Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,128,011 |
C→T |
A199A (GCC→GCT) |
metL → |
aspartokinase II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,128,011 | 0 | C | T | 100.0%
| 999.1
/ NA
| 266 | A199A (GCC→GCT) | metL | aspartokinase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (125/141); total (125/141) |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTG > NC_000913/4127921‑4128100
|
aGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTgg < 1:1399508/93‑1 (MQ=255)
aGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTgg < 2:5547244/93‑1 (MQ=255)
gggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGt > 1:6702775/1‑93 (MQ=255)
ggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTg > 1:4349083/1‑93 (MQ=255)
ggCTTCCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTg < 2:2801981/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGa > 1:387176/1‑93 (MQ=255)
tttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaaa > 2:1809953/1‑93 (MQ=255)
ttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAc < 2:2217321/93‑1 (MQ=255)
ttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAc < 2:4790583/93‑1 (MQ=255)
tCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACg < 1:3042996/93‑1 (MQ=255)
tttACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACgg < 2:971229/92‑1 (MQ=255)
cTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACgg > 2:5330033/1‑93 (MQ=255)
cTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACgg < 2:2682725/93‑1 (MQ=255)
cTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACgg < 1:582908/93‑1 (MQ=255)
ttACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACggg > 2:2880835/1‑92 (MQ=255)
tACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtg > 2:5742385/1‑93 (MQ=255)
tcccGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgc < 2:1475185/92‑1 (MQ=255)
cccGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAGACGGtgct > 2:2417621/1‑93 (MQ=255)
cccGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgct < 1:2843772/93‑1 (MQ=255)
ccGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgctg < 1:416313/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGctgctg > 2:6073975/1‑93 (MQ=255)
gctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTggg > 2:2140637/1‑93 (MQ=255)
ctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTgggg < 2:925514/93‑1 (MQ=255)
cAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGt < 1:3075569/93‑1 (MQ=255)
cAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGt > 1:3531400/1‑93 (MQ=255)
cAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGt < 1:3856810/93‑1 (MQ=255)
aaCAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTa > 2:826506/1‑93 (MQ=255)
aaCAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTa > 2:2767438/1‑93 (MQ=255)
aaCAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCGGGGGCGTa > 2:6704655/1‑93 (MQ=255)
aCAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTaa < 2:4376728/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAc < 1:6546458/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGCTGGTGCAACAGCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAc < 1:5581148/93‑1 (MQ=255)
aGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAATCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACg < 1:2174246/93‑1 (MQ=255)
aGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGGTTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTAGTGGGGCGTAACg > 1:6700776/1‑93 (MQ=255)
aGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACg > 2:4261231/1‑93 (MQ=255)
ctgctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGTCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGt < 2:4692000/93‑1 (MQ=255)
gTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAc < 2:5592997/93‑1 (MQ=255)
gTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCAGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAc > 1:3799624/1‑93 (MQ=255)
tGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACt < 2:3373290/93‑1 (MQ=255)
aaCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAtt < 2:6052632/93‑1 (MQ=255)
aaCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAtt < 1:2085258/93‑1 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc > 2:58672/1‑93 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc > 2:2467602/1‑93 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc < 1:5916888/93‑1 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc > 2:5284356/1‑93 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc > 1:3282817/1‑93 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc < 2:551192/93‑1 (MQ=255)
cATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTcc > 1:6082791/1‑93 (MQ=255)
cATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTcc > 2:6344948/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTGCCGACTATTCcgc > 1:335422/1‑93 (MQ=255)
gggCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGac > 1:2242881/1‑93 (MQ=255)
gggCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGac > 1:2730257/1‑93 (MQ=255)
aaaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaa > 1:5061892/1‑93 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGGCCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa < 2:2914315/93‑1 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa > 2:4427128/1‑93 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa < 1:1496132/93‑1 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa < 1:1819465/93‑1 (MQ=255)
aCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAAt > 2:3952350/1‑93 (MQ=255)
cGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATc < 2:4959981/93‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATc > 1:1126895/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCg > 1:1212628/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCg > 2:1282023/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCg > 2:3806104/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCg < 1:1552589/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACGCAAATCgg > 1:6414378/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCgg > 2:5618413/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGt < 1:5409313/93‑1 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg > 1:721836/1‑93 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg < 1:371133/93‑1 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg < 1:257469/93‑1 (MQ=255)
ggtggtGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTgc < 2:5087732/93‑1 (MQ=255)
gtggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACAAAAATCGGTgcg > 1:4671400/1‑93 (MQ=255)
tggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTgcgc < 1:2939235/93‑1 (MQ=255)
tggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTgcgc < 1:166724/93‑1 (MQ=255)
gtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTg < 1:2114108/93‑1 (MQ=255)
gACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGc < 2:3548022/93‑1 (MQ=255)
aCCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCg < 2:4604518/93‑1 (MQ=255)
gATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTGCGAGACGCAAATCGGTGCGGTGGCGGgtg > 1:980184/1‑93 (MQ=255)
gATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtg < 1:6008799/93‑1 (MQ=255)
gATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtg > 1:161148/1‑93 (MQ=255)
gATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtg > 2:751130/1‑93 (MQ=255)
aTTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtgt < 1:1845946/93‑1 (MQ=255)
aTTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgggt > 2:1337288/1‑93 (MQ=255)
tttATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtggt > 1:1348052/1‑91 (MQ=255)
tttATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGtt < 1:407403/93‑1 (MQ=255)
tttATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGtt < 1:2422476/93‑1 (MQ=255)
tttATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGtt < 2:2075394/93‑1 (MQ=255)
aTCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtct < 1:4852317/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtctc < 2:3017442/93‑1 (MQ=255)
gCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTaa > 2:1672813/1‑93 (MQ=255)
aacaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAcc > 2:4344130/1‑93 (MQ=255)
aacaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAcc > 1:1045165/1‑93 (MQ=255)
acaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCa < 2:1161088/93‑1 (MQ=255)
acaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGGAACCa > 2:3639234/1‑93 (MQ=255)
aacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATc < 2:1483232/93‑1 (MQ=255)
aacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGCGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATc < 1:5260920/93‑1 (MQ=255)
acGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCt < 1:4815332/93‑1 (MQ=255)
acGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCt > 2:3738349/1‑93 (MQ=255)
acGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCt < 2:325764/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTg < 1:3134210/93‑1 (MQ=255)
|
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTG > NC_000913/4127921‑4128100
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC > NC_000913/4127918‑4128104
|
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCT < SRR4302536.3406904/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCT > SRR4302536.6560397/1‑94 (MQ=60)
GAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTG < SRR4302536.6059917/94‑1 (MQ=60)
GAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTG < SRR4302536.217930/94‑1 (MQ=60)
GAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTG < SRR4302536.3237256/94‑1 (MQ=60)
GAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAAAAACGCTG > SRR4302536.2535936/1‑94 (MQ=60)
AAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGG > SRR4302536.1020726/1‑94 (MQ=60)
AAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGG > SRR4302536.1166440/1‑94 (MQ=60)
AAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGGCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGG > SRR4302536.440311/1‑94 (MQ=60)
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGT > SRR4302536.6776981/1‑94 (MQ=60)
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGT > SRR4302536.2308868/1‑94 (MQ=60)
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGT < SRR4302536.1441148/94‑1 (MQ=60)
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGT > SRR4302536.6901840/1‑94 (MQ=60)
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGT < SRR4302536.5348453/94‑1 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG > SRR4302536.314505/1‑94 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG > SRR4302536.4479227/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGA > SRR4302536.3197979/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGA > SRR4302536.397395/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAA > SRR4302536.1736464/1‑94 (MQ=60)
TTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAC < SRR4302536.6480817/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAC < SRR4302536.6107442/94‑1 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG > SRR4302536.5013881/1‑94 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG < SRR4302536.3132443/94‑1 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG < SRR4302536.2191007/94‑1 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT < SRR4302536.597740/94‑1 (MQ=60)
TTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTG < SRR4302536.395971/94‑1 (MQ=60)
TACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGC > SRR4302536.6091515/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT < SRR4302536.3420825/94‑1 (MQ=60)
CCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTG < SRR4302536.2927884/94‑1 (MQ=60)
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CGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT > SRR4302536.3144279/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCGGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGGGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT < SRR4302536.1886967/94‑1 (MQ=60)
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TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302536.1089441/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302536.4931083/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302536.1875038/94‑1 (MQ=60)
CTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGC < SRR4302536.5535056/94‑1 (MQ=60)
CTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGC > SRR4302536.3618754/1‑94 (MQ=60)
TGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCG < SRR4302536.3936427/94‑1 (MQ=60)
GCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGT > SRR4302536.3636926/1‑94 (MQ=60)
CAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTA > SRR4302536.6801904/1‑94 (MQ=60)
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CAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGGTTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTAGTGGGGCGTAACG > SRR4302536.6899801/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACG > SRR4302536.2230887/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACG < SRR4302536.6741398/94‑1 (MQ=60)
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AGGTGCTGGGGCAACATCCGGGCAAACGGCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAAGAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAATGG > SRR4302536.990778/1‑94 (MQ=60)
AGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAATCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGG < SRR4302536.2239726/94‑1 (MQ=60)
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GCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGT < SRR4302536.3478822/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGT > SRR4302536.5936932/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGTGCAACATCCGGGCAATCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGAGCTGCTGGGGCGTAACGGTT < SRR4302536.6719927/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTT < SRR4302536.2918639/94‑1 (MQ=60)
cccaGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGATACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCC < SRR4302536.1456671/90‑1 (MQ=60)
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GCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCC < SRR4302536.870496/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCC < SRR4302536.3054072/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAC > SRR4302536.6907461/1‑94 (MQ=60)
GGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCAGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAC > SRR4302536.3912931/1‑94 (MQ=60)
TGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTA < SRR4302536.2425459/94‑1 (MQ=60)
TGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTA < SRR4302536.1400769/94‑1 (MQ=60)
TGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTA > SRR4302536.4268537/1‑94 (MQ=60)
TGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTA < SRR4302536.3214705/94‑1 (MQ=60)
GCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAT > SRR4302536.6899917/1‑94 (MQ=60)
AACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTC > SRR4302536.3379363/1‑94 (MQ=60)
AACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTC < SRR4302536.2148028/94‑1 (MQ=60)
ACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCC < SRR4302536.6093137/94‑1 (MQ=60)
ACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCC > SRR4302536.6264230/1‑94 (MQ=60)
CATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCG > SRR4302536.3939416/1‑94 (MQ=60)
CATCCGGGCAAACGTCTGGTGGGGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCG > SRR4302536.3327366/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTGCCGACTATTCCGC > SRR4302536.344314/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTAACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC < SRR4302536.6918276/94‑1 (MQ=60)
TCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCG < SRR4302536.2389540/94‑1 (MQ=60)
CGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGAC > SRR4302536.2310757/1‑94 (MQ=60)
CGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGAC > SRR4302536.2811647/1‑94 (MQ=60)
TGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACAC > SRR4302536.6107813/1‑94 (MQ=60)
GGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACAC > SRR4302536.159480/1‑94 (MQ=60)
GCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACA > SRR4302536.3670330/1‑94 (MQ=60)
GCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACA < SRR4302536.1278735/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACA < SRR4302536.127810/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACA < SRR4302536.2285367/94‑1 (MQ=60)
CAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAA > SRR4302536.5213519/1‑94 (MQ=60)
AAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAA > SRR4302536.2843901/1‑94 (MQ=60)
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CGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCG > SRR4302536.2786561/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCG > SRR4302536.1249057/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGAGACACAAATCG > SRR4302536.4083484/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGGGGGGGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGGTGGGGCGCAACGGTTCCGACTACTTCGCGACACAAATCG > SRR4302536.178886/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACGCAAATCGG > SRR4302536.6606043/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGG < SRR4302536.1598210/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGG > SRR4302536.5864271/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTTGTGACCGTATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGTTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGT < SRR4302536.6088409/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTG > SRR4302536.742963/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTG < SRR4302536.5509952/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTG < SRR4302536.5570954/94‑1 (MQ=60)
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tggtggtgaccaatgTTATCAGCCACAACAGCGCTGGTGAAGCGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTTC < SRR4302536.6189210/79‑1 (MQ=60)
TGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGC < SRR4302536.380929/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGC < SRR4302536.264349/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTGACCGTATTTATCAGCCGCAACAACTCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCG < SRR4302536.3072616/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACAAAAATCGGTGCG > SRR4302536.4811851/1‑94 (MQ=60)
TGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCT < SRR4302536.171067/94‑1 (MQ=60)
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GTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGG < SRR4302536.2177637/94‑1 (MQ=60)
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TGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGC > SRR4302536.4486611/1‑94 (MQ=60)
CGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGG > SRR4302536.297713/1‑94 (MQ=60)
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GGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTGCGAGACGCAAATCGGTGCGGTGGCGGGTG > SRR4302536.1009120/1‑94 (MQ=60)
GGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTG > SRR4302536.165330/1‑94 (MQ=60)
GGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTG > SRR4302536.4867805/1‑94 (MQ=60)
GGAATTATCAGGCGCAACAACACTGGCGAAACGTGGCTACTGGGGCGTAACGCTTCCGGCTATTCCGCGACACAAATCGcggcgctgacggggg > SRR4302536.2534514/1‑79 (MQ=18)
GATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGT < SRR4302536.6187929/94‑1 (MQ=60)
ATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCTTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTT < SRR4302536.2279251/94‑1 (MQ=60)
ATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTT < SRR4302536.1901555/94‑1 (MQ=60)
ATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGGT > SRR4302536.1388235/1‑94 (MQ=60)
ATTTATCACCCGCAACAACGCTGGTTAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGCTGCGCTGGCGGGTTTT < SRR4302536.1566743/94‑1 (MQ=60)
TTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTT < SRR4302536.2495724/94‑1 (MQ=60)
TTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTT < SRR4302536.418152/94‑1 (MQ=60)
TTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTT < SRR4302536.5739880/94‑1 (MQ=60)
TTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGCTT < SRR4302536.4327119/94‑1 (MQ=60)
TATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCT < SRR4302536.5024843/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTC < SRR4302536.4998324/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCG < SRR4302536.1931650/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCG > SRR4302536.3721776/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCG > SRR4302536.1735833/1‑94 (MQ=60)
CGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAA > SRR4302536.4576945/1‑94 (MQ=60)
GCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAC > SRR4302536.29455/1‑94 (MQ=60)
CAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACC > SRR4302536.1076258/1‑94 (MQ=60)
CAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACC > SRR4302536.1244230/1‑94 (MQ=60)
ACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCAT < SRR4302536.2161912/94‑1 (MQ=60)
AACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGCGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCT < SRR4302536.5417703/94‑1 (MQ=60)
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CGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGG < SRR4302536.1552341/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGA < SRR4302536.3653763/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCCTCTGGAG > SRR4302536.426433/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG > SRR4302536.4120768/1‑94 (MQ=60)
TGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACGAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC > SRR4302536.6818735/1‑94 (MQ=60)
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TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC > NC_000913/4127918‑4128104
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
