Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,903,264 |
T→C |
L147P (CTT→CCT) |
b1820 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,903,264 | 0 | T | C | 100.0%
| 697.4
/ NA
| 210 | L147P (CTT→CCT) | b1820 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (73/137); total (73/137) |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
CGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCT > NC_000913/1903174‑1903353
|
cGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCtc < 2:2435952/93‑1 (MQ=255)
ggAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCctct < 1:4703120/93‑1 (MQ=255)
ggAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCctct < 2:6032712/93‑1 (MQ=255)
gAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCtctc > 1:5557004/1‑93 (MQ=255)
gAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCtctc < 2:6344284/93‑1 (MQ=255)
gAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCtctc > 2:1132453/1‑93 (MQ=255)
aGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGt > 2:4518997/1‑93 (MQ=255)
gATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGtt > 2:5191993/1‑93 (MQ=255)
tGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTc < 1:5901949/93‑1 (MQ=255)
ggCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCa > 2:3791263/1‑93 (MQ=255)
ggCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCa > 1:1341479/1‑93 (MQ=255)
ggCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCa > 1:6297103/1‑93 (MQ=255)
gCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCaa > 1:3044148/1‑93 (MQ=255)
cGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAAc < 2:177645/93‑1 (MQ=255)
gtgtTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACt < 2:4282282/93‑1 (MQ=255)
ttaggTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAACCTGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCa < 1:1147399/90‑1 (MQ=255)
ttGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCaa > 2:2177274/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCaa > 2:6483059/1‑93 (MQ=255)
tGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAAt > 1:1023022/1‑93 (MQ=255)
tGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAAt < 1:2425363/93‑1 (MQ=255)
ggTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATa < 1:1558113/93‑1 (MQ=255)
ggTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATa > 2:6280193/1‑93 (MQ=255)
gTGATGCAATAAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAAtca > 1:819525/1‑91 (MQ=255)
aTGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATGTCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGtt > 2:3555513/1‑93 (MQ=255)
tGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTa < 2:5605482/93‑1 (MQ=255)
tGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTa < 2:621375/93‑1 (MQ=255)
gCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGATATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTAt < 1:1920308/93‑1 (MQ=255)
cAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATg < 2:4997630/93‑1 (MQ=255)
cAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATg < 2:2881382/93‑1 (MQ=255)
aaTTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGa < 1:4822831/93‑1 (MQ=255)
tAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAAtt < 1:4024134/93‑1 (MQ=255)
gAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTa < 2:6540149/93‑1 (MQ=255)
aaCAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAg > 1:5471822/1‑93 (MQ=255)
gCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCaa > 1:6371845/1‑93 (MQ=255)
gCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCaa > 1:392020/1‑93 (MQ=255)
gCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCaa > 2:6090484/1‑93 (MQ=255)
gCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCaa > 1:6190277/1‑93 (MQ=255)
cGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCaaa < 1:4922310/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGc < 2:1648064/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGc < 2:1672457/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGc < 1:3470228/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTAt < 2:1843245/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTAt > 1:5199399/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTAt < 2:5724805/93‑1 (MQ=255)
cTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATg < 2:5557631/93‑1 (MQ=255)
cTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATg > 2:2794345/1‑93 (MQ=255)
cTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATg > 1:3608695/1‑93 (MQ=255)
cTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATg < 1:2329874/93‑1 (MQ=255)
tGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGt < 2:3853011/93‑1 (MQ=255)
tGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGt < 1:1313654/93‑1 (MQ=255)
gTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGtt < 1:5358752/93‑1 (MQ=255)
gTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGtt > 2:3720077/1‑93 (MQ=255)
gTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGtt > 1:2799643/1‑93 (MQ=255)
ttAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGttt < 1:2396869/93‑1 (MQ=255)
tAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTa < 2:2036113/93‑1 (MQ=255)
aaTCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAg < 1:3277812/93‑1 (MQ=255)
aTCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAgt > 2:5439525/1‑93 (MQ=255)
aTCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAgt < 2:6716314/93‑1 (MQ=255)
gcgTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTAt < 2:2663735/93‑1 (MQ=255)
ttCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTAtttt < 2:6486427/93‑1 (MQ=255)
cGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTta > 1:3017408/1‑93 (MQ=255)
aaTATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTtaata > 2:1478553/1‑93 (MQ=255)
aaTATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTtaata < 1:4872613/93‑1 (MQ=255)
aaTATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTtaata < 2:258734/93‑1 (MQ=255)
aaTATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTtaata < 1:6506618/93‑1 (MQ=255)
atatCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTtaataa > 2:2099814/1‑93 (MQ=255)
atatCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTtaataa < 1:200729/93‑1 (MQ=255)
atatCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTtaataa < 1:6578424/93‑1 (MQ=255)
tatCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTaataat < 1:915876/93‑1 (MQ=255)
tatCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTaataat < 1:6034615/93‑1 (MQ=255)
atCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATc < 1:4074714/93‑1 (MQ=255)
atCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATc < 1:3791263/93‑1 (MQ=255)
tCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCa < 2:3311386/93‑1 (MQ=255)
tCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCa < 2:292195/93‑1 (MQ=255)
gacgaTCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGa < 2:2314636/93‑1 (MQ=255)
acgaTCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGAc < 2:400248/93‑1 (MQ=255)
cgaTCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACa < 1:5453657/93‑1 (MQ=255)
cgaTCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACa < 1:2591070/93‑1 (MQ=255)
cgaTCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACa < 2:5904336/93‑1 (MQ=255)
gaTCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACAt < 2:1061079/93‑1 (MQ=255)
gaTCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACAt < 2:5060509/93‑1 (MQ=255)
gaTCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACAt > 1:4506734/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGAACAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATa > 1:6532261/1‑93 (MQ=255)
cTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGc < 2:4785364/93‑1 (MQ=255)
cTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGc < 2:5225226/93‑1 (MQ=255)
ggAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCtt < 1:4214133/93‑1 (MQ=255)
gAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTa < 1:4852999/93‑1 (MQ=255)
aaaaaaTTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAg < 1:5247015/93‑1 (MQ=255)
aaaaaaTTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAg < 2:2245226/93‑1 (MQ=255)
aaaaTTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGc < 1:5405836/93‑1 (MQ=255)
aaaaTTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGc < 2:2867043/93‑1 (MQ=255)
aaTTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCta > 2:6302521/1‑93 (MQ=255)
tttATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCtata > 1:2080596/1‑93 (MQ=255)
ttATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTatat > 1:459604/1‑93 (MQ=255)
ttATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTatat < 2:128034/93‑1 (MQ=255)
ttATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTatat < 1:1677228/93‑1 (MQ=255)
tataAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATAtt < 2:1926564/93‑1 (MQ=255)
taAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTAc < 2:5289276/93‑1 (MQ=255)
aGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACct > 1:5764968/1‑93 (MQ=255)
aGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACct < 1:2530177/93‑1 (MQ=255)
|
CGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCT > NC_000913/1903174‑1903353
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTT > NC_000913/1903171‑1903356
|
TGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCC < SRR4302536.2379994/94‑1 (MQ=60)
TGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCC > SRR4302536.6786631/1‑94 (MQ=60)
TGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCC < SRR4302536.5393029/94‑1 (MQ=60)
TCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTC < SRR4302536.225980/94‑1 (MQ=60)
GGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTC < SRR4302536.4844547/94‑1 (MQ=60)
GGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTC < SRR4302536.210152/94‑1 (MQ=60)
GGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTC > SRR4302536.5722507/1‑94 (MQ=60)
AAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGT > SRR4302536.4478152/1‑94 (MQ=60)
AAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGT > SRR4302536.5647428/1‑94 (MQ=60)
GATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTT < SRR4302536.4134073/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTC > SRR4302536.534536/1‑94 (MQ=60)
TGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCA < SRR4302536.6077708/94‑1 (MQ=60)
TGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCA > SRR4302536.6484690/1‑94 (MQ=60)
TGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCA > SRR4302536.1381476/1‑94 (MQ=60)
GGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAA > SRR4302536.3133618/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCA < SRR4302536.5551277/94‑1 (MQ=60)
ttaGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAACCTGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAA < SRR4302536.1181903/91‑1 (MQ=60)
GTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAA > SRR4302536.3249132/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAA < SRR4302536.5447564/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAAT > SRR4302536.1053316/1‑94 (MQ=60)
TGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATA < SRR4302536.2498675/94‑1 (MQ=60)
GGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAA < SRR4302536.1603869/94‑1 (MQ=60)
GGTGATGCAATAAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATCA > SRR4302536.843644/1‑94 (MQ=60)
GTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAG < SRR4302536.3279313/94‑1 (MQ=60)
TGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGT < SRR4302536.4854875/94‑1 (MQ=60)
ATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTA > SRR4302536.4695500/1‑94 (MQ=60)
GCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGATATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATG < SRR4302536.1978086/94‑1 (MQ=60)
CAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGA < SRR4302536.6057632/94‑1 (MQ=60)
AATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAA < SRR4302536.4967972/94‑1 (MQ=60)
TTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATT < SRR4302536.845417/94‑1 (MQ=60)
TTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATT < SRR4302536.1666127/94‑1 (MQ=60)
TAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTT < SRR4302536.4143518/94‑1 (MQ=60)
GAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAG < SRR4302536.2450083/94‑1 (MQ=60)
GAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAG > SRR4302536.6134861/1‑94 (MQ=60)
GAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAG > SRR4302536.5635287/1‑94 (MQ=60)
AACAGCGTCGGCTGTTAATCCGTGTTCGAAATATCGACGATGTGGGAAAAACTTATAAGCCTCCCGTTTCGACTCAATTAGCTATTTATTTAGC > SRR4302536.4827358/1‑94 (MQ=40)
AACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGC < SRR4302536.3514563/94‑1 (MQ=60)
AGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAA > SRR4302536.4975456/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAA > SRR4302536.6374661/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAA > SRR4302536.6561733/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAA > SRR4302536.402373/1‑94 (MQ=60)
GCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAA > SRR4302536.4835709/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAG < SRR4302536.5070229/94‑1 (MQ=60)
TCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCT < SRR4302536.3573654/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTAT > SRR4302536.5354406/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATG > SRR4302536.3716592/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATG < SRR4302536.5616883/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATG < SRR4302536.421975/94‑1 (MQ=60)
CTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGT < SRR4302536.2400568/94‑1 (MQ=60)
TGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTGAACTCAATAAGGTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTT > SRR4302536.1374844/1‑94 (MQ=60)
TGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTT < SRR4302536.1352869/94‑1 (MQ=60)
TGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTT > SRR4302536.2882679/1‑94 (MQ=60)
GTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTT < SRR4302536.5518642/94‑1 (MQ=60)
GTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTT > SRR4302536.3972363/1‑94 (MQ=60)
TTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTA < SRR4302536.2469428/94‑1 (MQ=60)
TTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTA < SRR4302536.2046373/94‑1 (MQ=60)
TAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAG < SRR4302536.1906315/94‑1 (MQ=60)
TAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAG < SRR4302536.378857/94‑1 (MQ=60)
AATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGT < SRR4302536.3374153/94‑1 (MQ=60)
AATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGT > SRR4302536.5758100/1‑94 (MQ=60)
ATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTG < SRR4302536.2658332/94‑1 (MQ=60)
TCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGT < SRR4302536.1281893/94‑1 (MQ=60)
CGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTAT < SRR4302536.6769767/94‑1 (MQ=60)
CGTTCGAAATATCGACGATCTGTAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTAATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTT < SRR4302536.2290355/94‑1 (MQ=60)
CGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTT < SRR4302536.5047141/94‑1 (MQ=60)
GTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTT < SRR4302536.670969/94‑1 (MQ=60)
TCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCCATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTA > SRR4302536.5470680/1‑94 (MQ=60)
TCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTA > SRR4302536.3106077/1‑94 (MQ=60)
AATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAA > SRR4302536.6520464/1‑94 (MQ=60)
AATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAA > SRR4302536.2480354/1‑94 (MQ=60)
AATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAA < SRR4302536.5019205/94‑1 (MQ=60)
AATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAA < SRR4302536.6700531/94‑1 (MQ=60)
ATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAAT < SRR4302536.206021/94‑1 (MQ=60)
ATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAAT < SRR4302536.6774192/94‑1 (MQ=60)
TATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATC < SRR4302536.814222/94‑1 (MQ=60)
TATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATC < SRR4302536.6214568/94‑1 (MQ=60)
TATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATC < SRR4302536.942878/94‑1 (MQ=60)
ATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCA < SRR4302536.486373/94‑1 (MQ=60)
ATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCA < SRR4302536.3904368/94‑1 (MQ=60)
ATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCA < SRR4302536.4195476/94‑1 (MQ=60)
ATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATCTTTAATAATCA < SRR4302536.4195273/94‑1 (MQ=60)
TCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAG < SRR4302536.2524461/94‑1 (MQ=60)
GACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGAC > SRR4302536.659379/1‑94 (MQ=60)
CGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACAT < SRR4302536.6403320/94‑1 (MQ=60)
CGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACAT > SRR4302536.4641946/1‑94 (MQ=60)
CGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACAT < SRR4302536.2668872/94‑1 (MQ=60)
CGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACAT < SRR4302536.5616762/94‑1 (MQ=60)
CGATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACAT < SRR4302536.1015251/94‑1 (MQ=60)
GATCTGGAACAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATA > SRR4302536.6726838/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAG < SRR4302536.4156673/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCT < SRR4302536.947834/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCT < SRR4302536.257159/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCT > SRR4302536.5245932/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCT > SRR4302536.1143463/1‑94 (MQ=60)
CTGAAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCT < SRR4302536.5000201/94‑1 (MQ=60)
TGGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTT < SRR4302536.3031578/94‑1 (MQ=60)
GGAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTA < SRR4302536.4339439/94‑1 (MQ=60)
GAAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAG < SRR4302536.4999026/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGG < SRR4302536.5403379/94‑1 (MQ=60)
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AATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTAT < SRR4302536.1410679/94‑1 (MQ=60)
ATTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATA > SRR4302536.2143237/1‑94 (MQ=60)
TTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATAT > SRR4302536.471619/1‑94 (MQ=60)
TTTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATAT < SRR4302536.5766/94‑1 (MQ=60)
TTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATT < SRR4302536.6223137/94‑1 (MQ=60)
TTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATT < SRR4302536.3125788/94‑1 (MQ=60)
TTATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATT < SRR4302536.1725853/94‑1 (MQ=60)
ATGAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTAC > SRR4302536.6605796/1‑94 (MQ=60)
ATAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTAC > SRR4302536.2881902/1‑94 (MQ=60)
TAAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACC > SRR4302536.3617466/1‑94 (MQ=60)
AAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCT > SRR4302536.5936481/1‑94 (MQ=60)
AAGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCT < SRR4302536.5613927/94‑1 (MQ=60)
AGCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTC < SRR4302536.2606433/94‑1 (MQ=60)
GCCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCT < SRR4302536.909607/94‑1 (MQ=60)
CCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTT > SRR4302536.2119188/1‑94 (MQ=60)
CCTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTT > SRR4302536.3631977/1‑94 (MQ=60)
|
TGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTT > NC_000913/1903171‑1903356
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
