Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1357 |
179.3 |
9500450 |
96.1% |
9129932 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,544,971 |
T→C |
G259G (GGT→GGC) |
gntT → |
gluconate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,544,971 | 0 | T | C | 96.7%
| 536.4
/ 4.4
| 180 | G259G (GGT→GGC) | gntT | gluconate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/3); new base C (87/86); total (91/89) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.47e-01 |
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
GGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGA > NC_000913/3544881‑3545060
|
ggTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGa < 1:4653893/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTAGTCGGGATGGCGATGCTTGCGCTGGCCGAATGGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGAccc < 2:2967624/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGAccc < 1:645430/93‑1 (MQ=255)
ccGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCg > 1:185759/1‑93 (MQ=255)
ggTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGt > 1:4732030/1‑93 (MQ=255)
gtaCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATg > 2:3519186/1‑93 (MQ=255)
taCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATgg > 2:4410958/1‑93 (MQ=255)
aCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGc < 1:2245399/93‑1 (MQ=255)
aCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGc > 2:3602685/1‑93 (MQ=255)
cTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCa > 2:797722/1‑93 (MQ=255)
tGATGGCGATGCGTGCGATTGCCTAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCaa < 2:3392558/93‑1 (MQ=255)
tGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCaa > 1:3144163/1‑93 (MQ=255)
gATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAAc > 2:1739597/1‑93 (MQ=255)
tGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGc > 2:2879575/1‑93 (MQ=255)
gggCGAGGCGTGCGATTGCCAAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGc < 1:1061095/92‑1 (MQ=255)
ggCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCt > 2:338682/1‑93 (MQ=255)
gCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTg > 1:1621789/1‑93 (MQ=255)
ggATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGa < 1:1660743/92‑1 (MQ=255)
gATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGAt > 2:4017499/1‑93 (MQ=255)
gATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAt > 2:3369768/1‑93 (MQ=255)
gATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTCAt > 2:341254/1‑93 (MQ=255)
aTGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAtt > 2:1099643/1‑93 (MQ=255)
aTGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAtt < 1:2592629/93‑1 (MQ=255)
tgcgtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTg > 2:1414205/1‑93 (MQ=255)
gcgtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGc > 2:412713/1‑93 (MQ=255)
cgtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGcc > 2:1973394/1‑93 (MQ=255)
gtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGACACGCTGATTGCCg > 2:2122174/1‑93 (MQ=255)
tgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGt > 1:412200/1‑93 (MQ=255)
gcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTg > 2:323687/1‑93 (MQ=255)
gcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTg > 2:3876570/1‑93 (MQ=255)
aTTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTg > 1:3662541/1‑93 (MQ=255)
ttGCCGAAATGATCCTGCCGACAGGTCACGCTTTACTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGCAATGGGAACGCTGATTGGCGTGCTGa > 2:2679508/1‑93 (MQ=255)
tGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGAt < 1:2683551/93‑1 (MQ=255)
gCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGAtt > 2:3297164/1‑93 (MQ=255)
cGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGc < 2:1841873/93‑1 (MQ=255)
gAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCg > 2:1589695/1‑93 (MQ=255)
gAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCg > 2:1047933/1‑93 (MQ=255)
aaaTGATGCTGCCGAAAGGTCACGTTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGa < 1:352390/93‑1 (MQ=255)
aaaTGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGa < 2:164851/93‑1 (MQ=255)
aaaTGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGa < 2:479964/93‑1 (MQ=255)
aaaTGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGa < 2:2435697/93‑1 (MQ=255)
aaaTGACCCTGCCGAAAGGTAACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGa < 1:352389/93‑1 (MQ=255)
aaTGATCTTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAt < 1:4454914/93‑1 (MQ=255)
aTGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATg > 1:2077753/1‑93 (MQ=255)
tGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGt > 1:2867312/1‑93 (MQ=255)
tGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGAGATGt > 2:181925/1‑93 (MQ=255)
gacccTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGtt < 1:3753968/90‑1 (MQ=255)
gATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGtt > 2:2937965/1‑93 (MQ=255)
gATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGtt > 1:4473231/1‑93 (MQ=255)
gATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGtt > 2:3603803/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTc < 1:4522945/93‑1 (MQ=255)
aTCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTc > 2:83001/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTc > 1:110262/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTc > 1:1280202/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCAcc > 2:4510774/1‑93 (MQ=255)
gCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTTACCtt > 2:59182/1‑93 (MQ=255)
ccGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCttt < 2:2199367/93‑1 (MQ=255)
aaaGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGt > 2:2621723/1‑93 (MQ=255)
aaGGTCGCTCATACCTGCCGGTAGCGGAGTAACTAGGCGACCCGGTAGTAGATACGCTGATTGCCGTGCTAATTGAGATATTCACCTTTGGTc < 2:4202401/93‑1 (MQ=255)
aGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCt > 1:4717223/1‑93 (MQ=255)
ggTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTa < 2:2717788/93‑1 (MQ=255)
tCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTaaa > 2:537505/1‑93 (MQ=255)
cACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTTATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTaagc < 2:4655515/93‑3 (MQ=255)
cACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAAc > 2:3844506/1‑93 (MQ=255)
cACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAAc < 1:4155843/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAAcc > 2:2167941/1‑93 (MQ=255)
aCGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAAcc > 2:3689630/1‑93 (MQ=255)
aCGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAAcc > 1:299506/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCg < 1:2787188/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGt > 2:2521402/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGt < 2:3785824/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGt < 1:687110/93‑1 (MQ=255)
cTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTg < 2:1073044/93‑1 (MQ=255)
tttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTgg < 1:4022565/93‑1 (MQ=255)
tttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTgg > 2:3079041/1‑93 (MQ=255)
tttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTgg < 2:115868/93‑1 (MQ=255)
tCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTc < 2:810492/93‑1 (MQ=255)
tCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGAAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTc > 2:1469069/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACcgtcgtcgt > 2:2665175/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGtt > 1:2289419/1‑93 (MQ=255)
cGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCaa < 2:2532729/93‑1 (MQ=255)
ggTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGGTCAAt > 2:1727236/1‑93 (MQ=255)
gTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATg > 1:3605793/1‑93 (MQ=255)
gTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATg < 2:3558492/93‑1 (MQ=255)
gTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATg > 2:3591027/1‑93 (MQ=255)
gTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATg > 1:773841/1‑93 (MQ=255)
gTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATg < 2:4521390/93‑1 (MQ=255)
gTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATg < 1:2367737/93‑1 (MQ=255)
gAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAg < 1:1420751/93‑1 (MQ=255)
gAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGGGCTGATTGCGATGGTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGGTCAg > 1:1312421/1‑93 (MQ=255)
gAGTGCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAg < 2:257042/93‑1 (MQ=255)
ggtgccTCGTCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGa < 2:1553511/89‑1 (MQ=255)
gTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAt < 1:2179422/93‑1 (MQ=255)
gTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAt < 1:433384/93‑1 (MQ=255)
gTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAt > 2:1009649/1‑93 (MQ=255)
tCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTa < 2:4701861/93‑1 (MQ=255)
tcTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTaa < 1:4103331/92‑1 (MQ=255)
ccTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTaa < 1:2044873/93‑1 (MQ=255)
tCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACg > 2:2465444/1‑93 (MQ=255)
cGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGa > 1:873556/1‑93 (MQ=255)
|
GGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGA > NC_000913/3544881‑3545060
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG > NC_000913/3544878‑3545064
|
TCTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTACCGGTAGCGGAGTTCCTCGGC > SRR4302544.1791753/1‑94 (MQ=60)
GGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGAC < SRR4302544.4699946/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCC > SRR4302544.610352/1‑94 (MQ=60)
GCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCG < SRR4302544.651806/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCG > SRR4302544.187605/1‑94 (MQ=60)
CGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGT > SRR4302544.4778705/1‑94 (MQ=60)
tagttctgatgggcgtgccgtcgtatctCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTTCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAAT < SRR4302544.1655096/66‑1 (MQ=60)
TAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAAT < SRR4302544.1655222/94‑1 (MQ=60)
AGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCTAAATGGTCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCGGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATG < SRR4302544.3771521/94‑1 (MQ=60)
GTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGAGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGG > SRR4302544.1809506/1‑94 (MQ=60)
ACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCA < SRR4302544.2266517/94‑1 (MQ=60)
CTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAA > SRR4302544.3129774/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAA > SRR4302544.3174056/1‑94 (MQ=60)
GGGCGAGGCGTGCGATTGCCAAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCT < SRR4302544.1071635/94‑1 (MQ=60)
ggcgaggcgtgtgatggccgaaacgatcatgccgccaggcatCGCTTTCCTGCCGGTACCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTG < SRR4302544.1723810/52‑1 (MQ=60)
GGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTG > SRR4302544.1637768/1‑94 (MQ=60)
GGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAT < SRR4302544.1677098/94‑1 (MQ=60)
gagggGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATT < SRR4302544.700825/89‑1 (MQ=60)
GATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATT < SRR4302544.302492/94‑1 (MQ=60)
ATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTG < SRR4302544.2617570/94‑1 (MQ=60)
GCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCC < SRR4302544.1478815/94‑1 (MQ=60)
GCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCC < SRR4302544.4159299/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCG < SRR4302544.4739847/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCG > SRR4302544.678054/1‑94 (MQ=60)
GTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGT > SRR4302544.416403/1‑94 (MQ=60)
TGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCCCGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGAAACGCTGATTGCCGTG > SRR4302544.995165/1‑94 (MQ=60)
CGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTAGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCT > SRR4302544.252667/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCCGAAATGA‑CCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGA < SRR4302544.465318/94‑1 (MQ=60)
GATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTG > SRR4302544.3699072/1‑94 (MQ=60)
TGCCGAAATGATCCTGCTGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATT < SRR4302544.452595/94‑1 (MQ=60)
TGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATT < SRR4302544.2709265/94‑1 (MQ=60)
GCCGAAATGATACTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTG < SRR4302544.1230987/94‑1 (MQ=60)
CCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGC > SRR4302544.211520/1‑94 (MQ=60)
CGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCG > SRR4302544.4297959/1‑94 (MQ=60)
CGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCG < SRR4302544.4770215/94‑1 (MQ=60)
AAATGATGCTGCCGAAAGGTCACGTTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAT < SRR4302544.356000/94‑1 (MQ=60)
AAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAT > SRR4302544.1337944/1‑94 (MQ=60)
AAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAT < SRR4302544.831334/94‑1 (MQ=60)
AAATGACCCTGCCGAAAGGTAACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAT < SRR4302544.355999/94‑1 (MQ=60)
AATGATCTTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATG < SRR4302544.4499786/94‑1 (MQ=60)
AATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATG > SRR4302544.2097722/1‑94 (MQ=60)
ATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGT > SRR4302544.2894992/1‑94 (MQ=60)
TGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTT > SRR4302544.4518221/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTC > SRR4302544.111270/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTC > SRR4302544.1292816/1‑94 (MQ=60)
GACCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTC < SRR4302544.3791242/94‑1 (MQ=60)
ATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCA < SRR4302544.4568219/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCT > SRR4302544.3446956/1‑94 (MQ=60)
CCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTG > SRR4302544.4115881/1‑94 (MQ=60)
AAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCT > SRR4302544.2636071/1‑94 (MQ=60)
AAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCT > SRR4302544.4763821/1‑94 (MQ=60)
AGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTA > SRR4302544.1298126/1‑94 (MQ=60)
GTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAA < SRR4302544.2303723/94‑1 (MQ=60)
CACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACC < SRR4302544.4197008/94‑1 (MQ=60)
CACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACC > SRR4302544.302607/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGT < SRR4302544.2814014/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTG < SRR4302544.693948/94‑1 (MQ=60)
GCCTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCGACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTG < SRR4302544.2825623/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGG > SRR4302544.1973492/1‑94 (MQ=60)
CTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGG > SRR4302544.4471400/1‑94 (MQ=60)
TTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGT < SRR4302544.4062619/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTT > SRR4302544.2310998/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTT > SRR4302544.699799/1‑94 (MQ=60)
GCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCA > SRR4302544.3634668/1‑94 (MQ=60)
CGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAAT < SRR4302544.4188723/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATG > SRR4302544.781357/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATG > SRR4302544.3640811/1‑94 (MQ=60)
GTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGG < SRR4302544.2390141/94‑1 (MQ=60)
GGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGGGCTGATTGCGATGGTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGGTCAG > SRR4302544.1325325/1‑94 (MQ=60)
GAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGA < SRR4302544.1434897/94‑1 (MQ=60)
GTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATT < SRR4302544.2200061/94‑1 (MQ=60)
GTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATT < SRR4302544.437760/94‑1 (MQ=60)
GTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATT > SRR4302544.403714/1‑94 (MQ=60)
TTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTA < SRR4302544.2076284/94‑1 (MQ=60)
TTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTA < SRR4302544.2794027/94‑1 (MQ=60)
TCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAAC < SRR4302544.4144145/94‑1 (MQ=60)
CCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAAC < SRR4302544.2064584/94‑1 (MQ=60)
CCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAAC < SRR4302544.3666716/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACG < SRR4302544.2329206/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCGACCCGGAAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGAGTGCGATGTGCACCTGAGGGCTAAACCGTGGTCGTTCAAAGGATCAGAGTAACG > SRR4302544.4242523/1‑94 (MQ=53)
TCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGA > SRR4302544.882222/1‑94 (MQ=60)
GGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACA < SRR4302544.599162/94‑1 (MQ=60)
CGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG > SRR4302544.2054317/1‑94 (MQ=60)
|
TCTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG > NC_000913/3544878‑3545064
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
