Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,779,462 |
T→C |
V15A (GTT→GCT) |
ydiS → |
YdiS |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,779,462 | 0 | T | C | 100.0%
| 625.4
/ NA
| 196 | V15A (GTT→GCT) | ydiS | YdiS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (102/94); total (102/94) |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
TCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAAC > NC_000913/1779372‑1779550
|
tCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTg < 1:6494238/93‑1 (MQ=255)
cAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGc > 2:1479321/1‑93 (MQ=255)
aaCCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCgctgct > 2:5782029/1‑93 (MQ=255)
aaCCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGcg > 1:6373086/1‑92 (MQ=255)
ccACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTgg < 2:1838598/93‑1 (MQ=255)
ccACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTgg < 2:1446211/93‑1 (MQ=255)
cacaTCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGt < 2:4750416/93‑1 (MQ=255)
cacaTCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGt > 2:267278/1‑93 (MQ=255)
acaTCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTa > 1:1010267/1‑93 (MQ=255)
aTCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGc < 2:3512292/93‑1 (MQ=255)
tctcCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCg > 2:5613359/1‑93 (MQ=255)
tctcCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCg > 2:2393741/1‑93 (MQ=255)
tctcCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCg > 1:5916346/1‑93 (MQ=255)
ctcCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGCCAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGt < 1:3381892/93‑1 (MQ=255)
ctcCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGt < 1:2203994/93‑1 (MQ=255)
ctcCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGt < 2:4827216/93‑1 (MQ=255)
cccGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTg < 1:1323246/93‑1 (MQ=255)
cccGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTg > 1:508928/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGc > 2:6301077/1‑93 (MQ=255)
cGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGcc > 2:5152265/1‑93 (MQ=255)
gCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCg > 2:6505663/1‑93 (MQ=255)
tGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCa > 1:2790844/1‑93 (MQ=255)
gTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCAc > 2:2927889/1‑93 (MQ=255)
gTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCAc < 1:5177913/93‑1 (MQ=255)
tAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACt > 2:6210512/1‑93 (MQ=255)
aaaCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTg > 1:5282294/1‑93 (MQ=255)
aaaCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTg > 1:5593744/1‑93 (MQ=255)
aaCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTgg > 1:1871739/1‑93 (MQ=255)
aaCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTgg > 2:4026452/1‑93 (MQ=255)
aaCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTgg < 2:3639673/93‑1 (MQ=255)
aaCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTgg < 1:2515023/93‑1 (MQ=255)
aaCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTgg > 1:2356857/1‑93 (MQ=255)
aaCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTgg < 2:2285934/93‑1 (MQ=255)
aaCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTgg > 1:3102106/1‑93 (MQ=255)
aCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGt > 2:54744/1‑93 (MQ=255)
aCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGt > 2:600666/1‑93 (MQ=255)
aCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGt > 1:1647704/1‑93 (MQ=255)
aCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGt < 1:330727/93‑1 (MQ=255)
aCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATGGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGt < 1:4120731/93‑1 (MQ=255)
aGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATg < 1:3136730/93‑1 (MQ=255)
aGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATg < 1:11068/93‑1 (MQ=255)
aGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATg < 1:88820/93‑1 (MQ=255)
gggAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCa > 2:3941745/1‑93 (MQ=255)
gggAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCa < 1:5454424/93‑1 (MQ=255)
ggAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATTGCAc > 1:5148541/1‑93 (MQ=255)
ggAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCAc > 2:4326526/1‑93 (MQ=255)
ggAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCAc > 1:6285326/1‑93 (MQ=255)
gggAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGc < 1:4451399/93‑1 (MQ=255)
gggAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGc < 1:4688825/93‑1 (MQ=255)
gggAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGc > 2:3648143/1‑93 (MQ=255)
ggAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGcc < 2:171104/93‑1 (MQ=255)
aGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTCGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCgg > 2:322166/1‑93 (MQ=255)
gCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCggg > 1:6154624/1‑93 (MQ=255)
cATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGc < 2:5961136/93‑1 (MQ=255)
aTAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGGGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCt > 1:3912385/1‑93 (MQ=255)
aTAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCt > 2:3864663/1‑93 (MQ=255)
tAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTg > 2:2537573/1‑93 (MQ=255)
gCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATg < 1:4405318/93‑1 (MQ=255)
aTGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTc < 2:316425/93‑1 (MQ=255)
aTGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTc > 1:2631562/1‑93 (MQ=255)
gTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCt < 1:3471799/93‑1 (MQ=255)
cGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTgg < 2:3271894/93‑1 (MQ=255)
cGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTgg < 1:5239834/93‑1 (MQ=255)
ggATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTggg > 2:1222951/1‑92 (MQ=255)
ggATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGt > 2:6286289/1‑93 (MQ=255)
gATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTg < 1:3069239/93‑1 (MQ=255)
gATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTg > 1:1751978/1‑93 (MQ=255)
gATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTg > 1:4374336/1‑93 (MQ=255)
aTGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGa > 1:4014303/1‑93 (MQ=255)
aTGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGa < 1:1172222/93‑1 (MQ=255)
aTGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGa < 1:5512288/93‑1 (MQ=255)
gACAAATTTGATGCCGTTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATa < 2:2159968/93‑1 (MQ=255)
gACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATa < 2:6368858/93‑1 (MQ=255)
cAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGa > 2:1616514/1‑93 (MQ=255)
aaaTTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGaa < 2:2137686/93‑1 (MQ=255)
aaaTTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGaa < 1:2710650/93‑1 (MQ=255)
aaaTTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGaa > 2:4478652/1‑93 (MQ=255)
aaTTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAAc > 2:4792621/1‑93 (MQ=255)
aaTTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAAc < 1:4200351/93‑1 (MQ=255)
aaTTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAAc < 1:1558109/93‑1 (MQ=255)
tttGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTGCTGGTGATAGAAcgc > 1:4917/1‑93 (MQ=255)
tttGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAAcgc < 2:1931468/93‑1 (MQ=255)
ttGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAAcgcg < 1:5837269/93‑1 (MQ=255)
ttGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAAcgcg < 1:5369872/93‑1 (MQ=255)
ttGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAAcgcg < 2:669801/93‑1 (MQ=255)
tGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACgcgg < 1:6190620/93‑1 (MQ=255)
gATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGGGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGGGATAGAACgcggg > 1:5941253/1‑92 (MQ=255)
tGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGa < 1:84318/93‑1 (MQ=255)
gCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGAc > 2:684676/1‑93 (MQ=255)
gCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGAc < 1:1034773/93‑1 (MQ=255)
ccATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACa > 2:5102327/1‑93 (MQ=255)
ccATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACa > 2:339520/1‑93 (MQ=255)
ccATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACa < 1:1381869/93‑1 (MQ=255)
ttGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTg < 2:107185/93‑1 (MQ=255)
ttGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTg > 1:127370/1‑93 (MQ=255)
gtgGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGcc < 1:3650122/93‑1 (MQ=255)
gTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGa < 1:787702/93‑1 (MQ=255)
gTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGa < 2:6591186/93‑1 (MQ=255)
tCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGAt < 1:2000067/93‑1 (MQ=255)
tCGGTGCCGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGAt < 2:1807082/93‑1 (MQ=255)
|
TCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAAC > NC_000913/1779372‑1779550
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTTCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGA > NC_000913/1779370‑1779554
|
TTTCACCCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCT < SRR4302536.1261830/94‑1 (MQ=60)
TCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGC < SRR4302536.6687862/94‑1 (MQ=60)
cacccccacCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCT < SRR4302536.4715045/85‑1 (MQ=60)
CACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTA > SRR4302536.1040066/1‑94 (MQ=60)
ATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCG > SRR4302536.6092586/1‑94 (MQ=60)
CTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGCCAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTT < SRR4302536.3482400/94‑1 (MQ=60)
CTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTT < SRR4302536.2270535/94‑1 (MQ=60)
TCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTG > SRR4302536.521980/1‑94 (MQ=60)
CCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGC < SRR4302536.2568784/94‑1 (MQ=60)
CCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGC < SRR4302536.1362749/94‑1 (MQ=60)
CTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCA > SRR4302536.2873679/1‑94 (MQ=60)
CTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCA > SRR4302536.2002420/1‑94 (MQ=60)
GTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACT < SRR4302536.5332380/94‑1 (MQ=60)
GTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACT < SRR4302536.6448454/94‑1 (MQ=60)
TAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTG > SRR4302536.5439741/1‑94 (MQ=60)
TAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTG > SRR4302536.5760050/1‑94 (MQ=60)
AAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTG < SRR4302536.4747846/94‑1 (MQ=60)
AAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGG > SRR4302536.2428291/1‑94 (MQ=60)
AAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGG > SRR4302536.1118820/1‑94 (MQ=60)
AAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGG > SRR4302536.3192659/1‑94 (MQ=60)
AAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGG > SRR4302536.1928070/1‑94 (MQ=60)
AACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGT > SRR4302536.1695615/1‑94 (MQ=60)
AACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGT < SRR4302536.2590860/94‑1 (MQ=60)
ACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTC < SRR4302536.339508/94‑1 (MQ=60)
ACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATGGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTC < SRR4302536.4242908/94‑1 (MQ=60)
CAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATG < SRR4302536.6636033/94‑1 (MQ=60)
AGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGG < SRR4302536.11388/94‑1 (MQ=60)
AGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGG < SRR4302536.3228531/94‑1 (MQ=60)
AGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGG < SRR4302536.91194/94‑1 (MQ=60)
GGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATTGCAC > SRR4302536.5302174/1‑94 (MQ=60)
GGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCAC < SRR4302536.5617544/94‑1 (MQ=60)
GGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCAC > SRR4302536.6472637/1‑94 (MQ=60)
GGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCAC > SRR4302536.5302175/1‑94 (MQ=60)
TGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACG > SRR4302536.895464/1‑94 (MQ=60)
GAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGA < SRR4302536.1764525/94‑1 (MQ=60)
GAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTGGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGA < SRR4302536.1353700/94‑1 (MQ=60)
AAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAG > SRR4302536.6526320/1‑94 (MQ=60)
GGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCC < SRR4302536.4829820/94‑1 (MQ=60)
GGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCC < SRR4302536.4585087/94‑1 (MQ=60)
GGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCG < SRR4302536.5152107/94‑1 (MQ=60)
GGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCG > SRR4302536.5441748/1‑94 (MQ=60)
agaaaaacgaatgtcggataaaaattttgaggcatttgtgggggggGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGG < SRR4302536.4410719/48‑1 (MQ=60)
AGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGG > SRR4302536.6337977/1‑94 (MQ=60)
AGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGG > SRR4302536.1150471/1‑94 (MQ=60)
CATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGGGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCT > SRR4302536.4028683/1‑94 (MQ=60)
CATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCT < SRR4302536.5664486/94‑1 (MQ=60)
CATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCT > SRR4302536.1616275/1‑94 (MQ=60)
ATAACGCATGTCGGATGACAAATCTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAACGTTGCCGCACTGGTCATGGCACCAGCCGGGATG > SRR4302536.4371048/1‑94 (MQ=60)
AACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGA > SRR4302536.3227648/1‑94 (MQ=60)
ACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGAT < SRR4302536.1297128/94‑1 (MQ=60)
ACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGAT > SRR4302536.6094140/1‑94 (MQ=60)
GCGTGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGT > SRR4302536.4329419/1‑94 (MQ=60)
GCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGT < SRR4302536.4537044/94‑1 (MQ=60)
GCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGT > SRR4302536.2360236/1‑94 (MQ=60)
CATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTC > SRR4302536.2710471/1‑94 (MQ=60)
TGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCT < SRR4302536.3335476/94‑1 (MQ=60)
TGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCT < SRR4302536.3177974/94‑1 (MQ=60)
GTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTG < SRR4302536.3575281/94‑1 (MQ=60)
CTGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCAGGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGT < SRR4302536.5396124/94‑1 (MQ=60)
CGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGT < SRR4302536.5395953/94‑1 (MQ=60)
CGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGT > SRR4302536.4245190/1‑94 (MQ=60)
GGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTG > SRR4302536.1803622/1‑94 (MQ=60)
GGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTG > SRR4302536.2946054/1‑94 (MQ=60)
GGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTG < SRR4302536.6259830/94‑1 (MQ=60)
GGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTG > SRR4302536.4504975/1‑94 (MQ=60)
GGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGCGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTG > SRR4302536.862114/1‑94 (MQ=60)
GATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGA > SRR4302536.4133418/1‑94 (MQ=60)
GATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGA < SRR4302536.3159185/94‑1 (MQ=60)
ATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCTCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGAT < SRR4302536.1376604/94‑1 (MQ=60)
ATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGAT < SRR4302536.1207496/94‑1 (MQ=60)
ATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGAT < SRR4302536.5676695/94‑1 (MQ=60)
TGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATA < SRR4302536.5577261/94‑1 (MQ=60)
TGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATA > SRR4302536.3619648/1‑94 (MQ=60)
TGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATA < SRR4302536.6682544/94‑1 (MQ=60)
GACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAG < SRR4302536.5043857/94‑1 (MQ=60)
AAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAAC < SRR4302536.2791507/94‑1 (MQ=60)
AATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACG < SRR4302536.4325215/94‑1 (MQ=60)
AATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACG > SRR4302536.3879122/1‑94 (MQ=60)
AATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACG < SRR4302536.1603865/94‑1 (MQ=60)
ATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTGCTGGTGATAGAACGC > SRR4302536.5039/1‑94 (MQ=60)
TTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGG < SRR4302536.6011182/94‑1 (MQ=60)
TTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGG > SRR4302536.3452238/1‑94 (MQ=60)
TTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGG < SRR4302536.5530051/94‑1 (MQ=60)
TGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGGGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGGGATAGAACGCGGG > SRR4302536.6118260/1‑94 (MQ=60)
TGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGC < SRR4302536.6375024/94‑1 (MQ=60)
GATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGAGATAGAACGtgtca > SRR4302536.3490463/1‑89 (MQ=60)
GATGCCATTGTGCTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGCTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATCGCCTGGTGATAGAACGGGGCG > SRR4302536.6350230/1‑94 (MQ=60)
ATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGA > SRR4302536.998160/1‑94 (MQ=60)
ATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGA < SRR4302536.5301452/94‑1 (MQ=60)
ATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGA > SRR4302536.1600263/1‑94 (MQ=60)
TGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGAC < SRR4302536.86575/94‑1 (MQ=60)
gcttTTGTGGTCGGTGCGGGGGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACA < SRR4302536.5700236/90‑1 (MQ=60)
GCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACA < SRR4302536.1906002/94‑1 (MQ=60)
GCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACA < SRR4302536.1065455/94‑1 (MQ=60)
CCATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAG < SRR4302536.1423035/94‑1 (MQ=60)
CATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGT > SRR4302536.5712661/1‑94 (MQ=60)
CATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGT > SRR4302536.392735/1‑94 (MQ=60)
ATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTG > SRR4302536.130733/1‑94 (MQ=60)
ATTGTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTG > SRR4302536.789745/1‑94 (MQ=60)
GTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCG < SRR4302536.2730855/94‑1 (MQ=60)
GTGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCA < SRR4302536.3759254/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGG < SRR4302536.5380140/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGG > SRR4302536.2182788/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGG > SRR4302536.4127259/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATACAACGCGGCGACAGCGCCGG > SRR4302536.6078385/1‑94 (MQ=60)
GGGTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGG < SRR4302536.3542922/94‑1 (MQ=60)
GTCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGAT < SRR4302536.810762/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGAT < SRR4302536.4524811/94‑1 (MQ=60)
TCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGGGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATG < SRR4302536.2687283/94‑1 (MQ=60)
TCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATG < SRR4302536.2060260/94‑1 (MQ=60)
TCGGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATG > SRR4302536.5807635/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACATTGCCGGATGTA > SRR4302536.1045794/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTA > SRR4302536.4544559/1‑94 (MQ=60)
TGCGGGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCGCTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGGGCCGGATGTAAA < SRR4302536.4168643/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACA < SRR4302536.278474/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATG > SRR4302536.1735834/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATG < SRR4302536.1155690/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGTAGCGTTGCCGCTCTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGA > SRR4302536.6741524/1‑94 (MQ=60)
|
TTTCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGA > NC_000913/1779370‑1779554
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
