Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,338,481 |
C→T |
A189V (GCC→GTC) |
yrbG → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,338,481 | 0 | C | T | 99.5%
| 803.1
/ NA
| 219 | A189V (GCC→GTC) | yrbG | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (65/153); minor base G (1/0); total (66/153) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.01e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTATCG > NC_000913/3338391‑3338570
|
ccAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCa < 2:1201731/93‑1 (MQ=255)
cAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCAc < 2:6288717/93‑1 (MQ=255)
cAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCAc < 2:1165074/93‑1 (MQ=255)
cAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCAc > 1:5070886/1‑93 (MQ=255)
agagagCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCCTTGCGCTTTTCATCATGCCCGTGGTCAcc > 1:2091244/1‑92 (MQ=255)
agagagCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCAcg < 1:5430271/93‑1 (MQ=255)
gagagCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCAcgc < 1:1445543/93‑1 (MQ=255)
gagagCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCAcgc > 2:3240742/1‑93 (MQ=255)
gagCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCgg < 1:6025555/93‑1 (MQ=255)
agcagcTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCCTTTCGCTTATTATCATTCCCGTGGTGAcgccgg > 2:1093241/1‑90 (MQ=255)
gcagcTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCgggt > 2:4972622/1‑91 (MQ=255)
gcagcTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGAt < 2:6064369/93‑1 (MQ=255)
cagcTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATTCTGGCAGGGGGCACGCGGGtg > 1:6156239/1‑93 (MQ=255)
cagcTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGAtg < 2:1748771/93‑1 (MQ=255)
cagcTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGAtg < 2:3331970/93‑1 (MQ=255)
cagcTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGAtg < 1:6069206/93‑1 (MQ=255)
agcTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGAtgg < 1:4229111/93‑1 (MQ=255)
agcTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGAtgg < 1:3458353/93‑1 (MQ=255)
gcTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGGCTTGCGCTTATTATCATGACAGTGGTCCCGCGGAgggg > 2:1544221/1‑92 (MQ=255)
ttGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGAtggtgg < 2:1007156/93‑1 (MQ=255)
gCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGtt < 1:2731173/93‑1 (MQ=255)
cAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTg < 1:1649127/93‑1 (MQ=255)
agagCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGGTGa > 2:3904725/1‑93 (MQ=255)
gagCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGGATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGAt > 1:4943807/1‑93 (MQ=255)
gagCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGAt < 1:752124/93‑1 (MQ=255)
gagCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGGTGAt > 2:4258837/1‑93 (MQ=255)
gagCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCCGCCTTTCGCTTATCATCATGCCCGTGGTCACGCCGATGGTGGGTGAt > 2:2361867/1‑93 (MQ=255)
gCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATaa < 2:298991/93‑1 (MQ=255)
gCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATaa < 1:151042/93‑1 (MQ=255)
gCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCCGCATTTCGCTTATCATCATGCCACTGGTCACGCGGGTGGTGGGTGATaa > 2:5492925/1‑93 (MQ=255)
gCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGc < 2:4120882/93‑1 (MQ=255)
ccccgTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGcc < 2:5857433/90‑1 (MQ=255)
cgcgTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCa > 1:3993808/1‑93 (MQ=255)
gcgTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCAc < 2:5402389/93‑1 (MQ=255)
gTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGGATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGGGGTTGATAAAGCCACgg > 2:3418956/1‑93 (MQ=255)
aCGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGc < 2:4608867/93‑1 (MQ=255)
cggcggATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCt < 1:2659058/93‑1 (MQ=255)
ggcggATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTg < 1:1709753/93‑1 (MQ=255)
ggcggATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCCGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGGTGATAACGCCACGGTGCTg > 2:3557761/1‑93 (MQ=255)
gcggATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTgg > 2:2861447/1‑93 (MQ=255)
ggATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATTATCATGCCCGTGGTCACGCGGGTGGTGGGTGATAAAGCCACCGTGCTcgcg > 2:6003727/1‑93 (MQ=255)
ggATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCg < 2:1471712/93‑1 (MQ=255)
gATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGGGCTTTTTATCATTCCAGTGGTCACCCGGCTGGTGGTTGATAACGTCACCGTGCTGGCGa > 2:4761807/1‑93 (MQ=255)
gATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCCGCATTGCGCTTTTCATCATATCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGa > 2:5814279/1‑93 (MQ=255)
aTTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGaa < 2:4500277/93‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGaa < 1:3231716/93‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGaa > 2:1887194/1‑93 (MQ=255)
ttGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAAt < 2:6204737/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAAt > 1:4679484/1‑93 (MQ=255)
tGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAAtt < 1:1661919/93‑1 (MQ=255)
tGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCCGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACCGTGCTCGCGAAtt > 1:2057010/1‑93 (MQ=255)
gCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTa < 1:5343250/93‑1 (MQ=255)
gCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTa < 1:1360767/93‑1 (MQ=255)
ccGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTTGCGAATTACt > 1:3482779/1‑93 (MQ=255)
cGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACtt < 1:3943441/93‑1 (MQ=255)
cGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACtt < 1:3266159/93‑1 (MQ=255)
gTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACttt < 1:1863315/93‑1 (MQ=255)
gTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACttt > 2:5215256/1‑93 (MQ=255)
gTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGGTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACttt > 1:287146/1‑93 (MQ=255)
tCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTg < 2:2177322/93‑1 (MQ=255)
gcgTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTggc > 2:1520889/1‑91 (MQ=255)
cgTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCa < 1:1745233/93‑1 (MQ=255)
gTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCAt < 2:2554731/93‑1 (MQ=255)
tttttATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATc < 2:1389303/93‑1 (MQ=255)
tttttATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATc > 2:1630600/1‑93 (MQ=255)
tttttATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATc < 2:1939208/93‑1 (MQ=255)
tttttATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATc > 1:5672690/1‑93 (MQ=255)
tttttATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATc > 2:781559/1‑93 (MQ=255)
ttttATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCa > 2:1254189/1‑93 (MQ=255)
ttttATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCa < 2:352904/93‑1 (MQ=255)
ttttATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCa < 1:4750109/93‑1 (MQ=255)
ttATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGc > 2:4316407/1‑93 (MQ=255)
ttATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGc < 1:2012049/93‑1 (MQ=255)
tATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCg < 1:453806/93‑1 (MQ=255)
aTGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGa < 2:5614864/93‑1 (MQ=255)
gCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGtt < 1:2283369/93‑1 (MQ=255)
gCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGtt < 1:3678367/93‑1 (MQ=255)
tCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGa < 2:813631/93‑1 (MQ=255)
tCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGa < 1:3293249/93‑1 (MQ=255)
cGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGAc < 1:105316/93‑1 (MQ=255)
gCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGa > 1:4313750/1‑93 (MQ=255)
aTTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATg < 2:4022468/93‑1 (MQ=255)
gcgcTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGCCGATGGGt > 1:1246590/1‑93 (MQ=255)
cgcTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTc > 2:2460475/1‑93 (MQ=255)
cTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTg < 2:755900/93‑1 (MQ=255)
ttATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGa < 1:25052/93‑1 (MQ=255)
tATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGAc > 1:381897/1‑93 (MQ=255)
tcatGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCaa > 2:1328374/1‑93 (MQ=255)
atGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAAtt > 2:3823480/1‑93 (MQ=255)
atGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAAtt < 2:2721821/93‑1 (MQ=255)
tGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTg > 2:3703644/1‑93 (MQ=255)
tGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTg < 1:5336776/93‑1 (MQ=255)
gCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCGGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGc < 1:30769/93‑1 (MQ=255)
ccAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCt > 2:5233605/1‑93 (MQ=255)
aGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTAt > 1:4114094/1‑93 (MQ=255)
aGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTAt > 1:109794/1‑93 (MQ=255)
aGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTAt > 1:903829/1‑93 (MQ=255)
aGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTCTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTAt < 1:4428789/93‑1 (MQ=255)
gTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTATc < 1:234636/93‑1 (MQ=255)
gTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTATc > 1:4795608/1‑93 (MQ=255)
|
CCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTATCG > NC_000913/3338391‑3338570
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGACCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTATCGGAAC > NC_000913/3338388‑3338574
|
TGACCAGATAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGT < SRR4302533.5690606/94‑1 (MQ=60)
TGACCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGGATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGT > SRR4302533.2031886/1‑94 (MQ=60)
TGACCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCCTTGCGCTTTTCATCATGCCAGTGGG > SRR4302533.1478814/1‑94 (MQ=60)
GACCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCCGCATTGCGCTTATTATCATGCCAGTGGTC > SRR4302533.3084433/1‑94 (MQ=60)
ACCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATTATGCCAGTGGTCA > SRR4302533.2783894/1‑94 (MQ=60)
ACCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCA < SRR4302533.504321/94‑1 (MQ=60)
CCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCAC < SRR4302533.387021/94‑1 (MQ=60)
CCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCAC < SRR4302533.3693524/94‑1 (MQ=60)
CCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCAC > SRR4302533.5101539/1‑94 (MQ=60)
CCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCAC < SRR4302533.4305716/94‑1 (MQ=60)
CAGAGAGCAGCTTGGAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACG < SRR4302533.4205036/94‑1 (MQ=60)
AGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGC < SRR4302533.5462975/94‑1 (MQ=60)
GAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCG < SRR4302533.1454266/94‑1 (MQ=60)
GAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGA < SRR4302533.6062067/94‑1 (MQ=60)
CAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGG < SRR4302533.6105928/94‑1 (MQ=60)
AGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGT < SRR4302533.4254679/94‑1 (MQ=60)
AGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGT < SRR4302533.3479703/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTG < SRR4302533.1765468/94‑1 (MQ=60)
CTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGG < SRR4302533.2072148/94‑1 (MQ=60)
GCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTG < SRR4302533.2747931/94‑1 (MQ=60)
GCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTG < SRR4302533.6192300/94‑1 (MQ=60)
CAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGA < SRR4302533.1659120/94‑1 (MQ=60)
AGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGGATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGAT > SRR4302533.4973733/1‑94 (MQ=60)
AGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTTTCATCATTCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGGT > SRR4302533.1470540/1‑94 (MQ=60)
GAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATA < SRR4302533.3716587/94‑1 (MQ=60)
GAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATA < SRR4302533.756556/94‑1 (MQ=60)
AGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAA < SRR4302533.4804974/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATTGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAAC > SRR4302533.1605486/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAAC < SRR4302533.3374208/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAAC < SRR4302533.152010/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAAC < SRR4302533.5431844/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAAC < SRR4302533.2810282/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCCTTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGGTGGTGGgtggtaaac > SRR4302533.3288582/1‑85 (MQ=60)
TGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCCGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGC > SRR4302533.2178317/1‑94 (MQ=60)
CCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCA > SRR4302533.5671842/1‑94 (MQ=60)
CCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCA > SRR4302533.4018128/1‑94 (MQ=60)
CCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGGTGATAACGCCA > SRR4302533.4686656/1‑94 (MQ=60)
CCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCCGCATTGCGCTTATCATCATGCCCGTGGTCACGCGGAGGGTGGgtgattacggcc > SRR4302533.1580776/1‑82 (MQ=60)
CGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCAATGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTTACGCGGGTGGTGGTTGATAACGCCAC > SRR4302533.4476583/1‑94 (MQ=60)
GCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACG < SRR4302533.953188/94‑1 (MQ=60)
GTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGT < SRR4302533.4041163/94‑1 (MQ=60)
GTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGT < SRR4302533.5371676/94‑1 (MQ=60)
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GTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGGCACGCGGATGGTGGGTGATAACGCCACGGT > SRR4302533.2304071/1‑94 (MQ=60)
TGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTG < SRR4302533.1729821/94‑1 (MQ=60)
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ACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCCTCATGCCAGTGGGCACGCGGATGGGGGTTGATAACGCCACGGTGCT > SRR4302533.4002645/1‑94 (MQ=60)
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CGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTG < SRR4302533.2675390/94‑1 (MQ=60)
GGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGG < SRR4302533.1720116/94‑1 (MQ=60)
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TTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCCGTGGTCACGCGGATGGTGGGTGATAACGCCACGGTGCTTGCGAATT > SRR4302533.4792020/1‑94 (MQ=60)
TTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGGATT > SRR4302533.1375154/1‑94 (MQ=60)
TTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATT < SRR4302533.4945533/94‑1 (MQ=60)
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TGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTA < SRR4302533.1671966/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTAC < SRR4302533.1368942/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTAC < SRR4302533.5375292/94‑1 (MQ=60)
CCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTTGCGAATTACT > SRR4302533.3504263/1‑94 (MQ=60)
CCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACT > SRR4302533.1665047/1‑94 (MQ=60)
CCGTCGTGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGTCAGTGGTCACGCGAATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTT < SRR4302533.3188980/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTT < SRR4302533.4117086/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTT > SRR4302533.3500361/1‑94 (MQ=60)
