Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,496,430 |
T→C |
I322I (ATT→ATC) |
cysG → |
uroporphyrinogen III methylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,496,430 | 0 | T | C | 100.0%
| 616.3
/ NA
| 191 | I322I (ATT→ATC) | cysG | uroporphyrinogen III methylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (98/93); total (98/93) |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
AGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG > NC_000913/3496340‑3496519
|
aaaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtc > 1:3968102/1‑93 (MQ=255)
aaaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGAGAGCCGTTTATTTTTGGCCGTCGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtc < 2:1955194/93‑1 (MQ=255)
aaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtct > 2:2096032/1‑93 (MQ=255)
aaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtct > 2:2581638/1‑93 (MQ=255)
cgcgTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACTCTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCg < 2:5490732/93‑1 (MQ=255)
gtggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtg < 2:5086899/93‑1 (MQ=255)
tggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtgg > 1:4006692/1‑93 (MQ=255)
ggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtggt > 1:1089954/1‑93 (MQ=255)
ggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtggt < 2:2828834/93‑1 (MQ=255)
ggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtggt < 2:816125/93‑1 (MQ=255)
gtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGtt < 2:1257571/93‑1 (MQ=255)
ggCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTc < 1:2071950/92‑1 (MQ=255)
cGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCg < 2:3863726/93‑1 (MQ=255)
ggCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCgg > 2:1090214/1‑93 (MQ=255)
gCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCggg > 2:2862630/1‑93 (MQ=255)
gCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCggg > 1:5625358/1‑93 (MQ=255)
gCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCggg < 1:1808817/93‑1 (MQ=255)
gAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTAt < 1:804149/93‑1 (MQ=255)
aaGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTa < 2:2048396/93‑1 (MQ=255)
aGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTAc < 1:6143633/93‑1 (MQ=255)
aGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTAc > 2:1811283/1‑93 (MQ=255)
gCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAg > 2:153727/1‑93 (MQ=255)
cGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGc < 1:5288967/93‑1 (MQ=255)
gATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCt > 2:631816/1‑93 (MQ=255)
gATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCt > 2:2245968/1‑93 (MQ=255)
gATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCt > 1:2625155/1‑93 (MQ=255)
gATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCt > 1:2433302/1‑93 (MQ=255)
aTCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCtt > 1:2090832/1‑93 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTc > 2:947180/1‑93 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTc > 2:4070703/1‑93 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTc > 1:3109215/1‑93 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACAGCAGCTTc > 2:1972869/1‑93 (MQ=255)
ccGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCt > 2:4411350/1‑93 (MQ=255)
ggTTTATTTTTGGCCGTGGGGGAGAAGAGATGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCGCGTTCTCGGGGGTTCCGGGTATTACGGCAGCTTCTg > 2:417220/2‑93 (MQ=255)
cGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTg < 1:143350/93‑1 (MQ=255)
tttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAGACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGt < 1:1030980/93‑1 (MQ=255)
tttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGt > 2:185030/1‑93 (MQ=255)
tttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGt > 1:364819/1‑93 (MQ=255)
ttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGtt > 2:5101880/1‑93 (MQ=255)
aTTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGc < 2:2362486/93‑1 (MQ=255)
tttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGct > 2:5838160/1‑93 (MQ=255)
ttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGctc < 1:4183087/93‑1 (MQ=255)
ttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGctc > 2:4252577/1‑93 (MQ=255)
tttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGctct < 2:2385802/93‑1 (MQ=255)
tGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGc > 2:3352031/1‑93 (MQ=255)
cGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAGCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAt < 2:927076/93‑1 (MQ=255)
cGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAt > 1:5146327/1‑93 (MQ=255)
gtggtgGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAtt > 1:5928227/1‑93 (MQ=255)
gtggtgGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAtt > 2:1363017/1‑93 (MQ=255)
ggtggCGAAGAGGTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTGGCTCTGCCTATTCg < 2:3563797/93‑1 (MQ=255)
ggtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCg < 1:3799395/93‑1 (MQ=255)
gtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCgg > 1:2828352/1‑93 (MQ=255)
gtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCgg > 1:2147544/1‑93 (MQ=255)
gtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCgg < 1:131592/93‑1 (MQ=255)
tggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCggg < 1:4306967/93‑1 (MQ=255)
cGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAt < 1:3626920/93‑1 (MQ=255)
gAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAtt < 2:4844059/93‑1 (MQ=255)
gAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAtt < 2:2925155/93‑1 (MQ=255)
aacagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTc > 1:424546/4‑93 (MQ=255)
aaGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTc < 1:6101762/93‑1 (MQ=255)
agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGTTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTcc < 1:698480/93‑1 (MQ=255)
gagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCa < 2:3731957/93‑1 (MQ=255)
cTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTc > 2:3590272/1‑93 (MQ=255)
cTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTc < 2:2694179/93‑1 (MQ=255)
tGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCa < 1:6014798/93‑1 (MQ=255)
tGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCa > 2:1214174/1‑93 (MQ=255)
tGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCa > 1:1607114/1‑93 (MQ=255)
ggAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGTTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAc > 1:5264791/1‑93 (MQ=255)
ggAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAc > 2:455672/1‑93 (MQ=255)
ggAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAc > 1:3875686/1‑93 (MQ=255)
ggAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAc > 2:3547087/1‑93 (MQ=255)
aaCACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGTAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCa < 1:3372693/93‑1 (MQ=255)
aaCACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCa < 1:4729861/93‑1 (MQ=255)
aaCACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCa < 2:1024655/93‑1 (MQ=255)
acacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAt < 1:2120013/93‑1 (MQ=255)
acacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAt < 2:5813044/93‑1 (MQ=255)
acacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAt < 1:439729/93‑1 (MQ=255)
cacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATc < 1:4577469/93‑1 (MQ=255)
acTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcg > 1:2509227/1‑93 (MQ=255)
cTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcgc > 2:6178644/1‑93 (MQ=255)
cTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcgc < 1:3552999/93‑1 (MQ=255)
tgtgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTAGTTCCGGGGATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcgct > 1:2931702/1‑92 (MQ=255)
gtgCACCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGa < 1:2366741/93‑1 (MQ=255)
tgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAt < 2:3471911/93‑1 (MQ=255)
tgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAt < 2:5637545/93‑1 (MQ=255)
tgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAt > 2:5331368/1‑93 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCTACTCACGCATCGCGATTa > 2:3063329/1‑93 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCTCGCATCGCGATTa < 2:6051510/93‑1 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTa < 1:5040644/93‑1 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTa < 1:3239285/93‑1 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTa < 2:4142116/93‑1 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAGCGCGATTa < 2:6154079/93‑1 (MQ=255)
aCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATg < 2:429793/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGc < 1:4479846/93‑1 (MQ=255)
cgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGccc < 1:733686/93‑1 (MQ=255)
gggTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCa < 1:3441518/93‑1 (MQ=255)
gggTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCa < 2:4964613/93‑1 (MQ=255)
gggTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGAATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCa > 2:321579/1‑93 (MQ=255)
gTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCTaga < 1:4100749/93‑1 (MQ=255)
tATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCagag < 1:1515616/93‑1 (MQ=255)
|
AGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG > NC_000913/3496340‑3496519
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > NC_000913/3496337‑3496523
|
AAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATC < SRR4302533.3371161/94‑1 (MQ=60)
AAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCC > SRR4302533.4440314/1‑94 (MQ=60)
AAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCC < SRR4302533.4594431/94‑1 (MQ=60)
AAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCC < SRR4302533.2177574/94‑1 (MQ=60)
AGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCG < SRR4302533.5316914/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTT > SRR4302533.6161174/1‑94 (MQ=60)
CAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTC > SRR4302533.4418221/1‑94 (MQ=60)
CAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTC > SRR4302533.3992273/1‑94 (MQ=60)
AAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCT > SRR4302533.4154697/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTG > SRR4302533.2111026/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTG > SRR4302533.1565119/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTG > SRR4302533.3941857/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTG < SRR4302533.2099624/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGG > SRR4302533.4031086/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGT > SRR4302533.1096392/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTC > SRR4302533.2332604/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCC < SRR4302533.2084714/94‑1 (MQ=60)
CGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCGGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGCTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGG < SRR4302533.858394/94‑1 (MQ=60)
GGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGG > SRR4302533.5659370/1‑94 (MQ=60)
GCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGT < SRR4302533.640642/94‑1 (MQ=60)
GCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGT < SRR4302533.1819822/94‑1 (MQ=60)
CTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTA > SRR4302533.3881153/1‑94 (MQ=60)
CTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTA > SRR4302533.4471105/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTAT > SRR4302533.6088166/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTAT > SRR4302533.4876972/1‑94 (MQ=60)
TAAAGGTGCCGATCCGTTTATTTTTGTCCGTGGTGACGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATT < SRR4302533.2898272/94‑1 (MQ=60)
GAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATT < SRR4302533.808873/94‑1 (MQ=60)
GAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATT < SRR4302533.4317539/94‑1 (MQ=60)
AGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACC < SRR4302533.6180626/94‑1 (MQ=60)
TGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCA > SRR4302533.1448853/1‑94 (MQ=60)
GGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCTGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAG > SRR4302533.3649465/1‑94 (MQ=60)
GGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTCTTACCGCAG > SRR4302533.2158887/1‑94 (MQ=60)
GCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGC < SRR4302533.1285495/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCT < SRR4302533.5320642/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCT < SRR4302533.1416567/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCT > SRR4302533.2641263/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCT > SRR4302533.2448336/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTT > SRR4302533.2103710/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGGGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTT > SRR4302533.3210202/1‑94 (MQ=60)
ATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTC > SRR4302533.562939/1‑94 (MQ=60)
ATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTC > SRR4302533.3128327/1‑94 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCT < SRR4302533.714088/94‑1 (MQ=60)
CGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGG < SRR4302533.144267/94‑1 (MQ=60)
GTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGT > SRR4302533.367032/1‑94 (MQ=60)
TTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAGACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTT < SRR4302533.1037043/94‑1 (MQ=60)
TTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTT < SRR4302533.5166340/94‑1 (MQ=60)
TTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGCATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTT > SRR4302533.3064997/1‑94 (MQ=60)
TTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCT < SRR4302533.4208418/94‑1 (MQ=60)
GGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCT > SRR4302533.2602350/1‑94 (MQ=60)
GGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCT > SRR4302533.4006413/1‑94 (MQ=60)
GCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAT < SRR4302533.4540931/94‑1 (MQ=60)
CCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAT < SRR4302533.4243590/94‑1 (MQ=60)
CCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAT > SRR4302533.5177429/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT < SRR4302533.3559753/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT > SRR4302533.5964061/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCG < SRR4302533.4712843/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGG < SRR4302533.3822654/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGG > SRR4302533.2845752/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGG > SRR4302533.2160772/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGG < SRR4302533.132419/94‑1 (MQ=60)
TGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGT < SRR4302533.4332887/94‑1 (MQ=60)
CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATT < SRR4302533.3649238/94‑1 (MQ=60)
GAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTC > SRR4302533.2521720/1‑94 (MQ=60)
GAACAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTC > SRR4302533.427082/1‑94 (MQ=60)
AAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCC < SRR4302533.6138602/94‑1 (MQ=60)
AGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGTTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCA < SRR4302533.702611/94‑1 (MQ=60)
AGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCA > SRR4302533.2650671/1‑94 (MQ=60)
GAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCAC < SRR4302533.2408393/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT > SRR4302533.3287544/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCC > SRR4302533.3765793/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCA > SRR4302533.1616866/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCA > SRR4302533.1899493/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGTTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAC > SRR4302533.5296388/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAC < SRR4302533.6051248/94‑1 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAC > SRR4302533.3899344/1‑94 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACG < SRR4302533.5245081/94‑1 (MQ=60)
GAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGC > SRR4302533.406660/1‑94 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGTAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT < SRR4302533.3393520/94‑1 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT < SRR4302533.4758538/94‑1 (MQ=60)
ACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATC < SRR4302533.2133087/94‑1 (MQ=60)
ACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATC < SRR4302533.442353/94‑1 (MQ=60)
CACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCG < SRR4302533.4605213/94‑1 (MQ=60)
CACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCG > SRR4302533.2524687/1‑94 (MQ=60)
CTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCG < SRR4302533.3574883/94‑1 (MQ=60)
CTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCG > SRR4302533.5979632/1‑94 (MQ=60)
CTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTAGTTCCGGGGATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCT > SRR4302533.2949632/1‑94 (MQ=60)
TGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGA > SRR4302533.5685205/1‑94 (MQ=60)
GTGCACCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAT < SRR4302533.2381379/94‑1 (MQ=60)
GCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTA > SRR4302533.3424397/1‑94 (MQ=60)
CAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAT < SRR4302533.5071155/94‑1 (MQ=60)
CAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAT < SRR4302533.3259248/94‑1 (MQ=60)
AACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATG > SRR4302533.793049/1‑94 (MQ=60)
CGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCC < SRR4302533.4506947/94‑1 (MQ=60)
CGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCA < SRR4302533.738002/94‑1 (MQ=60)
GGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAG < SRR4302533.3462771/94‑1 (MQ=60)
GTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCTAGAG < SRR4302533.4125705/94‑1 (MQ=60)
GTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG < SRR4302533.1704592/94‑1 (MQ=60)
TATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGC < SRR4302533.3648980/94‑1 (MQ=60)
TATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGC < SRR4302533.1524744/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCG > SRR4302533.1737878/1‑94 (MQ=60)
ATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCG > SRR4302533.4430993/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > SRR4302533.6190591/1‑94 (MQ=60)
|
AAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > NC_000913/3496337‑3496523
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
