Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,544,360 |
+G |
coding (166/1314 nt) |
gntT → |
gluconate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,544,358 | 1 | . | G | 99.5%
| 648.2
/ ‑3.9
| 203 | coding (164/1314 nt) | gntT | gluconate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base G (107/95); total (108/95) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.84e-01 |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑C‑GGACG‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > NC_000913/3544283‑3544437
|
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGcc < 1:1076592/93‑1 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGcc < 1:5981087/93‑1 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGcc > 1:4973440/1‑93 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGcc > 1:4657486/1‑93 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGcc < 2:3142478/93‑1 (MQ=255)
tgacgcTTGCTGTTGGATTAAAGCAAGTAATGCCGCTCGATAATGTTATGGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTg < 2:2347609/90‑1 (MQ=255)
tGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTg > 2:4930959/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGc > 2:5990426/1‑93 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGcc > 2:2639925/1‑93 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGcc < 2:2712239/93‑1 (MQ=255)
gcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCt < 1:3007706/93‑1 (MQ=255)
gcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCt < 1:3779375/93‑1 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTg > 2:3674252/1‑93 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTg > 1:2760924/1‑93 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTg < 2:1909449/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGa > 2:3793616/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGa < 2:2080042/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGa < 1:5496086/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGa > 2:4733843/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 2:5750149/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt > 2:4137190/1‑93 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt > 2:2552077/1‑93 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt > 1:1891719/1‑93 (MQ=255)
tttGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATg < 2:4115029/92‑1 (MQ=255)
gTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATg > 2:3988264/1‑93 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggg > 1:2565364/1‑93 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGt > 1:4992565/1‑93 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCTTCAAAGCCGGGGCC‑GC‑C‑GGGCGGCTCGGTAGCCTTGCCCTGTTCTTGGGtt > 1:5549170/1‑93 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtt > 1:3294092/1‑93 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtt < 2:1870636/93‑1 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtt < 1:3598747/93‑1 (MQ=255)
aTTANTNCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTNATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGttt < 1:76558/93‑1 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGttt < 1:1749122/93‑1 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGttt < 2:1600147/93‑1 (MQ=255)
ttAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt > 1:3131629/1‑93 (MQ=255)
tAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTg > 1:1610063/1‑93 (MQ=255)
aaTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGGCGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTgg < 1:3621974/93‑1 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTggg > 1:806758/1‑92 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgc > 2:3365553/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgc > 1:942426/1‑93 (MQ=255)
tGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcg > 1:4074710/1‑93 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcgc > 2:2688101/1‑93 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcgc < 2:6434/93‑1 (MQ=255)
cAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa < 1:4773782/93‑1 (MQ=255)
cAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGAG‑GGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa > 2:5572493/1‑93 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa > 1:2406792/1‑93 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa < 1:2792620/93‑1 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa > 1:1816064/1‑93 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt < 2:1186294/93‑1 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt < 1:2183521/93‑1 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc < 2:4526932/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt > 1:2506440/1‑93 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt < 2:4400861/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 2:3293258/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg > 1:5672610/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg < 1:64628/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGTCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTggg > 1:143511/1‑93 (MQ=255)
gCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGGCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTggg > 2:2257439/1‑93 (MQ=255)
cTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa > 2:1266760/1‑93 (MQ=255)
cTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa > 1:2578855/1‑93 (MQ=255)
cTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa > 1:2289332/1‑93 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa < 1:1196779/93‑1 (MQ=255)
tgATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt < 1:6209459/92‑1 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt < 2:4768755/93‑1 (MQ=255)
gATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATg > 2:3670238/1‑93 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc > 1:1335014/1‑93 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc < 2:5816294/93‑1 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGGGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTCTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc > 1:2908612/1‑93 (MQ=255)
tAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt > 1:139838/1‑93 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTg < 2:2973931/93‑1 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTg > 2:1979545/1‑93 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTg < 2:344807/93‑1 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg < 2:3191640/93‑1 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg < 2:1822689/93‑1 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 2:1409198/1‑93 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg < 1:5901200/93‑1 (MQ=255)
aGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGc < 1:1000206/93‑1 (MQ=255)
gTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCa > 2:4262111/1‑93 (MQ=255)
gTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCa > 1:113338/1‑93 (MQ=255)
gTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCa < 2:4995182/93‑1 (MQ=255)
atgaTTGTCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATCCTGGCa < 2:3403654/90‑1 (MQ=255)
ttATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCCTGCCCTGATCATGGGGTTTTGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAg > 2:5706274/1‑93 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGa > 1:3462392/1‑93 (MQ=255)
ttGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACt > 1:5769067/1‑93 (MQ=255)
ttGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACt > 2:603693/1‑93 (MQ=255)
tGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTg < 2:3423295/93‑1 (MQ=255)
tGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTg < 2:250730/93‑1 (MQ=255)
gCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCg < 2:3557774/93‑1 (MQ=255)
cTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCgg > 1:5155859/1‑93 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGt > 2:4891162/1‑93 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGt < 2:4419224/93‑1 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGt < 2:5208980/93‑1 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGt > 1:454627/1‑93 (MQ=255)
tCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg > 1:6154799/1‑93 (MQ=255)
tCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg > 2:2774890/1‑93 (MQ=255)
aaaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCACTGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAATGCGGTGGCGca > 1:5813766/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATTGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGcac > 2:5509030/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGcac > 1:2025707/1‑93 (MQ=255)
aGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGcaca < 1:4347354/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACaa < 2:3846686/93‑1 (MQ=255)
|
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑C‑GGACG‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > NC_000913/3544283‑3544437
