Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,819,792 |
A→G |
V20V (GTA→GTG) |
rpoZ → |
RNA polymerase omega subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,819,792 | 0 | A | G | 100.0%
| 905.6
/ NA
| 279 | V20V (GTA→GTG) | rpoZ | RNA polymerase omega subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (156/123); total (156/123) |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
GTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGC > NC_000913/3819702‑3819881
|
gTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTATAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCt > 2:1461978/1‑93 (MQ=255)
tCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTg > 2:4626851/1‑93 (MQ=255)
tCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTg > 2:1144901/1‑93 (MQ=255)
cATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTgg < 1:1110363/93‑1 (MQ=255)
ctttCTTCTCCTGTCGATCTGTTTAAGTATGGCACGGGTAGCTGTGCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAGGCGTTTTGGCCTGGGGCTGGt < 2:4478574/92‑1 (MQ=255)
aTTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGt > 1:1368224/1‑93 (MQ=255)
aTTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGt > 1:5638450/1‑93 (MQ=255)
aTTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATCGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGt > 2:2933785/1‑93 (MQ=255)
tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc < 1:359767/93‑1 (MQ=255)
tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc > 1:4769600/1‑93 (MQ=255)
tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc < 1:2999181/93‑1 (MQ=255)
tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc > 1:54635/1‑93 (MQ=255)
ttcttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcg < 1:2377201/93‑1 (MQ=255)
ttcttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcg < 2:3033309/93‑1 (MQ=255)
ttcttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcg > 2:5068763/1‑93 (MQ=255)
cttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcgcc > 2:3210144/1‑93 (MQ=255)
ttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcgccg > 2:3253437/1‑93 (MQ=255)
tcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcgccgc < 1:6100945/93‑1 (MQ=255)
ccTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCcgcgcg < 2:1687477/93‑1 (MQ=255)
ccTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCcgcgcg > 1:249674/1‑93 (MQ=255)
cTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGt < 2:797585/93‑1 (MQ=255)
ggAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTcgcg > 1:1642906/1‑93 (MQ=255)
gtgCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGGGTCgcgc < 2:1561773/91‑1 (MQ=255)
gAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCgcgc > 2:1874398/1‑93 (MQ=255)
aGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCt < 1:2916676/93‑1 (MQ=255)
ttttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTc > 1:2784477/1‑93 (MQ=255)
ttttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTc < 2:5038020/93‑1 (MQ=255)
ttttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTc > 1:1478746/1‑93 (MQ=255)
tAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGa < 2:5277335/93‑1 (MQ=255)
gTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGc > 1:4120409/1‑93 (MQ=255)
aTGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAg > 1:3286760/1‑93 (MQ=255)
tGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAgg > 1:3418045/1‑93 (MQ=255)
ggCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGt < 1:5364917/93‑1 (MQ=255)
ggCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGt < 1:4261971/93‑1 (MQ=255)
ggCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGt < 2:5849300/93‑1 (MQ=255)
gCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTa < 1:2100117/93‑1 (MQ=255)
gCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTa < 1:2145490/93‑1 (MQ=255)
gCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTa < 2:5230916/93‑1 (MQ=255)
gCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTa < 1:3479597/93‑1 (MQ=255)
aCGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAgg > 1:3086941/1‑93 (MQ=255)
gcgTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCg > 2:5122409/1‑93 (MQ=255)
tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaa > 1:3988800/1‑93 (MQ=255)
tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaa > 1:2600271/1‑93 (MQ=255)
aaCTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaga < 2:5009847/93‑3 (MQ=255)
aaCTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaaa < 2:6180628/93‑1 (MQ=255)
aaCTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaaa > 2:3434011/1‑93 (MQ=255)
aCTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAg > 2:1995391/1‑93 (MQ=255)
tGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGa > 1:5129531/1‑93 (MQ=255)
tGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGa > 2:694608/1‑93 (MQ=255)
gTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGCGAAGGAt > 2:2462608/1‑93 (MQ=255)
gTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGAGGAAAGGAt > 2:2616332/1‑93 (MQ=255)
ttCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATc < 1:4185630/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATc < 1:4092754/93‑1 (MQ=255)
tCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATcc < 2:4391520/93‑1 (MQ=255)
tCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATcc < 2:4673713/93‑1 (MQ=255)
aGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGc < 2:2129010/93‑1 (MQ=255)
ggACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATGCGCt > 2:5623464/1‑93 (MQ=255)
ggACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCt < 2:5379569/93‑1 (MQ=255)
gcGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTgg < 1:812447/92‑1 (MQ=255)
aCGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTgg > 1:6151584/1‑93 (MQ=255)
cGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGt < 2:2724085/93‑1 (MQ=255)
cTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAc > 2:2763357/1‑93 (MQ=255)
cTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAc > 2:3981416/1‑93 (MQ=255)
cTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAc < 1:659680/93‑1 (MQ=255)
tGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAcc < 1:230410/93‑1 (MQ=255)
gTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCg > 2:2033626/1‑93 (MQ=255)
gTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCg > 2:4812499/1‑93 (MQ=255)
gTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCg > 2:1288606/1‑93 (MQ=255)
gTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCg > 1:1435507/1‑93 (MQ=255)
agagAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGga > 1:4170767/1‑93 (MQ=255)
gagaAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaa > 1:3781825/1‑93 (MQ=255)
aaaaTTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaagga > 1:1270364/1‑91 (MQ=255)
ttGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACg > 1:5920959/1‑93 (MQ=255)
tGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGa < 1:1043630/93‑1 (MQ=255)
tGGTAACCGTTTTGACCTGGAGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGa > 2:6064501/1‑93 (MQ=255)
ggTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGAt < 1:5044477/93‑1 (MQ=255)
ggTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGAt < 2:4732986/93‑1 (MQ=255)
gTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATa < 1:4392020/93‑1 (MQ=255)
gTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATa > 2:6276609/1‑93 (MQ=255)
gTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATa < 2:1381800/93‑1 (MQ=255)
aaCCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATaaa < 1:4506903/93‑1 (MQ=255)
aaCCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGAACCGGAAGAAAACGATaaa < 2:6143444/93‑1 (MQ=255)
cGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAAcc > 2:1782383/1‑93 (MQ=255)
cGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAAcc < 2:1010480/93‑1 (MQ=255)
gTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCa < 2:4080924/93‑1 (MQ=255)
ttttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAc > 2:4288301/1‑93 (MQ=255)
ttttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAc < 1:1534967/93‑1 (MQ=255)
ttttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAc < 1:4914124/93‑1 (MQ=255)
tttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACt > 1:5086923/1‑93 (MQ=255)
tctGACGTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCACGTAAGATGCAGCTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTCCCGGAAGAAAACGATAAAACCACt < 2:3679209/91‑1 (MQ=255)
tGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGt > 1:6261000/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTaa > 1:4644410/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTaa > 1:1923639/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTaa > 1:1800142/1‑93 (MQ=255)
ccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAt > 1:4854169/1‑93 (MQ=255)
ccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAt < 2:3556054/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATc < 1:5897945/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATc > 1:4872749/1‑93 (MQ=255)
tGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATcg < 1:725165/93‑1 (MQ=255)
tGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATcg > 2:739971/1‑93 (MQ=255)
|
GTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGC > NC_000913/3819702‑3819881
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCGCTG > NC_000913/3819699‑3819885
|
CCAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTG < SRR4302533.1032517/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTG < SRR4302533.1775268/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTG < SRR4302533.606558/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTG < SRR4302533.4637827/94‑1 (MQ=60)
CAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGC > SRR4302533.529830/1‑94 (MQ=60)
CAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGC > SRR4302533.5005450/1‑94 (MQ=60)
GTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTG < SRR4302533.2341131/94‑1 (MQ=60)
GTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTG > SRR4302533.692638/1‑94 (MQ=60)
CATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGT > SRR4302533.1376451/1‑94 (MQ=60)
CATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGT > SRR4302533.5672540/1‑94 (MQ=60)
CATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGT < SRR4302533.1116950/94‑1 (MQ=60)
ATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTC > SRR4302533.1279202/1‑94 (MQ=60)
ATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTC > SRR4302533.3747713/1‑94 (MQ=60)
ATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTC > SRR4302533.4798509/1‑94 (MQ=60)
ATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTC < SRR4302533.4802112/94‑1 (MQ=60)
ATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTC > SRR4302533.55004/1‑94 (MQ=60)
TTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCG < SRR4302533.4209141/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCG < SRR4302533.3017525/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCG > SRR4302533.4609561/1‑94 (MQ=60)
TTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCG < SRR4302533.361957/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGC < SRR4302533.2391910/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGC > SRR4302533.672302/1‑94 (MQ=60)
CTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCG < SRR4302533.4017984/94‑1 (MQ=60)
CTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCG > SRR4302533.5518244/1‑94 (MQ=60)
TCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCG < SRR4302533.6137784/94‑1 (MQ=60)
ACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCG > SRR4302533.3443131/1‑94 (MQ=60)
ACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCG > SRR4302533.251215/1‑94 (MQ=60)
CCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGT > SRR4302533.1392876/1‑94 (MQ=60)
CCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGT > SRR4302533.2128980/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTC > SRR4302533.4037517/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTC > SRR4302533.2794133/1‑94 (MQ=60)
TGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCG > SRR4302533.4712277/1‑94 (MQ=60)
TGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCG < SRR4302533.2775620/94‑1 (MQ=60)
GTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGC > SRR4302533.4898631/1‑94 (MQ=60)
TGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCG > SRR4302533.1652854/1‑94 (MQ=60)
GGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGC > SRR4302533.2023161/1‑94 (MQ=60)
AGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTC < SRR4302533.2934558/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCG > SRR4302533.1088328/1‑94 (MQ=60)
TTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTC > SRR4302533.1487679/1‑94 (MQ=60)
TTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTC > SRR4302533.4985720/1‑94 (MQ=60)
TTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTC > SRR4302533.2801585/1‑94 (MQ=60)
TTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAG > SRR4302533.980212/1‑94 (MQ=60)
taatgATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGAT < SRR4302533.3072843/89‑1 (MQ=60)
TAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGAT < SRR4302533.148277/94‑1 (MQ=60)
AAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATG < SRR4302533.259016/94‑1 (MQ=60)
AGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGC > SRR4302533.3209634/1‑94 (MQ=60)
AGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGC > SRR4302533.4145429/1‑94 (MQ=60)
AGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGC > SRR4302533.6235334/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCA > SRR4302533.2123272/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCA < SRR4302533.3905200/94‑1 (MQ=60)
TATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAG < SRR4302533.6127698/94‑1 (MQ=60)
TATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAG < SRR4302533.6153253/94‑1 (MQ=60)
TATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAG > SRR4302533.3265025/1‑94 (MQ=60)
TATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAG > SRR4302533.3307050/1‑94 (MQ=60)
TATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAG < SRR4302533.423921/94‑1 (MQ=60)
ATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGG > SRR4302533.3439168/1‑94 (MQ=60)
GGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTA < SRR4302533.4909379/94‑1 (MQ=60)
GGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTA < SRR4302533.5397145/94‑1 (MQ=60)
GGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTA < SRR4302533.4287650/94‑1 (MQ=60)
GCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAG < SRR4302533.3501066/94‑1 (MQ=60)
GCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAG < SRR4302533.2113071/94‑1 (MQ=60)
GCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAG < SRR4302533.2158703/94‑1 (MQ=60)
GCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGCTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAG < SRR4302533.5154361/94‑1 (MQ=60)
CACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGG > SRR4302533.3105922/1‑94 (MQ=60)
CACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGG > SRR4302533.4525625/1‑94 (MQ=60)
ACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGC < SRR4302533.3559781/94‑1 (MQ=60)
ACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGC < SRR4302533.1934105/94‑1 (MQ=60)
CGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGA > SRR4302533.2484544/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGGA > SRR4302533.349456/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAA > SRR4302533.1321809/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAA > SRR4302533.2616249/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAA > SRR4302533.2524967/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAA > SRR4302533.2390177/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAA > SRR4302533.1848396/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAA > SRR4302533.4013096/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGGGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAA > SRR4302533.609677/1‑94 (MQ=60)
TAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAA > SRR4302533.4136507/1‑94 (MQ=60)
AACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAGCCGTTTTGACCTGGTGCTGTGCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAG < SRR4302533.5707291/94‑1 (MQ=60)
AACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAG > SRR4302533.3925296/1‑94 (MQ=60)
AACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAG > SRR4302533.1677824/1‑94 (MQ=60)
AACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAG < SRR4302533.4902928/94‑1 (MQ=60)
ACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGG > SRR4302533.5151768/1‑94 (MQ=60)
CTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGCTGCAGGTAGGCGGAAAGGA > SRR4302533.4287140/1‑94 (MQ=60)
CTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGA > SRR4302533.5160517/1‑94 (MQ=60)
CTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGCAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGGCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGA > SRR4302533.4800384/1‑94 (MQ=60)
TGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGAT < SRR4302533.1495461/94‑1 (MQ=60)
TGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGAT < SRR4302533.1454084/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAGCCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCC < SRR4302533.1408710/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCC < SRR4302533.4117667/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCC > SRR4302533.2812726/1‑94 (MQ=60)
TTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCC < SRR4302533.4210975/94‑1 (MQ=60)
CAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGC < SRR4302533.155247/94‑1 (MQ=60)
AGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCT < SRR4302533.2463537/94‑1 (MQ=60)
AGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCT < SRR4302533.4434365/94‑1 (MQ=60)
GGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTG < SRR4302533.4205562/94‑1 (MQ=60)
GACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGG > SRR4302533.6188606/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGT < SRR4302533.817206/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGT < SRR4302533.1633900/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTA < SRR4302533.5124553/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTA > SRR4302533.435277/1‑94 (MQ=60)
CTGTAGAGAAAATTGGTATCCGTTTTGCCCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACC < SRR4302533.3401839/94‑1 (MQ=60)
CTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACC > SRR4302533.5580303/1‑94 (MQ=60)
CTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACC < SRR4302533.3042664/94‑1 (MQ=60)
CTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACC < SRR4302533.663567/94‑1 (MQ=60)
TGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCG < SRR4302533.231838/94‑1 (MQ=60)
TGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCG > SRR4302533.1444174/1‑94 (MQ=60)
GTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGG < SRR4302533.1140690/94‑1 (MQ=60)
TAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGA > SRR4302533.4196038/1‑94 (MQ=60)
AGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAA > SRR4302533.3339534/1‑94 (MQ=60)
AGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAA > SRR4302533.3804988/1‑94 (MQ=60)
AGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGA > SRR4302533.4887265/1‑94 (MQ=60)
AGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGA < SRR4302533.4173253/94‑1 (MQ=60)
AGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGA > SRR4302533.649187/1‑94 (MQ=60)
GAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGGA > SRR4302533.1277964/1‑94 (MQ=60)
AAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAA < SRR4302533.769616/94‑1 (MQ=60)
AAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAA > SRR4302533.5766306/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACG > SRR4302533.2265376/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACG > SRR4302533.5956748/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACG < SRR4302533.6216872/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACG < SRR4302533.902311/94‑1 (MQ=60)
TGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGAT < SRR4302533.1049765/94‑1 (MQ=60)
GGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATA < SRR4302533.5075001/94‑1 (MQ=60)
GGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATA < SRR4302533.5075000/94‑1 (MQ=60)
GGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATA < SRR4302533.5471875/94‑1 (MQ=60)
GGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATA < SRR4302533.205389/94‑1 (MQ=60)
GTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAA < SRR4302533.4418534/94‑1 (MQ=60)
GTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAA < SRR4302533.6324030/94‑1 (MQ=60)
TAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAA > SRR4302533.5814497/1‑94 (MQ=60)
AACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAA < SRR4302533.4534199/94‑1 (MQ=60)
ACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAAC > SRR4302533.4296089/1‑94 (MQ=60)
ACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAAC < SRR4302533.4953945/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAC > SRR4302533.1662868/1‑94 (MQ=60)
GTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAC > SRR4302533.4555018/1‑94 (MQ=60)
GTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAC < SRR4302533.5937313/94‑1 (MQ=60)
TTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACT < SRR4302533.4118272/94‑1 (MQ=60)
TTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACT > SRR4302533.5117660/1‑94 (MQ=60)
TTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACT < SRR4302533.6146757/94‑1 (MQ=60)
TTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACT < SRR4302533.5301176/94‑1 (MQ=60)
TTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACT < SRR4302533.4943891/94‑1 (MQ=60)
TTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACT < SRR4302533.1544190/94‑1 (MQ=60)
TTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGT < SRR4302533.5352852/94‑1 (MQ=60)
TTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGT < SRR4302533.2982661/94‑1 (MQ=60)
TTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGT > SRR4302533.6298434/1‑94 (MQ=60)
GACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAA > SRR4302533.4672548/1‑94 (MQ=60)
GACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAA > SRR4302533.1935376/1‑94 (MQ=60)
GACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAA > SRR4302533.1811095/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAT > SRR4302533.4883588/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAT < SRR4302533.2955153/94‑1 (MQ=60)
ACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAT < SRR4302533.5401545/94‑1 (MQ=60)
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CCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATC > SRR4302533.3766067/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATC > SRR4302533.3059689/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATC > SRR4302533.4902274/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCG < SRR4302533.5933565/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGC < SRR4302533.729453/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCG > SRR4302533.4216786/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGTCGCGGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCGCT < SRR4302533.1188475/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCGCT < SRR4302533.1493886/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCGCTG > SRR4302533.4879477/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCGCTG > SRR4302533.5798585/1‑94 (MQ=60)
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CCAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCGCTG > NC_000913/3819699‑3819885
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
