Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1357 |
179.3 |
9500450 |
96.1% |
9129932 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,185,017 |
Δ1 bp |
coding (38/339 nt) |
b2107 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,185,014 | 0 | T | . | 96.5%
| 614.8
/ 14.0
| 143 | coding (35/339 nt) | b2107 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/3); new base . (70/67); total (72/71) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 |
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
TATTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGTAGT > NC_000913/2184922‑2185102
|
tatTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCt < 2:4117359/93‑1 (MQ=255)
tatTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCt > 2:3938206/1‑93 (MQ=255)
ttGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCttt < 2:3100490/93‑1 (MQ=255)
gTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCtttgc < 1:3806110/93‑3 (MQ=255)
tATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCtttgct < 2:4234378/93‑4 (MQ=255)
tATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCtttgct > 1:2891126/1‑90 (MQ=255)
aTGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCtttgctg < 2:4008681/93‑5 (MQ=255)
tGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTgg > 1:1241802/1‑93 (MQ=255)
gCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGtt < 1:2089706/93‑1 (MQ=255)
cAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTa < 2:4709976/93‑1 (MQ=255)
aGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTAc > 2:614401/1‑93 (MQ=255)
aGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTAc < 1:2360496/93‑1 (MQ=255)
aGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTAc < 1:282044/93‑1 (MQ=255)
ggAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTAc > 2:1391829/1‑93 (MQ=255)
ggAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTAcc > 1:3698607/1‑93 (MQ=255)
ggAAAGATATGCGACTGATATCACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTAcc > 2:1264631/1‑93 (MQ=255)
aaaGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAg < 1:3222214/93‑1 (MQ=255)
aaaGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAg < 2:2365951/93‑1 (MQ=255)
gATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTgc < 2:946597/93‑1 (MQ=255)
tatGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTgccg > 1:480176/1‑93 (MQ=255)
tatGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTgccg > 1:4030583/1‑93 (MQ=255)
tGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTgccgcc > 1:2429588/1‑93 (MQ=255)
gCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCt < 1:4578712/93‑1 (MQ=255)
gACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTgg > 1:1869589/1‑93 (MQ=255)
gACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTgg > 1:4639364/1‑93 (MQ=255)
aCTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGCGCCGCCTggg > 2:3289637/1‑93 (MQ=255)
tGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGcc > 2:1477058/1‑93 (MQ=255)
aCAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAg < 1:3859629/93‑1 (MQ=255)
aCAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAg < 2:3511432/93‑1 (MQ=255)
aCAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAg > 2:4356291/1‑93 (MQ=255)
aGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGcc > 2:1336970/1‑93 (MQ=255)
gATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGcc > 2:3320733/1‑93 (MQ=255)
gATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCa < 2:3073659/93‑1 (MQ=255)
aTCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGATGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCAc < 1:885039/93‑1 (MQ=255)
tCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCAcc < 2:1970439/93‑1 (MQ=255)
tCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCAcc > 1:350094/1‑93 (MQ=255)
ccccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACcg > 2:2034008/1‑93 (MQ=255)
cccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACcgc < 2:3454371/93‑1 (MQ=255)
cccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACcgc < 2:2570331/93‑1 (MQ=255)
ccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACcgcg > 1:2582650/1‑93 (MQ=255)
cAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCgg < 2:2972884/93‑1 (MQ=255)
cAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCgg > 2:303619/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCggg > 2:2871038/1‑93 (MQ=255)
aaGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGt > 1:531738/1‑93 (MQ=255)
aaGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGt < 1:605098/93‑1 (MQ=255)
aGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGtt < 1:2921049/93‑1 (MQ=255)
aGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGtt < 2:1997808/93‑1 (MQ=255)
tGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCGGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTGCg > 2:2587872/1‑93 (MQ=255)
tGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCg < 2:4033961/93‑1 (MQ=255)
ggAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGa > 2:686926/1‑93 (MQ=255)
ggAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGa > 1:3377286/1‑93 (MQ=255)
agagTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGAcc > 1:1821439/1‑93 (MQ=255)
gTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAAt < 1:3283318/93‑1 (MQ=255)
gTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAAt > 1:4506083/1‑93 (MQ=255)
tttATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATa < 2:4746365/93‑1 (MQ=255)
ttATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATAc < 2:1565049/93‑1 (MQ=255)
aTGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCt < 1:977928/93‑1 (MQ=255)
aTGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCt > 2:633173/1‑93 (MQ=255)
aTGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCt < 1:4372423/93‑1 (MQ=255)
tGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTc > 2:4610193/1‑93 (MQ=255)
tGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTc > 2:4610194/1‑93 (MQ=255)
cATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGa > 2:188545/1‑93 (MQ=255)
aTTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGaa > 2:4080772/1‑93 (MQ=255)
aTTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGaa > 2:2904314/1‑93 (MQ=255)
aTTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGaa > 2:2164044/1‑93 (MQ=255)
ttAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAt < 2:2651190/93‑1 (MQ=255)
tAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAtt < 2:3121753/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAttt > 2:1364753/1‑93 (MQ=255)
aaaTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCt > 2:1095394/1‑93 (MQ=255)
aaaTAAGAGGTTGCTGGGTGCG‑ATTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCt < 1:3641027/93‑1 (MQ=255)
aaTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTa > 1:3908059/1‑93 (MQ=255)
aaTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTa > 1:3992151/1‑93 (MQ=255)
aaTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGACGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTa > 1:4279011/1‑93 (MQ=255)
aTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTaa > 2:2181710/1‑93 (MQ=255)
tAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAg > 1:2730398/1‑93 (MQ=255)
tAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAg > 1:789226/1‑93 (MQ=255)
aGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTa < 1:3724251/93‑1 (MQ=255)
aGATGTTGCTGGCTGCGC‑TTTGCTGGTTGCCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTa < 1:209344/93‑1 (MQ=255)
gATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTAt < 2:1239431/93‑1 (MQ=255)
gATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTAt < 1:1765260/93‑1 (MQ=255)
gATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTAt < 1:1982870/93‑1 (MQ=255)
aTGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATg < 1:3834510/93‑1 (MQ=255)
tGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGa > 2:1714308/1‑93 (MQ=255)
tGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACACATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGa > 2:1307848/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGa < 1:1765296/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGt < 2:2494624/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGtt < 1:874853/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGtt < 2:728647/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTaa < 2:277452/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTaa < 1:4096624/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGCGC‑TGTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCGCCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTaa < 2:233024/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAag > 2:2136043/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAag < 2:1073101/93‑1 (MQ=255)
gggTGCGC‑TTTGCTGTTTACCAGTGCCGCCTGGTCCGAGCCAGCATCCGCGGGTTCGTCCACTACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAagc < 2:4715516/93‑2 (MQ=255)
gggTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAagc < 2:4230574/93‑2 (MQ=255)
gggTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAagc > 1:465260/1‑92 (MQ=255)
ggTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAagca < 2:3190003/93‑3 (MQ=255)
ggTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAagca < 1:1367631/93‑3 (MQ=255)
gTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAagcag < 1:80280/93‑1 (MQ=255)
tGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAagcagt > 2:129933/1‑93 (MQ=255)
|
TATTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGTAGT > NC_000913/2184922‑2185102
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGTAGTTTCATTGC > NC_000913/2184924‑2185110
|
TTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTG < SRR4302544.956148/94‑1 (MQ=60)
GTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCT > SRR4302544.2918985/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCT < SRR4302544.3843827/94‑1 (MQ=60)
ATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGG > SRR4302544.1254059/1‑94 (MQ=60)
GCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTTCGC‑TTTGCTGGTTA < SRR4302544.2109818/94‑1 (MQ=60)
GCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTA < SRR4302544.2109819/94‑1 (MQ=60)
AGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACC < SRR4302544.284983/94‑1 (MQ=60)
AGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACC > SRR4302544.3735435/1‑94 (MQ=60)
AGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACC < SRR4302544.2382845/94‑1 (MQ=60)
AAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGT < SRR4302544.3252980/94‑1 (MQ=60)
GATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCC < SRR4302544.393999/94‑1 (MQ=60)
ATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGGGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCG > SRR4302544.4070729/1‑94 (MQ=60)
ATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCG > SRR4302544.4070730/1‑94 (MQ=60)
ATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCG > SRR4302544.484879/1‑94 (MQ=60)
TATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGC > SRR4302544.704950/1‑94 (MQ=60)
TATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGC > SRR4302544.2669841/1‑94 (MQ=60)
ATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCC > SRR4302544.2452713/1‑94 (MQ=60)
GCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTG < SRR4302544.4624319/94‑1 (MQ=60)
CGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGG < SRR4302544.4577742/94‑1 (MQ=60)
CGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGG > SRR4302544.1887657/1‑94 (MQ=60)
CGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGG > SRR4302544.4685321/1‑94 (MQ=60)
ACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGC < SRR4302544.3897947/94‑1 (MQ=60)
ATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACC > SRR4302544.4740560/1‑94 (MQ=60)
ATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACC > SRR4302544.1729300/1‑94 (MQ=60)
ATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACC > SRR4302544.353684/1‑94 (MQ=60)
ATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGATGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACC < SRR4302544.893806/94‑1 (MQ=60)
CCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGC > SRR4302544.586596/1‑94 (MQ=60)
CCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCG > SRR4302544.2607472/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGT > SRR4302544.537012/1‑94 (MQ=60)
AAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTT > SRR4302544.3295824/1‑94 (MQ=60)
AAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTT < SRR4302544.611037/94‑1 (MQ=60)
AGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTC < SRR4302544.2949135/94‑1 (MQ=60)
TGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGA > SRR4302544.3409523/1‑94 (MQ=60)
GAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACC > SRR4302544.1839198/1‑94 (MQ=60)
AGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAAT > SRR4302544.4551269/1‑94 (MQ=60)
AGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAAT < SRR4302544.2575727/94‑1 (MQ=60)
GTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATA < SRR4302544.3314604/94‑1 (MQ=60)
ATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTC < SRR4302544.987510/94‑1 (MQ=60)
ATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTC < SRR4302544.4416750/94‑1 (MQ=60)
GACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGG < SRR4302544.843545/94‑1 (MQ=60)
tcaATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGG < SRR4302544.2261970/91‑1 (MQ=60)
CATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAA > SRR4302544.4630493/1‑94 (MQ=60)
CATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAA > SRR4302544.2985387/1‑94 (MQ=60)
ATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAT > SRR4302544.3734966/1‑94 (MQ=60)
TAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTT > SRR4302544.3863368/1‑94 (MQ=60)
AAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTA > SRR4302544.3946888/1‑94 (MQ=60)
AAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTA > SRR4302544.4031891/1‑94 (MQ=60)
AAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGACGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTA > SRR4302544.4322710/1‑94 (MQ=60)
AAATAAGAGGTTGCTGGGTGCG‑ATTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTA < SRR4302544.3677351/94‑1 (MQ=60)
ATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAG > SRR4302544.2756711/1‑94 (MQ=60)
ATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAG > SRR4302544.3446835/1‑94 (MQ=60)
ATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAG > SRR4302544.796856/1‑94 (MQ=60)
TAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGT > SRR4302544.4367995/1‑94 (MQ=60)
AGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTAT < SRR4302544.3761290/94‑1 (MQ=60)
AGATGTTGCTGGCTGCGC‑TTTGCTGGTTGCCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTAT < SRR4302544.211500/94‑1 (MQ=60)
GATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATG < SRR4302544.2002128/94‑1 (MQ=60)
GATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATG < SRR4302544.2002127/94‑1 (MQ=60)
GATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATG < SRR4302544.1782532/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGA < SRR4302544.3872531/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAG < SRR4302544.4106421/94‑1 (MQ=60)
GTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAG < SRR4302544.1782568/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTA < SRR4302544.883530/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTA < SRR4302544.2849009/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAG < SRR4302544.4137394/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGC < SRR4302544.377167/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGC > SRR4302544.469826/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAG < SRR4302544.1381229/94‑1 (MQ=60)
GTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGT < SRR4302544.81054/94‑1 (MQ=60)
CGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTC < SRR4302544.1679019/94‑1 (MQ=60)
gcTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCA > SRR4302544.1725383/3‑94 (MQ=60)
CTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCAT > SRR4302544.2556297/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCAT > SRR4302544.1918555/1‑94 (MQ=60)
TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCCCCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGCAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCATT < SRR4302544.999112/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCATT > SRR4302544.2106288/1‑94 (MQ=60)
TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCATT < SRR4302544.999113/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCATTG < SRR4302544.653192/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCATTG < SRR4302544.697760/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCATTG < SRR4302544.2926548/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCATTGC < SRR4302544.2890145/94‑1 (MQ=60)
|
TTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGTAGTTTCATTGC > NC_000913/2184924‑2185110
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
