Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_000913 |
4,056,373 |
A→G |
K129K (AAA→AAG) |
yihK → |
putative GTP‑binding factor |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_000913 | 4,056,373 | 0 | A | G | 100.0%
| 937.7
/ NA
| 288 | K129K (AAA→AAG) | yihK | putative GTP‑binding factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (140/148); total (140/148) |
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGA > NC_000913/4056283‑4056462
|
tGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGt < 2:2965159/93‑1 (MQ=255)
tGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGt < 1:2499722/93‑1 (MQ=255)
tGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGt > 1:3706735/1‑93 (MQ=255)
gACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGtt < 2:5776132/93‑1 (MQ=255)
aCGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACTCGCTTCGTAACCAAAAAGGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTg < 1:5669117/93‑1 (MQ=255)
cGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGa > 2:3951046/1‑93 (MQ=255)
cGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGa < 2:4126921/93‑1 (MQ=255)
gCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGAc < 2:4376351/93‑1 (MQ=255)
cATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGAcc < 1:2312212/93‑1 (MQ=255)
aTTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCg > 1:1759815/1‑93 (MQ=255)
tGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGccc < 2:3160477/93‑1 (MQ=255)
tGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGccc < 1:6373367/93‑1 (MQ=255)
gACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCt < 1:5332352/93‑1 (MQ=255)
aCGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTg < 1:6047165/93‑1 (MQ=255)
cGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTgg < 1:4971264/93‑1 (MQ=255)
gCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGgcg > 2:1771286/1‑93 (MQ=255)
gCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGgcg > 1:6180950/1‑93 (MQ=255)
ccGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGgcgcg > 2:4554660/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGt > 2:5048711/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGt < 1:822074/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGt > 2:3065290/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGATGAGCGCCCTCGCGCGCGt > 2:6575491/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCAAACGCGCTTCGTAAACAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTc > 2:3265838/1‑93 (MQ=255)
gCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTcc < 2:1667399/93‑1 (MQ=255)
ccGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCt < 1:5995282/93‑1 (MQ=255)
cGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTg > 2:6293776/1‑93 (MQ=255)
gCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTgt > 2:4796654/1‑92 (MQ=255)
cAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGAt < 2:1487118/93‑1 (MQ=255)
cAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGAt > 1:5877251/1‑93 (MQ=255)
aaaCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGAtt < 1:2750/93‑1 (MQ=255)
aaCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTg < 1:6700076/93‑1 (MQ=255)
aCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTgg < 1:960597/93‑1 (MQ=255)
cgcgCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTggg < 1:6196/93‑1 (MQ=255)
cgcgCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTggg < 2:2185397/93‑1 (MQ=255)
cgcTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCTCGCGTCCTGATTGGGtt > 2:330363/1‑93 (MQ=255)
gcTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtg > 2:1822774/1‑93 (MQ=255)
gcTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtg > 2:1464800/1‑93 (MQ=255)
gcTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtg < 1:3342103/93‑1 (MQ=255)
cTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgt < 1:477860/93‑1 (MQ=255)
cTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgt < 1:416711/93‑1 (MQ=255)
cTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgt < 2:5582245/93‑1 (MQ=255)
ttCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGCTTGGGTtgtg > 1:1553440/1‑93 (MQ=255)
ttCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgtg > 2:2058149/1‑93 (MQ=255)
gTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAt > 2:2982615/1‑93 (MQ=255)
aaCCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa > 1:6469554/1‑93 (MQ=255)
aaCCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa > 1:2140131/1‑93 (MQ=255)
aaCCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa > 2:1088409/1‑93 (MQ=255)
aaCCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCGGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa < 2:6417309/93‑1 (MQ=255)
aaaaaaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTa < 1:3065290/93‑1 (MQ=255)
aaaaaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAt < 2:6711539/93‑1 (MQ=255)
aaaaaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAt < 1:1044454/93‑1 (MQ=255)
aaaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTc > 2:1311923/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTc > 1:3637596/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGCTGTTATCAACAAAGCTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCg > 1:656816/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGa > 2:2568283/1‑93 (MQ=255)
cGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATc < 1:1113696/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCt > 1:542080/1‑93 (MQ=255)
tttGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTg > 1:3028295/1‑93 (MQ=255)
ttGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGt < 1:3148105/93‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGt < 1:1001270/93‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGt > 2:1970922/1‑93 (MQ=255)
tGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGtt < 2:6018208/93‑1 (MQ=255)
gCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTc < 1:4671017/93‑1 (MQ=255)
gCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTc < 2:2472792/93‑1 (MQ=255)
cTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCg < 2:772989/93‑1 (MQ=255)
cTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCg > 1:1625160/1‑93 (MQ=255)
ttACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACGAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGt < 2:1592671/93‑1 (MQ=255)
ttACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGt < 2:4088277/93‑1 (MQ=255)
ttACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGt > 2:1720095/1‑93 (MQ=255)
tACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGtt > 2:5365377/1‑93 (MQ=255)
cGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTaa < 2:6171327/93‑1 (MQ=255)
cGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTaa > 2:384842/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAc > 2:5851217/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAc > 2:3355370/1‑93 (MQ=255)
gCCGGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAcc < 1:1977139/93‑1 (MQ=255)
cTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTc < 1:1175811/93‑1 (MQ=255)
tGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCg > 1:2685585/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAc > 2:3104608/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAc > 2:3488919/1‑93 (MQ=255)
aGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAcg < 2:958330/93‑1 (MQ=255)
gCCGATTGTTGTTATCAACAGGGTTGACCGCCCTGGGGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAcgc < 1:6321690/93‑1 (MQ=255)
gCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAcgc < 1:702352/93‑1 (MQ=255)
gCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAcgc < 1:5762992/93‑1 (MQ=255)
gCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAcgc < 2:6346001/93‑1 (MQ=255)
aTTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgacc < 2:4708231/93‑1 (MQ=255)
aTTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgacc < 2:5200243/93‑1 (MQ=255)
aTTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgacc < 2:2309085/93‑1 (MQ=255)
ttgttgTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgaccg > 2:2733136/1‑93 (MQ=255)
tgttgtTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgaccga > 1:6658000/1‑93 (MQ=255)
tgttgtTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgaccga < 1:558649/93‑1 (MQ=255)
tgttgtTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgaccga > 2:876707/1‑93 (MQ=255)
gttgttATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgaccgac > 1:445980/1‑93 (MQ=255)
gttATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGag > 1:136220/1‑93 (MQ=255)
tATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGagca < 1:5241981/93‑1 (MQ=255)
tCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGagcagc < 2:5383299/93‑1 (MQ=255)
tCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGagcagc < 1:4023272/93‑1 (MQ=255)
caacaaGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCt < 2:1630017/93‑1 (MQ=255)
caacaaGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCt < 1:385628/93‑1 (MQ=255)
aacaaGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGCTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTg > 2:6651363/1‑93 (MQ=255)
caaGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGa < 1:4298444/93‑1 (MQ=255)
|
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGA > NC_000913/4056283‑4056462
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTT > NC_000913/4056280‑4056465
|
ggtgggcgaATTTGACGACCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTACCCAAAAAAGCGTTTGCTAAGGCCCTGAGGCCGATTCTTGTTATCAACAAG < SRR4302536.6633071/85‑1 (MQ=58)
TGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAG < SRR4302536.6863648/94‑1 (MQ=60)
GGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAG < SRR4302536.6863649/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCGCATTGGCCGGCCGGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACAAAAAAAGCGTGTGCTTGGGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGG < SRR4302536.4910919/94‑1 (MQ=60)
GTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGG > SRR4302536.2153766/1‑94 (MQ=60)
GTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGG < SRR4302536.1007621/94‑1 (MQ=60)
GTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGG < SRR4302536.3364038/94‑1 (MQ=60)
GTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGG < SRR4302536.2949771/94‑1 (MQ=60)
GTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGG < SRR4302536.5016056/94‑1 (MQ=60)
TTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGT > SRR4302536.3817550/1‑94 (MQ=60)
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTT < SRR4302536.1028470/94‑1 (MQ=60)
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTT < SRR4302536.2575107/94‑1 (MQ=60)
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTT < SRR4302536.3071960/94‑1 (MQ=60)
TGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCCATTGTTGTTATCAACAAGGTT < SRR4302536.6765073/94‑1 (MQ=60)
ACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACTCGCTTCGTAACCAAAAAGGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGA < SRR4302536.5837624/94‑1 (MQ=60)
CGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGAC < SRR4302536.2813388/94‑1 (MQ=60)
CGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGAC < SRR4302536.1521438/94‑1 (MQ=60)
GCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACC < SRR4302536.6517025/94‑1 (MQ=60)
CATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCG < SRR4302536.2382386/94‑1 (MQ=60)
CATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCG < SRR4302536.2064365/94‑1 (MQ=60)
CATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCG > SRR4302536.1812594/1‑94 (MQ=60)
CATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCG > SRR4302536.6604866/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGC > SRR4302536.1123088/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGC > SRR4302536.1287485/1‑94 (MQ=60)
ATATGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGC > SRR4302536.6606604/1‑94 (MQ=60)
TTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCC > SRR4302536.4061961/1‑94 (MQ=60)
TGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACTAGGTTGACCGCCCT < SRR4302536.6799064/94‑1 (MQ=60)
TGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCT < SRR4302536.4236083/94‑1 (MQ=60)
TGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCT < SRR4302536.6563304/94‑1 (MQ=60)
GACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTG < SRR4302536.5951319/94‑1 (MQ=60)
GACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTG < SRR4302536.5491673/94‑1 (MQ=60)
ACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGG < SRR4302536.6350227/94‑1 (MQ=60)
ACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGG < SRR4302536.6227525/94‑1 (MQ=60)
CGGCCCGATGCCGCAACCGCGTTTCGTACCCAAAAAACCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGTTTGTTGTAATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGC < SRR4302536.616452/94‑1 (MQ=60)
CGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGC < SRR4302536.5120588/94‑1 (MQ=60)
CGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGC < SRR4302536.3218253/94‑1 (MQ=60)
GGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCG > SRR4302536.6365040/1‑94 (MQ=60)
GCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGC > SRR4302536.5556992/1‑94 (MQ=60)
CCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCG < SRR4302536.3184387/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATTAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGactc > SRR4302536.5920831/1‑90 (MQ=60)
ATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTC < SRR4302536.846270/94‑1 (MQ=60)
CCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTG < SRR4302536.6173998/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGAT < SRR4302536.1760128/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGAT > SRR4302536.6052308/1‑94 (MQ=60)
CAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATT < SRR4302536.4261091/94‑1 (MQ=60)
CAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATT < SRR4302536.6404324/94‑1 (MQ=60)
CAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATT > SRR4302536.407252/1‑94 (MQ=60)
CAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATT < SRR4302536.3141585/94‑1 (MQ=60)
AAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTG < SRR4302536.2824/94‑1 (MQ=60)
AAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTG > SRR4302536.6023187/1‑94 (MQ=60)
AACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGG > SRR4302536.3245570/1‑94 (MQ=60)
AACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGG < SRR4302536.6899084/94‑1 (MQ=60)
AACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGG > SRR4302536.5097186/1‑94 (MQ=60)
ACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGG < SRR4302536.988989/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGT < SRR4302536.3807258/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGT > SRR4302536.2172573/1‑94 (MQ=60)
CGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGT < SRR4302536.6355/94‑1 (MQ=60)
GCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTT > SRR4302536.6213359/1‑94 (MQ=60)
CGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTG < SRR4302536.4774869/94‑1 (MQ=60)
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GCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGT < SRR4302536.3441123/94‑1 (MQ=60)
GCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGT > SRR4302536.5748652/1‑94 (MQ=60)
GCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGT > SRR4302536.6891838/1‑94 (MQ=60)
CTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGCTTGGGTTGTG > SRR4302536.1599084/1‑94 (MQ=60)
CTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTG < SRR4302536.490305/94‑1 (MQ=60)
CTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTG < SRR4302536.427701/94‑1 (MQ=60)
CTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTG > SRR4302536.1636630/1‑94 (MQ=60)
TCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGA > SRR4302536.4595804/1‑94 (MQ=60)
CGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAT < SRR4302536.771554/94‑1 (MQ=60)
CGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAT > SRR4302536.878057/1‑94 (MQ=60)
GTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATC > SRR4302536.3912862/1‑94 (MQ=60)
TAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCA < SRR4302536.267567/94‑1 (MQ=60)
TAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCA > SRR4302536.6662652/1‑94 (MQ=60)
TAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCA > SRR4302536.6558136/1‑94 (MQ=60)
TAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCA > SRR4302536.2204380/1‑94 (MQ=60)
AACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGGGTCCTGATTGGGGTGTGGATCAG > SRR4302536.4291954/1‑94 (MQ=60)
AACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAG > SRR4302536.6173931/1‑94 (MQ=60)
AACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAG < SRR4302536.2288128/94‑1 (MQ=60)
CCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGT < SRR4302536.1177258/94‑1 (MQ=60)
CAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTA > SRR4302536.5813809/1‑94 (MQ=60)
CAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTA > SRR4302536.3532406/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAT < SRR4302536.3155169/94‑1 (MQ=60)
AAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGGTGTGGATCAGGTAT > SRR4302536.6124698/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCTGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATT < SRR4302536.4494987/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATT > SRR4302536.178831/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATT < SRR4302536.1980536/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATT < SRR4302536.1075521/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGCGTTGGCTTACGGCATGAAGCCGATTGTTGTTAACAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATT < SRR4302536.1352286/94‑1 (MQ=60)
AAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTC > SRR4302536.3746375/1‑94 (MQ=60)
AAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATAAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTTGATCATGGATTC > SRR4302536.2425970/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGTGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCG < SRR4302536.1606107/94‑1 (MQ=60)
AAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCG < SRR4302536.6909695/94‑1 (MQ=60)
AAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCG > SRR4302536.3753330/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGCTGTTATCAACAAAGCTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCG > SRR4302536.676072/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGGTGTGTGTCAGGTATTCGA > SRR4302536.5487997/1‑94 (MQ=60)
AGCTTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGAT < SRR4302536.5898225/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGAT > SRR4302536.3927737/1‑94 (MQ=60)
GCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATC > SRR4302536.6184401/1‑94 (MQ=60)
tgtatgcttacgtcaatAAGCCGATTGTTGTTGTCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTAATTGGTTTGTGGATCTGGTATTCGATCT < SRR4302536.2796006/77‑1 (MQ=60)
CGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCT > SRR4302536.555904/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCT < SRR4302536.2518454/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCT < SRR4302536.1147122/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGGTGAGGTGTTGGATCTG > SRR4302536.2843872/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTG > SRR4302536.4844201/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTG > SRR4302536.3117278/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCTTACGGCCGGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTG < SRR4302536.94266/94‑1 (MQ=60)
TTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTT < SRR4302536.1030810/94‑1 (MQ=60)
TTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTT < SRR4302536.3240290/94‑1 (MQ=60)
GCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCG < SRR4302536.4811460/94‑1 (MQ=60)
GCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCG > SRR4302536.1672484/1‑94 (MQ=60)
TTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTT > SRR4302536.4379756/1‑94 (MQ=60)
TACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTA < SRR4302536.5471735/94‑1 (MQ=60)
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CGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGGCCTGGTTGGGTTGTTGATCAGGCATTCGATCTGTTCGTTAAC > SRR4302536.5864778/1‑94 (MQ=60)
GGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACC < SRR4302536.5378169/94‑1 (MQ=60)
GCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCT < SRR4302536.5576138/94‑1 (MQ=60)
GCCGGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCT < SRR4302536.2036589/94‑1 (MQ=60)
CTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCG < SRR4302536.2368129/94‑1 (MQ=60)
CTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCG < SRR4302536.1211205/94‑1 (MQ=60)
CTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCG > SRR4302536.149622/1‑94 (MQ=60)
CTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCG > SRR4302536.2765795/1‑94 (MQ=60)
CTGAAGCAGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCG < SRR4302536.260983/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAC < SRR4302536.45561/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAC < SRR4302536.6378849/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAC < SRR4302536.642939/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTGTTGTTATCAACAGGGTTGACCGCCCTGGGGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCG < SRR4302536.6509981/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCG < SRR4302536.5934424/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCG < SRR4302536.722866/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCG > SRR4302536.3745673/1‑94 (MQ=60)
CCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGC > SRR4302536.1060613/1‑94 (MQ=60)
CCGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGA < SRR4302536.5753111/94‑1 (MQ=60)
CGATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGAC < SRR4302536.6257691/94‑1 (MQ=60)
GATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACT > SRR4302536.1956168/1‑94 (MQ=60)
GATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACC > SRR4302536.675987/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCG > SRR4302536.5213990/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGA > SRR4302536.6855869/1‑94 (MQ=60)
TGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGAC < SRR4302536.572878/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGAC > SRR4302536.457713/1‑94 (MQ=60)
TTGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGA > SRR4302536.3285968/1‑94 (MQ=60)
TGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAG > SRR4302536.4972367/1‑94 (MQ=60)
TGTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAG > SRR4302536.139780/1‑94 (MQ=60)
GTTATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGC > SRR4302536.1163866/1‑94 (MQ=60)
TATCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAG < SRR4302536.5398166/94‑1 (MQ=60)
AGCAACAAGGTTGGCCGCCCTGGCTCACGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGC < SRR4302536.711993/94‑1 (MQ=60)
TCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCT < SRR4302536.4142635/94‑1 (MQ=60)
TCAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCT < SRR4302536.671904/94‑1 (MQ=60)
CAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTG < SRR4302536.395800/94‑1 (MQ=60)
CAACAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTG < SRR4302536.780062/94‑1 (MQ=60)
CAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGAC < SRR4302536.4426935/94‑1 (MQ=60)
CAAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGAC > SRR4302536.1307800/1‑94 (MQ=60)
AAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACT > SRR4302536.4659339/1‑94 (MQ=60)
AAGGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACT < SRR4302536.335692/94‑1 (MQ=60)
AGGTTGCCCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTT < SRR4302536.6287394/94‑1 (MQ=60)
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GGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTT > NC_000913/4056280‑4056465
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |