Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,752,708 |
T→C |
K478K (AAA→AAG) |
b3588 ← |
aldehyde dehydrogenase B |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,752,708 | 0 | T | C | 100.0%
| 728.7
/ NA
| 220 | K478K (AAA→AAG) | b3588 | aldehyde dehydrogenase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (120/100); total (120/100) |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
CGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTTATA > NC_000913/3752618‑3752797
|
cGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGAttgctt < 1:6306806/93‑1 (MQ=255)
ggTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGAttgcttg > 1:1333445/1‑93 (MQ=255)
gTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGAttgcttgt > 2:4455704/1‑93 (MQ=255)
tttATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTa < 2:2583344/93‑1 (MQ=255)
tATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATTCCTGATTGCTTGTAGc < 2:3757590/93‑1 (MQ=255)
tATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGc < 2:3680381/93‑1 (MQ=255)
tATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGc < 2:4144202/93‑1 (MQ=255)
ccGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGccac < 1:5095325/93‑1 (MQ=255)
gAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGccacca < 1:4368619/93‑1 (MQ=255)
aGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCaa > 1:6082216/1‑93 (MQ=255)
gTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCaaa > 1:3210742/1‑93 (MQ=255)
gTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCaaa > 2:545853/1‑93 (MQ=255)
tAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAc < 1:3396466/93‑1 (MQ=255)
tAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAc > 1:5663070/1‑93 (MQ=255)
aGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAcg > 1:4665143/1‑93 (MQ=255)
aGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAcg < 1:754082/93‑1 (MQ=255)
gCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAcgc < 1:957273/93‑1 (MQ=255)
gCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAcgc < 2:6309073/93‑1 (MQ=255)
gCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAcgc < 2:3797507/93‑1 (MQ=255)
tCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAcgccg > 1:3980690/1‑93 (MQ=255)
tCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAcgccg > 2:5933974/1‑93 (MQ=255)
ccAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCAt < 2:5883397/93‑1 (MQ=255)
ccAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCAt > 1:353808/1‑93 (MQ=255)
ccAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCAt > 2:104650/1‑93 (MQ=255)
ccAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCAt > 2:722720/1‑93 (MQ=255)
agcagGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCAAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCAtgt < 1:3441062/93‑1 (MQ=255)
gcagGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCAtgtg > 2:3868362/1‑93 (MQ=255)
cagGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGc > 1:2228679/1‑93 (MQ=255)
cagGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGc > 2:3775800/1‑93 (MQ=255)
agGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGcc > 1:1012089/1‑93 (MQ=255)
agGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGcc > 1:1597599/1‑93 (MQ=255)
gCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCTTGTGCCgg < 2:6139841/93‑1 (MQ=255)
gCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCgg < 2:4924283/93‑1 (MQ=255)
aCTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGt < 2:4685574/93‑1 (MQ=255)
aCTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGt < 2:818849/93‑1 (MQ=255)
cTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTa > 2:5415923/1‑93 (MQ=255)
ggTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGc > 2:1272352/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCg > 1:3289501/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCg > 2:6218639/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTg > 2:3011951/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGa > 1:4158443/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGAt < 2:1566463/93‑1 (MQ=255)
tGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATaa > 1:542031/1‑93 (MQ=255)
tGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATaa > 1:2498697/1‑93 (MQ=255)
ggTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTATCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAAc < 1:1904978/93‑1 (MQ=255)
ggTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAAc > 1:3265457/1‑93 (MQ=255)
ggTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAAc < 1:1695595/93‑1 (MQ=255)
gTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACa < 2:3201770/93‑1 (MQ=255)
tAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAg < 1:3815515/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGt < 1:1515112/93‑1 (MQ=255)
aTGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGtt < 2:5603473/93‑1 (MQ=255)
aTGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGtt > 1:2738146/1‑93 (MQ=255)
ccAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTcc > 2:5088013/1‑93 (MQ=255)
cAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCca > 1:3890083/1‑93 (MQ=255)
cAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCca < 2:3476248/93‑1 (MQ=255)
aGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCcac < 2:1103820/93‑1 (MQ=255)
aGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCcac > 1:5240130/1‑93 (MQ=255)
aGCATCATCTGGTGTGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCcac < 2:2976577/93‑1 (MQ=255)
gCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCGCCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCcaca < 1:4488446/93‑1 (MQ=255)
gCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCcaca > 1:5795255/1‑93 (MQ=255)
gCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCcaca > 1:6173957/1‑93 (MQ=255)
tcatcTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACAcgc > 1:4724889/1‑93 (MQ=255)
tcTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGcc < 2:4940985/93‑1 (MQ=255)
cTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGccc > 1:4421620/1‑93 (MQ=255)
ttGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCa < 1:369079/93‑1 (MQ=255)
tgtgGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAg > 1:186549/1‑93 (MQ=255)
gtgGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGc > 2:2120414/1‑93 (MQ=255)
tgGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGcc > 1:2115876/1‑93 (MQ=255)
tgGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGcc < 1:3061492/93‑1 (MQ=255)
tgGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGcc < 2:2796576/93‑1 (MQ=255)
tgGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGcc > 1:6024534/1‑93 (MQ=255)
gggTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCt > 1:5873231/1‑93 (MQ=255)
gTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGt < 2:1321957/93‑1 (MQ=255)
tttCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTa > 1:4687948/1‑93 (MQ=255)
tttCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTa < 2:2191327/93‑1 (MQ=255)
tttCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTa < 1:1398667/93‑1 (MQ=255)
tttCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTa > 2:1499629/1‑93 (MQ=255)
tttCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCCGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTa > 1:865307/1‑93 (MQ=255)
ttCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTAt < 2:3304161/93‑1 (MQ=255)
ttCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTAt < 2:1876109/93‑1 (MQ=255)
tCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATg < 1:5512502/93‑1 (MQ=255)
cgACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCcg > 1:3995601/1‑93 (MQ=255)
cgACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCcg < 2:4788963/93‑1 (MQ=255)
gACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCcgc > 1:124312/1‑93 (MQ=255)
gACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCcgc < 2:2290629/93‑1 (MQ=255)
aCCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCcgcg > 2:3591075/1‑93 (MQ=255)
aCCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCcgcg < 2:2001601/93‑1 (MQ=255)
ccGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCgcgc > 2:112759/1‑93 (MQ=255)
ccGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCgcgc > 2:3088590/1‑93 (MQ=255)
ccGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCgcgc > 2:1383093/1‑93 (MQ=255)
cGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGcc > 1:407563/1‑93 (MQ=255)
gATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGccc > 1:2968809/1‑93 (MQ=255)
aTACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGcccc > 2:6236710/1‑93 (MQ=255)
aTACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGcccc < 2:1431566/93‑1 (MQ=255)
aCCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCAt > 2:4580612/1‑93 (MQ=255)
ccTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATc < 2:2692974/93‑1 (MQ=255)
ccTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATc > 2:182078/1‑93 (MQ=255)
tGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCtt > 2:52532/1‑93 (MQ=255)
aTTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTtat > 2:3235116/1‑93 (MQ=255)
ttgcttgtAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTtata < 1:1279641/93‑1 (MQ=255)
|
CGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTTATA > NC_000913/3752618‑3752797
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTTATAGGCC > NC_000913/3752615‑3752801
|
CAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGC < SRR4302533.3447948/94‑1 (MQ=60)
AACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCT > SRR4302533.1872383/1‑94 (MQ=60)
AACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCCCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCT > SRR4302533.6083422/1‑94 (MQ=60)
ACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTT < SRR4302533.4167631/94‑1 (MQ=60)
ACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTT < SRR4302533.5220535/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTG > SRR4302533.1341448/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTG > SRR4302533.5378162/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTG < SRR4302533.6344591/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTG > SRR4302533.6267008/1‑94 (MQ=60)
TTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAG < SRR4302533.935151/94‑1 (MQ=60)
ATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCA > SRR4302533.5821264/1‑94 (MQ=60)
CCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACC < SRR4302533.5126110/94‑1 (MQ=60)
GAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAA > SRR4302533.6118993/1‑94 (MQ=60)
GAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAA < SRR4302533.3286739/94‑1 (MQ=60)
GAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAA < SRR4302533.4394991/94‑1 (MQ=60)
AGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAA > SRR4302533.3230517/1‑94 (MQ=60)
GTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAC > SRR4302533.5697284/1‑94 (MQ=60)
GTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAC < SRR4302533.4018633/94‑1 (MQ=60)
GTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAAC < SRR4302533.2628861/94‑1 (MQ=60)
TAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACG < SRR4302533.3417440/94‑1 (MQ=60)
TAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACG > SRR4302533.4693407/1‑94 (MQ=60)
TAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACG < SRR4302533.1610700/94‑1 (MQ=60)
AGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGC > SRR4302533.3731060/1‑94 (MQ=60)
AGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGC < SRR4302533.758521/94‑1 (MQ=60)
AGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGC > SRR4302533.5914593/1‑94 (MQ=60)
AGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGACTGCTTGTAGCCACCAAACGC > SRR4302533.6111880/1‑94 (MQ=60)
GCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCC < SRR4302533.2330444/94‑1 (MQ=60)
GCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCC < SRR4302533.962902/94‑1 (MQ=60)
CTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCG < SRR4302533.4740883/94‑1 (MQ=60)
CTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCG > SRR4302533.4004926/1‑94 (MQ=60)
CTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCG > SRR4302533.1650458/1‑94 (MQ=60)
ACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCAT > SRR4302533.355966/1‑94 (MQ=60)
CCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATG < SRR4302533.743175/94‑1 (MQ=60)
CAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGT < SRR4302533.205594/94‑1 (MQ=60)
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AGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCAAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTG < SRR4302533.3462310/94‑1 (MQ=60)
GCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGC > SRR4302533.2242435/1‑94 (MQ=60)
GCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGC > SRR4302533.5633321/1‑94 (MQ=60)
CAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCC > SRR4302533.1018012/1‑94 (MQ=60)
CAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCC > SRR4302533.1607273/1‑94 (MQ=60)
CAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCC < SRR4302533.3478917/94‑1 (MQ=60)
AGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCG > SRR4302533.1255092/1‑94 (MQ=60)
GCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGG < SRR4302533.3198300/94‑1 (MQ=60)
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TTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAG < SRR4302533.1361530/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCG > SRR4302533.3309810/1‑94 (MQ=60)
TTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTG > SRR4302533.4505160/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGA > SRR4302533.4183642/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGAT < SRR4302533.3647694/94‑1 (MQ=60)
CTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAA > SRR4302533.545251/1‑94 (MQ=60)
CTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAA > SRR4302533.5535983/1‑94 (MQ=60)
CTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAA > SRR4302533.3353054/1‑94 (MQ=60)
CTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAA > SRR4302533.2514113/1‑94 (MQ=60)
TGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAAC > SRR4302533.3285608/1‑94 (MQ=60)
GGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTATCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACA < SRR4302533.1916600/94‑1 (MQ=60)
GGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACA < SRR4302533.5123002/94‑1 (MQ=60)
GGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACA < SRR4302533.1705862/94‑1 (MQ=60)
TAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGGTTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGT > SRR4302533.4461408/1‑94 (MQ=60)
TAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGT < SRR4302533.1905230/94‑1 (MQ=60)
TAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGT < SRR4302533.3838846/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTT < SRR4302533.1524236/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTT > SRR4302533.2754936/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTG < SRR4302533.1798444/94‑1 (MQ=60)
GCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGT < SRR4302533.4426814/94‑1 (MQ=60)
TCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTTTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGGTTGTCC > SRR4302533.5173894/1‑94 (MQ=60)
TCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCC > SRR4302533.1394412/1‑94 (MQ=60)
TCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTCGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCC > SRR4302533.3404759/1‑94 (MQ=60)
CCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCA > SRR4302533.3913818/1‑94 (MQ=60)
CAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCAC > SRR4302533.5271633/1‑94 (MQ=60)
CAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCAC > SRR4302533.6178535/1‑94 (MQ=60)
CAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCAC < SRR4302533.3460548/94‑1 (MQ=60)
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AGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACA > SRR4302533.6211060/1‑94 (MQ=60)
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GCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCGCCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACAC < SRR4302533.4515617/94‑1 (MQ=60)
GCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACAC < SRR4302533.610864/94‑1 (MQ=60)
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ATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGC > SRR4302533.4753537/1‑94 (MQ=60)
ATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCC > SRR4302533.1107661/1‑94 (MQ=60)
ATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCC > SRR4302533.3176275/1‑94 (MQ=60)
TCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCC > SRR4302533.4448353/1‑94 (MQ=60)
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TTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAG < SRR4302533.3947754/94‑1 (MQ=60)
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TGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCT > SRR4302533.5908731/1‑94 (MQ=60)
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GTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTA > SRR4302533.4716362/1‑94 (MQ=60)
GTTTCGCGACCGATACCTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCCGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTA > SRR4302533.870374/1‑94 (MQ=60)
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ctgtaTGATTGCTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCA < SRR4302533.824005/89‑1 (MQ=60)
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CAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATACCTGATTGTTTGTAGCCACCAAACGCCGCATGTGCCGGGTAAGCGTGATAACAGTTGGTCCACACGCGCCCAGCCTGTATGCCGCGCCCCATCTTATAGGCC > NC_000913/3752615‑3752801
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
