Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,785,382 |
G→A |
T306T (ACG→ACA) |
b3613 → |
putative membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,785,382 | 0 | G | A | 100.0%
| 1022.8
/ NA
| 276 | T306T (ACG→ACA) | b3613 | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (113/163); total (113/163) |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
ACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAT > NC_000913/3785292‑3785471
|
accgaccgAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACt < 2:2577421/93‑1 (MQ=255)
ccgaccgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTg > 2:2789660/1‑93 (MQ=255)
ccgaccgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTg > 1:722257/1‑93 (MQ=255)
gaccgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCTGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCa < 1:2842846/93‑1 (MQ=255)
accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCAt < 2:80598/93‑1 (MQ=255)
accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCAt < 2:3308633/93‑1 (MQ=255)
gaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGc < 1:1439489/93‑1 (MQ=255)
gaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGc > 1:4484990/1‑93 (MQ=255)
gaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGc > 2:1265817/1‑93 (MQ=255)
gaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGc > 2:1879078/1‑93 (MQ=255)
gaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGCTCGCGGGCCGACACTGCATCGc > 1:874374/1‑93 (MQ=255)
gCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATg > 1:3223331/1‑93 (MQ=255)
cGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATgg < 2:842143/93‑1 (MQ=255)
gAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGc > 1:5995291/1‑93 (MQ=255)
aaaaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCg > 1:3030923/1‑93 (MQ=255)
aaaaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCg < 1:1013688/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCg < 1:2488755/93‑1 (MQ=255)
aaaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGa > 2:5803571/1‑93 (MQ=255)
aaaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGa > 1:4571293/1‑93 (MQ=255)
aaaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGa > 2:6171008/1‑93 (MQ=255)
aaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGaa > 1:490155/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACa > 1:1994495/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGATGTCCCGTGCCGGTGGTCGGGGCTCGCCGCGTGGTCTGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAg < 1:2746389/93‑1 (MQ=255)
gcGCTGATGTCCCGTACCGGTTGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAg < 1:2271175/92‑1 (MQ=255)
cGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGc < 2:6002998/93‑1 (MQ=255)
gCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCt < 2:5522140/93‑1 (MQ=255)
gCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCt > 1:5914842/1‑93 (MQ=255)
cTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCGGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTa > 1:1210831/1‑93 (MQ=255)
cTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTa > 1:1507417/1‑93 (MQ=255)
tcaTGTCCCGTACGGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCGGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAc < 2:3463314/91‑1 (MQ=255)
tGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAc > 1:1308672/1‑93 (MQ=255)
tGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAc < 1:5658680/93‑1 (MQ=255)
gATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAcg > 1:4507587/1‑92 (MQ=255)
gATGTCCCGTACCGGTGGTCGGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACa < 2:211939/93‑1 (MQ=255)
aTGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAg < 1:2038403/93‑1 (MQ=255)
tCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAgggg > 1:5851503/1‑92 (MQ=255)
gcccGTACCGGTGGTCTGTGCGCGCCGCGTGTTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGt < 2:3894819/92‑1 (MQ=255)
cccGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCGGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTg < 2:3401698/93‑1 (MQ=255)
cccGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTg < 1:106362/93‑1 (MQ=255)
ccGTGCGGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGa < 2:1149095/93‑1 (MQ=255)
cGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGaa < 2:567323/93‑1 (MQ=255)
gtgccGGTGGTCGGGGCACGCCGCGTGGTCAGGCATTCGGGCCGGTTGGCGGCCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAAt < 1:98909/90‑1 (MQ=255)
gTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAAt < 1:4022914/93‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTAc < 2:5462460/93‑1 (MQ=255)
ggtggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGc > 1:5351221/1‑93 (MQ=255)
gtggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCt > 1:5535540/1‑93 (MQ=255)
gtggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCGACAGGGTGAATTACGCt > 1:819924/1‑93 (MQ=255)
tggtCTGGGCGCGCCGCGTGTTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTg < 1:43248/93‑1 (MQ=255)
tggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTg < 1:3447005/93‑1 (MQ=255)
tggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTg > 2:1629407/1‑93 (MQ=255)
ggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTgg < 2:3800596/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGaaa < 2:4903421/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGaaa > 1:6151414/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGaaa < 1:1849161/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGaaa < 2:3976980/93‑1 (MQ=255)
tGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAg > 1:2576629/1‑93 (MQ=255)
gggCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGTCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAgg < 1:2315433/93‑1 (MQ=255)
gggCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAgg < 1:2427224/93‑1 (MQ=255)
ggCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGt > 2:1493840/1‑93 (MQ=255)
ggCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGt < 2:2014377/93‑1 (MQ=255)
ggCCCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGt < 2:4173911/93‑1 (MQ=255)
gccgcgcAGTGTGGTCAGGCATGCTGGGCGGTTCGCAGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGt < 2:2892989/91‑1 (MQ=255)
cgcgcCGCTTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAt < 2:5369440/93‑1 (MQ=255)
cgccgcGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATgg < 2:3703658/93‑1 (MQ=255)
cgccgcGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATgg < 2:4664429/93‑1 (MQ=255)
gccgcGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGt > 1:1108984/1‑93 (MQ=255)
ccgcGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGtt < 1:2128886/93‑1 (MQ=255)
ccgcGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGtt > 2:6213680/1‑93 (MQ=255)
gcgTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTAt > 1:4006915/1‑93 (MQ=255)
gcgTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTAt > 2:2341594/1‑93 (MQ=255)
gcgTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTAt > 2:2264129/1‑93 (MQ=255)
gTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCg < 1:540138/93‑1 (MQ=255)
gTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCg > 1:156496/1‑93 (MQ=255)
ggTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATTGTTATCGGt < 2:1593364/93‑1 (MQ=255)
ggTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGt < 2:2190847/93‑1 (MQ=255)
ggTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGt > 1:3774287/1‑93 (MQ=255)
tCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGc > 2:709212/1‑93 (MQ=255)
aGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCtt > 1:1725301/1‑93 (MQ=255)
aGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCtt < 1:5054894/93‑1 (MQ=255)
aGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCtt < 1:4617761/93‑1 (MQ=255)
ggCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTc < 1:1262074/93‑1 (MQ=255)
ggCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTc < 2:1529641/93‑1 (MQ=255)
gCATTCTGGCCGGCTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCt > 1:4696326/1‑93 (MQ=255)
ctttCTGGCCGGTTCGGGGGCCGACACTGCATCGCTATTGCCAACAGGTTCAGGGTGAATTACGGTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTg < 2:4382572/91‑1 (MQ=255)
aTTCGGGCCGTTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGTTTATCGGTTCTTCTGa < 2:4346326/93‑1 (MQ=255)
tCTGGCCGGTCCGCGGGCCGACACTGCATCGCTAGGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAg < 2:261536/93‑1 (MQ=255)
tGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGt < 2:1448745/93‑1 (MQ=255)
ggTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGa < 2:50247/93‑1 (MQ=255)
ggTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGa > 2:3206356/1‑93 (MQ=255)
gTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGaa < 1:4290695/93‑1 (MQ=255)
ttCGCGTGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAg > 2:5240134/1‑93 (MQ=255)
cgGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTaa < 2:1773830/93‑1 (MQ=255)
gggCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTaaa < 1:6065001/93‑1 (MQ=255)
gggCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTaaa < 2:1703684/93‑1 (MQ=255)
gggCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTaaa < 2:3578232/93‑1 (MQ=255)
ggCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAg > 2:2934478/1‑93 (MQ=255)
ggCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAg > 1:3693076/1‑93 (MQ=255)
gCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGc < 2:5575025/93‑1 (MQ=255)
gACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAt < 1:6277430/93‑1 (MQ=255)
gACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAt > 2:3162697/1‑93 (MQ=255)
|
ACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAT > NC_000913/3785292‑3785471
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGC > NC_000913/3785289‑3785474
|
CAACCCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACA < SRR4302533.4117528/94‑1 (MQ=60)
AAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACAC < SRR4302533.1100505/94‑1 (MQ=60)
AAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACAC > SRR4302533.2411203/1‑94 (MQ=60)
acccggcgGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACT < SRR4302533.2226061/86‑1 (MQ=60)
AACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGGTCGCGGGCCGACACT > SRR4302533.840485/1‑94 (MQ=60)
ACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTG > SRR4302533.726520/1‑94 (MQ=60)
CGCCCGAAAGCAAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGTTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCA < SRR4302533.1366497/94‑1 (MQ=60)
CGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCGGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCA < SRR4302533.3734546/94‑1 (MQ=60)
GACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCTGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCAT < SRR4302533.2860342/94‑1 (MQ=60)
GACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCAT > SRR4302533.560864/1‑94 (MQ=60)
GACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCAT > SRR4302533.5447827/1‑94 (MQ=60)
ACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATC > SRR4302533.5166269/1‑94 (MQ=60)
ACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATC < SRR4302533.1288069/94‑1 (MQ=60)
CGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGC > SRR4302533.4512146/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGC > SRR4302533.4335521/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGCTCGCGGGCCGACACTGCATCGC > SRR4302533.879506/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCT > SRR4302533.845043/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCT < SRR4302533.1448175/94‑1 (MQ=60)
AAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTA > SRR4302533.4567210/1‑94 (MQ=60)
AAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTAT < SRR4302533.5862185/94‑1 (MQ=60)
AGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATG < SRR4302533.4698500/94‑1 (MQ=60)
AGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATG > SRR4302533.1457485/1‑94 (MQ=60)
AGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATG > SRR4302533.3243207/1‑94 (MQ=60)
AGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATG < SRR4302533.5582656/94‑1 (MQ=60)
GCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGG < SRR4302533.3758684/94‑1 (MQ=60)
GCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGG < SRR4302533.3475493/94‑1 (MQ=60)
GCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGG < SRR4302533.2466518/94‑1 (MQ=60)
CGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGC > SRR4302533.1765386/1‑94 (MQ=60)
CGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGC > SRR4302533.6031601/1‑94 (MQ=60)
GAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCG > SRR4302533.3049470/1‑94 (MQ=60)
AAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGA > SRR4302533.4598997/1‑94 (MQ=60)
AAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGA < SRR4302533.2504082/94‑1 (MQ=60)
AAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGA < SRR4302533.1019624/94‑1 (MQ=60)
AAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAA > SRR4302533.493085/1‑94 (MQ=60)
AATCGCTGATGTCCCGTACGGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCGGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACA < SRR4302533.4588739/94‑1 (MQ=60)
AATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACA > SRR4302533.2006733/1‑94 (MQ=60)
AATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACA > SRR4302533.805060/1‑94 (MQ=60)
AATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACA > SRR4302533.6112078/1‑94 (MQ=60)
AGCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAG < SRR4302533.3053045/94‑1 (MQ=60)
TCGCTGATGTCCCGTGCCGGTGGTCGGGGCTCGCCGCGTGGTCTGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGC < SRR4302533.2763226/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGATGTCCCGTACCGGTTGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGC < SRR4302533.2285228/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCT > SRR4302533.5950587/1‑94 (MQ=60)
GCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCGGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTA > SRR4302533.1218100/1‑94 (MQ=60)
GCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTA > SRR4302533.3554439/1‑94 (MQ=60)
GCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTA > SRR4302533.1516501/1‑94 (MQ=60)
CTGATGTCCCTTACCGGAGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATTGCGAACAGCTAC > SRR4302533.3755237/1‑94 (MQ=60)
CTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAC > SRR4302533.5917899/1‑94 (MQ=60)
CTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAC > SRR4302533.1316528/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTCCA < SRR4302533.6126916/94‑1 (MQ=60)
TGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACG > SRR4302533.4534887/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACA > SRR4302533.295856/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACA < SRR4302533.6002625/94‑1 (MQ=60)
TGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACA < SRR4302533.5692873/94‑1 (MQ=60)
GATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAG > SRR4302533.6241607/1‑94 (MQ=60)
GATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAG < SRR4302533.4603532/94‑1 (MQ=60)
ATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGG > SRR4302533.4659776/1‑94 (MQ=60)
ATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGG < SRR4302533.2050976/94‑1 (MQ=60)
TGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGG < SRR4302533.3466802/94‑1 (MQ=60)
GTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGG > SRR4302533.1315597/1‑94 (MQ=60)
GTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGG > SRR4302533.5886881/1‑94 (MQ=60)
CCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGA > SRR4302533.5384938/1‑94 (MQ=60)
CCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGA > SRR4302533.4038917/1‑94 (MQ=60)
CCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGA < SRR4302533.107026/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGGTGGTCGGGGCACGCCGCGTGGTCAGGCATTCGGGCCGGTTGGCGGCCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATT < SRR4302533.99523/94‑1 (MQ=60)
GTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATT < SRR4302533.4047408/94‑1 (MQ=60)
GTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATT < SRR4302533.1527401/94‑1 (MQ=60)
GTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATT > SRR4302533.1724363/1‑94 (MQ=60)
GTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATT > SRR4302533.3813848/1‑94 (MQ=60)
GTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGGGAATT > SRR4302533.2048484/1‑94 (MQ=60)
TACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTA < SRR4302533.1994644/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACG > SRR4302533.1134458/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGC > SRR4302533.4372922/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGC > SRR4302533.5383331/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCT < SRR4302533.1260856/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCT > SRR4302533.5568963/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCGACAGGGTGAATTACGCT > SRR4302533.824731/1‑94 (MQ=60)
TGGTCTGGGCGCGCCGCGTGTTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGG < SRR4302533.43543/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGG < SRR4302533.3468291/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGG < SRR4302533.447077/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAA > SRR4302533.645289/1‑94 (MQ=60)
TCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAA > SRR4302533.6188436/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAG > SRR4302533.2592481/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAG < SRR4302533.1860441/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGG > SRR4302533.2159752/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGG > SRR4302533.6052960/1‑94 (MQ=60)
GGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGTCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGT < SRR4302533.2329773/94‑1 (MQ=60)
GGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGT < SRR4302533.210797/94‑1 (MQ=60)
GGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGT < SRR4302533.2442230/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTA < SRR4302533.4630508/94‑1 (MQ=60)
GCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAT > SRR4302533.2823959/1‑94 (MQ=60)
GCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGCTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAT < SRR4302533.6037327/94‑1 (MQ=60)
CGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATG < SRR4302533.1627277/94‑1 (MQ=60)
GCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGG < SRR4302533.787268/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGT > SRR4302533.1115567/1‑94 (MQ=60)
CCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTA < SRR4302533.702970/94‑1 (MQ=60)
CCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTA < SRR4302533.2142013/94‑1 (MQ=60)
CCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTA < SRR4302533.250514/94‑1 (MQ=60)
CCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTA < SRR4302533.2611540/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTAT > SRR4302533.5454171/1‑94 (MQ=60)
CGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTAT > SRR4302533.4031309/1‑94 (MQ=60)
gcgtcacccGGCATTCTGCCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATC < SRR4302533.5619317/85‑1 (MQ=60)
CGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCG > SRR4302533.157493/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCG < SRR4302533.1093826/94‑1 (MQ=60)
GTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGG < SRR4302533.543351/94‑1 (MQ=60)
GTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGG < SRR4302533.4252658/94‑1 (MQ=60)
TGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGT > SRR4302533.3797423/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGC < SRR4302533.223314/94‑1 (MQ=60)
TCAGGCATTCTGGCCGTTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCT < SRR4302533.3853388/94‑1 (MQ=60)
TCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCT > SRR4302533.2410478/1‑94 (MQ=60)
TCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCT > SRR4302533.2292287/1‑94 (MQ=60)
CAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTT > SRR4302533.1735771/1‑94 (MQ=60)
AGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTC < SRR4302533.5085452/94‑1 (MQ=60)
AGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTC < SRR4302533.4645748/94‑1 (MQ=60)
GGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCT < SRR4302533.1269622/94‑1 (MQ=60)
GGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCT < SRR4302533.3003579/94‑1 (MQ=60)
GGCATTCTGGCCGGCTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCT > SRR4302533.4724792/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAA < SRR4302533.2597289/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAA < SRR4302533.2556475/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAA < SRR4302533.1353611/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAA < SRR4302533.4283362/94‑1 (MQ=60)
TTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAG < SRR4302533.1448863/94‑1 (MQ=60)
TTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAG < SRR4302533.4516882/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGCATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACT < SRR4302533.3399683/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACT < SRR4302533.6201195/94‑1 (MQ=60)
CGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGA > SRR4302533.24845/1‑94 (MQ=60)
GGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAA > SRR4302533.4516429/1‑94 (MQ=60)
GGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAA < SRR4302533.931062/94‑1 (MQ=60)
GTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAG < SRR4302533.4316499/94‑1 (MQ=60)
TCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTT < SRR4302533.2827602/94‑1 (MQ=60)
TCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTT > SRR4302533.5241442/1‑94 (MQ=60)
CGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTA < SRR4302533.1037118/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTA < SRR4302533.4745821/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAGGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTA < SRR4302533.5794906/94‑1 (MQ=60)
GCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAA < SRR4302533.1838959/94‑1 (MQ=60)
CGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGATATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAA > SRR4302533.893762/1‑94 (MQ=60)
GGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAG < SRR4302533.4894911/94‑1 (MQ=60)
GGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAG < SRR4302533.6101711/94‑1 (MQ=60)
GGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAG < SRR4302533.2039093/94‑1 (MQ=60)
GGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAG < SRR4302533.4993180/94‑1 (MQ=60)
GGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAG > SRR4302533.3715764/1‑94 (MQ=60)
GGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAG < SRR4302533.5386478/94‑1 (MQ=60)
GGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGC < SRR4302533.1101757/94‑1 (MQ=60)
GGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGC < SRR4302533.2438772/94‑1 (MQ=60)
GCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCG < SRR4302533.1195304/94‑1 (MQ=60)
GCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCG < SRR4302533.5889269/94‑1 (MQ=60)
CCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGA > SRR4302533.212340/1‑94 (MQ=60)
CCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGA > SRR4302533.1223212/1‑94 (MQ=60)
CGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAT > SRR4302533.1999841/1‑94 (MQ=60)
CGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAT < SRR4302533.4031944/94‑1 (MQ=60)
GACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATT < SRR4302533.6314910/94‑1 (MQ=60)
GACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATG > SRR4302533.5867662/1‑94 (MQ=60)
ACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTG > SRR4302533.1928719/1‑94 (MQ=60)
ACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTG < SRR4302533.4808779/94‑1 (MQ=60)
ACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTG > SRR4302533.5627487/1‑94 (MQ=60)
ACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTG > SRR4302533.2745863/1‑94 (MQ=60)
CACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGC > SRR4302533.2846950/1‑94 (MQ=60)
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CAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGC > NC_000913/3785289‑3785474
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
