Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,973,993 |
T→C |
E96G (GAA→GGA) |
motB ← |
MotB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,973,993 | 0 | T | C | 100.0%
| 628.7
/ NA
| 192 | E96G (GAA→GGA) | motB | MotB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (99/93); total (99/93) |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
ATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGC > NC_000913/1973903‑1974081
|
tCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTcccc < 2:3948527/93‑1 (MQ=255)
cAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCcccc > 1:4967156/1‑93 (MQ=255)
aaCTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTcccccc < 2:5531488/93‑1 (MQ=255)
aaCTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTcccccc < 1:2055778/93‑1 (MQ=255)
aaCTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTcccccc < 2:1244521/93‑1 (MQ=255)
aaCTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTcccccc > 1:6548586/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTCGAGATCCCCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCt < 1:6094079/93‑1 (MQ=255)
aCTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCt < 1:4729965/93‑1 (MQ=255)
aCTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCt < 2:5742986/93‑1 (MQ=255)
aCTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCt < 2:1091078/93‑1 (MQ=255)
cTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTg < 2:151860/93‑1 (MQ=255)
ggTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGc > 1:4379163/1‑93 (MQ=255)
ggTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGc > 1:1909911/1‑93 (MQ=255)
cGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCttt < 2:3300979/93‑1 (MQ=255)
agaTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTgg < 2:4860692/93‑1 (MQ=255)
aTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGgt < 1:795771/93‑1 (MQ=255)
aTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGgt < 1:3748128/93‑1 (MQ=255)
aTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGgt > 2:567941/1‑93 (MQ=255)
tCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGgtg < 2:1729947/93‑1 (MQ=255)
tCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGgtg < 2:1565779/93‑1 (MQ=255)
aCCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTa > 2:2266115/1‑93 (MQ=255)
aCCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTa > 2:5345453/1‑93 (MQ=255)
cccGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAat < 2:6287412/93‑1 (MQ=255)
ccGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatc < 1:244300/93‑1 (MQ=255)
cGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatca < 1:3783175/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAAtcatca > 2:4343534/1‑93 (MQ=255)
aTTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcac > 2:3065460/1‑93 (MQ=255)
aTTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcac > 2:537425/1‑93 (MQ=255)
aTTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcac > 2:6079563/1‑93 (MQ=255)
tCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcaccac > 1:937222/1‑93 (MQ=255)
tCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcaccac < 1:1012324/93‑1 (MQ=255)
tCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcaccac > 1:1725719/1‑93 (MQ=255)
tCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcaccac < 1:3402828/93‑1 (MQ=255)
tCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcaccac < 1:2721904/93‑1 (MQ=255)
cGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAccg < 1:5532343/93‑1 (MQ=255)
cGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAccg > 2:4454727/1‑93 (MQ=255)
gCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAccgc < 1:4898110/93‑1 (MQ=255)
gCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAccgc < 2:2695345/93‑1 (MQ=255)
aTCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCgg > 1:6615140/1‑93 (MQ=255)
gACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGaa < 2:2479659/93‑1 (MQ=255)
gACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGaa > 1:2297153/1‑93 (MQ=255)
aCTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAt > 2:4158325/1‑93 (MQ=255)
aCTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAt > 1:4677754/1‑93 (MQ=255)
aCTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAt > 1:90096/1‑93 (MQ=255)
cTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAtt > 2:4532956/1‑93 (MQ=255)
tttGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTg > 1:145910/1‑93 (MQ=255)
ttGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTGCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTgg < 2:2195493/93‑1 (MQ=255)
gCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGc > 1:1155159/1‑93 (MQ=255)
gCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGc < 1:126520/93‑1 (MQ=255)
gCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATGCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGc > 2:4695213/1‑93 (MQ=255)
gCTCCATGCGGTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGc < 2:3859419/93‑1 (MQ=255)
cTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCt > 2:5628013/1‑93 (MQ=255)
tCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCtt > 2:1003987/1‑93 (MQ=255)
cATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTc > 1:1381760/1‑93 (MQ=255)
cATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTc < 2:1670859/93‑1 (MQ=255)
cATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTc < 1:5161638/93‑1 (MQ=255)
aTGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCa > 1:4093856/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCAc < 2:5260281/93‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACt < 1:2501771/93‑1 (MQ=255)
cGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTa > 1:359929/1‑93 (MQ=255)
gTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTAt < 2:5808019/93‑1 (MQ=255)
gTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTAt < 1:2138473/93‑1 (MQ=255)
gTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTAt > 2:1748522/1‑93 (MQ=255)
ttttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTAtt < 2:6436527/93‑1 (MQ=255)
tttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTa < 1:2300041/93‑1 (MQ=255)
tttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTa > 1:327368/1‑93 (MQ=255)
ttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAg < 2:1456074/93‑1 (MQ=255)
tttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGa < 1:5057156/93‑1 (MQ=255)
ttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGaa < 1:6048772/93‑1 (MQ=255)
ttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGaa > 2:407153/1‑93 (MQ=255)
aGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATg < 1:5680048/93‑1 (MQ=255)
aGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATg < 2:2158156/93‑1 (MQ=255)
aGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATg > 2:3770372/1‑93 (MQ=255)
gCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGc > 2:5039667/1‑93 (MQ=255)
gCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGc < 1:2944108/93‑1 (MQ=255)
gCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGc < 1:4489480/93‑1 (MQ=255)
ctctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCg > 2:2906932/1‑93 (MQ=255)
ctctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCg > 2:1192604/1‑93 (MQ=255)
tctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGa < 1:3108619/93‑1 (MQ=255)
ctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAt < 2:3902097/93‑1 (MQ=255)
ctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAt > 2:2575437/1‑93 (MQ=255)
ttCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATc < 1:2799294/93‑1 (MQ=255)
aTGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgccg > 1:686081/1‑93 (MQ=255)
aTGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgccg > 1:2844151/1‑93 (MQ=255)
aTGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgccg > 1:6149469/1‑93 (MQ=255)
aTGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgccc > 2:3461446/1‑92 (MQ=255)
tGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgccgc > 1:2005990/1‑93 (MQ=255)
ggCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTa > 1:159302/1‑93 (MQ=255)
tgctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAcc > 2:5965438/1‑93 (MQ=255)
tgctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAcc > 1:711906/1‑93 (MQ=255)
tgctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAcc > 1:3868824/1‑93 (MQ=255)
gctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCg > 2:3632969/1‑93 (MQ=255)
gctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCg < 2:6008204/93‑1 (MQ=255)
ctTATTCGCTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGc < 1:1540662/93‑1 (MQ=255)
ctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGc > 2:1897233/1‑93 (MQ=255)
ctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGc < 2:2367961/93‑1 (MQ=255)
ttATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAACGCa > 1:2053410/1‑93 (MQ=255)
tATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAg > 2:4075929/1‑93 (MQ=255)
tATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAg > 2:2464697/1‑93 (MQ=255)
cACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGc < 2:203805/93‑1 (MQ=255)
|
ATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGC > NC_000913/1973903‑1974081
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAGT > NC_000913/1973900‑1974085
|
TCTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTC < SRR4302536.4998891/94‑1 (MQ=60)
CTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGTCTGCTTATTCACTCC > SRR4302536.6273367/1‑94 (MQ=60)
CTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCC > SRR4302536.4604952/1‑94 (MQ=60)
TATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCC > SRR4302536.2367625/1‑94 (MQ=60)
ATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCC > SRR4302536.708305/1‑94 (MQ=60)
TCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCC > SRR4302536.5116365/1‑94 (MQ=60)
CAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCC < SRR4302536.451091/94‑1 (MQ=60)
CAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCC > SRR4302536.6743585/1‑94 (MQ=60)
AACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCT < SRR4302536.2535928/94‑1 (MQ=60)
AACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCT < SRR4302536.3773481/94‑1 (MQ=60)
AACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCT < SRR4302536.2117684/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTCGAGATCCCCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTG < SRR4302536.6275798/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTG < SRR4302536.4872287/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGC < SRR4302536.6826119/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGC > SRR4302536.1967389/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGC > SRR4302536.4509914/1‑94 (MQ=60)
GGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCT < SRR4302536.4205115/94‑1 (MQ=60)
GTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTT < SRR4302536.5222884/94‑1 (MQ=60)
TAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGG < SRR4302536.5511718/94‑1 (MQ=60)
AGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGG < SRR4302536.3888899/94‑1 (MQ=60)
GATCACCCCGCAATTTACGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGGTGTTCGGCTGCTTATTAACTCCTCCCTGGCTTTGTGT > SRR4302536.723795/1‑94 (MQ=60)
ATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTG < SRR4302536.3860164/94‑1 (MQ=60)
ATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTG < SRR4302536.819081/94‑1 (MQ=60)
ACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTACTCCCTCCCCCCCGGCTTTGGGTGTAA > SRR4302536.1022798/1‑94 (MQ=60)
CCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCA < SRR4302536.250813/94‑1 (MQ=60)
CGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCAT < SRR4302536.3896055/94‑1 (MQ=60)
CGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCAT > SRR4302536.743785/1‑94 (MQ=60)
GCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATC < SRR4302536.1140078/94‑1 (MQ=60)
AATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCAC > SRR4302536.2117556/1‑94 (MQ=60)
TTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCA < SRR4302536.3679701/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAC > SRR4302536.964850/1‑94 (MQ=60)
TTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAC > SRR4302536.1775555/1‑94 (MQ=60)
TCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACC < SRR4302536.1042210/94‑1 (MQ=60)
TCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACC < SRR4302536.3504038/94‑1 (MQ=60)
TCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACC < SRR4302536.1311418/94‑1 (MQ=60)
TCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACC < SRR4302536.2803087/94‑1 (MQ=60)
CCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCG < SRR4302536.950397/94‑1 (MQ=60)
CGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGC < SRR4302536.5697266/94‑1 (MQ=60)
GCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCC > SRR4302536.5726086/1‑94 (MQ=60)
GCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCC < SRR4302536.5045416/94‑1 (MQ=60)
AATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGG < SRR4302536.5099312/94‑1 (MQ=60)
AATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGG > SRR4302536.6811827/1‑94 (MQ=60)
ATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGG > SRR4302536.1462435/1‑94 (MQ=60)
ATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGG > SRR4302536.2023976/1‑94 (MQ=60)
CGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAA > SRR4302536.2366859/1‑94 (MQ=60)
CGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAA < SRR4302536.6277374/94‑1 (MQ=60)
CGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAA < SRR4302536.2089778/94‑1 (MQ=60)
GACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAT > SRR4302536.4818425/1‑94 (MQ=60)
GACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAT > SRR4302536.92498/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTG > SRR4302536.149715/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTG < SRR4302536.2217376/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGG < SRR4302536.4399955/94‑1 (MQ=60)
TGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGC > SRR4302536.1189924/1‑94 (MQ=60)
GCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCT < SRR4302536.1626093/94‑1 (MQ=60)
GCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCT < SRR4302536.129864/94‑1 (MQ=60)
CTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTT < SRR4302536.5751153/94‑1 (MQ=60)
TCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTT > SRR4302536.1505624/1‑94 (MQ=60)
TCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTT < SRR4302536.2922913/94‑1 (MQ=60)
CCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTC > SRR4302536.1422925/1‑94 (MQ=60)
CATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCA < SRR4302536.5315643/94‑1 (MQ=60)
CATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCA > SRR4302536.4215244/1‑94 (MQ=60)
GCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTA > SRR4302536.369446/1‑94 (MQ=60)
GCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTA < SRR4302536.2577205/94‑1 (MQ=60)
GCGTTTTTTCAGCTCTTCAATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTA > SRR4302536.4800438/1‑94 (MQ=60)
GCGTTTTTTCAGCTCGTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACGCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGAGAATTGGGCTTTCACTA < SRR4302536.4883587/94‑1 (MQ=60)
GTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATT < SRR4302536.2202682/94‑1 (MQ=60)
TTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTA > SRR4302536.336062/1‑94 (MQ=60)
TTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAG < SRR4302536.2369833/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAG < SRR4302536.5143949/94‑1 (MQ=60)
TTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAA < SRR4302536.5208639/94‑1 (MQ=60)
TTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAA < SRR4302536.6229188/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTTGTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAAT < SRR4302536.557557/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAAT < SRR4302536.905894/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAAT < SRR4302536.1776744/94‑1 (MQ=60)
CAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTTGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGttatttgactattagaaatt > SRR4302536.3404545/1‑74 (MQ=60)
CAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATG > SRR4302536.3754257/1‑94 (MQ=60)
AGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTTGGCTTTCACTATTAGAAATGC > SRR4302536.257940/1‑94 (MQ=60)
AGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGC < SRR4302536.5848922/94‑1 (MQ=60)
AGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGC > SRR4302536.2199496/1‑94 (MQ=60)
GCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCG < SRR4302536.4624286/94‑1 (MQ=60)
GCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCG < SRR4302536.3030902/94‑1 (MQ=60)
CTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGA > SRR4302536.3356632/1‑94 (MQ=60)
TCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAT < SRR4302536.3199385/94‑1 (MQ=60)
TTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCG < SRR4302536.2882316/94‑1 (MQ=60)
TTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCG > SRR4302536.6239595/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCC > SRR4302536.2247639/1‑94 (MQ=60)
GATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCG > SRR4302536.6332687/1‑94 (MQ=60)
GATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCG > SRR4302536.1286331/1‑94 (MQ=60)
GATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCG > SRR4302536.706167/1‑94 (MQ=60)
GATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCG > SRR4302536.2928269/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGC > SRR4302536.2066353/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGC > SRR4302536.3148479/1‑94 (MQ=60)
TGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCC > SRR4302536.3026693/1‑94 (MQ=60)
GTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCC > SRR4302536.6652422/1‑94 (MQ=60)
TCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGTGATCGCCGCCCGT > SRR4302536.4837901/1‑94 (MQ=60)
CGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTA > SRR4302536.2471672/1‑94 (MQ=60)
CGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTA > SRR4302536.163424/1‑94 (MQ=60)
CGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTA < SRR4302536.171887/94‑1 (MQ=60)
CGGCTGCTGATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTA > SRR4302536.6802016/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACC > SRR4302536.3983935/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACC > SRR4302536.732706/1‑94 (MQ=60)
CGCTTATTCACCCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCG < SRR4302536.5030931/94‑1 (MQ=60)
GCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGC < SRR4302536.2828850/94‑1 (MQ=60)
CTTATTCGCTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCA < SRR4302536.1585960/94‑1 (MQ=60)
CTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCA > SRR4302536.6200753/1‑94 (MQ=60)
CTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAACGCA > SRR4302536.2115257/1‑94 (MQ=60)
ATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTC < SRR4302536.3934989/94‑1 (MQ=60)
ACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCA > SRR4302536.1738834/1‑94 (MQ=60)
ACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCA > SRR4302536.2181463/1‑94 (MQ=60)
CTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAG < SRR4302536.4921751/94‑1 (MQ=60)
TCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAGT > SRR4302536.5449584/1‑94 (MQ=60)
|
TCTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAGT > NC_000913/1973900‑1974085
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
