Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,071,598 |
A→G |
R680G (AGG→GGG) |
b2000 → |
outer membrane fluffing protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,071,598 | 0 | A | G | 100.0%
| 675.8
/ NA
| 208 | R680G (AGG→GGG) | b2000 | outer membrane fluffing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (87/121); total (87/121) |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAA > NC_000913/2071508‑2071687
|
gcGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACggg < 2:4673446/92‑1 (MQ=255)
cGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGc < 1:5085200/93‑1 (MQ=255)
cGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGc < 2:310671/93‑1 (MQ=255)
gggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTg > 1:6454550/1‑93 (MQ=255)
gggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTg > 1:1461780/1‑93 (MQ=255)
gggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTg > 2:4823233/1‑93 (MQ=255)
ggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGc > 2:4767354/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAGGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCa < 1:478090/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCa < 1:2837342/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAg < 1:4705622/93‑1 (MQ=255)
ggCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGc > 1:2543666/1‑93 (MQ=255)
aCCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGt > 1:4464439/1‑93 (MQ=255)
aCCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGt > 2:2691974/1‑93 (MQ=255)
ccAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTg > 2:1199576/1‑93 (MQ=255)
ccAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTg > 1:2960044/1‑93 (MQ=255)
aGCGGTAAGGGTATTCAGTTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGcc < 2:2853396/93‑1 (MQ=255)
gCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCt < 1:3591582/93‑1 (MQ=255)
gCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCt > 1:2289328/1‑93 (MQ=255)
cGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCtt < 1:5416154/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCttt > 1:181887/1‑93 (MQ=255)
gTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTa > 1:1948480/1‑93 (MQ=255)
tAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTaa > 1:5240548/1‑93 (MQ=255)
aaGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAac > 2:3333810/1‑93 (MQ=255)
aGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAact > 2:5447580/1‑93 (MQ=255)
gggTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAacta < 1:2923019/93‑1 (MQ=255)
ggTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTAAactac < 1:5557254/93‑1 (MQ=255)
ggTATTCAGGTGGGGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTTCCTTTAactac < 1:3194948/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTcc < 1:4195487/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTccc < 2:3489211/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCt < 1:1011790/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACCCCCt < 1:5936812/93‑1 (MQ=255)
tggtggAAGCCATTAACGGTGCCCCCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTTCTCCCTCAAcc < 1:3025284/93‑1 (MQ=255)
gtggAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCgg > 2:4592776/1‑93 (MQ=255)
gtggAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCgg < 2:2624198/93‑1 (MQ=255)
tggAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCggg > 1:3216239/1‑93 (MQ=255)
tggAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACAACTCCCTCAACCggg < 1:2383534/93‑1 (MQ=255)
gAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGAc < 2:4282516/93‑1 (MQ=255)
aGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAg < 2:1023272/93‑1 (MQ=255)
gCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGt < 2:4221629/93‑1 (MQ=255)
gCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGt > 2:6671069/1‑93 (MQ=255)
gCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGt > 2:2837071/1‑93 (MQ=255)
gCCATGAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAATGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGt < 2:3364704/93‑1 (MQ=255)
ccATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCGGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtg < 1:3719126/93‑1 (MQ=255)
ccATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtg < 1:1591869/93‑1 (MQ=255)
cATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtga < 1:5817602/93‑1 (MQ=255)
cATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtga > 1:6091724/1‑93 (MQ=255)
cATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtga < 2:4086621/93‑1 (MQ=255)
aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat > 1:5055534/1‑93 (MQ=255)
aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat < 2:5252696/93‑1 (MQ=255)
aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat > 2:5496925/1‑93 (MQ=255)
ttAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGTCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatg < 1:3874738/93‑1 (MQ=255)
ttAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatg > 2:438082/1‑93 (MQ=255)
ttAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatg > 2:6391554/1‑93 (MQ=255)
tAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatga > 1:4227961/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATgaga < 2:2911060/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATgaga < 1:1098621/93‑1 (MQ=255)
ggTGCCACCACGGAGGAAGGGTCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGc < 1:4004990/93‑1 (MQ=255)
ggTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGc > 2:1471954/1‑93 (MQ=255)
ggTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGc > 1:6257418/1‑93 (MQ=255)
ggTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGc < 1:2621418/93‑1 (MQ=255)
gTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCt < 2:6227266/93‑1 (MQ=255)
gCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTgg < 1:1189085/93‑1 (MQ=255)
ccacGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATc > 2:6713432/1‑93 (MQ=255)
ccacGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATc < 2:1633229/93‑1 (MQ=255)
caacGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGTCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTTCTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATc < 2:3422699/91‑1 (MQ=255)
acGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTg > 2:3823250/1‑93 (MQ=255)
acGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTg > 2:4034775/1‑93 (MQ=255)
acGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGATGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTg > 2:6546456/1‑93 (MQ=255)
cGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTgc < 2:2167517/93‑1 (MQ=255)
ggaggaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTgcg < 2:325184/93‑1 (MQ=255)
ggaggaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTgcg < 2:5721371/93‑1 (MQ=255)
gaggaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTgcgc < 1:3436146/93‑1 (MQ=255)
gaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGt < 1:3577883/93‑1 (MQ=255)
gaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGt > 2:5608459/1‑93 (MQ=255)
aGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGa > 2:5129269/1‑93 (MQ=255)
ggggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaa < 2:5404866/93‑1 (MQ=255)
ggggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaa > 1:2462402/1‑93 (MQ=255)
gggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaaa > 1:6594080/1‑93 (MQ=255)
gggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaaa > 2:5833012/1‑93 (MQ=255)
gtccTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaaaa < 1:639528/91‑1 (MQ=255)
ggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaaaa < 2:296645/93‑1 (MQ=255)
ggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaaaa < 1:5256734/93‑1 (MQ=255)
ggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaaaa > 1:5847724/1‑93 (MQ=255)
cTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGc < 2:5031161/93‑1 (MQ=255)
cTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGc > 1:1849331/1‑93 (MQ=255)
cTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTAATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGc < 1:1519666/93‑1 (MQ=255)
tttGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCt < 2:3964106/93‑1 (MQ=255)
tttGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCt < 2:5935962/93‑1 (MQ=255)
ttGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCtt < 1:231109/93‑1 (MQ=255)
tGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTa < 1:467449/93‑1 (MQ=255)
gTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTAt > 1:2137204/1‑93 (MQ=255)
ccAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCg < 2:4152057/93‑1 (MQ=255)
ccAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCg > 2:1955927/1‑93 (MQ=255)
cAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGt < 2:2511667/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGt < 2:5902749/93‑1 (MQ=255)
ggggAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGc > 1:1145396/1‑93 (MQ=255)
ggAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAg > 2:6509213/1‑93 (MQ=255)
ggAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAg < 1:5688339/93‑1 (MQ=255)
gAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGa > 1:132640/1‑93 (MQ=255)
aaCGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGaa < 1:721290/93‑1 (MQ=255)
|
TCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAA > NC_000913/2071508‑2071687
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGT > NC_000913/2071505‑2071689
|
GCGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACG < SRR4302536.990776/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGG > SRR4302536.6755331/1‑94 (MQ=60)
GTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGG < SRR4302536.6168889/94‑1 (MQ=60)
CGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCT < SRR4302536.5237346/94‑1 (MQ=60)
CGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCT < SRR4302536.1433388/94‑1 (MQ=60)
GGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTG > SRR4302536.6647308/1‑94 (MQ=60)
GGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTG > SRR4302536.1505026/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAGGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAG < SRR4302536.490540/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAG < SRR4302536.1126560/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAG < SRR4302536.745455/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAG < SRR4302536.2921309/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAG < SRR4302536.1254665/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGG < SRR4302536.4847125/94‑1 (MQ=60)
TGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGC > SRR4302536.2620287/1‑94 (MQ=60)
GGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCC > SRR4302536.5014572/1‑94 (MQ=60)
GCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCG < SRR4302536.329327/94‑1 (MQ=60)
GACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGT > SRR4302536.4598569/1‑94 (MQ=60)
ACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTG > SRR4302536.3047233/1‑94 (MQ=60)
ACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTG < SRR4302536.2937188/94‑1 (MQ=60)
AGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCT > SRR4302536.2358765/1‑94 (MQ=60)
GCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTT < SRR4302536.3699015/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTT < SRR4302536.5578030/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTT > SRR4302536.186701/1‑94 (MQ=60)
GGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTA > SRR4302536.2007070/1‑94 (MQ=60)
GGTAAGGGAATTCAGGCGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGTAGGGGCCTTTGTACAGAGGAACAGGCTGCAGGGCGGTGCCTTTA > SRR4302536.5877551/1‑94 (MQ=60)
GTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAA > SRR4302536.5396688/1‑94 (MQ=60)
AAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACT > SRR4302536.3612807/1‑94 (MQ=60)
GGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTAC < SRR4302536.3009265/94‑1 (MQ=60)
GGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACT < SRR4302536.662152/94‑1 (MQ=60)
GGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTAAACTACT < SRR4302536.5722760/94‑1 (MQ=60)
GGTATTCAGGTGGGGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTTCCTTTAACTACT < SRR4302536.3288602/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCC < SRR4302536.4320178/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCT > SRR4302536.5482371/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTC < SRR4302536.1041659/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACCCCCTC < SRR4302536.6113652/94‑1 (MQ=60)
AGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAA > SRR4302536.571929/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCCCCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTTCTCCCTCAACCG < SRR4302536.3114169/94‑1 (MQ=60)
GTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGG > SRR4302536.3310569/1‑94 (MQ=60)
GTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGG > SRR4302536.3225129/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACAACTCCCTCAACCGGGA < SRR4302536.2455724/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGAC > SRR4302536.1945741/1‑94 (MQ=60)
GAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACA < SRR4302536.5957764/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACA < SRR4302536.3387030/94‑1 (MQ=60)
GCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCCTTGGCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAAacgtgcccgtg > SRR4302536.6669142/1‑83 (MQ=60)
CCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCGGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGA < SRR4302536.3830293/94‑1 (MQ=60)
CCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGA > SRR4302536.6273387/1‑94 (MQ=60)
CCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGA < SRR4302536.1638414/94‑1 (MQ=60)
CATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGAT < SRR4302536.404492/94‑1 (MQ=60)
CATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGAT < SRR4302536.2562140/94‑1 (MQ=60)
CATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGAT > SRR4302536.5206979/1‑94 (MQ=60)
CATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGAT < SRR4302536.5990899/94‑1 (MQ=60)
CATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGAT > SRR4302536.6509623/1‑94 (MQ=60)
ATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATG > SRR4302536.6254837/1‑94 (MQ=60)
ATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATG > SRR4302536.2653325/1‑94 (MQ=60)
TTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGTCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGA < SRR4302536.3989993/94‑1 (MQ=60)
TTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGA > SRR4302536.4353760/1‑94 (MQ=60)
TAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAG < SRR4302536.2521956/94‑1 (MQ=60)
agcgtggCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTCCTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAG < SRR4302536.6101254/87‑1 (MQ=60)
ACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAG < SRR4302536.6008003/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAG > SRR4302536.2524477/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAG < SRR4302536.1131566/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGC > SRR4302536.6443842/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGC < SRR4302536.4953791/94‑1 (MQ=60)
GGTGCCACCACGGAGGAAGGGTCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCT < SRR4302536.4123834/94‑1 (MQ=60)
GGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCT < SRR4302536.2700050/94‑1 (MQ=60)
GGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCT < SRR4302536.6360836/94‑1 (MQ=60)
TGCCACCACTGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGG > SRR4302536.6709493/1‑94 (MQ=60)
GCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTTGT < SRR4302536.4332413/94‑1 (MQ=60)
GCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGT < SRR4302536.1224843/94‑1 (MQ=60)
CCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGTAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTCCTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTA < SRR4302536.317325/94‑1 (MQ=60)
ACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCTGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGCGATGAGAGCTGGTATC > SRR4302536.2346846/1‑94 (MQ=60)
CCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCT < SRR4302536.3067447/94‑1 (MQ=60)
ACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGC < SRR4302536.2411691/94‑1 (MQ=60)
CGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCG > SRR4302536.1898828/1‑94 (MQ=60)
GAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCA < SRR4302536.3538450/94‑1 (MQ=60)
GAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGGATCTGAGCA > SRR4302536.1858596/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGGGGCCTTTGTGCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTGCTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAG < SRR4302536.4319565/94‑1 (MQ=60)
AGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAG > SRR4302536.5876223/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGGGGCCTTTGAACGGGGGAACGGGCTGCAGGCCTGTGCCTTTAACTGCGCCCTCAGCCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAG < SRR4302536.6906015/94‑1 (MQ=60)
GAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTG < SRR4302536.3020933/94‑1 (MQ=60)
GAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTG < SRR4302536.3684873/94‑1 (MQ=60)
AAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGA < SRR4302536.3690959/94‑1 (MQ=60)
AGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTGCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAA > SRR4302536.2374532/1‑94 (MQ=60)
AGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAA < SRR4302536.1163396/94‑1 (MQ=60)
AGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAA > SRR4302536.3821201/1‑94 (MQ=60)
AGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAA > SRR4302536.2536755/1‑94 (MQ=60)
AGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAA < SRR4302536.1607720/94‑1 (MQ=60)
AGGGGCCTTTGCCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAA > SRR4302536.735949/1‑94 (MQ=60)
gggtgCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTGTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAA < SRR4302536.3028801/89‑1 (MQ=60)
GGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAA > SRR4302536.1547799/1‑94 (MQ=60)
GGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAA > SRR4302536.3892166/1‑94 (MQ=60)
GGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAA > SRR4302536.4065887/1‑94 (MQ=60)
GGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAA > SRR4302536.6790235/1‑94 (MQ=60)
GGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAA < SRR4302536.4468374/94‑1 (MQ=60)
GGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAA > SRR4302536.6021952/1‑94 (MQ=60)
GTCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAAT < SRR4302536.658406/94‑1 (MQ=60)
GGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAAT < SRR4302536.5413390/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATG < SRR4302536.5215050/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGC < SRR4302536.46857/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGC > SRR4302536.1905063/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGC > SRR4302536.1218672/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCT < SRR4302536.1795364/94‑1 (MQ=60)
CTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTAATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCT < SRR4302536.1564396/94‑1 (MQ=60)
TTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTT < SRR4302536.5645149/94‑1 (MQ=60)
TTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTA < SRR4302536.691588/94‑1 (MQ=60)
TTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTA < SRR4302536.237266/94‑1 (MQ=60)
TGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTAT > SRR4302536.2201336/1‑94 (MQ=60)
TGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTAT < SRR4302536.479657/94‑1 (MQ=60)
TGGCCAGGGGAACGGTCTGCAGGCCGGTGCCTGTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATTCTTAT < SRR4302536.733315/94‑1 (MQ=60)
CAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTG < SRR4302536.5324026/94‑1 (MQ=60)
AGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGC > SRR4302536.1179838/1‑94 (MQ=60)
GGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCA > SRR4302536.4903769/1‑94 (MQ=60)
GGAACGGGNTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGA < SRR4302536.5412934/94‑1 (MQ=60)
GGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGA > SRR4302536.2086891/1‑94 (MQ=60)
GGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGA > SRR4302536.136130/1‑94 (MQ=60)
GGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGA < SRR4302536.5857482/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGCAG > SRR4302536.6243611/1‑94 (MQ=60)
AACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAG < SRR4302536.4837880/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAG < SRR4302536.2902242/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAG < SRR4302536.742404/94‑1 (MQ=60)
ACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGT < SRR4302536.2886576/94‑1 (MQ=60)
|
GCGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGT > NC_000913/2071505‑2071689
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
