Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_000913 |
3,544,363 |
+C |
coding (169/1314 nt) |
gntT → |
gluconate permease |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_000913 | 3,544,363 | 1 | . | C | 99.4%
| 1322.9
/ ‑1.5
| 357 | coding (169/1314 nt) | gntT | gluconate permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (175/179); total (177/180) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 375 total aligned reads displayed.
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GC‑G‑GAC‑G‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGAT > NC_000913/3544280‑3544457
|
tCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGcc < 2:11008892/96‑1 (MQ=255)
tCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGcc > 1:6414264/1‑96 (MQ=255)
ccTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCt < 1:3252996/96‑1 (MQ=255)
ccTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCt < 2:4662697/96‑1 (MQ=255)
cTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCtt < 1:5661220/96‑1 (MQ=255)
cTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCtt > 1:710230/1‑96 (MQ=255)
cTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCtt > 1:12461378/1‑96 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGc < 2:7985317/96‑1 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGc > 1:449597/1‑96 (MQ=255)
gaggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGcc > 1:8829938/3‑96 (MQ=255)
gTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGcc > 1:2738919/1‑96 (MQ=255)
tGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCTGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGccc < 1:12187471/96‑1 (MQ=255)
tGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGccc > 2:3558267/1‑96 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCt > 1:5268949/1‑96 (MQ=255)
ggCGCTTGCTCTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCt < 2:10729356/96‑1 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTg < 2:3776203/96‑1 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTg > 2:1942500/1‑96 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGGGGCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGccccg > 2:9505353/1‑94 (MQ=255)
gagcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTg > 1:10573567/3‑96 (MQ=255)
cgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GGC‑GC‑TCGTTAGCCTTGCCCTGa > 1:5969881/1‑96 (MQ=255)
gcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAt > 2:2553920/1‑96 (MQ=255)
gcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAt > 2:10005167/1‑96 (MQ=255)
gcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAt < 2:6871313/96‑1 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGCATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATc < 2:13485075/96‑1 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATc > 1:4061436/1‑96 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 2:114683/96‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 2:7061962/96‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCa > 1:11175121/1‑96 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCCTGCCCTGATCa > 1:4886104/1‑96 (MQ=255)
tGCTGTTGGATTAATACAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt > 1:8162212/1‑96 (MQ=255)
gCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCAtt > 1:10186256/1‑95 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCGCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATgg > 2:6587944/1‑96 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggg > 2:4565357/1‑96 (MQ=255)
ttGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtt < 1:6121168/96‑1 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAGAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GGC‑GC‑TCCGTAGCCTTGCCCTGCTCATGGGttt > 2:5252159/1‑96 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGACTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt < 1:3879167/96‑1 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt < 1:9557917/96‑1 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt < 2:13186885/96‑1 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt < 2:9843810/96‑1 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTg < 1:11711303/96‑1 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTg > 1:8703525/1‑96 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCATGATCATGGGTTTTgg > 1:12794623/1‑96 (MQ=255)
agtGCAAGGAATGCCGCTGGGTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAACCGGGGTCGGC‑G‑GGG‑GGCTCCGTAGCCGTGCCCTGTTCCTGGGGTTTGgggc > 1:7515184/3‑96 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa > 2:9367048/1‑96 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa > 2:14361416/1‑96 (MQ=255)
tccAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa > 1:11064607/3‑96 (MQ=255)
tGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa > 1:14243133/1‑96 (MQ=255)
tGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa < 2:235181/96‑1 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt > 1:151491/1‑96 (MQ=255)
aaGGACTGCCGCTTGATAAAGTTATCGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc < 1:1349967/96‑1 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc > 2:7474504/1‑96 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCCATGCt > 1:8478752/1‑96 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt < 1:12247778/96‑1 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg < 1:13792329/96‑1 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg > 1:9153000/1‑96 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg < 2:13771322/96‑1 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGc < 2:13939700/96‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCa < 1:1716749/96‑1 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCGAAGCCGGTGTCGGCGG‑GACGG‑‑CCGGGAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa > 2:12711520/1‑96 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa > 1:433977/1‑96 (MQ=255)
cGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGGCTTGCCCTGGTCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa > 2:5482624/1‑96 (MQ=255)
cGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa < 2:11888663/96‑1 (MQ=255)
gCTGGATAGAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGTGCAATGCTGGGCAAAAt > 2:12961415/1‑96 (MQ=255)
gCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt < 1:7201753/96‑1 (MQ=255)
cTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATg < 2:400897/96‑1 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGTCCTGATCTTGGGTTTTTGCGCAATGCTGGGCACAATGc > 1:2647804/1‑96 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc < 2:9223522/96‑1 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc < 2:12427413/96‑1 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc > 2:10460078/1‑96 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc > 1:4563850/1‑96 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc < 1:14086394/96‑1 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc > 2:582205/1‑96 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt < 1:1942500/96‑1 (MQ=255)
gATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGATTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTg > 1:2253307/1‑96 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 1:7922512/1‑96 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGC‑GAGAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGGGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 1:12941497/1‑96 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCGCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg < 1:2422263/96‑1 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAGCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCa > 2:12246082/1‑96 (MQ=255)
gTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAA‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAc > 1:9879887/1‑96 (MQ=255)
ttATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACt < 2:5660297/96‑1 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTg < 1:10050557/96‑1 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTg > 1:3752637/1‑96 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGc < 1:5044688/96‑1 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGc < 2:3186326/96‑1 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGc < 1:11966714/96‑1 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGc < 1:304147/96‑1 (MQ=255)
gCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTg < 1:6684923/96‑1 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgc > 2:811131/1‑96 (MQ=255)
cgaTCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg > 1:10718722/3‑96 (MQ=255)
ccATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGGTCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg > 2:2071964/1‑96 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcgc > 2:8802691/1‑96 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGca > 1:5446774/1‑96 (MQ=255)
tCAAAGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGcac < 2:6254962/96‑1 (MQ=255)
aaGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAc < 2:8574210/96‑1 (MQ=255)
aaGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAc < 1:13081371/96‑1 (MQ=255)
aaGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAc > 1:5322197/1‑96 (MQ=255)
aGCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACg > 2:4934978/1‑96 (MQ=255)
gCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGGGGCGCACAACGt > 2:10325846/1‑96 (MQ=255)
gCCGGTGTCGGCGG‑GAC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGGGGCGCACAACGt > 2:4198212/1‑96 (MQ=255)
gg‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGAt > 1:12977787/2‑96 (MQ=255)
|
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GC‑G‑GAC‑G‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGAT > NC_000913/3544280‑3544457
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 224 total aligned reads displayed.
CTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑CG‑G‑‑AC‑G‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAA > NC_000913/3544276‑3544463
|
NNNGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCT < SRR4302518.9567977/101‑1 (MQ=60)
NNNGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCT < SRR4302518.13943656/101‑1 (MQ=60)
CTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCT < SRR4302518.3404156/101‑1 (MQ=60)
TCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGGTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGATATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT > SRR4302518.6639907/1‑101 (MQ=60)
TCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302518.1817463/101‑1 (MQ=60)
TCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302518.5709618/101‑1 (MQ=60)
TCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302518.5948624/101‑1 (MQ=60)
NNNTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302518.12877312/101‑1 (MQ=60)
NNNTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302518.12622319/101‑1 (MQ=60)
NNNTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302518.7510372/101‑1 (MQ=60)
NNNCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTG < SRR4302518.10377756/101‑1 (MQ=60)
NNNCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTG < SRR4302518.8013337/101‑1 (MQ=60)
CGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTG < SRR4302518.809084/101‑1 (MQ=60)
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCC < SRR4302518.6142453/101‑1 (MQ=60)
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCC < SRR4302518.3489429/101‑1 (MQ=60)
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCC > SRR4302518.6742110/1‑101 (MQ=60)
GCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCC < SRR4302518.2392369/101‑1 (MQ=60)
NNNCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCTGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCC < SRR4302518.12765533/101‑1 (MQ=60)
CTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCNNN > SRR4302518.13047720/1‑101 (MQ=60)
CTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCT > SRR4302518.737952/1‑101 (MQ=60)
TCGTTGCGCTTGCTGTGGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTG < SRR4302518.2865660/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTG < SRR4302518.13653864/101‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGA > SRR4302518.467387/1‑101 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCNNN > SRR4302518.8907894/1‑101 (MQ=60)
CGTAGCGCTTGCTGTAGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGA < SRR4302518.5829635/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAT < SRR4302518.10834871/101‑1 (MQ=60)
GTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAT > SRR4302518.2868898/1‑101 (MQ=60)
GAGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTNNN > SRR4302518.9258310/1‑101 (MQ=60)
TGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATC > SRR4302518.5665093/1‑101 (MQ=60)
NNNCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATC < SRR4302518.8118986/101‑1 (MQ=60)
NNNGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGACTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCA < SRR4302518.12923679/101‑1 (MQ=60)
GGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCA > SRR4302518.5539633/1‑101 (MQ=60)
GCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATNNN > SRR4302518.13845934/1‑101 (MQ=60)
GCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302518.6928575/101‑1 (MQ=60)
GAGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATNNN > SRR4302518.11069683/1‑101 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑GC‑GC‑TCGTTAGCCTTGCCCTGATCATG > SRR4302518.6272730/1‑101 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCNNN > SRR4302518.14868719/1‑101 (MQ=60)
gttggTGTTGGATTAACGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑ACTC‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG < SRR4302518.3441121/96‑1 (MQ=60)
NNNGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG < SRR4302518.10426300/101‑1 (MQ=60)
CTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG > SRR4302518.4257673/1‑101 (MQ=60)
CTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG > SRR4302518.5116535/1‑101 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGNNN > SRR4302518.10228958/1‑101 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGNNN > SRR4302518.11698344/1‑101 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGT < SRR4302518.839830/101‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCCTGCCCTGATCATGGGT > SRR4302518.5141022/1‑101 (MQ=60)
TGCTGTTGTATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGNNN > SRR4302518.13555848/1‑101 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGNNN > SRR4302518.9630949/1‑101 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGNNN > SRR4302518.12778691/1‑101 (MQ=60)
NNNGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCGATCAAAGCCGGTGTC‑GGTGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATAATGGGTTT < SRR4302518.13548414/101‑1 (MQ=60)
GCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATtggnnn > SRR4302518.10667710/1‑95 (MQ=60)
NNNTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302518.10020409/101‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATTCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302518.4717242/101‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGACTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302518.4063301/101‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT > SRR4302518.1155899/1‑101 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302518.7175612/101‑1 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG > SRR4302518.4429767/1‑101 (MQ=60)
NNNTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302518.12264771/101‑1 (MQ=60)
TTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTNNN > SRR4302518.8945555/1‑101 (MQ=60)
NNNGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC < SRR4302518.14863746/101‑1 (MQ=60)
NNNTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC < SRR4302518.13261743/101‑1 (MQ=60)
NNNTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC < SRR4302518.11398409/101‑1 (MQ=60)
NNNTAATTCAAGGAATGACGCTTGTTAAAGTTATTTGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTTGCGTA < SRR4302518.7939860/101‑1 (MQ=39)
NNNTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCA < SRR4302518.13440826/101‑1 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCTGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCA > SRR4302518.3789060/1‑101 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCNNN > SRR4302518.9126688/1‑101 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTTCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302518.6078486/1‑101 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAA > SRR4302518.5676284/1‑101 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCATGATCATGGGTTTTGGCGNNN > SRR4302518.13390439/1‑101 (MQ=60)
TGAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAGGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCNNN > SRR4302518.11058097/1‑101 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCANNN > SRR4302518.10282099/1‑101 (MQ=60)
TAATGCAAGGAAGGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302518.279591/101‑1 (MQ=60)
NNNTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302518.9129302/101‑1 (MQ=60)
ACTGCAAGGACTGCCGCTTGATAAAGTTATCGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGC < SRR4302518.1405868/101‑1 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGC < SRR4302518.4321916/101‑1 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGNNN > SRR4302518.12780769/1‑101 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGNNN > SRR4302518.14899542/1‑101 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302518.1319322/101‑1 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGCTTTGGCGCAATGNNN > SRR4302518.11471728/1‑101 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCGGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302518.2694132/101‑1 (MQ=60)
NNNAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG < SRR4302518.14423734/101‑1 (MQ=60)
GCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG > SRR4302518.157720/1‑101 (MQ=60)
NNNGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG < SRR4302518.14173103/101‑1 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTNNN > SRR4302518.12548314/1‑101 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG < SRR4302518.6788212/101‑1 (MQ=60)
NNNGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGT < SRR4302518.11857094/101‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302518.858383/101‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC > SRR4302518.5542993/1‑101 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302518.2505374/101‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302518.5783156/101‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302518.407374/101‑1 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCCATGCTGGNNN > SRR4302518.8893191/1‑101 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCA < SRR4302518.1792955/101‑1 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCA > SRR4302518.1357016/1‑101 (MQ=60)
AAGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CG‑G‑‑GC‑GGCTCGGTAGCCTTGGCCTGATCATGGGTTTTGGCGGAATGCTtgnnn > SRR4302518.12284984/1‑96 (MQ=60)
NNNTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAA < SRR4302518.12583236/101‑1 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTTGCGCAATGCTGGGCAAA > SRR4302518.3355211/1‑101 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCNNN > SRR4302518.9594458/1‑101 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCNNN > SRR4302518.7821249/1‑101 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGGC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGtgaaa > SRR4302518.7353893/1‑96 (MQ=60)
NNNGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAGA < SRR4302518.11992247/101‑1 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAA > SRR4302518.4015955/1‑101 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGGAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAA > SRR4302518.4795580/1‑101 (MQ=60)
NNNCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302518.13509721/101‑1 (MQ=60)
NNNCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302518.7579274/101‑1 (MQ=60)
NNNCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302518.9211953/101‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG > SRR4302518.6673277/1‑101 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG < SRR4302518.219687/101‑1 (MQ=60)
NNNGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGC < SRR4302518.14731417/101‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑GC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAANNN > SRR4302518.9340377/1‑101 (MQ=60)
NNNCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT < SRR4302518.13622307/101‑1 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT < SRR4302518.5198965/101‑1 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTGGGCGATATGCTGGGCAAAATNNN > SRR4302518.14931669/1‑101 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT > SRR4302518.451028/1‑101 (MQ=60)
NNNTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302518.12063833/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302518.7805173/101‑1 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302518.2420163/101‑1 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG > SRR4302518.6130185/1‑101 (MQ=60)
GCTGGATAAATTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGGC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCGCTGCTCATGGGGTTTGGCGCTATGCTAGGCAAAATGCTGG > SRR4302518.4425256/1‑101 (MQ=37)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG > SRR4302518.1289872/1‑101 (MQ=60)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG > SRR4302518.1649147/1‑101 (MQ=60)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG > SRR4302518.3356263/1‑101 (MQ=60)
GCTGGATAAAGTTATTGGCGCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG < SRR4302518.2539400/101‑1 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑GC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC > SRR4302518.5480479/1‑101 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC < SRR4302518.660426/101‑1 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC > SRR4302518.1719432/1‑101 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC > SRR4302518.3012552/1‑101 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGTCCTGATCTTGGGTTTTTGCGCAATGCTGGGCACAATGCTGGCG > SRR4302518.2774397/1‑101 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGNNN > SRR4302518.14196983/1‑101 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA > SRR4302518.4803888/1‑101 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGGGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGNNN > SRR4302518.11011730/1‑101 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG > SRR4302518.6804158/1‑101 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG < SRR4302518.4215084/101‑1 (MQ=60)
GGATAAAGTTAGTGGCTCCATTAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑GC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGACAAAATGCTGGCAG > SRR4302518.4160228/1‑101 (MQ=58)
GATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCNNN > SRR4302518.12521846/1‑101 (MQ=60)
GATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGATTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGA > SRR4302518.2362504/1‑101 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGAG‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGGGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCANNN > SRR4302518.13541604/1‑101 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCANNN > SRR4302518.8783839/1‑101 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCANNN > SRR4302518.8319381/1‑101 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGNNN > SRR4302518.10665943/1‑101 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302518.5422543/101‑1 (MQ=60)
NNNAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302518.13094239/101‑1 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCCTCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTG < SRR4302518.4573655/101‑1 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTG > SRR4302518.5515867/1‑101 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTG > SRR4302518.4837261/1‑101 (MQ=60)
NNNTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGC < SRR4302518.12537509/101‑1 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGC < SRR4302518.316408/101‑1 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGC < SRR4302518.5306267/101‑1 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGC < SRR4302518.1432682/101‑1 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCA < SRR4302518.4752965/60‑1 (MQ=42)
AGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCG > SRR4302518.1106435/1‑101 (MQ=60)
GTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CG‑GGAAG‑C‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACagnnn > SRR4302518.10351705/1‑96 (MQ=60)
GTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGNNN > SRR4302518.8952050/1‑101 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑GC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAGGCTGGCAGACTGCNNN > SRR4302518.9373661/1‑101 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGannn > SRR4302518.10528492/1‑97 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302518.6396875/101‑1 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGG > SRR4302518.4948038/1‑101 (MQ=60)
NNNTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302518.14675228/101‑1 (MQ=60)
NNNTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302518.10250213/101‑1 (MQ=60)
GTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302518.2117099/101‑1 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTG > SRR4302518.3929404/1‑101 (MQ=60)
NNNGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGG < SRR4302518.8449295/101‑1 (MQ=60)
TGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTATCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCGGGGCAAAATGCTGACGGACCGCGGTGGCG > SRR4302518.6612070/1‑101 (MQ=58)
GGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGNNN > SRR4302518.10392017/1‑101 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGC > SRR4302518.1697023/1‑101 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑CCGGTAGCCGTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCGGGCAGACTTCGGCGGCGC > SRR4302518.6423963/1‑101 (MQ=58)
GCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302518.4132145/1‑101 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGNNN > SRR4302518.7433992/1‑101 (MQ=60)
TGCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCNNN > SRR4302518.11106296/1‑101 (MQ=60)
TCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAGTGCGGTGGCGgnnn > SRR4302518.11692282/1‑97 (MQ=60)
TCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACA < SRR4302518.2216501/101‑1 (MQ=60)
NNNTCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGTACAA < SRR4302518.14990711/101‑1 (MQ=60)
CGATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCANNN > SRR4302518.11222214/1‑101 (MQ=60)
CCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > SRR4302518.287965/1‑101 (MQ=60)
NNNCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC < SRR4302518.11107964/101‑1 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACANNN > SRR4302518.11385573/1‑101 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACG > SRR4302518.188298/1‑101 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACG > SRR4302518.3204873/1‑101 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACG > SRR4302518.5724453/1‑101 (MQ=60)
CAAAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGGGGCGCACAACGTA > SRR4302518.5168638/1‑101 (MQ=60)
AAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATC < SRR4302518.1838132/101‑1 (MQ=60)
AAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATC > SRR4302518.5595123/1‑101 (MQ=60)
AAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATC < SRR4302518.1066455/101‑1 (MQ=60)
AAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATC < SRR4302518.5626737/101‑1 (MQ=60)
AAGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATC < SRR4302518.410476/101‑1 (MQ=60)
AGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGCGGCGCACAACGTANNN > SRR4302518.7487062/1‑101 (MQ=60)
AGCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGGAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTGGGCGCAATGCTGGTCAAAATGCTGTCAGACTGCGGTGGCGCCCAACGcannn > SRR4302518.9308543/1‑96 (MQ=56)
GCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATNNN > SRR4302518.14773270/1‑101 (MQ=60)
GCCGGTGTC‑GGCGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGC > SRR4302518.4630546/1‑101 (MQ=60)
G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAGAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACATCGTATCGCCACCACGCTGATT > SRR4302518.1231543/1‑101 (MQ=60)
G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATT > SRR4302518.5940336/1‑101 (MQ=60)
G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATT > SRR4302518.2836921/1‑101 (MQ=60)
G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTG > SRR4302518.758584/1‑101 (MQ=60)
G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTCCCTTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGAAAAATGCTGGCAGACGGGGGTGGCGCACAACGAATCGCCACCACGCTGATTG < SRR4302518.5348616/101‑1 (MQ=60)
NN‑N‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCC < SRR4302518.10480811/101‑1 (MQ=60)
G‑G‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGNNN > SRR4302518.13579221/1‑101 (MQ=60)
C‑C‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCA < SRR4302518.1793759/101‑1 (MQ=60)
C‑‑TCGGTCGCCTTGCGCTGTTCATGGGTTTTGGCGCACTGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCCCAACGTATCGCCCCCACGCTGATTGCCAA < SRR4302518.5486591/101‑1 (MQ=60)
C‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAA > SRR4302518.6335864/1‑101 (MQ=60)
C‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAA > SRR4302518.1205186/1‑101 (MQ=60)
C‑‑TCGGTAGCCTTGACCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGTGCAAAATGCTGTCAGACTGCGGGGGCGCACAACGGATCGCCACCACGCTGATggcnnn > SRR4302518.14028949/1‑95 (MQ=60)
|
CTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑CG‑G‑‑AC‑G‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAA > NC_000913/3544276‑3544463
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |