Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,628,759 |
G→A |
R488C (CGT→TGT) |
yhiJ ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,628,759 | 0 | G | A | 100.0%
| 1069.2
/ NA
| 285 | R488C (CGT→TGT) | yhiJ | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (156/129); total (156/129) |
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
ACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAAC > NC_000913/3628669‑3628847
|
aCTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACagg < 1:1810478/93‑1 (MQ=255)
cTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGc > 2:6070737/1‑93 (MQ=255)
cTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGc < 1:4617410/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCg < 1:4392646/93‑1 (MQ=255)
cAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTa > 1:351189/1‑93 (MQ=255)
gggAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAg > 1:2196270/1‑93 (MQ=255)
gggAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAg < 1:3934755/93‑1 (MQ=255)
gAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGAc > 2:400371/1‑93 (MQ=255)
aGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGAcc > 1:1426655/1‑93 (MQ=255)
aGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGAcc < 2:2512821/93‑1 (MQ=255)
gTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCt > 1:2399668/1‑93 (MQ=255)
gTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCt > 2:3194626/1‑93 (MQ=255)
tGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTa < 1:2276477/93‑1 (MQ=255)
tGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTa > 1:5352138/1‑93 (MQ=255)
aGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTccc < 2:548384/93‑1 (MQ=255)
aGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTccc < 1:3613589/93‑1 (MQ=255)
aGGCACTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTccc < 2:915086/93‑1 (MQ=255)
ggCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTcccc < 2:1614675/93‑1 (MQ=255)
tGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTc < 1:2984236/93‑1 (MQ=255)
tGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTc < 2:2215307/93‑1 (MQ=255)
tGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTc < 2:5289333/93‑1 (MQ=255)
gCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCg < 2:1373764/93‑1 (MQ=255)
aCCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGcc > 2:1722061/1‑93 (MQ=255)
aCCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGcc > 1:937098/1‑93 (MQ=255)
cAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTa > 2:3057944/1‑93 (MQ=255)
aGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTAt < 1:2890310/93‑1 (MQ=255)
aGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCAGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTAt < 1:3143672/93‑1 (MQ=255)
gggTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATg > 1:460236/1‑93 (MQ=255)
gggTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTATCCCCGTTTCGCCTATg < 1:1001255/93‑1 (MQ=255)
ggTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGc < 1:4192355/93‑1 (MQ=255)
ggTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGc > 2:416803/1‑93 (MQ=255)
ggTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGc < 1:6235506/93‑1 (MQ=255)
gTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCg < 1:4726020/93‑1 (MQ=255)
gTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCg > 1:520635/1‑93 (MQ=255)
tAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGtt < 1:1873084/93‑1 (MQ=255)
aaTTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTtc > 1:707618/1‑93 (MQ=255)
aaTTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTtc < 2:4967890/93‑1 (MQ=255)
tttGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTtctc < 2:428187/93‑1 (MQ=255)
tttGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTtctc > 1:157995/1‑93 (MQ=255)
ttGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTctct > 1:3806855/1‑93 (MQ=255)
tGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCtt < 2:770536/93‑1 (MQ=255)
tGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCtt < 2:514943/93‑1 (MQ=255)
ggCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTc > 2:5187108/1‑93 (MQ=255)
gCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTcc < 1:1161310/93‑1 (MQ=255)
tATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCAt > 1:48440/1‑93 (MQ=255)
tATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCAt > 2:347600/1‑93 (MQ=255)
tgcatgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCAttt > 2:2034134/1‑93 (MQ=255)
tgcatgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCAttt < 1:570145/93‑1 (MQ=255)
gcatgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTc > 1:6171381/1‑93 (MQ=255)
gcatgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTc < 1:4025357/93‑1 (MQ=255)
gcatgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTc < 1:814321/93‑1 (MQ=255)
catgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTcc < 1:4451747/93‑1 (MQ=255)
catgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTcc < 1:2491601/93‑1 (MQ=255)
tgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGt > 2:5849690/1‑93 (MQ=255)
tgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGt < 1:5590774/93‑1 (MQ=255)
tgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGt > 2:742907/1‑93 (MQ=255)
tgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGt > 2:2655616/1‑93 (MQ=255)
tGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTAt > 2:544366/1‑93 (MQ=255)
tGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTAt < 1:5464228/93‑1 (MQ=255)
tGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTAt > 2:1601472/1‑93 (MQ=255)
gAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTAtg > 2:3030137/1‑93 (MQ=255)
aaCATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTAtgt < 1:5035782/93‑1 (MQ=255)
aaCATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTAtgt < 2:1058075/93‑1 (MQ=255)
aCATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTAtgtg > 1:5628445/1‑93 (MQ=255)
cATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGc > 2:4805785/1‑93 (MQ=255)
cATCCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGGTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCTCCATTTCCGTTATGTGc < 2:2724383/93‑1 (MQ=255)
aTTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGca > 2:1164003/1‑93 (MQ=255)
ttcttcCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGcaa < 1:5069432/93‑1 (MQ=255)
ttcttcCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGcaa < 2:1849462/93‑1 (MQ=255)
tcttcCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGcaac < 1:4522057/93‑1 (MQ=255)
tcttcCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGAACTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGcaac > 1:3444943/1‑93 (MQ=255)
cttcCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGcaaca > 2:5657271/1‑93 (MQ=255)
cttcCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGcaaca > 2:2364179/1‑93 (MQ=255)
ccAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACt > 1:2639920/1‑93 (MQ=255)
ccAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACt > 2:1493365/1‑93 (MQ=255)
cAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACtt < 2:2841850/93‑1 (MQ=255)
aGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTg > 1:1237495/1‑93 (MQ=255)
aGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTg > 2:3764284/1‑93 (MQ=255)
aGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTg < 1:212720/93‑1 (MQ=255)
gCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCATCAACTTGa < 2:6158498/93‑1 (MQ=255)
gCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGa > 2:2276522/1‑93 (MQ=255)
gCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGa < 1:3321996/93‑1 (MQ=255)
gCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGa < 1:2733880/93‑1 (MQ=255)
gCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGa < 2:3614293/93‑1 (MQ=255)
cATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGAt < 2:3847669/93‑1 (MQ=255)
aTGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGAtt > 1:5954924/1‑93 (MQ=255)
tGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGAttt > 2:555569/1‑93 (MQ=255)
tGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGAttt > 1:357098/1‑93 (MQ=255)
tGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGAttt > 1:2513822/1‑93 (MQ=255)
tGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGAttt > 2:4694551/1‑93 (MQ=255)
gTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCCACAACTTGATTta > 2:5763807/1‑93 (MQ=255)
tttACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTtat > 2:4513517/1‑93 (MQ=255)
ttACTGTCACAGGCTTGAAGACCTAAACCTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTtata < 1:3866425/93‑1 (MQ=255)
ttACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCTCCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTtata < 1:4783412/93‑1 (MQ=255)
ttACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTtata > 1:3236864/1‑93 (MQ=255)
tACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATAc < 1:5969371/93‑1 (MQ=255)
cTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCt > 1:246607/1‑93 (MQ=255)
tGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTa > 2:3964437/1‑93 (MQ=255)
gTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTaa > 2:5975389/1‑93 (MQ=255)
tCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAAc > 2:3303983/1‑93 (MQ=255)
|
ACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAAC > NC_000913/3628669‑3628847
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTG > NC_000913/3628666‑3628852
|
AAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACA < SRR4302533.3940116/94‑1 (MQ=60)
AAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACA > SRR4302533.4433396/1‑94 (MQ=60)
AGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAG > SRR4302533.1067378/1‑94 (MQ=60)
AGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAG < SRR4302533.383957/94‑1 (MQ=60)
AGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAG < SRR4302533.4079270/94‑1 (MQ=60)
AGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAG < SRR4302533.1227283/94‑1 (MQ=60)
AGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAG > SRR4302533.526144/1‑94 (MQ=60)
AGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAG < SRR4302533.1315071/94‑1 (MQ=60)
AGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAG < SRR4302533.1397636/94‑1 (MQ=60)
GACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGG < SRR4302533.1773947/94‑1 (MQ=60)
GACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGG > SRR4302533.2506013/1‑94 (MQ=60)
GACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGG > SRR4302533.6275507/1‑94 (MQ=60)
ACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGC < SRR4302533.1821539/94‑1 (MQ=60)
ACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTACAGCATGTTTACTGTCACAGGC < SRR4302533.1264500/94‑1 (MQ=60)
CTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCG < SRR4302533.4645370/94‑1 (MQ=60)
CTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCG > SRR4302533.4566381/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGT < SRR4302533.4419163/94‑1 (MQ=60)
TCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTT < SRR4302533.4222076/94‑1 (MQ=60)
TCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTT > SRR4302533.5654991/1‑94 (MQ=60)
CCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTA > SRR4302533.353331/1‑94 (MQ=60)
CCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTA > SRR4302533.2951543/1‑94 (MQ=60)
CAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAA > SRR4302533.2141506/1‑94 (MQ=60)
CAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAA > SRR4302533.4135252/1‑94 (MQ=60)
AGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAG > SRR4302533.3607182/1‑94 (MQ=60)
AGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAG > SRR4302533.2209804/1‑94 (MQ=60)
AGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAG < SRR4302533.1838280/94‑1 (MQ=60)
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AGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCT > SRR4302533.2414486/1‑94 (MQ=60)
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TGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAA < SRR4302533.3218225/94‑1 (MQ=60)
GGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAA < SRR4302533.2276610/94‑1 (MQ=60)
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TAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTC < SRR4302533.1884501/94‑1 (MQ=60)
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GCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCA > SRR4302533.525587/1‑94 (MQ=60)
CAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCAC > SRR4302533.2116293/1‑94 (MQ=60)
AATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACC < SRR4302533.4760141/94‑1 (MQ=60)
AATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACC < SRR4302533.5706841/94‑1 (MQ=60)
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TTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCAT > SRR4302533.48776/1‑94 (MQ=60)
TTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCAT < SRR4302533.4644769/94‑1 (MQ=60)
TTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCAT < SRR4302533.4426724/94‑1 (MQ=60)
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GCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCC < SRR4302533.819088/94‑1 (MQ=60)
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CATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCG < SRR4302533.2506947/94‑1 (MQ=60)
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TGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTT > SRR4302533.522699/1‑94 (MQ=60)
GCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTA < SRR4302533.547149/94‑1 (MQ=60)
GCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTA > SRR4302533.267518/1‑94 (MQ=60)
CTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTAT > SRR4302533.2986967/1‑94 (MQ=60)
CTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTAT > SRR4302533.3022475/1‑94 (MQ=60)
TGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATG < SRR4302533.347762/94‑1 (MQ=60)
TGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATG < SRR4302533.5497156/94‑1 (MQ=60)
TGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATG > SRR4302533.1179696/1‑94 (MQ=60)
TGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATG < SRR4302533.5383904/94‑1 (MQ=60)
GAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGT > SRR4302533.2431709/1‑94 (MQ=60)
AACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTG < SRR4302533.5066282/94‑1 (MQ=60)
AACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTG > SRR4302533.5662477/1‑94 (MQ=60)
ACATTCTTCCAGCATGTTTACTTTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGTCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGC > SRR4302533.3895263/1‑94 (MQ=60)
ATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTattttcaaa > SRR4302533.5779169/1‑85 (MQ=60)
TTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAAC < SRR4302533.5100043/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAAC < SRR4302533.5100042/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGAACTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAAC > SRR4302533.3466215/1‑94 (MQ=60)
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AGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGA < SRR4302533.214057/94‑1 (MQ=60)
AGCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGA > SRR4302533.281294/1‑94 (MQ=60)
GCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGAT < SRR4302533.2750650/94‑1 (MQ=60)
GCATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGAT < SRR4302533.3342514/94‑1 (MQ=60)
CATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATT > SRR4302533.5990946/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTT > SRR4302533.359273/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTT > SRR4302533.334995/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTT > SRR4302533.4578172/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTT > SRR4302533.2529312/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTT > SRR4302533.48381/1‑94 (MQ=60)
TGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTA < SRR4302533.1913514/94‑1 (MQ=60)
TGTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTA > SRR4302533.4758758/1‑94 (MQ=60)
GTTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTAT < SRR4302533.710279/94‑1 (MQ=60)
TTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATA > SRR4302533.159724/1‑94 (MQ=60)
TTTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATA > SRR4302533.3256811/1‑94 (MQ=60)
TTACTGTCACAGGCTTGAAGACCTAAACCTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATAC < SRR4302533.3890028/94‑1 (MQ=60)
TTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCTCCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATAC < SRR4302533.4812389/94‑1 (MQ=60)
TTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATAC > SRR4302533.2697889/1‑94 (MQ=60)
TTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATAC < SRR4302533.4697057/94‑1 (MQ=60)
TTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATAC < SRR4302533.3921545/94‑1 (MQ=60)
TTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATAC < SRR4302533.4819388/94‑1 (MQ=60)
TTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATAC > SRR4302533.49857/1‑94 (MQ=60)
TTACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATAC > SRR4302533.6004192/1‑94 (MQ=60)
TACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACC < SRR4302533.3267210/94‑1 (MQ=60)
TACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACC < SRR4302533.6058447/94‑1 (MQ=60)
TACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACC < SRR4302533.6005507/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCT < SRR4302533.927490/94‑1 (MQ=60)
ACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCT < SRR4302533.4957485/94‑1 (MQ=60)
ACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCT > SRR4302533.248133/1‑94 (MQ=60)
ACTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCT > SRR4302533.1639075/1‑94 (MQ=60)
CTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTA > SRR4302533.4503677/1‑94 (MQ=60)
CTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTA > SRR4302533.2398166/1‑94 (MQ=60)
CTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTA > SRR4302533.893013/1‑94 (MQ=60)
CTGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCAGTTATGTGCAACAACTTGATTTATTCCTA > SRR4302533.4504578/1‑94 (MQ=60)
TGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAA < SRR4302533.5087855/94‑1 (MQ=60)
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TGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAA < SRR4302533.4363636/94‑1 (MQ=60)
TGTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAA < SRR4302533.285063/94‑1 (MQ=60)
GTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAAC < SRR4302533.73272/94‑1 (MQ=60)
GTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAAC > SRR4302533.738469/1‑94 (MQ=60)
GTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAAC > SRR4302533.121390/1‑94 (MQ=60)
GTCACAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAAC < SRR4302533.5847597/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTT > SRR4302533.1492715/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTG > SRR4302533.3066592/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTG > SRR4302533.182203/1‑94 (MQ=60)
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AAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTG > NC_000913/3628666‑3628852
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
