Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,762,307 |
T→C |
Q35R (CAG→CGG) |
ydiC ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,762,307 | 0 | T | C | 99.6%
| 715.6
/ NA
| 225 | Q35R (CAG→CGG) | ydiC | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (116/107); total (118/107) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TTGTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCTGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCT > NC_000913/1762217‑1762396
|
tGTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGgccgct < 2:3538452/93‑1 (MQ=255)
ccGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTg > 2:2526943/1‑93 (MQ=255)
gCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGcca < 1:2178132/93‑1 (MQ=255)
tCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGccacc > 2:6471649/1‑93 (MQ=255)
cGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGccacca < 2:536712/93‑1 (MQ=255)
cGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGccacca < 2:5728713/93‑1 (MQ=255)
cGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGccacca < 1:2074128/93‑1 (MQ=255)
cGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGccacca < 2:3145285/93‑1 (MQ=255)
aaCACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTc > 1:2600717/1‑93 (MQ=255)
aaCACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTc > 2:4147063/1‑93 (MQ=255)
aaCACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTc > 1:1474815/1‑93 (MQ=255)
aaCACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGACACCAgata > 2:3106218/1‑90 (MQ=255)
aaCACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACACCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTc > 1:5882343/1‑93 (MQ=255)
acacTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCa > 1:4403062/1‑93 (MQ=255)
acacTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCa > 2:6389770/1‑93 (MQ=255)
acTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACg < 2:454738/93‑1 (MQ=255)
tCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGAtg < 1:3647485/93‑1 (MQ=255)
aGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATgtgt > 1:2956099/1‑93 (MQ=255)
aGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATgtgt > 2:4009750/1‑93 (MQ=255)
gCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTa < 1:5747116/93‑1 (MQ=255)
acaTAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATc > 1:1188496/1‑93 (MQ=255)
caTAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcg > 2:3940053/1‑93 (MQ=255)
gCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcgccgc < 1:872150/93‑1 (MQ=255)
gCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcgccgc > 1:1077393/1‑93 (MQ=255)
gCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcgccgc < 2:2438469/93‑1 (MQ=255)
gCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcgccgc < 1:4381543/93‑1 (MQ=255)
gCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcgccgc > 1:4219840/1‑93 (MQ=255)
ccAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCt < 1:1431012/93‑1 (MQ=255)
cAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTg > 2:6279299/1‑93 (MQ=255)
cAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTg > 2:139808/1‑93 (MQ=255)
aaaGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATGCCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGc < 2:2939653/93‑1 (MQ=255)
aGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCgg > 2:3041907/1‑93 (MQ=255)
aGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCgg > 2:200724/1‑93 (MQ=255)
gCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCggg > 2:5157479/1‑93 (MQ=255)
gCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTCGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCggg < 2:6046790/93‑1 (MQ=255)
ccGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGgtg > 1:5061576/1‑93 (MQ=255)
cgcAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCa < 2:3682539/93‑1 (MQ=255)
gcAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAg > 2:4795039/1‑93 (MQ=255)
gcAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAg < 2:5964007/93‑1 (MQ=255)
gcAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAg < 2:4468940/93‑1 (MQ=255)
ccAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAg < 1:5549476/92‑1 (MQ=255)
aGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCg > 1:3091603/1‑93 (MQ=255)
aGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCg > 2:6171936/1‑93 (MQ=255)
aGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCg > 2:2319627/1‑93 (MQ=255)
gCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGt > 1:1029715/1‑93 (MQ=255)
gCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGt < 2:1060335/93‑1 (MQ=255)
gCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGt > 2:5604255/1‑93 (MQ=255)
gCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGt > 1:1558938/1‑93 (MQ=255)
gCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGt > 1:3744696/1‑93 (MQ=255)
cccGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGtt < 1:2356331/93‑1 (MQ=255)
cGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTaa < 2:2691518/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAg > 2:4843847/1‑93 (MQ=255)
tttGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGc > 2:4209397/1‑93 (MQ=255)
tttGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGc > 2:6163010/1‑93 (MQ=255)
tttGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGc < 1:3971001/93‑1 (MQ=255)
tttGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGc > 2:4599503/1‑93 (MQ=255)
gCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCtt > 1:469322/1‑93 (MQ=255)
gCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCtt > 1:1690181/1‑93 (MQ=255)
cTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTg < 1:3855999/93‑1 (MQ=255)
ttCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGc > 2:4507213/1‑93 (MQ=255)
tCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGcc < 1:4589658/93‑1 (MQ=255)
tCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGcc < 2:1438126/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTAGGCCCACGCCCACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAg < 1:3394212/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAg < 2:3435031/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAg < 2:6071954/93‑1 (MQ=255)
gCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGc > 2:1603748/1‑93 (MQ=255)
tAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCgca > 2:3737863/1‑91 (MQ=255)
aaGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGaaa < 1:6379418/93‑1 (MQ=255)
aGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAt > 2:6019510/1‑93 (MQ=255)
aGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAt > 1:2220309/1‑93 (MQ=255)
aGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAt > 1:6643332/1‑93 (MQ=255)
gcgcACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATc > 1:6030914/1‑93 (MQ=255)
gcgcACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATc < 1:353365/93‑1 (MQ=255)
gcgcACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATc < 1:1816973/93‑1 (MQ=255)
gcgcACGCCGACCATACCCGGCCGCTTGGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATc < 2:3308482/93‑1 (MQ=255)
cgcACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCt < 1:993724/93‑1 (MQ=255)
cgcACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCt < 1:4906347/93‑1 (MQ=255)
cACGCCGACCATACCCGGCCGCTGTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTtg < 2:5023012/93‑1 (MQ=255)
aCGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTtgt < 2:2926945/93‑1 (MQ=255)
aCGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTtgt > 2:6705610/1‑93 (MQ=255)
aCGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTtgt > 2:2856365/1‑93 (MQ=255)
cGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTtgtg > 1:2491358/1‑93 (MQ=255)
cGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTtgtg < 1:2845923/93‑1 (MQ=255)
cGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTtgtg > 1:3450391/1‑93 (MQ=255)
cGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTtgtg > 1:6448844/1‑93 (MQ=255)
gCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTgg > 1:4750901/1‑93 (MQ=255)
ccGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTggg < 1:1053858/93‑1 (MQ=255)
gACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGtt < 1:5224750/93‑1 (MQ=255)
gACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGtt < 1:2018076/93‑1 (MQ=255)
aCCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTa < 1:5296218/93‑1 (MQ=255)
cATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTaaa < 1:1730084/93‑1 (MQ=255)
aTACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAg < 2:2111143/93‑1 (MQ=255)
aCCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGt > 1:963964/1‑93 (MQ=255)
aCCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGt > 1:7867/1‑93 (MQ=255)
cccGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGtt > 2:3468727/1‑93 (MQ=255)
ccGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTc > 2:5479909/1‑93 (MQ=255)
cGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTcc < 2:4501268/93‑1 (MQ=255)
cGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTcc < 1:6215403/93‑1 (MQ=255)
ggCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCt > 2:4282946/1‑93 (MQ=255)
ggCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCt < 2:1320812/93‑1 (MQ=255)
|
TTGTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCTGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCT > NC_000913/1762217‑1762396
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCTGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAAT > NC_000913/1762219‑1762400
|
GTCCGGCTCGCTATCACTGTCGATCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCAGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTT < SRR4302536.1017078/94‑1 (MQ=60)
GGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCA < SRR4302536.2120692/94‑1 (MQ=60)
GCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCAC < SRR4302536.2243773/94‑1 (MQ=60)
TCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCA > SRR4302536.5943618/1‑94 (MQ=60)
CGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAG > SRR4302536.587633/1‑94 (MQ=60)
CGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAG < SRR4302536.3873828/94‑1 (MQ=60)
CGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAG < SRR4302536.2136593/94‑1 (MQ=60)
TAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTC > SRR4302536.2678801/1‑94 (MQ=60)
TAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTC > SRR4302536.1666396/1‑94 (MQ=60)
TAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTC > SRR4302536.1518415/1‑94 (MQ=60)
TAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACACCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTC > SRR4302536.6057562/1‑94 (MQ=60)
AACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCA > SRR4302536.4534721/1‑94 (MQ=60)
AACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCA < SRR4302536.3998418/94‑1 (MQ=60)
ACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCAC > SRR4302536.1566659/1‑94 (MQ=60)
CACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACG > SRR4302536.378679/1‑94 (MQ=60)
CACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACG < SRR4302536.5525440/94‑1 (MQ=60)
ACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGG > SRR4302536.5393232/1‑94 (MQ=60)
TGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGAT < SRR4302536.296075/94‑1 (MQ=60)
TCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGT < SRR4302536.3756535/94‑1 (MQ=60)
GAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGT > SRR4302536.3043193/1‑94 (MQ=60)
AGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTA > SRR4302536.4223272/1‑94 (MQ=60)
GCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTAT < SRR4302536.5918077/94‑1 (MQ=60)
GCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTAT < SRR4302536.6595184/94‑1 (MQ=60)
GCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTAT < SRR4302536.4262218/94‑1 (MQ=60)
CACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATC > SRR4302536.1224240/1‑94 (MQ=60)
acctcgccacAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCCCGGATGTGTATCG < SRR4302536.6273778/84‑1 (MQ=60)
CATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGC > SRR4302536.4505345/1‑94 (MQ=60)
CATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGCTCGCTTTGCCACCAGCTCACCGATGTGTATCGC > SRR4302536.1252571/1‑94 (MQ=60)
AGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGC > SRR4302536.4345372/1‑94 (MQ=60)
AGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGC > SRR4302536.1109647/1‑94 (MQ=60)
AGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGC > SRR4302536.3528353/1‑94 (MQ=60)
GCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCT < SRR4302536.4512356/94‑1 (MQ=60)
GCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCT < SRR4302536.897845/94‑1 (MQ=60)
GCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTGCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCT < SRR4302536.483843/94‑1 (MQ=60)
CCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTG < SRR4302536.1473504/94‑1 (MQ=60)
CCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTG > SRR4302536.286355/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGC < SRR4302536.6177138/94‑1 (MQ=60)
AAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCG < SRR4302536.273857/94‑1 (MQ=60)
AAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGG > SRR4302536.6820362/1‑94 (MQ=60)
AAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGG < SRR4302536.6120833/94‑1 (MQ=60)
GCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGT > SRR4302536.4965267/1‑94 (MQ=60)
CCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTG < SRR4302536.4792664/94‑1 (MQ=60)
CCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTG > SRR4302536.5213180/1‑94 (MQ=60)
GCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGC < SRR4302536.1761050/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGC < SRR4302536.5714796/94‑1 (MQ=60)
CAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCG > SRR4302536.3181978/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGT > SRR4302536.3856638/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGT > SRR4302536.1060228/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGT > SRR4302536.1604706/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGT < SRR4302536.2234279/94‑1 (MQ=60)
CCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTA < SRR4302536.2427751/94‑1 (MQ=60)
CCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAA < SRR4302536.2463688/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAG < SRR4302536.6457137/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGCTGCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAG < SRR4302536.1493804/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCTGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGC > SRR4302536.3246785/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGC > SRR4302536.2370486/1‑94 (MQ=60)
TTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCC < SRR4302536.4088870/94‑1 (MQ=60)
TTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCT > SRR4302536.751246/1‑94 (MQ=60)
TGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTT > SRR4302536.481583/1‑94 (MQ=60)
TGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTT > SRR4302536.829192/1‑94 (MQ=60)
TGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTT > SRR4302536.1739131/1‑94 (MQ=60)
TGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTT < SRR4302536.6710835/94‑1 (MQ=60)
GCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGTGTTAAGCCTTG < SRR4302536.965504/94‑1 (MQ=60)
CTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGC < SRR4302536.3970762/94‑1 (MQ=60)
CTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGC > SRR4302536.1085087/1‑94 (MQ=60)
CTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGGGTCAGCGTTAAGCCTTGC > SRR4302536.3645213/1‑94 (MQ=60)
TTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCC < SRR4302536.2639105/94‑1 (MQ=60)
TCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCA < SRR4302536.4727440/94‑1 (MQ=60)
TCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCA < SRR4302536.2244226/94‑1 (MQ=60)
ACGCCTAGGCCCACGCCCACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGG < SRR4302536.3495167/94‑1 (MQ=60)
CCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGA < SRR4302536.1281425/94‑1 (MQ=60)
CTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAA > SRR4302536.1095890/1‑94 (MQ=60)
AAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAT < SRR4302536.6273971/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAT > SRR4302536.6840862/1‑94 (MQ=60)
AAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAT < SRR4302536.6569566/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAT > SRR4302536.2287459/1‑94 (MQ=60)
AAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAT > SRR4302536.1001723/1‑94 (MQ=60)
AGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATC > SRR4302536.6210743/1‑94 (MQ=60)
GCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCT < SRR4302536.362723/94‑1 (MQ=60)
GCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCT < SRR4302536.1871791/94‑1 (MQ=60)
CGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTT < SRR4302536.1023043/94‑1 (MQ=60)
CGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTT < SRR4302536.5053849/94‑1 (MQ=60)
ACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTG > SRR4302536.2566507/1‑94 (MQ=60)
ACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTG > SRR4302536.3553153/1‑94 (MQ=60)
ACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTG > SRR4302536.6641467/1‑94 (MQ=60)
CGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGG > SRR4302536.4893865/1‑94 (MQ=60)
CGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGG < SRR4302536.2930086/94‑1 (MQ=60)
CGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGG < SRR4302536.5324031/94‑1 (MQ=60)
CGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGG > SRR4302536.1194769/1‑94 (MQ=60)
CCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGT < SRR4302536.1085343/94‑1 (MQ=60)
GACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTA > SRR4302536.3163876/1‑94 (MQ=60)
GACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTA > SRR4302536.5200241/1‑94 (MQ=60)
GACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTA < SRR4302536.5380441/94‑1 (MQ=60)
GACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTA < SRR4302536.2078809/94‑1 (MQ=60)
ACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAA < SRR4302536.5454154/94‑1 (MQ=60)
CCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAA > SRR4302536.1650157/1‑94 (MQ=60)
CATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAG < SRR4302536.5559751/94‑1 (MQ=60)
CATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAG < SRR4302536.1780027/94‑1 (MQ=60)
CATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAG > SRR4302536.4678701/1‑94 (MQ=60)
CATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAG > SRR4302536.1887860/1‑94 (MQ=60)
CATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAG < SRR4302536.3262169/94‑1 (MQ=60)
ATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGG > SRR4302536.5155701/1‑94 (MQ=60)
ATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGG > SRR4302536.3599376/1‑94 (MQ=60)
ATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGG > SRR4302536.3772459/1‑94 (MQ=60)
TACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGT > SRR4302536.8085/1‑94 (MQ=60)
TACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGT > SRR4302536.992440/1‑94 (MQ=60)
ACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTT < SRR4302536.2055681/94‑1 (MQ=60)
CCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCC > SRR4302536.4531052/1‑94 (MQ=60)
CCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCC < SRR4302536.4611009/94‑1 (MQ=60)
CCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCC < SRR4302536.2383155/94‑1 (MQ=60)
CGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCT < SRR4302536.6400597/94‑1 (MQ=60)
GGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTG > SRR4302536.3977660/1‑94 (MQ=60)
GGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTG < SRR4302536.1804112/94‑1 (MQ=60)
GGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTG < SRR4302536.9471/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAAT < SRR4302536.3558007/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAAT > SRR4302536.4965570/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGACGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTGCTGAAT > SRR4302536.4621543/1‑94 (MQ=60)
|
GTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCTGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAAT > NC_000913/1762219‑1762400
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
