Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I1 R1 | 1548 | 369.5 | 20095359 | 96.9% | 19472402 | 93.0 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,509,089 | T→C | N5S (AAC→AGC) E225E (GAA→GAG) |
yhfY ← yhfZ ← |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,509,089 | 0 | T | C | 99.7% | 1194.9 / NA | 370 | N5S (AAC→AGC) E225E (GAA→GAG) | yhfY yhfZ | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (187/182); minor base A (0/1); total (187/183) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 377 total aligned reads displayed.
CCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATC > NC_000913/3508999‑3509178 | ccTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTc < 2:2024492/93‑1 (MQ=255) cTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTcc > 2:7182477/1‑93 (MQ=255) tttGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCt > 2:733125/1‑93 (MQ=255) tttGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCt > 1:2756518/1‑93 (MQ=255) cAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTc < 1:2123589/93‑1 (MQ=255) aGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTcc < 2:9566708/93‑1 (MQ=255) aGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTcc > 2:9357968/1‑93 (MQ=255) aGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTcc > 2:8781046/1‑93 (MQ=255) gATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTccc > 2:2324757/1‑93 (MQ=255) gATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTccc > 1:257338/1‑93 (MQ=255) gATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTccc > 1:8000986/1‑93 (MQ=255) aTGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCTAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTcccc < 1:1153604/93‑1 (MQ=255) tGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCca > 1:9504872/1‑93 (MQ=255) tGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCca < 1:8426021/93‑1 (MQ=255) tGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCca < 1:4426113/93‑1 (MQ=255) ttCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCcac < 1:5750101/92‑1 (MQ=255) gTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCcac < 1:6146982/93‑1 (MQ=255) tctttATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCcact < 2:433370/90‑1 (MQ=255) tCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCcact > 2:9637899/1‑93 (MQ=255) ttATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCcactcac > 2:396761/1‑93 (MQ=255) ttATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCcactcac > 1:1905417/1‑93 (MQ=255) tATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCcactcact > 1:5816131/1‑93 (MQ=255) tATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCcactcact > 1:97737/1‑93 (MQ=255) tATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTAGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCcactcact > 2:1278344/1‑93 (MQ=255) tATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGGCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCcactcact > 2:6372297/1‑93 (MQ=255) tCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTAc > 1:6638822/1‑93 (MQ=255) cAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTAcc < 1:1323324/93‑1 (MQ=255) aaTAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTAGGCTCCTGTTCCCCACTCACTAcac > 1:7649011/1‑91 (MQ=255) aaCGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCgtt > 2:8685821/1‑93 (MQ=255) aaCGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCgtt < 1:7158614/93‑1 (MQ=255) aaCGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCgtt < 1:8620142/93‑1 (MQ=255) aCGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTACTGTTCCCCACTCACTACCCgttg > 2:3570161/1‑93 (MQ=255) ccctgcctCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCgttgtt < 1:162401/92‑1 (MQ=255) cctgcctCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGttgttg > 1:1460835/1‑93 (MQ=255) ctgcctCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGa < 1:8846246/93‑1 (MQ=255) ctgcctCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGa < 1:9160899/93‑1 (MQ=255) tgcctCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGAt > 1:348196/1‑93 (MQ=255) gcctCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATg < 1:7335924/93‑1 (MQ=255) gcctCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATg > 2:1828656/1‑93 (MQ=255) gccgCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATg < 1:5969070/93‑1 (MQ=255) tCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGc > 1:3884160/1‑93 (MQ=255) aaGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCa > 2:5707736/1‑93 (MQ=255) aGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAg > 2:2678888/1‑93 (MQ=255) gCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAgg < 2:9071264/93‑1 (MQ=255) cAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAggg < 1:9420975/93‑1 (MQ=255) ggTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCg < 1:2274046/93‑1 (MQ=255) gTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCgt > 1:3039941/1‑93 (MQ=255) gTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCgt > 1:8352697/1‑93 (MQ=255) ttGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCgtg > 1:10025568/1‑93 (MQ=255) tGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCgtgt < 2:6217575/93‑1 (MQ=255) gAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGtt > 2:294584/1‑93 (MQ=255) aGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGttt < 2:655363/93‑1 (MQ=255) gTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTa < 1:7772082/93‑1 (MQ=255) cTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTCCCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATc < 1:5593181/93‑1 (MQ=255) cTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATc < 1:7030775/93‑1 (MQ=255) tGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCt < 2:5401842/93‑1 (MQ=255) gTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTAc > 2:2856755/1‑93 (MQ=255) tttCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACa > 1:4774874/1‑93 (MQ=255) tttCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACa > 2:8511446/1‑93 (MQ=255) ttCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCGCTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACaa < 1:48762/93‑1 (MQ=255) ttCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACaa < 1:9911561/93‑1 (MQ=255) tCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCATGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTatcac > 1:7260276/1‑89 (MQ=255) 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tCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACg > 1:3239944/1‑93 (MQ=255) aGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACgca < 2:8601097/93‑1 (MQ=255) gATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACgcag < 1:329900/93‑1 (MQ=255) gATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACgcag > 2:4069287/1‑93 (MQ=255) aTGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACgcagc < 1:4127931/93‑1 (MQ=255) tGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACgcagca > 1:6850209/1‑93 (MQ=255) tGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACgcagca > 1:5010885/1‑93 (MQ=255) gCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGcagcag < 2:1582154/93‑1 (MQ=255) ccTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAgt < 1:4516038/93‑1 (MQ=255) ccTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAgt > 1:199645/1‑93 (MQ=255) tttCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAgttg > 2:5191317/1‑93 (MQ=255) tttCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAgttg > 1:2632235/1‑93 (MQ=255) ttCGTTTAATACCTCGGCTCCGGTTCCCCACTCACTCCCGGTTGTTGATGGGCGAGCGGGGCGTGTTTATTTACAACGGCACGCAGCAgttgt < 2:6812191/93‑1 (MQ=255) tCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAgttgtt < 1:9650866/93‑1 (MQ=255) tCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAgttgtt > 1:5414120/1‑93 (MQ=255) tCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAgttgtt < 2:4720303/93‑1 (MQ=255) tCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAgttgtt < 2:2102451/93‑1 (MQ=255) gTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGc > 2:9936450/1‑93 (MQ=255) tttAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCa < 1:37883/93‑1 (MQ=255) tttAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCa < 2:6940743/93‑1 (MQ=255) ttAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCAt < 2:488693/93‑1 (MQ=255) ttAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCAt > 1:7519209/1‑93 (MQ=255) ttAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCAt > 1:6447761/1‑93 (MQ=255) ttAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGCTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCAt < 2:8401245/93‑1 (MQ=255) taataaCTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCAtt > 2:3366424/1‑93 (MQ=255) taataaCTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCAtt > 2:1636787/1‑93 (MQ=255) taaCTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTggg < 2:9185887/93‑1 (MQ=255) cTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTaa < 2:7980099/93‑1 (MQ=255) cTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTaa < 2:1146900/93‑1 (MQ=255) tCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAat < 2:4637129/93‑1 (MQ=255) | CCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATC > NC_000913/3508999‑3509178 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
ATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCG > NC_000913/3508996‑3509182 | ATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGC > SRR4302540.7215189/1‑94 (MQ=60)ATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGC < SRR4302540.9653318/94‑1 (MQ=60)ATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTACCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGC > SRR4302540.1814606/1‑94 (MQ=60) TGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCT < SRR4302540.6251265/94‑1 (MQ=60) TGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCT > SRR4302540.4621803/1‑94 (MQ=60) TGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCT > SRR4302540.9752242/1‑94 (MQ=60) CCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCC > SRR4302540.9293069/1‑94 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT > SRR4302540.9653701/1‑94 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT > SRR4302540.9609332/1‑94 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT > SRR4302540.9158385/1‑94 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT > SRR4302540.2786305/1‑94 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT < SRR4302540.2956889/94‑1 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT > SRR4302540.8331152/1‑94 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT < SRR4302540.4825320/94‑1 (MQ=60) TTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTG < SRR4302540.6291984/94‑1 (MQ=60) TTGCAGATGTCCTTATCAATCACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATTCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGT > SRR4302540.338139/1‑94 (MQ=60) TTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGT < SRR4302540.2275886/94‑1 (MQ=60) tcgcgattttCTTATCAATAACGCCTCCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCGGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTT < SRR4302540.6111968/84‑1 (MQ=60) TGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTT < SRR4302540.6111966/94‑1 (MQ=60) GCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTC < SRR4302540.1308068/94‑1 (MQ=60) GCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTC < SRR4302540.451231/94‑1 (MQ=60) CAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCC > SRR4302540.3660086/1‑94 (MQ=60) CAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCC < SRR4302540.2146368/94‑1 (MQ=60) AGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCC > SRR4302540.8667390/1‑94 (MQ=60) AGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCC > SRR4302540.8094109/1‑94 (MQ=60) AGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCC > SRR4302540.259832/1‑94 (MQ=60) GATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCC > SRR4302540.2666876/1‑94 (MQ=60) GATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCC > SRR4302540.3159867/1‑94 (MQ=60) GATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCC > SRR4302540.7585170/1‑94 (MQ=60) GATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCC > SRR4302540.2593744/1‑94 (MQ=60) ATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCTAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCA < SRR4302540.1165614/94‑1 (MQ=60) ATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCA > SRR4302540.9617483/1‑94 (MQ=60) ATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCA > SRR4302540.8224212/1‑94 (MQ=60) TGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCAC < SRR4302540.4474065/94‑1 (MQ=60) GTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACT < SRR4302540.7135868/94‑1 (MQ=60) GTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACT < SRR4302540.7827993/94‑1 (MQ=60) GTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACT < SRR4302540.6215442/94‑1 (MQ=60) CCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCA < SRR4302540.9138123/94‑1 (MQ=60) CTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCAC > SRR4302540.8972506/1‑94 (MQ=60) CTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCAC > SRR4302540.6020756/1‑94 (MQ=60) CTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCAC < SRR4302540.8507228/94‑1 (MQ=60) CTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCAC > SRR4302540.1926244/1‑94 (MQ=60) TTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACT > SRR4302540.7214451/1‑94 (MQ=60) TTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACT > SRR4302540.2293016/1‑94 (MQ=60) TTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACT > SRR4302540.5880417/1‑94 (MQ=60) TTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACT > SRR4302540.98771/1‑94 (MQ=60) TATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTA > SRR4302540.8789236/1‑94 (MQ=60) TATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTA > SRR4302540.1712120/1‑94 (MQ=60) ATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTAC > SRR4302540.6712291/1‑94 (MQ=60) TCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACC > SRR4302540.49512/1‑94 (MQ=60) CAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATGTCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCC > SRR4302540.6319891/1‑94 (MQ=60) CAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCC > SRR4302540.200527/1‑94 (MQ=60) CAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCC > SRR4302540.4912555/1‑94 (MQ=60) CAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCC > SRR4302540.2089664/1‑94 (MQ=60) AATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCG < SRR4302540.6509668/94‑1 (MQ=60) ATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGT < SRR4302540.3135682/94‑1 (MQ=60) TAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTT > SRR4302540.955358/1‑94 (MQ=60) TAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTT > SRR4302540.9796251/1‑94 (MQ=60) TAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTT > SRR4302540.9853048/1‑94 (MQ=60) TAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTT > SRR4302540.8786125/1‑94 (MQ=60) AACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTG < SRR4302540.8720275/94‑1 (MQ=60) AACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTG > SRR4302540.7375977/1‑94 (MQ=60) AACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTG < SRR4302540.8720276/94‑1 (MQ=60) CGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTT > SRR4302540.7695929/1‑94 (MQ=60) GCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTG > SRR4302540.8278688/1‑94 (MQ=60) GCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTG > SRR4302540.4955518/1‑94 (MQ=60) GCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTG < SRR4302540.4928415/94‑1 (MQ=60) GCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTG > SRR4302540.1476446/1‑94 (MQ=60) GCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTG < SRR4302540.7521589/94‑1 (MQ=60) GCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTG < SRR4302540.5877330/94‑1 (MQ=60) GCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTG > SRR4302540.1476751/1‑94 (MQ=60) CCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGA > SRR4302540.42654/1‑94 (MQ=60) CCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGA < SRR4302540.5493313/94‑1 (MQ=60) CTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGAT < SRR4302540.9270847/94‑1 (MQ=60) CTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGAT < SRR4302540.8948578/94‑1 (MQ=60) CTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGAT < SRR4302540.5525876/94‑1 (MQ=60) CTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGAT < SRR4302540.8835605/94‑1 (MQ=60) CTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGAT > SRR4302540.408472/1‑94 (MQ=60) CTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGAT > SRR4302540.351741/1‑94 (MQ=60) GCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGG < SRR4302540.7417794/94‑1 (MQ=60) GCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGG < SRR4302540.6627210/94‑1 (MQ=60) GCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGG < SRR4302540.3322723/94‑1 (MQ=60) GCCGCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGG < SRR4302540.6035132/94‑1 (MQ=60) CCNCGCNNAGCAGGTTGAGTCNGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGG < SRR4302540.6686634/94‑1 (MQ=60) CTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGC > SRR4302540.3926357/1‑94 (MQ=60) TCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCG < SRR4302540.1252531/94‑1 (MQ=60) TCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCG < SRR4302540.5194471/94‑1 (MQ=60) TCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCG < SRR4302540.8987194/94‑1 (MQ=60) TCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCG < SRR4302540.2014026/94‑1 (MQ=60) GCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAG > SRR4302540.2631756/1‑94 (MQ=60) gataaacgtaatcacaactgctgagggtAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCA > SRR4302540.6064978/29‑94 (MQ=60) AAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCA < SRR4302540.9553500/94‑1 (MQ=60) AAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCA < SRR4302540.2018039/94‑1 (MQ=60) AAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAG < SRR4302540.4579349/94‑1 (MQ=60) GCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGG < SRR4302540.45551/94‑1 (MQ=60) GCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTCCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGG < SRR4302540.3703898/94‑1 (MQ=60) CAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGC < SRR4302540.9532948/94‑1 (MQ=60) CAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGC < SRR4302540.9826190/94‑1 (MQ=60) GGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGT > SRR4302540.1523175/1‑94 (MQ=60) GGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGT > SRR4302540.6001302/1‑94 (MQ=60) GGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGT < SRR4302540.2298458/94‑1 (MQ=60) GGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGT > SRR4302540.3073300/1‑94 (MQ=60) GGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGT > SRR4302540.8449640/1‑94 (MQ=60) GGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCATTGTTGATGACCGAGCAGGGCGG > SRR4302540.6001303/1‑94 (MQ=60) ggtgatgccGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTG < SRR4302540.6477741/85‑1 (MQ=60) GTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTG > SRR4302540.10142224/1‑94 (MQ=60) GTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTG < SRR4302540.2965245/94‑1 (MQ=60) GTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTG > SRR4302540.3368812/1‑94 (MQ=60) TTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT > SRR4302540.5557241/1‑94 (MQ=60) GAGTTTGG‑TTCCATATTAGATTCCTTTCGGTTAATAACCCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTA < SRR4302540.3278077/94‑1 (MQ=60) GAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTT < SRR4302540.7080106/94‑1 (MQ=60) AGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTA < SRR4302540.7857228/94‑1 (MQ=60) AGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTA > SRR4302540.1152807/1‑94 (MQ=60) AGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTA > SRR4302540.5028863/1‑94 (MQ=60) AGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTA < SRR4302540.3844790/94‑1 (MQ=60) GTCTTGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCGCTCGCTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTAT < SRR4302540.7254254/94‑1 (MQ=60) GTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTAT < SRR4302540.7659032/94‑1 (MQ=60) GTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTAT < SRR4302540.7862943/94‑1 (MQ=60) GTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTAT < SRR4302540.9397476/94‑1 (MQ=60) GTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTAT < SRR4302540.5836788/94‑1 (MQ=60) TCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATC > SRR4302540.6362170/1‑94 (MQ=60) CTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTCCCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCT < SRR4302540.5654722/94‑1 (MQ=60) CTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCT < SRR4302540.424105/94‑1 (MQ=60) CTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCT < SRR4302540.7108901/94‑1 (MQ=60) CTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGACGAGCAGGGCGTGTTTATCT > SRR4302540.3041433/1‑94 (MQ=60) TGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTA > SRR4302540.3845517/1‑94 (MQ=60) TGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTA > SRR4302540.7249964/1‑94 (MQ=60) TGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTA > SRR4302540.3845516/1‑94 (MQ=60) CGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTGCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTA < SRR4302540.7381007/94‑1 (MQ=60) GTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACA > SRR4302540.6559768/1‑94 (MQ=60) GTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACA > SRR4302540.4825886/1‑94 (MQ=60) GTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACA < SRR4302540.8350015/94‑1 (MQ=60) GTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACA < SRR4302540.8483684/94‑1 (MQ=60) TTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAAC < SRR4302540.10027327/94‑1 (MQ=60) TTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCATGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTAtcac > SRR4302540.7341289/1‑90 (MQ=60) TCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACG > SRR4302540.1524215/1‑94 (MQ=60) TCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACG > SRR4302540.8535255/1‑94 (MQ=60) CCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGG < SRR4302540.7323574/94‑1 (MQ=60) CCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGG < SRR4302540.3509403/94‑1 (MQ=60) CATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGC < SRR4302540.640079/94‑1 (MQ=60) ATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCA > SRR4302540.7058171/1‑94 (MQ=60) ATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCA > SRR4302540.8232385/1‑94 (MQ=60) TATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCAC < SRR4302540.8182327/94‑1 (MQ=60) TATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCAC < SRR4302540.1238238/94‑1 (MQ=60) TATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCAC < SRR4302540.1466670/94‑1 (MQ=60) TATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCAC > SRR4302540.7912464/1‑94 (MQ=60) TAGCAGATGCCGTTCGTTTATTAACTCGGCGCCCGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGtgcttgtgtttctacaattgcac > SRR4302540.9061048/1‑71 (MQ=52) ATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACG < SRR4302540.4396846/94‑1 (MQ=60) ATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACG > SRR4302540.3275196/1‑94 (MQ=60) CAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCA < SRR4302540.686895/94‑1 (MQ=60) AGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACagcagcagt > SRR4302540.7675442/1‑85 (MQ=60) AGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAG > SRR4302540.7675441/1‑94 (MQ=60) GATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGC < SRR4302540.333211/94‑1 (MQ=60) GATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACCGCACGCAGC > SRR4302540.2142491/1‑94 (MQ=60) ATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCA > SRR4302540.6926100/1‑94 (MQ=60) ATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCA > SRR4302540.5065144/1‑94 (MQ=60) ATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCA < SRR4302540.4172543/94‑1 (MQ=60) GCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGT > SRR4302540.201616/1‑94 (MQ=60) CCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTT < SRR4302540.4564962/94‑1 (MQ=60) CCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTT < SRR4302540.4564961/94‑1 (MQ=60) CCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTT < SRR4302540.685520/94‑1 (MQ=60) CCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTT < SRR4302540.5796372/94‑1 (MQ=60) CTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTG > SRR4302540.2640500/1‑94 (MQ=60) CTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTG > SRR4302540.2660724/1‑94 (MQ=60) CTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTG < SRR4302540.1499960/94‑1 (MQ=60) TTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTT < SRR4302540.7390308/94‑1 (MQ=60) TTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTT > SRR4302540.5473652/1‑94 (MQ=60) TTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTT < SRR4302540.6404927/94‑1 (MQ=60) TCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTG < SRR4302540.9764504/94‑1 (MQ=60) TCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTG > SRR4302540.1407955/1‑94 (MQ=60) TCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTG < SRR4302540.2707432/94‑1 (MQ=60) TCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTG > SRR4302540.8086427/1‑94 (MQ=60) GTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCA > SRR4302540.511416/1‑94 (MQ=60) TTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCAT < SRR4302540.38275/94‑1 (MQ=60) TTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCAT > SRR4302540.7603293/1‑94 (MQ=60) TTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCAT < SRR4302540.1662015/94‑1 (MQ=60) TTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATT < SRR4302540.9751440/94‑1 (MQ=60) TTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATT > SRR4302540.7986306/1‑94 (MQ=60) TAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTG > SRR4302540.9915555/1‑94 (MQ=60) TAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTG > SRR4302540.6641858/1‑94 (MQ=60) ATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGG > SRR4302540.6188015/1‑94 (MQ=60) ATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGG > SRR4302540.5679963/1‑94 (MQ=60) ATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGG < SRR4302540.2210246/94‑1 (MQ=60) TAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGT > SRR4302540.5673274/1‑94 (MQ=60) AACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTA < SRR4302540.2639695/94‑1 (MQ=60) CTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTAGCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAAT < SRR4302540.1138614/94‑1 (MQ=60) 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SRR4302540.3812752/94‑1 (MQ=60) GCTCCTGTTCCCCACGCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATC < SRR4302540.6479287/94‑1 (MQ=60) CTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCG > SRR4302540.5006345/1‑94 (MQ=60) CTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCG < SRR4302540.6804229/94‑1 (MQ=60) CTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCG > SRR4302540.4327658/1‑94 (MQ=60) CTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCG > SRR4302540.9707091/1‑94 (MQ=60) CTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCG > SRR4302540.6353054/1‑94 (MQ=60) | ATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCG > NC_000913/3508996‑3509182 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |