRR4302544.877052/94‑1 (MQ=60)
CGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGGGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTC > SRR4302544.2259736/1‑94 (MQ=60)
GTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCG < SRR4302544.3070049/94‑1 (MQ=60)
GTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCG > SRR4302544.279089/1‑94 (MQ=60)
TCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGT < SRR4302544.3849258/94‑1 (MQ=60)
TCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGT > SRR4302544.283475/1‑94 (MQ=60)
TCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGT > SRR4302544.2970134/1‑94 (MQ=60)
CCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTG < SRR4302544.3001056/94‑1 (MQ=60)
CACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGT < SRR4302544.2488046/94‑1 (MQ=60)
CACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGT > SRR4302544.4665089/1‑94 (MQ=60)
CACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGT > SRR4302544.364121/1‑94 (MQ=60)
ACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGTGTCTGATGTCTAATATTCGTGTT > SRR4302544.778208/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCGGTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGAT < SRR4302544.3619963/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGAT < SRR4302544.3619962/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGAT < SRR4302544.3266150/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATT < SRR4302544.1730994/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATT < SRR4302544.156872/94‑1 (MQ=60)
TGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTT > SRR4302544.1867379/1‑94 (MQ=60)
TGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTT < SRR4302544.2510798/94‑1 (MQ=60)
TGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTT < SRR4302544.1525150/94‑1 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT < SRR4302544.4037944/94‑1 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT > SRR4302544.2982012/1‑94 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT < SRR4302544.2690417/94‑1 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGACCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT < SRR4302544.2574981/94‑1 (MQ=60)
GATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATG > SRR4302544.4173600/1‑94 (MQ=60)
GATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATACTCGTGTTGATTTGATG > SRR4302544.2363435/1‑94 (MQ=60)
ATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGG < SRR4302544.3817416/94‑1 (MQ=60)
ATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGG < SRR4302544.2612669/94‑1 (MQ=60)
ATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGG > SRR4302544.3423829/1‑94 (MQ=60)
CGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCT < SRR4302544.66730/94‑1 (MQ=60)
CGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCT < SRR4302544.3460210/94‑1 (MQ=60)
CGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCT < SRR4302544.1462226/94‑1 (MQ=60)
ACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTA > SRR4302544.819322/1‑94 (MQ=60)
ACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTA > SRR4302544.798138/1‑94 (MQ=60)
CACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAC > SRR4302544.4212001/1‑94 (MQ=60)
CACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAC > SRR4302544.4726364/1‑94 (MQ=60)
CACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAC < SRR4302544.3237063/94‑1 (MQ=60)
ATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTC < SRR4302544.2243430/94‑1 (MQ=60)
ATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTC > SRR4302544.2553202/1‑94 (MQ=60)
TTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCG < SRR4302544.475368/94‑1 (MQ=60)
TTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCG < SRR4302544.4058465/94‑1 (MQ=60)
TTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCG > SRR4302544.704937/1‑94 (MQ=60)
GGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGA > SRR4302544.2375137/1‑94 (MQ=60)
GATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAT < SRR4302544.936712/94‑1 (MQ=60)
ATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATT < SRR4302544.3331766/94‑1 (MQ=60)
TATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTG > SRR4302544.547926/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGC > SRR4302544.1374302/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGC < SRR4302544.2467673/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGC < SRR4302544.4197658/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCT < SRR4302544.1545362/94‑1 (MQ=60)
GGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTG < SRR4302544.370930/94‑1 (MQ=60)
CGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGGGGTCGTGGGTCTGATGTCTAATATTCGGGTTGATTTTATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGC > SRR4302544.1740201/1‑94 (MQ=60)
CACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAG > SRR4302544.1637839/1‑94 (MQ=60)
CACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAG < SRR4302544.814245/94‑1 (MQ=60)
GCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC < SRR4302544.2002717/94‑1 (MQ=60)
|
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC > NC_000913/1941624‑1941805
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
