Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,544,971 |
T→C |
G259G (GGT→GGC) |
gntT → |
gluconate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,544,971 | 0 | T | C | 100.0%
| 808.2
/ NA
| 252 | G259G (GGT→GGC) | gntT | gluconate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (130/122); total (130/122) |
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
GGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGA > NC_000913/3544881‑3545060
|
ggTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGa > 2:6150150/1‑93 (MQ=255)
ggTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGa < 1:5776468/93‑1 (MQ=255)
ggTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGa > 1:5354208/1‑93 (MQ=255)
gCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGAccc < 1:1105419/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGAccc < 2:2588310/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGAccc < 1:3969289/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGAccc > 1:2304778/1‑93 (MQ=255)
ccGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCg > 1:323609/1‑93 (MQ=255)
cGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCgg > 1:1952340/1‑93 (MQ=255)
ggTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGt < 1:6172458/93‑1 (MQ=255)
tagtaCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTaa < 2:898545/93‑1 (MQ=255)
tagtaCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTaa < 1:3203127/93‑1 (MQ=255)
agtaCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAAt < 2:1825691/93‑1 (MQ=255)
gtaCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATg < 1:2247066/93‑1 (MQ=255)
taCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATgg > 1:5180651/1‑93 (MQ=255)
aTGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACg > 2:1744373/1‑93 (MQ=255)
gATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAt > 1:5226050/1‑93 (MQ=255)
aTGCGTCCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAtt < 2:5942611/93‑1 (MQ=255)
tgcgtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTg > 2:2225120/1‑93 (MQ=255)
gcgtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGc < 2:1291274/93‑1 (MQ=255)
cgtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGcc > 1:4763252/1‑93 (MQ=255)
gtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCg > 1:6251356/1‑93 (MQ=255)
gtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCg > 1:2666792/1‑93 (MQ=255)
gtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCg < 2:452453/93‑1 (MQ=255)
gtgcgATGGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCg < 2:3196663/93‑1 (MQ=255)
gATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCt > 1:5894563/1‑93 (MQ=255)
gATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCt > 1:697082/1‑93 (MQ=255)
gATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCt < 1:5148336/93‑1 (MQ=255)
aTTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTg > 2:4808613/1‑93 (MQ=255)
aTTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTg > 1:754894/1‑93 (MQ=255)
ttGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGa > 2:2912864/1‑93 (MQ=255)
gAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCg > 1:2489430/1‑93 (MQ=255)
aaTGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAt > 2:4178593/1‑93 (MQ=255)
aaTGACCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAt < 2:6172058/93‑1 (MQ=255)
tGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGt > 2:3599306/1‑93 (MQ=255)
gATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGtt > 2:4098069/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTc < 1:324638/93‑1 (MQ=255)
tCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCa > 2:5274474/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCa < 1:2021376/93‑1 (MQ=255)
cTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCAcc > 1:4710161/1‑93 (MQ=255)
tGCCGAAAGTTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCt < 2:3685187/93‑1 (MQ=255)
tGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGCTGTTCActt > 2:4664965/1‑91 (MQ=255)
tGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCt > 2:2772809/1‑93 (MQ=255)
tGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCt > 1:5132977/1‑93 (MQ=255)
gCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCtt < 2:1425760/93‑1 (MQ=255)
ccGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCttt < 2:2367924/93‑1 (MQ=255)
ccGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCttt < 1:4639779/93‑1 (MQ=255)
cGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTg < 2:1584210/93‑1 (MQ=255)
cGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTg < 2:1130779/93‑1 (MQ=255)
gAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTgg > 1:2793038/1‑93 (MQ=255)
gAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTgg > 2:2855504/1‑93 (MQ=255)
gAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTgg > 1:3523804/1‑93 (MQ=255)
gAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTgg > 2:4188937/1‑93 (MQ=255)
aaaGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGGAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGt > 1:5621191/1‑93 (MQ=255)
aaGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTc > 2:5469055/1‑93 (MQ=255)
aaGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTc < 1:3145526/93‑1 (MQ=255)
aGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCt > 2:5122577/1‑93 (MQ=255)
aGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCt < 1:1444831/93‑1 (MQ=255)
tCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTaaa < 2:2011519/93‑1 (MQ=255)
cACGCTTTCCTTCCGGTAGCTTAGTCCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATGGCCGTGCTGATTGCGATGTTCTCCTTTGGTCTAAAc < 2:3496899/93‑1 (MQ=255)
cACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAAc < 2:1042243/93‑1 (MQ=255)
cGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCg > 2:4065225/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCg < 2:3777655/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGt > 2:3843143/1‑93 (MQ=255)
cTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTg < 1:237288/93‑1 (MQ=255)
cTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTg < 1:1314569/93‑1 (MQ=255)
cTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTg > 1:4981109/1‑93 (MQ=255)
tttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTgg > 1:274439/1‑93 (MQ=255)
tttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTgg < 2:5832829/93‑1 (MQ=255)
tttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTgg > 2:5743406/1‑93 (MQ=255)
ttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGt < 2:2698171/93‑1 (MQ=255)
cTGCCGTTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGt < 1:1588125/93‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGt > 2:2308744/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGt > 2:3927897/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGtt > 2:5035273/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGtt > 2:702078/1‑93 (MQ=255)
gCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTc > 1:950525/1‑93 (MQ=255)
cGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCaa < 1:2921793/93‑1 (MQ=255)
ggTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAAt < 2:4630222/93‑1 (MQ=255)
cgTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGGAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAAt < 1:1890340/92‑1 (MQ=255)
gTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATg > 2:819642/1‑93 (MQ=255)
aGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGa < 1:1229821/93‑1 (MQ=255)
ggggAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGAt > 2:6211670/3‑93 (MQ=255)
gCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGAt > 1:1378366/1‑93 (MQ=255)
cGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATc > 2:2624712/1‑93 (MQ=255)
cGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATc < 2:4957243/93‑1 (MQ=255)
ggAGTTCCTCGGCGTCCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCa < 1:3808931/93‑1 (MQ=255)
gAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAg > 2:4499955/1‑93 (MQ=255)
gAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAg < 1:917285/93‑1 (MQ=255)
gAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAg > 2:6009239/1‑93 (MQ=255)
aGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGa < 2:5622149/93‑1 (MQ=255)
gTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAt < 1:4917257/93‑1 (MQ=255)
gTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAt < 2:553058/93‑1 (MQ=255)
ttCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAtt < 1:4296992/93‑1 (MQ=255)
tCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTa > 1:5481722/1‑93 (MQ=255)
cTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAAc < 1:1079940/93‑1 (MQ=255)
cTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAAc < 1:3544980/93‑1 (MQ=255)
cTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAAc > 1:1849639/1‑93 (MQ=255)
cGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGa < 1:441787/93‑1 (MQ=255)
cGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGa < 1:5002609/93‑1 (MQ=255)
|
GGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGA > NC_000913/3544881‑3545060
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG > NC_000913/3544878‑3545064
|
TCTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGC > SRR4302533.936324/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGC < SRR4302533.2672119/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCG > SRR4302533.5934507/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGA > SRR4302533.5386344/1‑94 (MQ=60)
GGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGAC < SRR4302533.5811355/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACC < SRR4302533.2280577/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCC > SRR4302533.2319054/1‑94 (MQ=60)
GCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCG < SRR4302533.1111972/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCG > SRR4302533.325583/1‑94 (MQ=60)
GCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCG < SRR4302533.3993466/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCG > SRR4302533.4433129/1‑94 (MQ=60)
CCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGG > SRR4302533.1964240/1‑94 (MQ=60)
GGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTA < SRR4302533.6209549/94‑1 (MQ=60)
TAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAAT < SRR4302533.3222841/94‑1 (MQ=60)
TAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAAT < SRR4302533.5189042/94‑1 (MQ=60)
TAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAAT < SRR4302533.2778427/94‑1 (MQ=60)
AGTACTGATGGCAATGCGTGCAATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATG < SRR4302533.5718986/94‑1 (MQ=60)
GTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGG < SRR4302533.2260952/94‑1 (MQ=60)
GTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGG > SRR4302533.5211936/1‑94 (MQ=60)
TACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGC < SRR4302533.1939563/94‑1 (MQ=60)
ACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCA > SRR4302533.1553251/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAA > SRR4302533.3820537/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAA > SRR4302533.1866914/1‑94 (MQ=60)
GATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACG > SRR4302533.3173789/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGAAACGC > SRR4302533.1829582/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAT > SRR4302533.5257498/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGTGCGATGCCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAT < SRR4302533.5156976/94‑1 (MQ=60)
GATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATT < SRR4302533.1906354/94‑1 (MQ=60)
ATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTG > SRR4302533.4881987/1‑94 (MQ=60)
ATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTG < SRR4302533.1337426/94‑1 (MQ=60)
GCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCC > SRR4302533.4792140/1‑94 (MQ=60)
CGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCG > SRR4302533.2683155/1‑94 (MQ=60)
CGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCG > SRR4302533.6288752/1‑94 (MQ=60)
CGTGCGATTGCCAAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCG < SRR4302533.3258567/94‑1 (MQ=60)
GTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCGACGCTGATTGCCGT > SRR4302533.5152100/1‑94 (MQ=60)
GTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGT > SRR4302533.3503021/1‑94 (MQ=60)
GTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGT > SRR4302533.619942/1‑94 (MQ=60)
CGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCT > SRR4302533.982223/1‑94 (MQ=60)
CGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCT > SRR4302533.701206/1‑94 (MQ=60)
CGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCT > SRR4302533.2343850/1‑94 (MQ=60)
CGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCT > SRR4302533.5930164/1‑94 (MQ=60)
GATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTG < SRR4302533.5179442/94‑1 (MQ=60)
GATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTG > SRR4302533.759336/1‑94 (MQ=60)
TTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGAT < SRR4302533.6017778/94‑1 (MQ=60)
TGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATT > SRR4302533.3825949/1‑94 (MQ=60)
TGCCAAAATGACCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATT < SRR4302533.2812890/94‑1 (MQ=60)
GCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTG > SRR4302533.24434/1‑94 (MQ=60)
GCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTG < SRR4302533.3236112/94‑1 (MQ=60)
CGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCG < SRR4302533.3935595/94‑1 (MQ=60)
CGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCG > SRR4302533.2504759/1‑94 (MQ=60)
AAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAT > SRR4302533.6286258/1‑94 (MQ=60)
ATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGT < SRR4302533.2322545/94‑1 (MQ=60)
TGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTT > SRR4302533.4768841/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTC > SRR4302533.5792223/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCA < SRR4302533.5025756/94‑1 (MQ=60)
ATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCA < SRR4302533.326619/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGAGCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCAC < SRR4302533.6301192/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCAC < SRR4302533.2033825/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACC > SRR4302533.124721/1‑94 (MQ=60)
CCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACC < SRR4302533.5580825/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACC > SRR4302533.4738709/1‑94 (MQ=60)
CCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACC > SRR4302533.4682522/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCT < SRR4302533.1100478/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCT > SRR4302533.5163986/1‑94 (MQ=60)
TGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTT > SRR4302533.2516591/1‑94 (MQ=60)
TGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTT > SRR4302533.922996/1‑94 (MQ=60)
GCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTT > SRR4302533.5195840/1‑94 (MQ=60)
CCGAAAGGTCGCGCTGTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTG < SRR4302533.517597/94‑1 (MQ=60)
CCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTG > SRR4302533.4095472/1‑94 (MQ=60)
CCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTG < SRR4302533.4667891/94‑1 (MQ=60)
CGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGG > SRR4302533.2810219/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGG < SRR4302533.6272757/94‑1 (MQ=60)
CGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGG > SRR4302533.3545522/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGG > SRR4302533.447278/1‑94 (MQ=60)
GAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGGAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGT > SRR4302533.5655167/1‑94 (MQ=60)
GAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGT > SRR4302533.2994449/1‑94 (MQ=60)
GAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATCGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGT > SRR4302533.523911/1‑94 (MQ=60)
AAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTC > SRR4302533.1969809/1‑94 (MQ=60)
AAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCT < SRR4302533.4383755/94‑1 (MQ=60)
AAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCT < SRR4302533.3164865/94‑1 (MQ=60)
AAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCT < SRR4302533.3549352/94‑1 (MQ=60)
AAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCT < SRR4302533.949083/94‑1 (MQ=60)
AGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTA > SRR4302533.1135060/1‑94 (MQ=60)
AGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTA < SRR4302533.1453547/94‑1 (MQ=60)
GTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAA > SRR4302533.4991957/1‑94 (MQ=60)
CACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACC > SRR4302533.1449158/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCG > SRR4302533.21314/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCG < SRR4302533.2735376/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGT > SRR4302533.735167/1‑94 (MQ=60)
GCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTG > SRR4302533.5011307/1‑94 (MQ=60)
CTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGG < SRR4302533.238757/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGG > SRR4302533.276109/1‑94 (MQ=60)
CTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGG < SRR4302533.1322455/94‑1 (MQ=60)
TTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGT > SRR4302533.1223660/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTC < SRR4302533.3961897/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTC < SRR4302533.5891153/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTC > SRR4302533.1365380/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTC < SRR4302533.2858283/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGT > SRR4302533.2407366/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGTTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTT < SRR4302533.1597721/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTC > SRR4302533.956107/1‑94 (MQ=60)
CCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAA < SRR4302533.4926226/94‑1 (MQ=60)
CGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAAT < SRR4302533.2939686/94‑1 (MQ=60)
CGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAAT > SRR4302533.3225832/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATG > SRR4302533.5345301/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATG > SRR4302533.3062997/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATG < SRR4302533.5468435/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATG > SRR4302533.269555/1‑94 (MQ=60)
CGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGGAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATG < SRR4302533.1901881/94‑1 (MQ=60)
GTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGG < SRR4302533.5488/94‑1 (MQ=60)
TAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGA < SRR4302533.3459117/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGAT < SRR4302533.1775457/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGAT < SRR4302533.1237183/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGAT > SRR4302533.1386659/1‑94 (MQ=60)
AGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGAT < SRR4302533.2157244/94‑1 (MQ=60)
GCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATC < SRR4302533.723150/94‑1 (MQ=60)
CGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCA > SRR4302533.1515214/1‑94 (MQ=60)
GGAGTTCCTCGGCGTCCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAG < SRR4302533.3832231/94‑1 (MQ=60)
GGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATAAG > SRR4302533.5004494/1‑94 (MQ=60)
GAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGA < SRR4302533.922674/94‑1 (MQ=60)
AGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAT > SRR4302533.5222122/1‑94 (MQ=60)
GTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATT < SRR4302533.4947039/94‑1 (MQ=60)
GTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATT < SRR4302533.4685203/94‑1 (MQ=60)
TTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTA > SRR4302533.5514770/1‑94 (MQ=60)
TTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTA < SRR4302533.4322833/94‑1 (MQ=60)
CCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAAC > SRR4302533.1860921/1‑94 (MQ=60)
CCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTAGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAAC < SRR4302533.818438/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACG < SRR4302533.3566829/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACG < SRR4302533.1086304/94‑1 (MQ=60)
CGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGAC < SRR4302533.5032932/94‑1 (MQ=60)
CGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGAC > SRR4302533.4796566/1‑94 (MQ=60)
CGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGAC < SRR4302533.444430/94‑1 (MQ=60)
GGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACA < SRR4302533.4833298/94‑1 (MQ=60)
GCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACAC < SRR4302533.2789826/94‑1 (MQ=60)
CGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG > SRR4302533.1590392/1‑94 (MQ=60)
CGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG < SRR4302533.4432618/94‑1 (MQ=60)
|
TCTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG > NC_000913/3544878‑3545064
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
