Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,544,363 |
+C |
coding (169/1314 nt) |
gntT → |
gluconate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,544,363 | 1 | . | C | 100.0%
| 989.0
/ NA
| 312 | V57L (GTC→CTC) | gntT | gluconate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (168/144); total (168/144) |
Only 100 of 329 total aligned reads displayed.
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑C‑GC‑G‑GA‑C‑G‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > NC_000913/3544283‑3544437
|
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGcc > 1:7756510/1‑93 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGcc > 1:1723171/1‑93 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGcc > 2:2986378/1‑93 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGcc > 2:6639203/1‑93 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGcc > 2:2247569/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCtt > 2:2142673/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCtt > 1:4448862/1‑93 (MQ=255)
tGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTg > 2:3433469/1‑93 (MQ=255)
tGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTg > 2:8728093/1‑93 (MQ=255)
tGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGGGT‑CGGCGG‑GA‑A‑GCTCGGTAGCCTTg > 2:3329686/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGc > 2:8083189/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGc < 2:251590/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCAG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGc < 1:2024660/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGACTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGc > 1:7165725/1‑93 (MQ=255)
cgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGccc < 2:6610296/93‑1 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTAG‑GCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTg < 1:3822436/93‑1 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTg > 2:7878001/1‑93 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTg > 1:3596692/1‑93 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTg < 2:5676841/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGa > 2:8035072/1‑93 (MQ=255)
tGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGAt > 2:8971200/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATc > 1:8578041/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 1:6651754/93‑1 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 1:798851/93‑1 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 1:2319639/93‑1 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 2:4668475/93‑1 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 1:5021046/93‑1 (MQ=255)
cTGTGGGATTAATGNAAGGAATGCCGCTGGATNAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 2:4800907/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGGAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt < 1:87459/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt > 2:420990/1‑93 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt > 1:9456314/1‑93 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt > 2:124336/1‑93 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt > 2:2006975/1‑93 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt < 2:88426/93‑1 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggg > 1:2933993/1‑93 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggg > 1:9066944/1‑93 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggg < 1:478437/93‑1 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GACC‑C‑TCGGTAGTCTTTCCCTGATCATGGGt > 2:7629193/1‑93 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GACC‑C‑TCGGTCGCCTTGCCCTGATCCTgggat > 2:7239022/1‑91 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGttt < 2:5299792/93‑1 (MQ=255)
ttAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt < 1:1891225/93‑1 (MQ=255)
ttAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGgttt > 1:8938397/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgc > 1:7349373/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgc < 2:6352859/93‑1 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcgc > 1:637206/1‑93 (MQ=255)
cAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa > 2:4966572/1‑93 (MQ=255)
cAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa > 1:1525466/1‑93 (MQ=255)
cAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa < 2:5935039/93‑1 (MQ=255)
cAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa > 1:9610833/1‑93 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGGCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa > 2:9174620/1‑93 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa < 1:3464643/93‑1 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑CGG‑TCGGTAGCCTTGCCGTGATCATGGGTTGTGGCGCAAt > 1:6953023/1‑93 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaag > 2:3597467/1‑92 (MQ=255)
ggAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATg > 2:2912543/1‑93 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc > 1:7425982/1‑93 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTGTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt < 2:7432013/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt < 1:4557897/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt > 1:640987/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGCTTGATAAATTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATTGGTTTTGGCGCAATGCTg < 2:9562946/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg > 2:8633999/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 2:9285887/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg > 1:5943890/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg > 2:1450636/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTTC‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCCGTAGCCCTGCCCTCATCCTGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGc > 1:2460835/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGc > 1:8355596/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGc < 2:947837/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaa > 1:7641254/1‑93 (MQ=255)
gCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaa > 1:2642059/1‑93 (MQ=255)
cTGTATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa < 1:2843697/93‑1 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt > 2:3926058/1‑93 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGGAGCCTTGCCCTGATCATGGGCTTTGGCGCAATACTGGGCAAAAt > 1:8243782/1‑93 (MQ=255)
tAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt > 1:9684231/1‑93 (MQ=255)
tAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt < 1:1192418/93‑1 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTg > 1:6910535/1‑93 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTg > 2:2646725/1‑93 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTg > 2:4514132/1‑93 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 1:4168766/1‑93 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg < 2:6759319/93‑1 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 1:3911895/1‑93 (MQ=255)
aGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGc < 1:1373846/93‑1 (MQ=255)
gTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCa < 2:668085/93‑1 (MQ=255)
ttATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAg > 2:1880445/1‑93 (MQ=255)
ttATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAg < 1:6007005/93‑1 (MQ=255)
ttATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGC‑GTGA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGATTTGGCGTAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAg > 2:5518271/1‑93 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGa < 1:8112150/93‑1 (MQ=255)
ttGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACt > 1:1272632/1‑93 (MQ=255)
ttGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACt > 1:3135707/1‑93 (MQ=255)
tGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTg > 2:7088012/1‑93 (MQ=255)
ggCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGc < 1:2200740/93‑1 (MQ=255)
gCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCg < 2:3938379/93‑1 (MQ=255)
gCTCCATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCg < 2:1926344/93‑1 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTgg > 2:8482999/1‑93 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTgg > 1:8048091/1‑93 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTgg < 2:9763588/93‑1 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgc > 1:9835737/1‑93 (MQ=255)
tCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg > 2:5760960/1‑93 (MQ=255)
tCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg > 1:5235587/1‑93 (MQ=255)
tCAAAGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg > 1:4723820/1‑93 (MQ=255)
aGCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGcaca > 1:5782566/1‑93 (MQ=255)
gCCGGTGT‑CGGCGG‑GA‑C‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACaa < 1:9176815/93‑1 (MQ=255)
|
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGT‑C‑GC‑G‑GA‑C‑G‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > NC_000913/3544283‑3544437
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CG‑‑CGGAC‑G‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTG > NC_000913/3544283‑3544455
|
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCT < SRR4302540.1990208/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTT < SRR4302540.8793750/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTT > SRR4302540.2932768/1‑94 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTT < SRR4302540.4804219/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTT < SRR4302540.8871345/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTT > SRR4302540.4497080/1‑94 (MQ=60)
GTGTCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTG < SRR4302540.3623823/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTG > SRR4302540.5168188/1‑94 (MQ=60)
TGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGC < SRR4302540.4603003/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGACTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGC > SRR4302540.7245614/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCC < SRR4302540.5051686/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCAGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCC < SRR4302540.2046535/94‑1 (MQ=60)
GCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCC > SRR4302540.7015149/1‑94 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCT < SRR4302540.1597620/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTG < SRR4302540.8318454/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTG > SRR4302540.3635992/1‑94 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTG < SRR4302540.3126702/94‑1 (MQ=60)
CTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GTAGGCG‑‑‑GGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGA < SRR4302540.3864039/94‑1 (MQ=60)
CTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGA > SRR4302540.1696198/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGAT < SRR4302540.6457388/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGAT > SRR4302540.8728129/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGAT < SRR4302540.6457389/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATC > SRR4302540.8677745/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302540.6590755/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302540.6725331/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT > SRR4302540.5760740/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302540.5075401/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT > SRR4302540.4098563/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT > SRR4302540.9568534/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302540.6769099/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302540.1465716/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302540.807333/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302540.2344611/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGGAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATG < SRR4302540.88386/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATG > SRR4302540.6556466/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATG > SRR4302540.9274830/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATG > SRR4302540.1625412/1‑94 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGG < SRR4302540.8090235/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGG < SRR4302540.1992059/94‑1 (MQ=60)
TTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG > SRR4302540.9175817/1‑94 (MQ=60)
TTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG > SRR4302540.2966188/1‑94 (MQ=60)
TGGATTAATGCGAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGT > SRR4302540.6083032/1‑94 (MQ=60)
TGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGT > SRR4302540.9286208/1‑94 (MQ=60)
TGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGT < SRR4302540.483561/94‑1 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTT < SRR4302540.2707221/94‑1 (MQ=60)
GTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302540.7521249/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302540.3790595/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302540.8371025/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302540.9908699/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTT > SRR4302540.9043166/1‑94 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG > SRR4302540.4387773/1‑94 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302540.4076491/94‑1 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302540.1911929/94‑1 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302540.2732871/94‑1 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCAGATGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCCGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302540.6028359/94‑1 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGG > SRR4302540.228989/1‑94 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGG > SRR4302540.1257473/1‑94 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC > SRR4302540.7868193/1‑94 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC > SRR4302540.7431365/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCG > SRR4302540.9006144/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCG > SRR4302540.4791960/1‑94 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC < SRR4302540.830235/94‑1 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC > SRR4302540.643983/1‑94 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCCC > SRR4302540.9921965/1‑94 (MQ=60)
GCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCA > SRR4302540.9724153/1‑94 (MQ=60)
GCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCA > SRR4302540.1542360/1‑94 (MQ=60)
ACAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCA < SRR4302540.3923535/94‑1 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302540.6073037/1‑94 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302540.775210/1‑94 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA < SRR4302540.2088177/94‑1 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302540.8663004/1‑94 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302540.2963808/1‑94 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGACTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302540.8997102/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGTGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT > SRR4302540.4642090/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGACGG‑TCGGTAGCCTTGCCGTGATCATGGGTTGTGGCGCAAT > SRR4302540.7030381/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT < SRR4302540.8611594/94‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT < SRR4302540.3502353/94‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT > SRR4302540.2535109/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT > SRR4302540.3863126/1‑94 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302540.7742515/94‑1 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302540.2841225/94‑1 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302540.8144230/94‑1 (MQ=60)
AGAAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302540.7956325/94‑1 (MQ=60)
GGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGC > SRR4302540.7508706/1‑94 (MQ=60)
GGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGC > SRR4302540.7508704/1‑94 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCT > SRR4302540.647816/1‑94 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG > SRR4302540.6009598/1‑94 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG > SRR4302540.6009597/1‑94 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302540.5953160/94‑1 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302540.4607163/94‑1 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302540.9134190/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG < SRR4302540.7301661/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG > SRR4302540.3613634/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG > SRR4302540.7061179/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG > SRR4302540.10055989/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG < SRR4302540.301637/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTTCCGG‑‑‑CG‑‑‑GGAC‑GCTCCGTAGCCCTGCCCTCATCCTGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC > SRR4302540.2487325/1‑94 (MQ=38)
GCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302540.1365062/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC > SRR4302540.8452573/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCA < SRR4302540.7493880/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCACAATGCTGGGCA > SRR4302540.871655/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCCA > SRR4302540.2658797/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAA > SRR4302540.2670709/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAA > SRR4302540.7381858/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAA > SRR4302540.7727249/1‑94 (MQ=60)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAA < SRR4302540.4731402/94‑1 (MQ=60)
CTGTATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAA < SRR4302540.2874468/94‑1 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAA > SRR4302540.4601256/1‑94 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302540.7973763/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302540.1209837/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGGAGCCTTGCCCTGATCATGGGCTTTGGCGCAATACTGGGCAAAAT > SRR4302540.8339595/1‑94 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG < SRR4302540.338349/94‑1 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG > SRR4302540.1351206/1‑94 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG > SRR4302540.6383117/1‑94 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG < SRR4302540.9755727/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT > SRR4302540.9798166/1‑94 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GTTGGCG‑‑‑GGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGTTCGGCAAGATGCTG > SRR4302540.8370509/1‑94 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG > SRR4302540.4756893/1‑94 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG > SRR4302540.6987415/1‑94 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG > SRR4302540.8370506/1‑94 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302540.1204707/94‑1 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG > SRR4302540.3954277/1‑94 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG > SRR4302540.4213975/1‑94 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG > SRR4302540.9092379/1‑94 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG > SRR4302540.9493114/1‑94 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC < SRR4302540.7704997/94‑1 (MQ=60)
AGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA < SRR4302540.1388416/94‑1 (MQ=60)
AGGTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA < SRR4302540.5033618/94‑1 (MQ=60)
GTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG < SRR4302540.9613217/94‑1 (MQ=60)
GTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG > SRR4302540.7092910/1‑94 (MQ=60)
GTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGCTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG > SRR4302540.3228089/1‑94 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCACAATGCTGGCAGA > SRR4302540.1533717/1‑94 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGA < SRR4302540.9574282/94‑1 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGA < SRR4302540.6073606/94‑1 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAC < SRR4302540.8206302/94‑1 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAC < SRR4302540.5764956/94‑1 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAC > SRR4302540.5204138/1‑94 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GA‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAC > SRR4302540.448369/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT > SRR4302540.2413624/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT > SRR4302540.8127692/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT > SRR4302540.1285738/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT > SRR4302540.3169910/1‑94 (MQ=60)
TTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTG > SRR4302540.214002/1‑94 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCG > SRR4302540.6864303/1‑94 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCG < SRR4302540.231818/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCG < SRR4302540.2224508/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCG < SRR4302540.2220500/94‑1 (MQ=60)
GCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGG < SRR4302540.4021508/94‑1 (MQ=60)
TCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTG < SRR4302540.1782895/94‑1 (MQ=60)
CCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGG > SRR4302540.8141580/1‑94 (MQ=60)
CATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGC > SRR4302540.9950753/1‑94 (MQ=60)
CATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGC > SRR4302540.7445391/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG > SRR4302540.8161853/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG > SRR4302540.3903235/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG > SRR4302540.4774275/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG > SRR4302540.9307749/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG > SRR4302540.5292699/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302540.9686867/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302540.5928440/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302540.6093807/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302540.6994745/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302540.7024004/1‑94 (MQ=60)
AAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACA > SRR4302540.5846443/1‑94 (MQ=60)
AAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACA > SRR4302540.237185/1‑94 (MQ=60)
AGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > SRR4302540.5355004/1‑94 (MQ=60)
AGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA < SRR4302540.1795221/94‑1 (MQ=60)
GCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC < SRR4302540.343496/94‑1 (MQ=60)
GCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC > SRR4302540.1404428/1‑94 (MQ=60)
GCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC < SRR4302540.9286883/94‑1 (MQ=60)
GGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCAC < SRR4302540.2699288/94‑1 (MQ=60)
GGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCAC < SRR4302540.3730531/94‑1 (MQ=60)
GGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCAC < SRR4302540.7639643/94‑1 (MQ=60)
C‑C‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTG < SRR4302540.3568508/94‑1 (MQ=60)
C‑C‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTG < SRR4302540.143978/94‑1 (MQ=60)
|
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑‑‑GT‑‑‑CG‑‑CGGAC‑G‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTG > NC_000913/3544283‑3544455
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
