Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1357 |
179.3 |
9500450 |
96.1% |
9129932 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,281,515 |
A→G |
R151R (CGT→CGC) |
yejK ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,281,515 | 0 | A | G | 99.4%
| 516.3
/ ‑4.7
| 160 | R151R (CGT→CGC) | yejK | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (62/96); total (64/96) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.96e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.22e-01 |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATACGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCT > NC_000913/2281425‑2281604
|
gAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGcg > 2:4639862/1‑93 (MQ=255)
aaaTCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATgcgc < 2:3362714/93‑1 (MQ=255)
aaTCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGcgcg > 2:95615/1‑93 (MQ=255)
aTCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATgcgcgc < 1:815375/93‑1 (MQ=255)
aTCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATgcgcgc < 1:815376/93‑1 (MQ=255)
gCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGcaaca > 1:392729/1‑93 (MQ=255)
ccACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCAGTTAAATCGATGCGCGcaacaa > 2:4465840/1‑93 (MQ=255)
aCTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAata < 2:1754938/93‑1 (MQ=255)
aCTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAata > 1:3865805/1‑93 (MQ=255)
aCTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAata < 1:3442879/93‑1 (MQ=255)
cTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAatat > 2:4562130/1‑93 (MQ=255)
tttGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATc < 2:186128/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATcc < 2:678900/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATcc < 1:212047/93‑1 (MQ=255)
cgcCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCa < 1:1062815/93‑1 (MQ=255)
gcCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAt < 2:3038242/93‑1 (MQ=255)
cccTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtg > 2:1816901/1‑93 (MQ=255)
cccTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtg > 2:3068372/1‑93 (MQ=255)
cccTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtg > 1:2361974/1‑93 (MQ=255)
ccTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtga > 2:2101904/1‑93 (MQ=255)
ccTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtga < 2:2618945/93‑1 (MQ=255)
ccTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtga < 1:175874/93‑1 (MQ=255)
cTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgat > 1:66307/1‑93 (MQ=255)
cTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgat > 1:4650691/1‑93 (MQ=255)
cTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgat > 1:3569009/1‑93 (MQ=255)
tACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgatt > 2:693633/1‑93 (MQ=255)
tACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgatt > 1:1637301/1‑93 (MQ=255)
tACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgatt > 1:2798881/1‑93 (MQ=255)
aCTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgattg < 2:2388812/93‑1 (MQ=255)
cTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgattga < 1:2565854/93‑1 (MQ=255)
cTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgattga > 2:3730508/1‑93 (MQ=255)
tCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgattgat > 2:2924337/1‑93 (MQ=255)
cccTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATc > 2:376174/1‑93 (MQ=255)
cccTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATc < 1:3153203/93‑1 (MQ=255)
cccTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGACTGATATc > 1:4340664/1‑93 (MQ=255)
cTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCaa > 2:2606292/1‑93 (MQ=255)
cTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCaa < 1:2032695/93‑1 (MQ=255)
cTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCaa < 1:1867812/93‑1 (MQ=255)
cTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCaa < 1:277771/93‑1 (MQ=255)
tttCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAg < 2:422846/93‑1 (MQ=255)
tttCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAg > 1:4372005/1‑93 (MQ=255)
tCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGAt > 1:4731316/1‑93 (MQ=255)
cggAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATaa < 2:412994/92‑1 (MQ=255)
aGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATaa < 2:412993/93‑1 (MQ=255)
aGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATaa < 1:2656303/93‑1 (MQ=255)
ggAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAt < 2:229728/93‑1 (MQ=255)
ggAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAt > 1:329362/1‑93 (MQ=255)
ggAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAt < 2:3600413/93‑1 (MQ=255)
gAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtg < 2:1239538/93‑1 (MQ=255)
gAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtg < 1:60564/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgg < 1:1147183/93‑1 (MQ=255)
aaGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtggg < 1:3971559/93‑1 (MQ=255)
aGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggt > 2:2315391/1‑93 (MQ=255)
aGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggt < 2:2210625/93‑1 (MQ=255)
gTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggtt < 1:910776/93‑1 (MQ=255)
gTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggtt > 1:3061923/1‑93 (MQ=255)
tGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggttg < 2:221807/93‑1 (MQ=255)
gagaTAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggttgg < 1:3622020/93‑1 (MQ=255)
gagaTAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggttgg < 1:1937672/93‑1 (MQ=255)
agaTAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggttggg < 1:1663619/93‑1 (MQ=255)
gaTAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggttgggt < 2:993364/93‑1 (MQ=255)
tAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGggttgggttg > 2:2329766/1‑93 (MQ=255)
tAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCAATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGggttgggttg < 2:2706320/93‑1 (MQ=255)
gCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGAt < 1:2400587/93‑1 (MQ=255)
gCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGAt < 1:2478307/93‑1 (MQ=255)
acGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGAt < 2:2945191/92‑1 (MQ=255)
acGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGGTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGAt < 1:379245/92‑1 (MQ=255)
ggTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTc < 2:680085/93‑1 (MQ=255)
ggTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTc < 2:3479749/93‑1 (MQ=255)
tGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCga < 2:1113091/93‑1 (MQ=255)
ctctGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGAtt < 2:2529434/93‑1 (MQ=255)
ctctGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGAtt < 1:2836961/93‑1 (MQ=255)
ttgATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTc < 2:3842558/91‑1 (MQ=255)
tGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTc < 1:2445480/93‑1 (MQ=255)
tGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTc < 2:3461629/93‑1 (MQ=255)
tGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATACGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTc > 2:2140896/1‑93 (MQ=255)
gATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGt < 2:1111778/93‑1 (MQ=255)
ttgTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTaa < 1:3787256/91‑1 (MQ=255)
tttCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAAcgc < 2:2439065/93‑1 (MQ=255)
ttCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAAcgcg < 1:3687350/93‑1 (MQ=255)
tCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACgcgc > 1:2251860/1‑93 (MQ=255)
cccATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCa < 1:4511311/93‑1 (MQ=255)
cccATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCa < 1:546800/93‑1 (MQ=255)
aTTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATAc > 2:819341/1‑93 (MQ=255)
aTTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATAc > 2:819340/1‑93 (MQ=255)
ttCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACt > 1:466258/1‑93 (MQ=255)
ttCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACt < 1:2541641/93‑1 (MQ=255)
gTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGCTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTc > 2:2063494/1‑93 (MQ=255)
gtAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCa < 1:1561074/92‑1 (MQ=255)
aaaTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAgg > 2:3426946/1‑93 (MQ=255)
aaaTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAgg < 1:3384645/93‑1 (MQ=255)
aaTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGt < 1:1884221/93‑1 (MQ=255)
aaTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGt < 2:2350628/93‑1 (MQ=255)
aaTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGt < 1:554167/93‑1 (MQ=255)
aTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGtt > 1:1327800/1‑93 (MQ=255)
aTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGtt > 2:2789352/1‑93 (MQ=255)
tCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTg > 1:1494078/1‑93 (MQ=255)
cGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGc < 1:3028428/93‑1 (MQ=255)
gATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCt > 1:4567579/1‑93 (MQ=255)
gATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCt > 1:4489570/1‑93 (MQ=255)
|
GAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATACGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCT > NC_000913/2281425‑2281604
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATACGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCTCA > NC_000913/2281424‑2281606
|
AGAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCG < SRR4302544.1072156/94‑1 (MQ=60)
GAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTCTCAGGAAATTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGC < SRR4302544.2480628/94‑1 (MQ=60)
AAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCG > SRR4302544.1209118/1‑94 (MQ=60)
ATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCA < SRR4302544.823337/94‑1 (MQ=60)
ATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCA > SRR4302544.4392015/1‑94 (MQ=60)
ATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCA < SRR4302544.823336/94‑1 (MQ=60)
CGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACA > SRR4302544.396710/1‑94 (MQ=60)
CACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATA > SRR4302544.3904190/1‑94 (MQ=60)
ACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAATTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATAT < SRR4302544.4640489/94‑1 (MQ=60)
ACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATAT < SRR4302544.3475783/94‑1 (MQ=60)
ACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATAT < SRR4302544.592192/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATC < SRR4302544.2984974/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCC < SRR4302544.1807448/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCG < SRR4302544.214231/94‑1 (MQ=60)
CGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAT < SRR4302544.1073384/94‑1 (MQ=60)
GCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATG > SRR4302544.1007780/1‑94 (MQ=60)
GCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATG > SRR4302544.2384339/1‑94 (MQ=60)
GCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATG < SRR4302544.4523602/94‑1 (MQ=60)
GCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATG < SRR4302544.643035/94‑1 (MQ=60)
CCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGAT < SRR4302544.177611/94‑1 (MQ=60)
CCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGAT > SRR4302544.4696724/1‑94 (MQ=60)
CCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGAT > SRR4302544.3603231/1‑94 (MQ=60)
CCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGAT > SRR4302544.66969/1‑94 (MQ=60)
CTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGGTTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATT > SRR4302544.1653425/1‑94 (MQ=60)
CTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATT > SRR4302544.1653424/1‑94 (MQ=60)
CTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATT > SRR4302544.2825848/1‑94 (MQ=60)
CTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGAT < SRR4302544.2590503/94‑1 (MQ=60)
TCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATA < SRR4302544.680937/94‑1 (MQ=60)
CGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATAT < SRR4302544.3608808/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATC > SRR4302544.2028983/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGACTGATATC > SRR4302544.4384830/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCA < SRR4302544.3183197/94‑1 (MQ=60)
CTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAG > SRR4302544.4416330/1‑94 (MQ=60)
CTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAG < SRR4302544.2052357/94‑1 (MQ=60)
CTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAG < SRR4302544.1885867/94‑1 (MQ=60)
CTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAG < SRR4302544.280672/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGAT > SRR4302544.4777988/1‑94 (MQ=60)
AGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAT < SRR4302544.2681773/94‑1 (MQ=60)
AGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAT > SRR4302544.332789/1‑94 (MQ=60)
AGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAT < SRR4302544.2402030/94‑1 (MQ=60)
GAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGG < SRR4302544.61181/94‑1 (MQ=60)
GAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGG < SRR4302544.1898883/94‑1 (MQ=60)
GAAAGTGAGATAGCGGGTAGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGG < SRR4302544.2382733/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGG < SRR4302544.1158591/94‑1 (MQ=60)
AAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGT < SRR4302544.4723195/94‑1 (MQ=60)
AAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGT < SRR4302544.4011065/94‑1 (MQ=60)
AGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTT > SRR4302544.260180/1‑94 (MQ=60)
AGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTT > SRR4302544.3091136/1‑94 (MQ=60)
GTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTG < SRR4302544.3927572/94‑1 (MQ=60)
GTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTG > SRR4302544.1468022/1‑94 (MQ=60)
GTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTG < SRR4302544.919781/94‑1 (MQ=60)
GAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGG < SRR4302544.1956428/94‑1 (MQ=60)
GAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGG < SRR4302544.3658112/94‑1 (MQ=60)
AGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGT < SRR4302544.1680001/94‑1 (MQ=60)
AGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGT < SRR4302544.2112959/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATG < SRR4302544.2423365/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATG < SRR4302544.383105/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATG < SRR4302544.2502016/94‑1 (MQ=60)
ACGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGGTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATG < SRR4302544.383106/94‑1 (MQ=60)
GGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCAGTTAAATCGATGCGTGTAACCATATCCGCCTGGTTGATATCAAGCTTATGGGTTTGGTTGATGTCG > SRR4302544.3293752/1‑94 (MQ=42)
TGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAG < SRR4302544.341240/94‑1 (MQ=60)
CTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTT < SRR4302544.2864363/94‑1 (MQ=60)
TGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCG < SRR4302544.2468792/94‑1 (MQ=60)
TGGATTGGTTGCTCATTCGGTTAAATCGATGCGCGTAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGTTTGATGTCGAGATTTTCG < SRR4302544.2833250/94‑1 (MQ=60)
GATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTT > SRR4302544.2554415/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTA < SRR4302544.478873/94‑1 (MQ=60)
TTGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAAC < SRR4302544.3824758/94‑1 (MQ=60)
TTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGC < SRR4302544.3724105/94‑1 (MQ=60)
TTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGC > SRR4302544.2273024/1‑94 (MQ=60)
TCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCA > SRR4302544.4004987/1‑94 (MQ=60)
cccatgtgcTTAAATCGATGCACGCACCAATACCCGCATGATTGATACCAAGCTAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTACCGCGCAT < SRR4302544.887283/85‑1 (MQ=60)
TCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCAT < SRR4302544.852293/94‑1 (MQ=60)
CCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCAT < SRR4302544.552169/94‑1 (MQ=60)
CCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCAT < SRR4302544.4556524/94‑1 (MQ=60)
CATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATAC > SRR4302544.3090771/1‑94 (MQ=60)
ATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACT < SRR4302544.4596384/94‑1 (MQ=60)
ATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACT > SRR4302544.470829/1‑94 (MQ=60)
TTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTG < SRR4302544.2566040/94‑1 (MQ=60)
TCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGCTATCACGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGC > SRR4302544.3278369/1‑94 (MQ=60)
TTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAG < SRR4302544.3486958/94‑1 (MQ=60)
GTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAG < SRR4302544.1576578/94‑1 (MQ=60)
AAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGT < SRR4302544.3416985/94‑1 (MQ=60)
AATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTT < SRR4302544.1649656/94‑1 (MQ=60)
AATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTT < SRR4302544.559587/94‑1 (MQ=60)
AATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTT < SRR4302544.1902437/94‑1 (MQ=60)
AATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTT > SRR4302544.1340859/1‑94 (MQ=60)
ATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTG > SRR4302544.2733761/1‑94 (MQ=60)
ATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTG > SRR4302544.1508854/1‑94 (MQ=60)
ATCGACGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTG > SRR4302544.4390667/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCT < SRR4302544.3057443/94‑1 (MQ=60)
CGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCT > SRR4302544.4613115/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCT < SRR4302544.3793777/94‑1 (MQ=60)
CGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCT > SRR4302544.4534648/1‑94 (MQ=60)
GATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCTC > SRR4302544.1805903/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCTCA < SRR4302544.1452929/94‑1 (MQ=60)
|
AGAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATACGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCTCA > NC_000913/2281424‑2281606
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
