Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,795,233 |
T→C |
L220P (CTG→CCG) |
rfaL → |
O‑antigen ligase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,795,233 | 0 | T | C | 100.0%
| 1720.6
/ NA
| 525 | L220P (CTG→CCG) | rfaL | O‑antigen ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (295/230); total (295/230) |
Only 100 of 529 total aligned reads displayed.
CTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTA > NC_000913/3795143‑3795322
|
tAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGtt > 1:522207/1‑93 (MQ=255)
tAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGtt > 2:822733/1‑93 (MQ=255)
aaGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTc < 2:4107169/93‑1 (MQ=255)
aGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTcc < 1:9634244/93‑1 (MQ=255)
aaaaaaTCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTccc < 1:3218396/92‑1 (MQ=255)
aaaaTCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCta < 1:9367947/93‑1 (MQ=255)
aaaaTCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGAAACCTTACTCCCGTTCCCta < 2:5095692/93‑1 (MQ=255)
aaaTCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCtat < 2:9607755/93‑1 (MQ=255)
aaaTCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCtat < 2:3866788/93‑1 (MQ=255)
aaaTCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCtat < 1:997243/93‑1 (MQ=255)
aaaTCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCtat < 1:5318653/93‑1 (MQ=255)
tcatcCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAAt < 1:7821597/93‑1 (MQ=255)
catcCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAAtt < 1:685477/93‑1 (MQ=255)
catcCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAAtt < 2:659822/93‑1 (MQ=255)
catcCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAAtt < 1:4935673/93‑1 (MQ=255)
atcCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAAttt < 1:7482452/93‑1 (MQ=255)
atcCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAAttt > 2:3542977/1‑93 (MQ=255)
tcCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTtg < 2:2395286/93‑1 (MQ=255)
cTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCTGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTtgtg < 1:7135395/93‑1 (MQ=255)
cTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTtgtg > 1:5155430/1‑93 (MQ=255)
ttttttATTTTTATTAAATAGTTGCGCTGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTgtgt < 2:2799858/93‑1 (MQ=255)
ttttttATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTgtgt > 1:3062881/1‑93 (MQ=255)
ttttttATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTgtgt > 2:5650200/1‑93 (MQ=255)
tttttatttttaTTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGtt < 1:1314662/93‑1 (MQ=255)
tttttatttttaTTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGtt < 2:4500828/93‑1 (MQ=255)
tttatttttattAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTtgc < 2:6265402/93‑1 (MQ=255)
tttatttttattAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTtgc < 1:3963802/93‑1 (MQ=255)
tatttttattAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTtgctg < 1:9752345/93‑1 (MQ=255)
ttttattAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCAt > 1:8719283/1‑93 (MQ=255)
ttttattAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCAt > 1:2369249/1‑93 (MQ=255)
ttattaAATTGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTa < 1:9172636/93‑1 (MQ=255)
tattaAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCACCCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTaa < 2:7394344/93‑1 (MQ=255)
tattaAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTaa > 1:9031170/1‑93 (MQ=255)
tattaAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTaa < 2:4825391/93‑1 (MQ=255)
tattaAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTaa > 2:6738761/1‑93 (MQ=255)
attaAATAGTTGCGCGGTACTTTCTGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAAt < 2:5502942/93‑1 (MQ=255)
attaAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAAt > 1:6420486/1‑93 (MQ=255)
ttaAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATa < 2:6435220/93‑1 (MQ=255)
taAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAg > 2:1922805/1‑93 (MQ=255)
aaTAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCt > 2:2584659/1‑93 (MQ=255)
aaTAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCt > 2:5919366/1‑93 (MQ=255)
aTAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCtt > 1:2464631/1‑93 (MQ=255)
aTAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCtt < 1:8327734/93‑1 (MQ=255)
tAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCtta < 1:4800610/93‑1 (MQ=255)
tAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCtta > 2:8032507/1‑93 (MQ=255)
aGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCttat > 1:7388992/1‑93 (MQ=255)
aGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCttat > 2:3738123/1‑93 (MQ=255)
ttGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCttatta < 2:1702165/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCttatta < 2:2671155/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCttatta > 1:5444038/1‑93 (MQ=255)
tGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTtattat < 2:8602892/93‑1 (MQ=255)
tGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTtattat > 2:6032487/1‑93 (MQ=255)
gcgcGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATtata > 1:3480207/1‑93 (MQ=255)
gcgcGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATtata < 1:216670/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATtata > 1:8099354/1‑93 (MQ=255)
cgcgGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTataa > 2:7794385/1‑93 (MQ=255)
gcgGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTataat > 1:6011946/1‑93 (MQ=255)
ggTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTAtaataa > 2:9122406/1‑93 (MQ=255)
gTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATaaa > 1:1008546/1‑93 (MQ=255)
gTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATaaa < 2:1134396/93‑1 (MQ=255)
gTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATaaa < 1:6446133/93‑1 (MQ=255)
gTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATaaa > 1:8433769/1‑93 (MQ=255)
tACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAAt < 2:3667979/93‑1 (MQ=255)
aCTTTATGTTCTCGCGCTAACACAAGACAGAGCAACGCTACTGCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGATGCATTAATAGCTTATTATAATAAATc < 2:7719770/93‑1 (MQ=255)
cTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCa > 1:3310932/1‑93 (MQ=255)
tttATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAGCCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAc > 2:9294225/1‑93 (MQ=255)
tttATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAc > 1:6519357/1‑93 (MQ=255)
tttATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAc > 2:8436596/1‑93 (MQ=255)
tttATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAc > 2:2253108/1‑93 (MQ=255)
ttATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAcc > 2:7112706/1‑93 (MQ=255)
ttATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAcc > 1:3559377/1‑93 (MQ=255)
ttATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAcc > 2:5260767/1‑93 (MQ=255)
tATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAccc > 1:1215452/1‑93 (MQ=255)
tATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAccc > 1:3693550/1‑93 (MQ=255)
gTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGAATTAATAGCTTATTATAATACATCACCCAAg > 1:268556/1‑93 (MQ=255)
ttCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGa > 1:5727535/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGaa < 2:6974146/93‑1 (MQ=255)
gcgcTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTc > 1:4618550/1‑93 (MQ=255)
cgcTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCa > 1:1446378/1‑93 (MQ=255)
tAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACtt > 2:1417603/1‑93 (MQ=255)
tAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACtt < 1:5076347/93‑1 (MQ=255)
aaCACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTc < 1:4176431/93‑1 (MQ=255)
aaCACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTc > 2:6860470/1‑93 (MQ=255)
cacaAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCct > 2:9449439/1‑93 (MQ=255)
agagCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGtt > 2:9869294/1‑93 (MQ=255)
agagCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGtt < 2:5813519/93‑1 (MQ=255)
gagCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTc > 1:553393/1‑93 (MQ=255)
gagCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTc > 1:6807644/1‑93 (MQ=255)
agCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTct < 2:2938594/93‑1 (MQ=255)
gCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTcta > 2:215621/1‑93 (MQ=255)
aaCCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTctact > 1:2867958/1‑93 (MQ=255)
aCCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTctacta > 1:1630836/1‑93 (MQ=255)
aCCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTctacta > 2:4969931/1‑93 (MQ=255)
ccTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTGCTCTATTGTTCTACTAAt < 2:4330939/93‑1 (MQ=255)
ccTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCAATTCCTCTATTGTTCTACTAAt < 1:1804377/93‑1 (MQ=255)
tACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTg > 1:4477564/1‑93 (MQ=255)
tACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTg > 1:8589164/1‑93 (MQ=255)
tCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCta > 1:6185692/1‑93 (MQ=255)
tCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCta < 2:8810179/93‑1 (MQ=255)
tCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCta < 2:9708995/93‑1 (MQ=255)
|
CTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTA > NC_000913/3795143‑3795322
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 289 total aligned reads displayed.
ATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATATT > NC_000913/3795140‑3795326
|
ATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCAACTCCC > SRR4302540.3691299/1‑94 (MQ=60)
ACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGT < SRR4302540.7342395/94‑1 (MQ=60)
CTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTT < SRR4302540.414024/94‑1 (MQ=60)
CTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTT < SRR4302540.10404/94‑1 (MQ=60)
CTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTT > SRR4302540.527816/1‑94 (MQ=60)
TAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTC > SRR4302540.3549274/1‑94 (MQ=60)
TAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTC > SRR4302540.4896915/1‑94 (MQ=60)
AAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCC < SRR4302540.6900702/94‑1 (MQ=60)
AGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCC > SRR4302540.5457883/1‑94 (MQ=60)
AGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCC < SRR4302540.9747754/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCT < SRR4302540.3253359/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCT < SRR4302540.1924648/94‑1 (MQ=60)
AAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTA < SRR4302540.3996216/94‑1 (MQ=60)
AAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTAT < SRR4302540.9479487/94‑1 (MQ=60)
AAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATA < SRR4302540.754999/94‑1 (MQ=60)
AAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATA < SRR4302540.5376893/94‑1 (MQ=60)
AAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATA < SRR4302540.5376894/94‑1 (MQ=60)
AAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATA > SRR4302540.3751583/1‑94 (MQ=60)
AAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATA < SRR4302540.1007388/94‑1 (MQ=60)
AATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAA < SRR4302540.7622253/94‑1 (MQ=60)
AATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAA < SRR4302540.8350234/94‑1 (MQ=60)
ATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAAT > SRR4302540.4653196/1‑94 (MQ=60)
ATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAAT > SRR4302540.10070446/1‑94 (MQ=60)
TCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATT < SRR4302540.1221811/94‑1 (MQ=60)
TCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATT < SRR4302540.7913004/94‑1 (MQ=60)
CATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTT > SRR4302540.4263860/1‑94 (MQ=60)
CATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTT < SRR4302540.692836/94‑1 (MQ=60)
CATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTT > SRR4302540.6172838/1‑94 (MQ=60)
CATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTT > SRR4302540.319285/1‑94 (MQ=60)
ATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTG > SRR4302540.7347765/1‑94 (MQ=60)
ATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTG < SRR4302540.7565975/94‑1 (MQ=60)
CCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTG < SRR4302540.4816863/94‑1 (MQ=60)
CCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTG > SRR4302540.5211392/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGT > SRR4302540.7485531/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGT > SRR4302540.9516799/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGT > SRR4302540.9756887/1‑94 (MQ=60)
TTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTT < SRR4302540.5564904/94‑1 (MQ=60)
TTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTT > SRR4302540.3696956/1‑94 (MQ=60)
TTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTT < SRR4302540.8670660/94‑1 (MQ=60)
TTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTT > SRR4302540.3351839/1‑94 (MQ=60)
TTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTG < SRR4302540.1328332/94‑1 (MQ=60)
TTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCT < SRR4302540.4006545/94‑1 (MQ=60)
TTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCT < SRR4302540.5410263/94‑1 (MQ=60)
TTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCT < SRR4302540.5253966/94‑1 (MQ=60)
TTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCT < SRR4302540.3036443/94‑1 (MQ=60)
TTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCT < SRR4302540.5044909/94‑1 (MQ=60)
TTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCT > SRR4302540.6500142/1‑94 (MQ=60)
TTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACAAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTTTTGCT > SRR4302540.2802329/1‑94 (MQ=60)
TTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTG < SRR4302540.3311182/94‑1 (MQ=60)
TTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTG < SRR4302540.9264083/94‑1 (MQ=60)
TATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGC < SRR4302540.9866774/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCA > SRR4302540.5580819/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCA < SRR4302540.1310337/94‑1 (MQ=60)
TTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCAT > SRR4302540.2394763/1‑94 (MQ=60)
TTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCAT > SRR4302540.8820520/1‑94 (MQ=60)
TTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCAT > SRR4302540.8820519/1‑94 (MQ=60)
TTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCAT < SRR4302540.2630454/94‑1 (MQ=60)
TTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATT < SRR4302540.6520646/94‑1 (MQ=60)
TTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATT < SRR4302540.6771366/94‑1 (MQ=60)
TTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATT < SRR4302540.958093/94‑1 (MQ=60)
TTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTA > SRR4302540.9850536/1‑94 (MQ=60)
TTATTAAATTGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAA < SRR4302540.9282670/94‑1 (MQ=60)
TTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAA < SRR4302540.6511777/94‑1 (MQ=60)
TATTAAATAGTTGCGCTGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAAT < SRR4302540.6343574/94‑1 (MQ=60)
TATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAAT > SRR4302540.4706877/1‑94 (MQ=60)
TATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAAT > SRR4302540.4191374/1‑94 (MQ=60)
TATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAAT > SRR4302540.6491946/1‑94 (MQ=60)
TATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAAT < SRR4302540.9437581/94‑1 (MQ=60)
TATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAAT > SRR4302540.7073303/1‑94 (MQ=60)
TATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTATGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAAT < SRR4302540.4702286/94‑1 (MQ=60)
ATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAGCCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATA < SRR4302540.2703991/94‑1 (MQ=60)
ATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATA > SRR4302540.4324329/1‑94 (MQ=60)
ATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATA > SRR4302540.7006161/1‑94 (MQ=60)
ATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCACTAACACAATCCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATA < SRR4302540.5225653/94‑1 (MQ=60)
TTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAG < SRR4302540.5285211/94‑1 (MQ=60)
TTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAG < SRR4302540.1437355/94‑1 (MQ=60)
AAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCT > SRR4302540.4916287/1‑94 (MQ=60)
AATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTT < SRR4302540.6509725/94‑1 (MQ=60)
ATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTA > SRR4302540.6589273/1‑94 (MQ=60)
ATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTA < SRR4302540.3257264/94‑1 (MQ=60)
ATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTA < SRR4302540.8424389/94‑1 (MQ=60)
TAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTAT > SRR4302540.7471321/1‑94 (MQ=60)
TAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTAT < SRR4302540.361529/94‑1 (MQ=60)
TAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTAT < SRR4302540.4851982/94‑1 (MQ=60)
TAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTAT > SRR4302540.4429654/1‑94 (MQ=60)
TAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTAT > SRR4302540.609932/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCTTTCCCTATAATTTGGGTTGCTGGTTTAATAGCTTTTT > SRR4302540.3553524/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATT > SRR4302540.9324575/1‑94 (MQ=60)
GTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTA > SRR4302540.5503943/1‑94 (MQ=60)
GTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTA > SRR4302540.2793824/1‑94 (MQ=60)
TTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTAT < SRR4302540.2465832/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATA > SRR4302540.3518101/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATA > SRR4302540.8193357/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATA < SRR4302540.1468146/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAA < SRR4302540.2266752/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAA < SRR4302540.218783/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAAT > SRR4302540.6078615/1‑94 (MQ=60)
GCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATA > SRR4302540.9174793/1‑94 (MQ=60)
GCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATA > SRR4302540.2966183/1‑94 (MQ=60)
CGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAA < SRR4302540.1923888/94‑1 (MQ=60)
CGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAA > SRR4302540.8063820/1‑94 (MQ=60)
CGGGACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAA > SRR4302540.7015751/1‑94 (MQ=60)
GGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCGTACGCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAA < SRR4302540.846082/94‑1 (MQ=60)
GGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAA > SRR4302540.1244347/1‑94 (MQ=60)
GGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAA > SRR4302540.8531679/1‑94 (MQ=60)
GGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAA > SRR4302540.1018777/1‑94 (MQ=60)
GGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAA > SRR4302540.5770955/1‑94 (MQ=60)
GGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATATGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAA > SRR4302540.9075926/1‑94 (MQ=60)
GTACTTTATGTTCTTGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAAT > SRR4302540.6789820/1‑94 (MQ=60)
GTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAAT > SRR4302540.8341220/1‑94 (MQ=60)
GTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAAT > SRR4302540.9870828/1‑94 (MQ=60)
TACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATC > SRR4302540.5143991/1‑94 (MQ=60)
TACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATC > SRR4302540.2321596/1‑94 (MQ=60)
ACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCA > SRR4302540.5631579/1‑94 (MQ=60)
ACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCA > SRR4302540.3201556/1‑94 (MQ=60)
ACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCA > SRR4302540.9193675/1‑94 (MQ=60)
ACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCA > SRR4302540.2478126/1‑94 (MQ=60)
ACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCA > SRR4302540.8725498/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAC > SRR4302540.6591772/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAC < SRR4302540.3300968/94‑1 (MQ=60)
CTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAC > SRR4302540.3080368/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAC > SRR4302540.8531905/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCAC < SRR4302540.5211895/94‑1 (MQ=60)
TTTATGTTCTGGCGCTGACACCAACCAGAGCACCCCTCCGCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACC < SRR4302540.1334648/94‑1 (MQ=60)
TTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACC < SRR4302540.5819293/94‑1 (MQ=60)
TTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACC < SRR4302540.5813802/94‑1 (MQ=60)
TTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACC > SRR4302540.134807/1‑94 (MQ=60)
TTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACC < SRR4302540.3426890/94‑1 (MQ=60)
TTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACC > SRR4302540.3598262/1‑94 (MQ=60)
TTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCC > SRR4302540.243071/1‑94 (MQ=60)
TTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCC > SRR4302540.3733889/1‑94 (MQ=60)
TATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCA > SRR4302540.1007227/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAA > SRR4302540.7545220/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAA > SRR4302540.1568035/1‑94 (MQ=60)
TGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAG < SRR4302540.5024824/94‑1 (MQ=60)
TGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAG < SRR4302540.6475415/94‑1 (MQ=60)
TGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAG < SRR4302540.4634048/94‑1 (MQ=60)
TGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGAATTAATAGCTTATTATAATACATCACCCAAG > SRR4302540.271205/1‑94 (MQ=60)
TGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACCCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAG > SRR4302540.2781627/1‑94 (MQ=60)
GTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGA > SRR4302540.5790609/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCACCCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAA < SRR4302540.1708258/94‑1 (MQ=60)
TTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAA > SRR4302540.342082/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAA > SRR4302540.4999572/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTC > SRR4302540.1589550/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTC > SRR4302540.233221/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTC > SRR4302540.4668071/1‑94 (MQ=60)
GCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCA > SRR4302540.1462106/1‑94 (MQ=60)
CGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCAC < SRR4302540.498514/94‑1 (MQ=60)
CGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCAC > SRR4302540.1206178/1‑94 (MQ=60)
CGCTAACACAAA‑CAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACT < SRR4302540.7706141/94‑1 (MQ=60)
GCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACT < SRR4302540.6851228/94‑1 (MQ=60)
GCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACT > SRR4302540.5578708/1‑94 (MQ=60)
GCGAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACT < SRR4302540.5198635/94‑1 (MQ=60)
CTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTT > SRR4302540.5612826/1‑94 (MQ=60)
CTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTT > SRR4302540.4556548/1‑94 (MQ=60)
TAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTC < SRR4302540.3355699/94‑1 (MQ=60)
TAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTC < SRR4302540.5131232/94‑1 (MQ=60)
TAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTC > SRR4302540.8933080/1‑94 (MQ=60)
TAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGGGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTC > SRR4302540.1729588/1‑94 (MQ=60)
AACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCC > SRR4302540.8207905/1‑94 (MQ=60)
AACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCC < SRR4302540.4221766/94‑1 (MQ=60)
AACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCC > SRR4302540.5333710/1‑94 (MQ=60)
AACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCC > SRR4302540.8207904/1‑94 (MQ=60)
AACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCC < SRR4302540.9336558/94‑1 (MQ=60)
ACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCT > SRR4302540.7963089/1‑94 (MQ=60)
ACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTGGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCT < SRR4302540.5543288/94‑1 (MQ=60)
CACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTC > SRR4302540.8586579/1‑94 (MQ=60)
CACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACGTCCTC > SRR4302540.5155148/1‑94 (MQ=60)
ACAAACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCT > SRR4302540.3861196/1‑94 (MQ=60)
ACCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTG > SRR4302540.1315840/1‑94 (MQ=60)
CCAGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGT < SRR4302540.8509047/94‑1 (MQ=60)
AGAGCAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTC > SRR4302540.6882975/1‑94 (MQ=60)
CAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACT > SRR4302540.6197803/1‑94 (MQ=60)
CAACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACT > SRR4302540.9127393/1‑94 (MQ=60)
AACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTA > SRR4302540.984612/1‑94 (MQ=60)
AACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTA > SRR4302540.9687446/1‑94 (MQ=60)
AACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTA > SRR4302540.689939/1‑94 (MQ=60)
AACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTA > SRR4302540.6382702/1‑94 (MQ=60)
AACCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTA < SRR4302540.2960883/94‑1 (MQ=60)
CCCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAAT < SRR4302540.3135340/94‑1 (MQ=60)
CCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATT < SRR4302540.1665029/94‑1 (MQ=60)
CCTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCAATTCCTCTATTGTTCTACTAATT < SRR4302540.1824029/94‑1 (MQ=60)
CTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTG > SRR4302540.8689013/1‑94 (MQ=60)
CTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTG > SRR4302540.413765/1‑94 (MQ=60)
CTACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTG > SRR4302540.8499918/1‑94 (MQ=60)
TACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGC < SRR4302540.6537573/94‑1 (MQ=60)
ACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCT > SRR4302540.723194/1‑94 (MQ=60)
ACTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCT > SRR4302540.723191/1‑94 (MQ=60)
CTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTA > SRR4302540.27088/1‑94 (MQ=60)
CTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTA < SRR4302540.8704269/94‑1 (MQ=60)
CTCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTA > SRR4302540.6254582/1‑94 (MQ=60)
TCCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTAT > SRR4302540.5149201/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATA < SRR4302540.8054698/94‑1 (MQ=60)
CCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATA > SRR4302540.6780243/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATA > SRR4302540.6780242/1‑94 (MQ=60)
CCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATAT < SRR4302540.2105625/94‑1 (MQ=60)
CCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATAT < SRR4302540.6984523/94‑1 (MQ=60)
CCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATAT > SRR4302540.6655047/1‑94 (MQ=60)
CCGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATAT > SRR4302540.5015397/1‑94 (MQ=60)
CGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATATT > SRR4302540.1785500/1‑94 (MQ=60)
|
ATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATATT > NC_000913/3795140‑3795326
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
