Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,088,609 |
T→C |
P132P (CCT→CCC) |
hisG → |
ATP phosphoribosyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,088,609 | 0 | T | C | 100.0%
| 793.3
/ NA
| 239 | P132P (CCT→CCC) | hisG | ATP phosphoribosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (125/114); total (125/114) |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
CGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCTCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCGG > NC_000913/2088519‑2088698
|
cggcTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCa < 1:1557429/93‑1 (MQ=255)
gcTGTCGTCTTTGGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCAcc > 1:5121850/1‑93 (MQ=255)
gcTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCAcc < 1:5513900/93‑1 (MQ=255)
tGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTg > 1:6715725/1‑93 (MQ=255)
tGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTg > 1:3310266/1‑93 (MQ=255)
gtcgtcTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGc < 1:3663754/93‑1 (MQ=255)
gtcgtcTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGc > 2:6115728/1‑93 (MQ=255)
tcgtcTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCt > 1:2454805/1‑93 (MQ=255)
gtcTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCa > 2:2346686/1‑93 (MQ=255)
cTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAg > 2:2160149/1‑93 (MQ=255)
cTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAg > 2:1439153/1‑93 (MQ=255)
cTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAg > 1:2522646/1‑93 (MQ=255)
tttCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGc > 2:4482038/1‑93 (MQ=255)
tttCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGc > 1:3037900/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGt > 2:1112071/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGt < 1:6113254/93‑1 (MQ=255)
tCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGt > 2:3139215/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGt < 2:6674838/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTa < 2:4873728/93‑1 (MQ=255)
tGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTAtc > 1:3440744/1‑93 (MQ=255)
tGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTAtc > 2:4542708/1‑93 (MQ=255)
tGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTAtc < 2:5562007/93‑1 (MQ=255)
ggCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTAtct < 2:1267798/93‑1 (MQ=255)
ggCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTAtct < 2:4218933/93‑1 (MQ=255)
gCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTAtctc < 1:5847708/93‑1 (MQ=255)
gCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTAtctc < 2:632555/93‑1 (MQ=255)
cGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGAcc > 2:5830590/1‑93 (MQ=255)
gCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCa < 2:2803009/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCa < 2:5329213/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAg < 2:2600108/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAg < 2:3706569/93‑1 (MQ=255)
cGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGa < 1:4267976/93‑1 (MQ=255)
ggTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGaa > 1:1001979/1‑93 (MQ=255)
ggTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGaa > 2:5941955/1‑93 (MQ=255)
gTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGaaa < 2:3999949/93‑1 (MQ=255)
ttGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAg < 1:1296889/93‑1 (MQ=255)
tgatgaAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAgg < 1:191866/93‑1 (MQ=255)
ggaAACCTGGGACAGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCAt < 1:6503731/92‑1 (MQ=255)
gaAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCAtc < 1:3950395/93‑1 (MQ=255)
gaAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCAtc < 1:4138936/93‑1 (MQ=255)
gaAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCAtc < 1:5845829/93‑1 (MQ=255)
gCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATctct > 1:149361/1‑93 (MQ=255)
gCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATctct > 2:1418811/1‑93 (MQ=255)
ccTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCtt < 1:2879011/93‑1 (MQ=255)
ccTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCtt < 2:1700682/93‑1 (MQ=255)
cTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCttt < 2:6456684/93‑1 (MQ=255)
tGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCtttt > 1:5439395/1‑93 (MQ=255)
gggACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTa > 1:4221772/1‑93 (MQ=255)
gggACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTa < 1:4086056/93‑1 (MQ=255)
gggACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTa < 1:953900/93‑1 (MQ=255)
gggACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTa > 2:410086/1‑93 (MQ=255)
aCGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAAt > 1:3083477/1‑93 (MQ=255)
tgTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATcc < 1:5634578/92‑1 (MQ=255)
ggTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATcc > 2:6484621/1‑93 (MQ=255)
gTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCt < 1:2420244/93‑1 (MQ=255)
ccGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGc > 2:5271970/1‑93 (MQ=255)
ccGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGc > 1:5698094/1‑93 (MQ=255)
cGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCt < 2:4966515/93‑1 (MQ=255)
gCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCtt > 1:6223181/1‑93 (MQ=255)
gCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCtt < 2:5610709/93‑1 (MQ=255)
gCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCtt < 1:4763757/93‑1 (MQ=255)
ctctCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTa > 1:1113458/1‑93 (MQ=255)
tctcCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTAc > 2:899199/1‑93 (MQ=255)
tctcCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTAc > 1:2640937/1‑93 (MQ=255)
tctcCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTAc > 2:5879507/1‑93 (MQ=255)
tctcCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTAc < 1:6544855/93‑1 (MQ=255)
ctcCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACt > 1:3582613/1‑93 (MQ=255)
ccTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGa > 2:2043046/1‑93 (MQ=255)
cTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGaa < 2:4783112/93‑1 (MQ=255)
ttAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTACCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAAc < 2:4607860/93‑1 (MQ=255)
tAAACTGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACg > 2:902698/1‑93 (MQ=255)
tAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACg > 2:1583920/1‑93 (MQ=255)
aaaCGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACgg < 1:4565183/93‑1 (MQ=255)
aaaCGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACgg > 2:5375413/1‑93 (MQ=255)
aaaCGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTCATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACgg > 2:3746426/1‑93 (MQ=255)
aaCGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGt > 1:4382010/1‑93 (MQ=255)
aCGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGtt < 1:4836220/93‑1 (MQ=255)
aCGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGtt < 2:572272/93‑1 (MQ=255)
cGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTc < 1:5312614/93‑1 (MQ=255)
ggTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCt < 2:4322604/93‑1 (MQ=255)
ggTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCt < 1:716317/93‑1 (MQ=255)
tAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGt > 2:701414/1‑93 (MQ=255)
aaCGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGTACGGTTCTGTTg > 2:362903/1‑93 (MQ=255)
aaCGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTg > 1:2033263/1‑93 (MQ=255)
aaCGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTg > 1:2242877/1‑93 (MQ=255)
gTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAGGCGTTATCTCGA‑CAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGt < 1:4256788/93‑1 (MQ=255)
gTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAg < 2:5460470/93‑1 (MQ=255)
gTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAg < 2:6243386/93‑1 (MQ=255)
tATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGt < 2:3405846/93‑1 (MQ=255)
aTCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTc > 2:3265669/1‑93 (MQ=255)
cACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGcccc < 2:452760/93‑1 (MQ=255)
cACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGcccc > 1:1683882/1‑93 (MQ=255)
aCCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGCAGCCCcg > 2:3387272/1‑93 (MQ=255)
aCCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAACGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCcg > 2:4697507/1‑93 (MQ=255)
ccTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCcgc < 1:4982128/93‑1 (MQ=255)
ctctTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCcgcg < 1:523281/93‑1 (MQ=255)
tctTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGt > 2:6028135/1‑93 (MQ=255)
tctTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGt > 1:2926491/1‑93 (MQ=255)
ttACCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGc < 1:5049349/93‑1 (MQ=255)
aTCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCg > 2:2376579/1‑93 (MQ=255)
|
CGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCTCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCGG > NC_000913/2088519‑2088698
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCTCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCGGACTG > NC_000913/2088517‑2088702
|
GGCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCC < SRR4302536.5602144/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCC < SRR4302536.66451/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCA < SRR4302536.4313985/94‑1 (MQ=60)
CGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCAC < SRR4302536.1603170/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTCGTCTTTGGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACC > SRR4302536.5274885/1‑94 (MQ=60)
GCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCT < SRR4302536.5678347/94‑1 (MQ=60)
CTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTG > SRR4302536.6915081/1‑94 (MQ=60)
CTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTG > SRR4302536.3408049/1‑94 (MQ=60)
TGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGC > SRR4302536.61209/1‑94 (MQ=60)
TGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGC > SRR4302536.374815/1‑94 (MQ=60)
TGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGC > SRR4302536.697910/1‑94 (MQ=60)
GTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGGCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCT > SRR4302536.2924442/1‑94 (MQ=60)
GTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCT < SRR4302536.3773287/94‑1 (MQ=60)
GTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCT > SRR4302536.2528930/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAA > SRR4302536.1546774/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAA > SRR4302536.119906/1‑94 (MQ=60)
TCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAG > SRR4302536.2598693/1‑94 (MQ=60)
CTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGC > SRR4302536.3127219/1‑94 (MQ=60)
CTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGATCAAGC > SRR4302536.4141362/1‑94 (MQ=60)
TCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTT < SRR4302536.6295465/94‑1 (MQ=60)
TCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTT < SRR4302536.1506869/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTAT > SRR4302536.422213/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATC > SRR4302536.2001903/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATC < SRR4302536.2387399/94‑1 (MQ=60)
ATGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATC > SRR4302536.3543221/1‑94 (MQ=60)
TGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTGTCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCT < SRR4302536.3333870/94‑1 (MQ=60)
TGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCT > SRR4302536.5184039/1‑94 (MQ=60)
GCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCG < SRR4302536.6021936/94‑1 (MQ=60)
GCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCG < SRR4302536.6913103/94‑1 (MQ=60)
ACGCCGCTTGCTCAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCCCCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACC < SRR4302536.1664736/94‑1 (MQ=60)
CGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCA > SRR4302536.6393704/1‑94 (MQ=60)
GCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAG < SRR4302536.2570867/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGA < SRR4302536.4279247/94‑1 (MQ=60)
CGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAA > SRR4302536.3145989/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAA > SRR4302536.1031545/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAA > SRR4302536.4356479/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAA < SRR4302536.4395184/94‑1 (MQ=60)
CGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAA < SRR4302536.2077714/94‑1 (MQ=60)
GGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAA < SRR4302536.1043609/94‑1 (MQ=60)
GGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAA > SRR4302536.3299140/1‑94 (MQ=60)
CGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAA < SRR4302536.1652513/94‑1 (MQ=60)
GTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAG > SRR4302536.1940416/1‑94 (MQ=60)
TTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGCCCAGAAAGG > SRR4302536.5554576/1‑94 (MQ=60)
TTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGG < SRR4302536.4922657/94‑1 (MQ=60)
TTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGG < SRR4302536.1335650/94‑1 (MQ=60)
TGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGC < SRR4302536.196930/94‑1 (MQ=60)
TGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGC < SRR4302536.5429795/94‑1 (MQ=60)
GATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACAGTAAACGTATCGCCAACTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCA > SRR4302536.143279/1‑94 (MQ=60)
ATGAAGCCTGGGACGGTCCGTGCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTGTCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCAT < SRR4302536.6144549/94‑1 (MQ=60)
ATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCAT < SRR4302536.5217149/94‑1 (MQ=60)
ATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCAT < SRR4302536.5097612/94‑1 (MQ=60)
ggaaaCCTGGGACAGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATC < SRR4302536.6697574/89‑1 (MQ=60)
TGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCTCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATC > SRR4302536.4391278/1‑94 (MQ=60)
TGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTTAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATC > SRR4302536.3030515/1‑94 (MQ=60)
GAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCT < SRR4302536.4067722/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCT < SRR4302536.6019995/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCT < SRR4302536.4261708/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCT < SRR4302536.1019039/94‑1 (MQ=60)
GAAACCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCT > SRR4302536.2285102/1‑94 (MQ=60)
AAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTC > SRR4302536.3544456/1‑94 (MQ=60)
AGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCT < SRR4302536.6021217/94‑1 (MQ=60)
AGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCT > SRR4302536.153249/1‑94 (MQ=60)
CCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTT < SRR4302536.4048127/94‑1 (MQ=60)
CCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTT < SRR4302536.2963987/94‑1 (MQ=60)
CTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTT > SRR4302536.5602069/1‑94 (MQ=60)
CTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTT < SRR4302536.2591439/94‑1 (MQ=60)
TGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTA > SRR4302536.4347378/1‑94 (MQ=60)
TGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTA > SRR4302536.4376558/1‑94 (MQ=60)
GGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAA < SRR4302536.982096/94‑1 (MQ=60)
GGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAA < SRR4302536.4207203/94‑1 (MQ=60)
GACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAAT > SRR4302536.3173683/1‑94 (MQ=60)
ACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATC < SRR4302536.575032/94‑1 (MQ=60)
ACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATC < SRR4302536.4402487/94‑1 (MQ=60)
TGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCT < SRR4302536.5801962/94‑1 (MQ=60)
GGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCT < SRR4302536.796834/94‑1 (MQ=60)
GGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCT < SRR4302536.6519878/94‑1 (MQ=60)
GTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTG < SRR4302536.3480623/94‑1 (MQ=60)
GTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTG < SRR4302536.2493438/94‑1 (MQ=60)
TCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATTGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGACAGCCATCTCTTTTGAATGCTGC > SRR4302536.4240324/1‑94 (MQ=60)
TCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGC > SRR4302536.5867524/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTT > SRR4302536.6408612/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTT > SRR4302536.2659708/1‑94 (MQ=60)
GCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTA < SRR4302536.4907215/94‑1 (MQ=60)
GCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTA > SRR4302536.1146878/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTAC > SRR4302536.2720101/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTAC > SRR4302536.3650709/1‑94 (MQ=60)
TCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACT > SRR4302536.3689737/1‑94 (MQ=60)
TCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACT < SRR4302536.5999842/94‑1 (MQ=60)
TCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACT < SRR4302536.6739753/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTG > SRR4302536.2781789/1‑94 (MQ=60)
TCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGA > SRR4302536.5569735/1‑94 (MQ=60)
TTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACG > SRR4302536.2506723/1‑94 (MQ=60)
TAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGG > SRR4302536.5697200/1‑94 (MQ=60)
AAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGT > SRR4302536.4512838/1‑94 (MQ=60)
AAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGT < SRR4302536.4702145/94‑1 (MQ=60)
AACGGTAAACGTATCCCCTCCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCAGCTTACTGAACGGTT < SRR4302536.3027513/94‑1 (MQ=60)
ACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTC < SRR4302536.4981783/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCT > SRR4302536.526115/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCT < SRR4302536.5471247/94‑1 (MQ=60)
GGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTG < SRR4302536.737272/94‑1 (MQ=60)
GGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTG > SRR4302536.4689328/1‑94 (MQ=60)
TAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTT > SRR4302536.5837180/1‑94 (MQ=60)
TAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTT < SRR4302536.4702636/94‑1 (MQ=60)
AAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTG < SRR4302536.5294225/94‑1 (MQ=60)
AAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTG > SRR4302536.2310753/1‑94 (MQ=60)
AAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTG > SRR4302536.2094490/1‑94 (MQ=60)
GTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAGGCGTTATCTCGA‑CAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTC < SRR4302536.4383604/94‑1 (MQ=60)
GTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGT > SRR4302536.2380864/1‑94 (MQ=60)
GTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGT > SRR4302536.926923/1‑94 (MQ=60)
TATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTC > SRR4302536.2971167/1‑94 (MQ=60)
TATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTC < SRR4302536.3773710/94‑1 (MQ=60)
TATCGCCACCTCTTACCCCCACCTGCTCACGCGTTATCTCGCCCAGAAAGGGATCTCGTTTAAATCCTGCTTACTGAACGCTTCTGTggaaatg < SRR4302536.1408508/94‑8 (MQ=60)
CGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCC < SRR4302536.6719731/94‑1 (MQ=60)
CGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCC > SRR4302536.5668814/1‑94 (MQ=60)
CCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCC > SRR4302536.682345/1‑94 (MQ=60)
CCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCC > SRR4302536.1732670/1‑94 (MQ=60)
CCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCG < SRR4302536.5131727/94‑1 (MQ=60)
CTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGT > SRR4302536.6591063/1‑94 (MQ=60)
CTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGT < SRR4302536.5946201/94‑1 (MQ=60)
CTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGT > SRR4302536.3012856/1‑94 (MQ=60)
CTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGT < SRR4302536.536683/94‑1 (MQ=60)
TCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTG < SRR4302536.4662459/94‑1 (MQ=60)
TTACCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCC < SRR4302536.5200653/94‑1 (MQ=60)
TATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCG < SRR4302536.514490/94‑1 (MQ=60)
TCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTAAAACCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCGGA < SRR4302536.4963675/94‑1 (MQ=60)
CCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCGGACTG < SRR4302536.4442464/94‑1 (MQ=60)
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GGCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCTCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCGGACTG > NC_000913/2088517‑2088702
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
