Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1357 |
179.3 |
9500450 |
96.1% |
9129932 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,128,011 |
C→T |
A199A (GCC→GCT) |
metL → |
aspartokinase II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,128,011 | 0 | C | T | 99.4%
| 552.0
/ ‑5.7
| 156 | A199A (GCC→GCT) | metL | aspartokinase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (75/80); total (76/80) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTG > NC_000913/4127921‑4128100
|
aGGGCTTTCTTCCCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTgg < 2:3973813/93‑1 (MQ=255)
aGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCTGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTgg > 1:3520763/1‑93 (MQ=255)
gggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGt < 2:3024854/93‑1 (MQ=255)
ggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTg > 1:4516696/1‑93 (MQ=255)
ggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTg < 2:2578972/93‑1 (MQ=255)
ggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTg < 2:2987262/93‑1 (MQ=255)
cTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaa > 1:3456655/1‑93 (MQ=255)
cTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaa < 1:1914044/93‑1 (MQ=255)
ttcttcCCCGTTTCTGCAACAGGTGCTGGTGGAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAc < 1:2355139/93‑1 (MQ=255)
ttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAc > 2:1587670/1‑93 (MQ=255)
cTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACgg < 1:1185566/93‑1 (MQ=255)
ttACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGt < 2:3482981/93‑1 (MQ=255)
ttACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGt > 1:3642726/1‑93 (MQ=255)
tACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGTAACGGtc > 2:2560088/1‑92 (MQ=255)
tACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtg > 1:3562786/1‑93 (MQ=255)
aCCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgc < 1:3757852/93‑1 (MQ=255)
cccGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgct < 2:1797204/93‑1 (MQ=255)
ccGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgctg > 2:4082241/1‑93 (MQ=255)
cGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACCTCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCCGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgctgc < 1:1322822/93‑1 (MQ=255)
cGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgctgc < 2:4354954/93‑1 (MQ=255)
gTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTgctgct > 2:753089/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTgctgct < 1:243166/93‑1 (MQ=255)
gTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTgctgct > 1:2730638/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTgctgct > 1:2107220/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGctgctg > 1:2352179/1‑93 (MQ=255)
tgctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTgg < 1:23650/93‑1 (MQ=255)
tgctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCGGCTgg > 1:875995/1‑93 (MQ=255)
tgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGTATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGc < 2:2170393/93‑1 (MQ=255)
tgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGc > 1:1820818/1‑93 (MQ=255)
tgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGc < 1:1340877/93‑1 (MQ=255)
gcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCg > 2:2075950/1‑93 (MQ=255)
caccAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAGCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCCGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGt < 2:1335278/90‑1 (MQ=255)
aaCAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTa > 1:1119335/1‑93 (MQ=255)
aCAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTaa > 1:2914837/1‑93 (MQ=255)
aCAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTaa < 1:3954767/93‑1 (MQ=255)
aCAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTaa < 2:1135219/93‑1 (MQ=255)
gctgctGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACgg < 2:2735312/93‑1 (MQ=255)
gctgctGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACgg < 1:3808033/93‑1 (MQ=255)
gctgctGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACgg < 2:3536470/93‑1 (MQ=255)
tgctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGtt < 2:1816091/93‑1 (MQ=255)
tgctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGtt > 1:610701/1‑93 (MQ=255)
gctgGTGCAGCATCCGGGCAAACGTCTGGTGATGACCGGATTTATCAGCCGCACCAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTc < 2:2531058/93‑1 (MQ=255)
gctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGCAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTc > 1:132471/1‑93 (MQ=255)
gctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTc < 1:594621/93‑1 (MQ=255)
gctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTc < 2:1565707/93‑1 (MQ=255)
ctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTcc < 2:1872844/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTccta > 1:3077227/1‑91 (MQ=255)
tGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACt < 1:215131/93‑1 (MQ=255)
tGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACt > 1:873480/1‑93 (MQ=255)
gCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTa < 1:3545880/93‑1 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACACCGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc < 2:3502868/93‑1 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc < 2:2652253/93‑1 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc > 2:4208299/1‑93 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc > 2:1326114/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcgc > 1:4662357/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcgc > 1:4411506/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcgc > 1:1238566/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcgc > 1:1563067/1‑93 (MQ=255)
gccAAATGTCGGGTGTTTACCTGAGTTATCAGCAGGAGCAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACAATTCCGCGtca < 2:570075/91‑1 (MQ=255)
gCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGacac < 2:4750186/93‑1 (MQ=255)
cAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGAcaca < 2:4054139/93‑1 (MQ=255)
acttCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAAt < 2:2679408/90‑1 (MQ=255)
aCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAAt < 1:3350319/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCg < 2:3771161/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTGGTGCCCGGATTTATCAGCCGCAACAACTCTGGTGAAACGGTCCTGCTGGGGCGTAACGTTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCgg < 1:431774/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCgg > 2:109573/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCgg < 2:3155823/93‑1 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg < 2:2159067/93‑1 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg < 2:4448507/93‑1 (MQ=255)
tggtggGGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg < 2:2797122/93‑1 (MQ=255)
tggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTgcgc < 1:3038209/93‑1 (MQ=255)
tggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTgcgc > 2:3073064/1‑93 (MQ=255)
tggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTgcgc < 1:2173985/93‑1 (MQ=255)
ggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCt > 1:46364/1‑93 (MQ=255)
tgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTgg > 2:1401748/1‑93 (MQ=255)
tgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTgg < 1:581218/93‑1 (MQ=255)
gACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGc < 2:1944754/93‑1 (MQ=255)
gACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGc < 2:1944755/93‑1 (MQ=255)
cGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCggg < 1:1285573/93‑1 (MQ=255)
ggATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCgggg > 1:480479/1‑92 (MQ=255)
ggATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCgggg > 1:4245369/1‑92 (MQ=255)
ggATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgt > 1:4245368/1‑93 (MQ=255)
gATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtg > 1:3186917/1‑93 (MQ=255)
gATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtg > 2:282790/1‑93 (MQ=255)
tttATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAGCGGGTCTGCGGGGGCCTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGtt < 1:4333289/93‑1 (MQ=255)
tATCAGCAGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtc < 2:2864077/93‑1 (MQ=255)
cAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTcg < 2:32784/93‑1 (MQ=255)
gCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTtgcg > 1:920533/1‑93 (MQ=255)
gCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTcgcg > 2:4581721/1‑93 (MQ=255)
gCAACAACGCTGGTGAAACGGTGTTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGGTTCTCGCGTaa > 1:4348077/1‑93 (MQ=255)
caacaaCGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAc < 2:1364541/93‑1 (MQ=255)
caacaaCGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAc < 2:1432293/93‑1 (MQ=255)
aacaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAcc < 1:2919138/93‑1 (MQ=255)
acaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCa > 1:2580609/1‑93 (MQ=255)
acaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCa > 2:158639/1‑93 (MQ=255)
acaacGCTGGTGAAACGGTACTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAACa > 2:3014403/1‑93 (MQ=255)
aacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATc < 2:1002142/93‑1 (MQ=255)
aacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATc > 1:2282636/1‑93 (MQ=255)
acGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCt > 1:703483/1‑93 (MQ=255)
acGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCt > 2:581605/1‑93 (MQ=255)
|
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTG > NC_000913/4127921‑4128100
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG > NC_000913/4127920‑4128103
|
AAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCTGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGG > SRR4302544.3554388/1‑94 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG > SRR4302544.4561928/1‑94 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG > SRR4302544.3015480/1‑94 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG < SRR4302544.2878479/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAA > SRR4302544.3489648/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAA < SRR4302544.1932540/94‑1 (MQ=60)
CTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAA > SRR4302544.63602/1‑94 (MQ=60)
TTCTTCCCCGTTTCTGCAACAGGTGCTGGTGGAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACG < SRR4302544.2377454/94‑1 (MQ=60)
TTCTTACCCGTTGCTGCAGCAGCTTCTGGTGCAACATCCGGCCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACG < SRR4302544.2377455/94‑1 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGACACGGT > SRR4302544.391583/1‑94 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT < SRR4302544.314227/94‑1 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT > SRR4302544.861589/1‑94 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT > SRR4302544.3679070/1‑94 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT < SRR4302544.1197351/94‑1 (MQ=60)
TTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTG > SRR4302544.3596944/1‑94 (MQ=60)
TCCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT < SRR4302544.3766390/94‑1 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT < SRR4302544.3279665/94‑1 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT < SRR4302544.3795152/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACCTCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCCGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT < SRR4302544.1335837/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT > SRR4302544.2127494/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT > SRR4302544.2135036/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT > SRR4302544.2756956/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTG > SRR4302544.2374465/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTG < SRR4302544.245694/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGCGACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGG > SRR4302544.1561225/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCGGCTGG > SRR4302544.884686/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302544.23881/94‑1 (MQ=60)
GCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGG > SRR4302544.470254/1‑94 (MQ=60)
CTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGC > SRR4302544.1838573/1‑94 (MQ=60)
CTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGC < SRR4302544.1597225/94‑1 (MQ=60)
TGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCG < SRR4302544.1354132/94‑1 (MQ=60)
CAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTA > SRR4302544.1130498/1‑94 (MQ=60)
AACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAA > SRR4302544.2942866/1‑94 (MQ=60)
AACAGCTACTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGACGCAACAAGGCTGGTGTAACGGTGCTGCTGGGGCGTAA > SRR4302544.2426967/1‑94 (MQ=60)
ACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAC < SRR4302544.3994082/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGT < SRR4302544.3845770/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGT < SRR4302544.4024198/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTT > SRR4302544.616697/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGCAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTC > SRR4302544.133687/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTC > SRR4302544.133686/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCC < SRR4302544.600456/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGAGGCGACCGGATTTATCAGCAGCAACAACGCTGGTGAAACAGCGCTGCTGGGGCGAAACGGTTCac > SRR4302544.3747841/1‑92 (MQ=60)
TGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCTA > SRR4302544.3106548/1‑94 (MQ=60)
GTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACT > SRR4302544.882145/1‑94 (MQ=60)
TGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTA < SRR4302544.217342/94‑1 (MQ=60)
GCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAT < SRR4302544.3579830/94‑1 (MQ=60)
CAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATT < SRR4302544.4319731/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC > SRR4302544.4708473/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC > SRR4302544.1250802/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC > SRR4302544.4456048/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC > SRR4302544.1578576/1‑94 (MQ=60)
AAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAA > SRR4302544.2087595/1‑94 (MQ=60)
ACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATC < SRR4302544.3382287/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGG > SRR4302544.224849/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTGGTGCCCGGATTTATCAGCCGCAACAACTCTGGTGAAACGGTCCTGCTGGGGCGTAACGTTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGT < SRR4302544.436145/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTG < SRR4302544.132882/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCG > SRR4302544.3602949/1‑94 (MQ=60)
GGGGGTGACCGGATTTATCAGCCGCATCAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATCCCGCGACACAAATCGGTGCG < SRR4302544.1193045/94‑1 (MQ=60)
TGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCT > SRR4302544.46827/1‑94 (MQ=60)
TGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCT < SRR4302544.2194586/94‑1 (MQ=60)
TGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCT < SRR4302544.3067287/94‑1 (MQ=60)
GGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTG < SRR4302544.2703210/94‑1 (MQ=60)
GTGCCCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGG < SRR4302544.994863/94‑1 (MQ=60)
GTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGG > SRR4302544.1211346/1‑94 (MQ=60)
TGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGC < SRR4302544.587038/94‑1 (MQ=60)
TGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGC < SRR4302544.586914/94‑1 (MQ=60)
CGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGT > SRR4302544.4288649/1‑94 (MQ=60)
CGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGT < SRR4302544.1298234/94‑1 (MQ=60)
CGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGG > SRR4302544.4288650/1‑94 (MQ=60)
CGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGG > SRR4302544.485184/1‑94 (MQ=60)
GGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTG > SRR4302544.3217266/1‑94 (MQ=60)
TTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAGCGGGTCTGCGGGGGCCTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTT < SRR4302544.4377403/94‑1 (MQ=60)
TTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTT < SRR4302544.4377402/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCG > SRR4302544.492538/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTTGCG > SRR4302544.929614/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCG > SRR4302544.929612/1‑94 (MQ=60)
CCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTA > SRR4302544.446678/1‑94 (MQ=60)
CCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTA > SRR4302544.4414617/1‑94 (MQ=60)
CGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGTTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGGTTCTCGCGTAA > SRR4302544.4392270/1‑94 (MQ=60)
CAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGGTGGGTCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACC < SRR4302544.2323262/94‑1 (MQ=60)
AACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCA > SRR4302544.2605408/1‑94 (MQ=60)
AACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCA < SRR4302544.2947206/94‑1 (MQ=60)
CAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATC > SRR4302544.2304143/1‑94 (MQ=60)
AACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCT > SRR4302544.710484/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGGGTTTCTCGCGTAACCATCTG > SRR4302544.3504889/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGG < SRR4302544.3575348/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGA < SRR4302544.4023597/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG > SRR4302544.2379513/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG < SRR4302544.2453544/94‑1 (MQ=60)
|
AAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG > NC_000913/4127920‑4128103
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