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCG‑‑CGGACG‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACG > NC_000913/3544283‑3544452
|
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCT < SRR4302533.1082940/94‑1 (MQ=60)
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCT < SRR4302533.6017311/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302533.1951308/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTT > SRR4302533.1579932/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTG > SRR4302533.4538663/1‑94 (MQ=60)
TGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGC > SRR4302533.3636214/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCC > SRR4302533.2230025/1‑94 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTG > SRR4302533.2777846/1‑94 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTG < SRR4302533.3026104/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTG > SRR4302533.3126764/1‑94 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTG < SRR4302533.3802528/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTACATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTG > SRR4302533.2777843/1‑94 (MQ=60)
CTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGA > SRR4302533.4171758/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAT < SRR4302533.884178/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAT < SRR4302533.467722/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAT < SRR4302533.5529236/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAT > SRR4302533.140512/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT > SRR4302533.1903264/1‑94 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGG > SRR4302533.4725444/1‑94 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGG > SRR4302533.2381959/1‑94 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGG > SRR4302533.5713440/1‑94 (MQ=60)
TTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG > SRR4302533.2581151/1‑94 (MQ=60)
TTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG < SRR4302533.1128270/94‑1 (MQ=60)
TGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGT > SRR4302533.5022834/1‑94 (MQ=60)
GGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCTTCAAAGCCGGGGCCGC‑CGGGCGGCTCGGTAGCCTTGCCCTGTTCTTGGGTT > SRR4302533.5582679/1‑94 (MQ=50)
GGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTT > SRR4302533.3314423/1‑94 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTT < SRR4302533.3620887/94‑1 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTT > SRR4302533.250344/1‑94 (MQ=60)
ATTANTNCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTNATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302533.77051/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT > SRR4302533.3150883/1‑94 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302533.1759772/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT > SRR4302533.2807060/1‑94 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG > SRR4302533.1619826/1‑94 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCCCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302533.5019439/94‑1 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGGCGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC < SRR4302533.3644261/94‑1 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGG > SRR4302533.811499/1‑94 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC > SRR4302533.947971/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCG > SRR4302533.4099516/1‑94 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC > SRR4302533.691265/1‑94 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC > SRR4302533.621646/1‑94 (MQ=60)
GCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCA < SRR4302533.2052025/94‑1 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302533.6011549/1‑94 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA < SRR4302533.4802709/94‑1 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302533.1837184/1‑94 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302533.1827150/1‑94 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302533.2421658/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT < SRR4302533.2809797/94‑1 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302533.2196985/94‑1 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCT > SRR4302533.2521891/1‑94 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCT < SRR4302533.2537071/94‑1 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302533.1051699/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG < SRR4302533.5808517/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG > SRR4302533.5706870/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGTCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG > SRR4302533.144431/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG < SRR4302533.65047/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302533.28738/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCA < SRR4302533.1158594/94‑1 (MQ=60)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAA > SRR4302533.2594725/1‑94 (MQ=60)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAA > SRR4302533.2303506/1‑94 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAA < SRR4302533.1336025/94‑1 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAGA > SRR4302533.1645993/1‑94 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302533.1203969/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT > SRR4302533.5478642/1‑94 (MQ=60)
TGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG < SRR4302533.6246701/94‑1 (MQ=60)
GATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGC > SRR4302533.1343024/1‑94 (MQ=60)
GATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGGGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTCTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGC > SRR4302533.2926467/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT > SRR4302533.140726/1‑94 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG > SRR4302533.5858700/1‑94 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC < SRR4302533.5936838/94‑1 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC < SRR4302533.5165952/94‑1 (MQ=60)
AGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA > SRR4302533.114057/1‑94 (MQ=60)
AGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA < SRR4302533.1006043/94‑1 (MQ=60)
GTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG < SRR4302533.2892568/94‑1 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGA > SRR4302533.3483766/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302533.2583719/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT > SRR4302533.5803894/1‑94 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCG > SRR4302533.6304387/1‑94 (MQ=60)
GCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGG > SRR4302533.5186992/1‑94 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302533.368336/94‑1 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT > SRR4302533.457342/1‑94 (MQ=60)
TCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTG < SRR4302533.5672220/94‑1 (MQ=60)
TCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTG < SRR4302533.5570864/94‑1 (MQ=60)
TCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTG < SRR4302533.3438307/94‑1 (MQ=60)
TCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTG < SRR4302533.5812013/94‑1 (MQ=60)
CATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGC > SRR4302533.3002330/1‑94 (MQ=60)
CATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGC > SRR4302533.1413096/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG > SRR4302533.4852745/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG > SRR4302533.601830/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG > SRR4302533.6191830/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG > SRR4302533.3241107/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCACTGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAATGCGGTGGCGCA > SRR4302533.5848878/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302533.3572697/1‑94 (MQ=60)
AAAGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCAC > SRR4302533.2038213/1‑94 (MQ=60)
AGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA < SRR4302533.4373561/94‑1 (MQ=60)
AGCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > SRR4302533.780769/1‑94 (MQ=60)
GCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC < SRR4302533.1786660/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTGTCGGCGGGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC > SRR4302533.2532099/1‑94 (MQ=60)
GGACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCAC < SRR4302533.4957129/94‑1 (MQ=60)
GACGC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACG < SRR4302533.3115842/94‑1 (MQ=60)
|
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCG‑‑CGGACG‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACG > NC_000913/3544283‑3544452
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
