Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 219 total aligned reads displayed.
CAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTTATAGGCC > NC_000913/3752615‑3752801
|
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ACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTT < SRR4302540.8675158/94‑1 (MQ=60)
ACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTT > SRR4302540.7250123/1‑94 (MQ=60)
ACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTT > SRR4302540.7250124/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTG < SRR4302540.1612137/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTG > SRR4302540.5318878/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTACCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTG < SRR4302540.5517050/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGT > SRR4302540.650598/1‑94 (MQ=60)
GGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGT < SRR4302540.3950112/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGT > SRR4302540.1090947/1‑94 (MQ=60)
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GGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGT < SRR4302540.6023629/94‑1 (MQ=60)
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GTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTA < SRR4302540.6644940/94‑1 (MQ=60)
GTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTA < SRR4302540.7349096/94‑1 (MQ=60)
TTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAG < SRR4302540.1724419/94‑1 (MQ=60)
TTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGC < SRR4302540.9642928/94‑1 (MQ=60)
TATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCC > SRR4302540.6021161/1‑94 (MQ=60)
TATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCC < SRR4302540.2190841/94‑1 (MQ=60)
ATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCA > SRR4302540.6921533/1‑94 (MQ=60)
ATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCA > SRR4302540.6733924/1‑94 (MQ=60)
TCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCAC < SRR4302540.591909/94‑1 (MQ=60)
CCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACC > SRR4302540.2096926/1‑94 (MQ=60)
CCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACC > SRR4302540.5837225/1‑94 (MQ=60)
CCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACC > SRR4302540.5837226/1‑94 (MQ=60)
CCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACC > SRR4302540.4237748/1‑94 (MQ=60)
GAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAA < SRR4302540.5688023/94‑1 (MQ=60)
GAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAA < SRR4302540.5045508/94‑1 (MQ=60)
GAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAA < SRR4302540.5045507/94‑1 (MQ=60)
AGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAA < SRR4302540.8439851/94‑1 (MQ=60)
GTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAAC < SRR4302540.6792657/94‑1 (MQ=60)
GTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAC < SRR4302540.2302017/94‑1 (MQ=60)
GTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAC < SRR4302540.7064032/94‑1 (MQ=60)
TAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACG < SRR4302540.7274453/94‑1 (MQ=60)
TAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACG < SRR4302540.2968103/94‑1 (MQ=60)
GAGCTCACCAGCAGGCACTTGGGTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACG < SRR4302540.1548472/94‑1 (MQ=60)
AGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGC > SRR4302540.6977058/1‑94 (MQ=60)
AGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGC > SRR4302540.810482/1‑94 (MQ=60)
GCTCACCAGCATGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCC < SRR4302540.9427817/94‑1 (MQ=60)
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TCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGC > SRR4302540.5278427/1‑94 (MQ=60)
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CACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCA > SRR4302540.5635611/1‑94 (MQ=60)
CACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCA > SRR4302540.1464314/1‑94 (MQ=60)
ACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCAT < SRR4302540.984510/94‑1 (MQ=60)
ACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCAT > SRR4302540.1529550/1‑94 (MQ=60)
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CAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGT < SRR4302540.4417735/94‑1 (MQ=60)
CAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGT < SRR4302540.1439422/94‑1 (MQ=60)
CAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGT < SRR4302540.3723174/94‑1 (MQ=60)
CAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGT < SRR4302540.3654036/94‑1 (MQ=60)
CAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGT < SRR4302540.3723172/94‑1 (MQ=60)
AGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTG < SRR4302540.5670838/94‑1 (MQ=60)
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CAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCTTGTGCG > SRR4302540.5458647/1‑94 (MQ=60)
CAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCC > SRR4302540.5458649/1‑94 (MQ=60)
AGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCG < SRR4302540.3175693/94‑1 (MQ=60)
GGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGG < SRR4302540.5896205/94‑1 (MQ=60)
GGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGG < SRR4302540.8679285/94‑1 (MQ=60)
GCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGG < SRR4302540.8821842/94‑1 (MQ=60)
GCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGG < SRR4302540.8821843/94‑1 (MQ=60)
ACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTA > SRR4302540.1329328/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAA > SRR4302540.2191313/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAA < SRR4302540.3973789/94‑1 (MQ=60)
CTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAA < SRR4302540.5860527/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAG > SRR4302540.3156786/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGC < SRR4302540.8121166/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCG < SRR4302540.8262572/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGG > SRR4302540.1965050/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTGGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGA < SRR4302540.201754/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGAT < SRR4302540.3520737/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGAT < SRR4302540.7672237/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGAT < SRR4302540.7218384/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATA < SRR4302540.10040779/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATA < SRR4302540.9361615/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATA > SRR4302540.105968/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATA < SRR4302540.10042421/94‑1 (MQ=60)
CTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAA < SRR4302540.3712323/94‑1 (MQ=60)
CTGGTAATGCGCCAGCATCATCTTGTTGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAA < SRR4302540.2367868/94‑1 (MQ=60)
TGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCTCGGTAAGCGTGATAAC > SRR4302540.2839839/1‑94 (MQ=60)
TGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAAC < SRR4302540.7099283/94‑1 (MQ=60)
TGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAAC > SRR4302540.106570/1‑94 (MQ=60)
TGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAAC > SRR4302540.106569/1‑94 (MQ=60)
TGGTAAGGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTGTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAAC < SRR4302540.7099282/94‑1 (MQ=60)
GGTAATGCTCCAGCCTCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGCTACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGCACGCGTGATAACA > SRR4302540.5193260/1‑94 (MQ=60)
GGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACA < SRR4302540.3437799/94‑1 (MQ=60)
GGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACA < SRR4302540.4810280/94‑1 (MQ=60)
GTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAG < SRR4302540.10084507/94‑1 (MQ=60)
GTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACAAAACGCCGAAGGTGCGGGGTAAGCGTGATAACAG > SRR4302540.3400143/1‑94 (MQ=60)
TAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGT < SRR4302540.7569916/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTT > SRR4302540.1929/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTG > SRR4302540.4171718/1‑94 (MQ=60)
TGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGG > SRR4302540.8850204/1‑94 (MQ=60)
GCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGT < SRR4302540.2870930/94‑1 (MQ=60)
TCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCA > SRR4302540.2863594/1‑94 (MQ=60)
TCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCC > SRR4302540.8257070/1‑94 (MQ=60)
TCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCC < SRR4302540.9215531/94‑1 (MQ=60)
TCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCC < SRR4302540.9672731/94‑1 (MQ=60)
CCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGACAACAGTTGGTCCA < SRR4302540.3771718/94‑1 (MQ=60)
CCAGCATCATATTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCA < SRR4302540.5477150/94‑1 (MQ=60)
CAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCAC < SRR4302540.8455101/94‑1 (MQ=60)
CAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCAC > SRR4302540.588048/1‑94 (MQ=60)
CAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCAC > SRR4302540.9400687/1‑94 (MQ=60)
CAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCAC < SRR4302540.4503431/94‑1 (MQ=60)
CAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCAC < SRR4302540.5269212/94‑1 (MQ=60)
CACCATCATCCTGTGGGTTTCGCGTCCGATACCTGATTGCTTGTACCCCCCCAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCAC < SRR4302540.5269211/94‑1 (MQ=60)
AGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACA < SRR4302540.5203365/94‑1 (MQ=60)
AGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACA > SRR4302540.1374416/1‑94 (MQ=60)
GCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACAC < SRR4302540.3728512/94‑1 (MQ=60)
GCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACAC < SRR4302540.5671188/94‑1 (MQ=60)
GCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACAC > SRR4302540.2096368/1‑94 (MQ=60)
GCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACAC < SRR4302540.6879022/94‑1 (MQ=60)
ATCATCTTGTGTGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTGGTAGCCACCAAACGCCTCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGC < SRR4302540.9403303/94‑1 (MQ=60)
ATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGC > SRR4302540.2864185/1‑94 (MQ=60)
ATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGC > SRR4302540.1952849/1‑94 (MQ=60)
ATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGC > SRR4302540.8521572/1‑94 (MQ=60)
ATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGC > SRR4302540.3306250/1‑94 (MQ=60)
ATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGC < SRR4302540.9403302/94‑1 (MQ=60)
ATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGC < SRR4302540.2389691/94‑1 (MQ=60)
ATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCGGATTGTTTGTAGCGACAAAACGCCGCATGGGCCGGGTGAGCGTGATGACAGTTGGTCCACACcg > SRR4302540.8521573/1‑92 (MQ=60)
ATCATCTTGGGGGCTTCGCGACCGATACCTGATAGCTTGTAGCCACTAAACGCCGCATGCGCCGGGCAAGCGCGAGAACAGATGGGCCACACGC > SRR4302540.7803670/1‑94 (MQ=32)
TCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCG < SRR4302540.4999521/94‑1 (MQ=60)
TCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCG < SRR4302540.9433884/94‑1 (MQ=60)
CATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGC < SRR4302540.7754155/94‑1 (MQ=60)
CATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGC < SRR4302540.4617638/94‑1 (MQ=60)
ATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCC > SRR4302540.4497341/1‑94 (MQ=60)
ATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCC > SRR4302540.9640847/1‑94 (MQ=60)
ATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCC < SRR4302540.7100646/94‑1 (MQ=60)
TCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCC < SRR4302540.9164559/94‑1 (MQ=60)
TCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCC > SRR4302540.9966194/1‑94 (MQ=60)
TTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAG > SRR4302540.5051093/1‑94 (MQ=60)
TGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGC > SRR4302540.2874135/1‑94 (MQ=60)
GTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGCGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCC > SRR4302540.1033502/1‑94 (MQ=60)
TGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCT < SRR4302540.3029743/94‑1 (MQ=60)
TGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCT < SRR4302540.4940615/94‑1 (MQ=60)
TGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCT > SRR4302540.2715475/1‑94 (MQ=60)
GGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTG < SRR4302540.3735480/94‑1 (MQ=60)
GGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGT < SRR4302540.87374/94‑1 (MQ=60)
GGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGT > SRR4302540.3104816/1‑94 (MQ=60)
GTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTA < SRR4302540.914866/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTAT < SRR4302540.5173147/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTAT < SRR4302540.4382485/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTAT < SRR4302540.7117277/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTAT < SRR4302540.7073954/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTAT < SRR4302540.8689448/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTAT > SRR4302540.6341490/1‑94 (MQ=60)
GTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTAT < SRR4302540.7354536/94‑1 (MQ=60)
TCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGC < SRR4302540.7150574/94‑1 (MQ=60)
CGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCC < SRR4302540.7911636/94‑1 (MQ=60)
CGCGACCGATACCTGATTGGTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGCGCCGGGTAAGCGCGAGAACAGCAGGTCCACACGCGCCCAGCCCGTAGGCC > SRR4302540.7806293/1‑94 (MQ=60)
CGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCC > SRR4302540.4754762/1‑94 (MQ=60)
GCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCG < SRR4302540.6540648/94‑1 (MQ=60)
CGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGC > SRR4302540.4556591/1‑94 (MQ=60)
GACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCG < SRR4302540.1743065/94‑1 (MQ=60)
GACCAATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTAATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCG < SRR4302540.4894614/94‑1 (MQ=60)
ACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGC > SRR4302540.7721903/1‑94 (MQ=60)
ACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGC > SRR4302540.8096348/1‑94 (MQ=60)
CCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATTCCGCGCC > SRR4302540.7209484/1‑94 (MQ=60)
CCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCC < SRR4302540.5352253/94‑1 (MQ=60)
CGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCC < SRR4302540.2280299/94‑1 (MQ=60)
CGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCC < SRR4302540.9810562/94‑1 (MQ=60)
CGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCC < SRR4302540.4115417/94‑1 (MQ=60)
GATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCC > SRR4302540.1885479/1‑94 (MQ=60)
GATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCC > SRR4302540.3125984/1‑94 (MQ=60)
GATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCC < SRR4302540.7614627/94‑1 (MQ=60)
GATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCC < SRR4302540.906711/94‑1 (MQ=60)
ATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCA > SRR4302540.1556323/1‑94 (MQ=60)
ATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCA > SRR4302540.10013416/1‑94 (MQ=60)
ATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCA > SRR4302540.3248799/1‑94 (MQ=60)
TACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCAT > SRR4302540.6989052/1‑94 (MQ=60)
TACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCAT > SRR4302540.6989053/1‑94 (MQ=60)
ACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATC < SRR4302540.7920820/94‑1 (MQ=60)
CCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCCTCT > SRR4302540.4819148/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCT > SRR4302540.4819144/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCCTCT > SRR4302540.7872194/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCCTCT > SRR4302540.7283366/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCT < SRR4302540.8626274/94‑1 (MQ=60)
CCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCT < SRR4302540.9347383/94‑1 (MQ=60)
CCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCT > SRR4302540.7283365/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTCCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCT < SRR4302540.7676123/94‑1 (MQ=60)
CTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTT > SRR4302540.3165835/1‑94 (MQ=60)
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TGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTTA > SRR4302540.5622560/1‑94 (MQ=60)
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ATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTTATA < SRR4302540.200422/94‑1 (MQ=60)
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ATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTTATA < SRR4302540.8673879/94‑1 (MQ=60)
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CAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTTATAGGCC > NC_000913/3752615‑3752801
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