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CGTCGCGTTTTTATGGCTCCGCATTGCGCCTTTCATCAAGCCAATGGTCACCCGGGTGGGGGTTGATAACGCCACcgtgccgggggaatacttt > SRR4302533.3287042/1‑75 (MQ=19)
GTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTG < SRR4302533.2346501/94‑1 (MQ=60)
GTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTG < SRR4302533.1874682/94‑1 (MQ=60)
CGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCC < SRR4302533.2683633/94‑1 (MQ=60)
GCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCA < SRR4302533.5354173/94‑1 (MQ=60)
CGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCAT < SRR4302533.1755850/94‑1 (MQ=60)
GTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATC > SRR4302533.5706950/1‑94 (MQ=60)
TTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAG < SRR4302533.70390/94‑1 (MQ=60)
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TTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAG < SRR4302533.4778909/94‑1 (MQ=60)
TTTATGGCTCGGCATGGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGC < SRR4302533.2079634/94‑1 (MQ=60)
TTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCG < SRR4302533.2024444/94‑1 (MQ=60)
TATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGA < SRR4302533.456520/94‑1 (MQ=60)
TATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGA < SRR4302533.1696926/94‑1 (MQ=60)
TATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGA < SRR4302533.2645466/94‑1 (MQ=60)
TTGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAG < SRR4302533.3698462/94‑1 (MQ=60)
GCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTG < SRR4302533.2297503/94‑1 (MQ=60)
GCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTG < SRR4302533.3700977/94‑1 (MQ=60)
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GGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGA > SRR4302533.3462519/1‑94 (MQ=60)
GGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGA > SRR4302533.4339718/1‑94 (MQ=60)
GCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGAT < SRR4302533.5850964/94‑1 (MQ=60)
CATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATG > SRR4302533.4216172/1‑94 (MQ=60)
CATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATG > SRR4302533.877370/1‑94 (MQ=60)
CATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATG > SRR4302533.6182096/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGG < SRR4302533.3276705/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGG < SRR4302533.2926696/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGG < SRR4302533.5103603/94‑1 (MQ=60)
TGCGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGCCGATGGGT > SRR4302533.1254032/1‑94 (MQ=60)
CGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCT < SRR4302533.894766/94‑1 (MQ=60)
CGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCT < SRR4302533.1198560/94‑1 (MQ=60)
CGCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCT < SRR4302533.168325/94‑1 (MQ=60)
GCTTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTG < SRR4302533.469454/94‑1 (MQ=60)
TTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGAC < SRR4302533.445351/94‑1 (MQ=60)
TTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGAC < SRR4302533.25219/94‑1 (MQ=60)
TTATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGAC > SRR4302533.384199/1‑94 (MQ=60)
ATCATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGG > SRR4302533.3254198/1‑94 (MQ=60)
CATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGGTGACGATGGGTCTGACGGCA > SRR4302533.1403654/1‑94 (MQ=60)
ATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAA > SRR4302533.5006380/1‑94 (MQ=60)
ATCATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAA > SRR4302533.1806012/1‑94 (MQ=60)
CATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATT > SRR4302533.2907054/1‑94 (MQ=60)
CATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATT < SRR4302533.1975343/94‑1 (MQ=60)
CATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATT < SRR4302533.1318977/94‑1 (MQ=60)
ATGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTG < SRR4302533.5436261/94‑1 (MQ=60)
TGCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGC < SRR4302533.5368767/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCGGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCT < SRR4302533.30981/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCT > SRR4302533.505605/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCT < SRR4302533.3150553/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCT < SRR4302533.2552519/94‑1 (MQ=60)
CAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTAT > SRR4302533.110490/1‑94 (MQ=60)
CAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTAT > SRR4302533.4139095/1‑94 (MQ=60)
CAGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTAT > SRR4302533.909128/1‑94 (MQ=60)
AGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTATC > SRR4302533.4824658/1‑94 (MQ=60)
AGTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTCTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTATC < SRR4302533.4455563/94‑1 (MQ=60)
GTGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTATCG < SRR4302533.236084/94‑1 (MQ=60)
TGGTCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTATCGG < SRR4302533.4722919/94‑1 (MQ=60)
TCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTATCGGAAC < SRR4302533.6216981/94‑1 (MQ=60)
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TGACCAGAGAGCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGACGGCAATTGCTATCGGAAC > NC_000913/3338388‑3338574
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
