| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I2 R1 | 1624 | 250.6 | 12620048 | 98.0% | 12367647 | 93.0 |
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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yhfY ← yhfZ ← |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,509,089 | 0 | T | C | 100.0% | 779.8 / NA | 242 | N5S (AAC→AGC) E225E (GAA→GAG) | yhfY yhfZ | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (136/106); total (136/106) | |||||||||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
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cctCTCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGAGGTCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTTCCCGTTGTTGATgg < 2:2843937/93‑1 (MQ=255) cctCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATgg > 1:4222452/1‑93 (MQ=255) tCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGc > 1:4716177/1‑93 (MQ=255) tCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGc > 1:3174192/1‑93 (MQ=255) tCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGc < 2:1347023/93‑1 (MQ=255) cGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCg > 1:1002752/1‑93 (MQ=255) cGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCg < 1:2047082/93‑1 (MQ=255) cGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCg > 1:1825044/1‑93 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
ATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCG > NC_000913/3508996‑3509182 | ATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGC > SRR4302533.5969699/1‑94 (MQ=60) TGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCT < SRR4302533.1145115/94‑1 (MQ=60) TGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCT > SRR4302533.6078668/1‑94 (MQ=60) TGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCT < SRR4302533.1450900/94‑1 (MQ=60) TGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCT > SRR4302533.3475185/1‑94 (MQ=60) GCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTC > SRR4302533.1314804/1‑94 (MQ=60) GCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTC > SRR4302533.4001367/1‑94 (MQ=60) CCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCC < SRR4302533.2416254/94‑1 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT > SRR4302533.6091156/1‑94 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT < SRR4302533.1392841/94‑1 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT < SRR4302533.3028250/94‑1 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT > SRR4302533.871827/1‑94 (MQ=60) TTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTG < SRR4302533.5829174/94‑1 (MQ=60) TTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGT > SRR4302533.2320650/1‑94 (MQ=60) TGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTT > SRR4302533.5907662/1‑94 (MQ=60) TGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTT > SRR4302533.2845757/1‑94 (MQ=60) GCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTC > SRR4302533.272465/1‑94 (MQ=60) CAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCC > SRR4302533.1264252/1‑94 (MQ=60) AGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCC > SRR4302533.3583292/1‑94 (MQ=60) AGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCC > SRR4302533.6172419/1‑94 (MQ=60) GTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACT > SRR4302533.3908639/1‑94 (MQ=60) CCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCA > SRR4302533.5023805/1‑94 (MQ=60) CCTTATCAATAACGCCTGCCGCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCA < SRR4302533.2669016/94‑1 (MQ=60) CTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCAC < SRR4302533.5904158/94‑1 (MQ=60) TTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGTCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACT > SRR4302533.3964018/1‑94 (MQ=60) TTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACT > SRR4302533.963282/1‑94 (MQ=60) TTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACT > SRR4302533.1463202/1‑94 (MQ=60) TATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTA > SRR4302533.581365/1‑94 (MQ=60) ATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCGTATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTAC > SRR4302533.3404584/1‑94 (MQ=60) ATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTAC > SRR4302533.23211/1‑94 (MQ=60) CAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCC > SRR4302533.1580763/1‑94 (MQ=60) AATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCG < SRR4302533.3842197/94‑1 (MQ=60) AATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCG > SRR4302533.4968859/1‑94 (MQ=60) AACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTG < SRR4302533.6189193/94‑1 (MQ=60) AACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTG > SRR4302533.5788869/1‑94 (MQ=60) CGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTT < SRR4302533.890644/94‑1 (MQ=60) CGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTT > SRR4302533.738526/1‑94 (MQ=60) CGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTT < SRR4302533.1964509/94‑1 (MQ=60) CGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTT > SRR4302533.3044850/1‑94 (MQ=60) GCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTG < SRR4302533.6049197/94‑1 (MQ=60) GCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTG > SRR4302533.4152188/1‑94 (MQ=60) GCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAAATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTG < SRR4302533.3883247/94‑1 (MQ=60) TGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATG < SRR4302533.5284962/94‑1 (MQ=60) TGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATG < SRR4302533.4802846/94‑1 (MQ=60) TGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATG > SRR4302533.5051678/1‑94 (MQ=60) GCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGG > SRR4302533.4247981/1‑94 (MQ=60) GCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGG > SRR4302533.2950586/1‑94 (MQ=60) CCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGG > SRR4302533.4593356/1‑94 (MQ=60) CTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGC > SRR4302533.4744768/1‑94 (MQ=60) CTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGC > SRR4302533.3193726/1‑94 (MQ=60) CTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGC > SRR4302533.3163992/1‑94 (MQ=60) TCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCG > SRR4302533.1836193/1‑94 (MQ=60) TCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCG < SRR4302533.3921307/94‑1 (MQ=60) TCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCG < SRR4302533.3997516/94‑1 (MQ=60) TCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCG > SRR4302533.1008611/1‑94 (MQ=60) CGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGA < SRR4302533.460942/94‑1 (MQ=60) CGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGA < SRR4302533.2059705/94‑1 (MQ=60) GCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAG < SRR4302533.5407299/94‑1 (MQ=60) GCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAG < SRR4302533.2670542/94‑1 (MQ=60) GCAAAGCAGGTTGAGTCTAGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAG < SRR4302533.3908862/94‑1 (MQ=60) AAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCA > SRR4302533.6011305/1‑94 (MQ=60) AAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAG < SRR4302533.6225484/94‑1 (MQ=60) AGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGG < SRR4302533.1218314/94‑1 (MQ=60) GCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGG < SRR4302533.2328442/94‑1 (MQ=60) CAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGC < SRR4302533.6094172/94‑1 (MQ=60) CAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGC < SRR4302533.2316759/94‑1 (MQ=60) AGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCG > SRR4302533.869790/1‑94 (MQ=60) AGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCG > SRR4302533.5073804/1‑94 (MQ=60) GGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGT > SRR4302533.5762159/1‑94 (MQ=60) TGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTT > SRR4302533.1357122/1‑94 (MQ=60) AGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTA > SRR4302533.4711397/1‑94 (MQ=60) TCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATC < SRR4302533.183560/94‑1 (MQ=60) CTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCT < SRR4302533.828396/94‑1 (MQ=60) CTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCT > SRR4302533.4156103/1‑94 (MQ=60) GGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTAC > SRR4302533.3836201/1‑94 (MQ=60) TTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATACCTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAA < SRR4302533.1935054/94‑1 (MQ=60) TTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAA > SRR4302533.5196541/1‑94 (MQ=60) TTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAAC < SRR4302533.6094555/94‑1 (MQ=60) TTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAAC > SRR4302533.5704799/1‑94 (MQ=60) TTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAAC < SRR4302533.401973/94‑1 (MQ=60) TCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACG < SRR4302533.1748786/94‑1 (MQ=60) CCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGG > SRR4302533.772232/1‑94 (MQ=60) ATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCA < SRR4302533.2041577/94‑1 (MQ=60) TATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCAC < SRR4302533.591232/94‑1 (MQ=60) ATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACG > SRR4302533.5413576/1‑94 (MQ=60) ATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACG < SRR4302533.190154/94‑1 (MQ=60) TCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGC > SRR4302533.6058559/1‑94 (MQ=60) TCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGC > SRR4302533.5391008/1‑94 (MQ=60) TCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGC > SRR4302533.5806439/1‑94 (MQ=60) AGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAG > SRR4302533.2196544/1‑94 (MQ=60) ATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCA > SRR4302533.959090/1‑94 (MQ=60) ATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCA > SRR4302533.5524343/1‑94 (MQ=60) TGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAG > SRR4302533.5543569/1‑94 (MQ=60) TGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAG > SRR4302533.2670158/1‑94 (MQ=60) CTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCCGCAGTTG > SRR4302533.4323078/1‑94 (MQ=60) CTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTG < SRR4302533.6157589/94‑1 (MQ=60) CTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTG < SRR4302533.4729947/94‑1 (MQ=60) TTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGT > SRR4302533.3663011/1‑94 (MQ=60) TTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGT > SRR4302533.2123326/1‑94 (MQ=60) TTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGT < SRR4302533.5521448/94‑1 (MQ=60) TTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTCCCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTT < SRR4302533.970690/94‑1 (MQ=60) TTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTT < SRR4302533.2387776/94‑1 (MQ=60) CGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGC > SRR4302533.5572362/1‑94 (MQ=60) CGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTCGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGC > SRR4302533.4466034/1‑94 (MQ=60) GTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCA < SRR4302533.6247996/94‑1 (MQ=60) GTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCA > SRR4302533.5577614/1‑94 (MQ=60) GTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCA > SRR4302533.3504992/1‑94 (MQ=60) TTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGCTGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACTACGGCACGCCGCAGTTGTTGCATT > SRR4302533.5236552/1‑94 (MQ=60) TTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATT > SRR4302533.5757087/1‑94 (MQ=60) AATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGGGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGG < SRR4302533.873385/94‑1 (MQ=60) AATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGG < SRR4302533.4828916/94‑1 (MQ=60) AATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGG > SRR4302533.615989/1‑94 (MQ=60) AATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGG > SRR4302533.2327174/1‑94 (MQ=60) AATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGG > SRR4302533.6001751/1‑94 (MQ=60) AATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGG < SRR4302533.5589621/94‑1 (MQ=60) TAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGT > SRR4302533.410432/1‑94 (MQ=60) AACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTA < SRR4302533.1481385/94‑1 (MQ=60) AACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTA < SRR4302533.146041/94‑1 (MQ=60) ACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAA < SRR4302533.2277447/94‑1 (MQ=60) ACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAA < SRR4302533.5737513/94‑1 (MQ=60) CTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAAT > SRR4302533.3241672/1‑94 (MQ=60) CTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAAT > SRR4302533.4192083/1‑94 (MQ=60) CTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAAT > SRR4302533.4938189/1‑94 (MQ=60) CGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCA < SRR4302533.4767383/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGTTCCCCAGTCACTGCCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCAT < SRR4302533.2265374/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCAT < SRR4302533.1735803/94‑1 (MQ=60) GCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATC > SRR4302533.2948097/1‑94 (MQ=60) GCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATC < SRR4302533.708962/94‑1 (MQ=60) GCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATC > SRR4302533.4330482/1‑94 (MQ=60) CTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCG < SRR4302533.5488155/94‑1 (MQ=60) | ATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCG > NC_000913/3508996‑3509182 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |