Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,925,742 |
T→C |
A320A (GCT→GCC) |
asnA → |
asparagine synthetase A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,925,742 | 0 | T | C | 100.0%
| 845.2
/ NA
| 262 | A320A (GCT→GCC) | asnA | asparagine synthetase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (141/121); total (141/121) |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
CATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGC > NC_000913/3925652‑3925831
|
cATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAgccgc > 1:4880112/1‑93 (MQ=255)
cggcggcggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGt < 1:302162/93‑1 (MQ=255)
gcggcggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGGCAGCCGCTGTTc > 2:2246487/1‑93 (MQ=255)
ggcggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTcgc < 1:1412004/93‑1 (MQ=255)
gcggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGGTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGTCAGCCGCTGGTcgcg > 2:2180088/1‑93 (MQ=255)
cggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCga < 2:3437271/93‑1 (MQ=255)
cggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCga < 1:4276031/93‑1 (MQ=255)
cggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCga < 2:3495298/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCgag < 1:75045/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCgag < 1:1216864/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCgag > 1:2706536/1‑93 (MQ=255)
gTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCgagc > 1:5387492/1‑92 (MQ=255)
gTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCgaga > 1:3817999/1‑93 (MQ=255)
gTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCgaga > 2:5021393/1‑93 (MQ=255)
tATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGagag > 1:3053395/1‑93 (MQ=255)
tATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGagag < 2:4204328/93‑1 (MQ=255)
tCGTCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCg < 2:1560824/93‑1 (MQ=255)
tCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCg > 2:1536225/1‑93 (MQ=255)
tCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCg > 2:4303008/1‑93 (MQ=255)
cGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGt < 1:1882429/93‑1 (MQ=255)
ggCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTc > 2:4792591/1‑93 (MQ=255)
gCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTcc < 2:4086426/93‑1 (MQ=255)
gCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTcc < 1:1094963/93‑1 (MQ=255)
ccAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTccc < 2:5291647/93‑1 (MQ=255)
ccAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTccc < 1:1433581/93‑1 (MQ=255)
cAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCt > 1:2236737/1‑93 (MQ=255)
cAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCt > 2:4287203/1‑93 (MQ=255)
cAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCACGAGAGGGTCCCt > 1:5073959/1‑93 (MQ=255)
aGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCtt > 2:5552813/1‑93 (MQ=255)
aGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCtt > 1:4207977/1‑93 (MQ=255)
aGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCtt < 2:1046699/93‑1 (MQ=255)
gTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTtc < 1:4380882/93‑1 (MQ=255)
tctcGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTtct > 1:262829/1‑93 (MQ=255)
ctcGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTtctc < 1:4582605/93‑1 (MQ=255)
ctcGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTtctc < 1:2026114/93‑1 (MQ=255)
ctcGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTtctc < 1:3861910/93‑1 (MQ=255)
ctcGTTTGACTATGCTGCGGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTtctc < 2:3361955/93‑1 (MQ=255)
tcGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTctct < 1:5193911/93‑1 (MQ=255)
tcGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTctct > 2:3648629/1‑93 (MQ=255)
gTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTctgc > 2:6042680/1‑93 (MQ=255)
ttGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTctgctg > 1:3718085/1‑93 (MQ=255)
gACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGCGTATGGCCAGACGCTGTTCGCGAGTGCGTCCCTTCTCTGCTGta > 1:886010/1‑93 (MQ=255)
aCTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCCGCCAGCCTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGtaa > 1:243803/1‑93 (MQ=255)
cTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGATGCCGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGtact > 1:2769711/1‑91 (MQ=255)
tATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGtaata > 1:3186761/1‑93 (MQ=255)
tATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGtaata < 2:2284094/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGtaataa > 2:5130373/1‑93 (MQ=255)
tgctgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTaataat < 1:4465336/93‑1 (MQ=255)
tgctgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTaataat < 1:3561357/93‑1 (MQ=255)
ctgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAAttt > 2:5891055/1‑93 (MQ=255)
tgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTa < 2:472146/93‑1 (MQ=255)
tgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTa > 1:24535/1‑93 (MQ=255)
gctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTAt > 2:3840812/1‑93 (MQ=255)
gctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTAt < 2:4269754/93‑1 (MQ=255)
gctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTAt < 1:1626817/93‑1 (MQ=255)
ctnctgcAACTGCCGCATATCGNCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATc < 1:4736723/93‑1 (MQ=255)
ctgctgcAACTGCCGCATATCGGCGAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATc < 1:5971494/93‑1 (MQ=255)
ctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATc < 2:276702/93‑1 (MQ=255)
ctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATc < 2:6084589/93‑1 (MQ=255)
ctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATc < 2:5329066/93‑1 (MQ=255)
gcACCTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGAGCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATcgccgc < 1:6281110/93‑1 (MQ=255)
gcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATcgccgc > 2:2665086/1‑93 (MQ=255)
gcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATcgccgc < 1:4414024/93‑1 (MQ=255)
cAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCgccgcc > 2:1885190/1‑93 (MQ=255)
gCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGt > 2:1384207/1‑93 (MQ=255)
ccGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTc > 2:1441647/1‑93 (MQ=255)
ccGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTc < 2:3797786/93‑1 (MQ=255)
cGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCt < 2:886555/93‑1 (MQ=255)
cGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCt > 1:1097004/1‑93 (MQ=255)
cGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCt < 2:2380922/93‑1 (MQ=255)
cATATCGGCCAGGTTCATTGTAGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGa < 1:3440718/93‑1 (MQ=255)
cATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGa < 2:1267923/93‑1 (MQ=255)
tatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGc > 1:213076/1‑93 (MQ=255)
tatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGc < 2:1173263/93‑1 (MQ=255)
tatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGc > 1:4163146/1‑93 (MQ=255)
tCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAg < 2:5637535/93‑1 (MQ=255)
ggCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAggc > 2:4532492/1‑93 (MQ=255)
ggTTGAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCtt < 2:4432046/93‑1 (MQ=255)
ggTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCtt < 1:4139170/93‑1 (MQ=255)
gTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTc > 1:4077381/1‑93 (MQ=255)
gTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTc < 1:6232971/93‑1 (MQ=255)
ttCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCg > 2:455810/1‑93 (MQ=255)
cAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCa < 1:4689748/93‑1 (MQ=255)
gtgtGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATc < 1:5771643/93‑1 (MQ=255)
gtgtGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCGTCGCATc > 1:2211864/1‑93 (MQ=255)
tgtgGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATcc > 1:2763657/1‑93 (MQ=255)
tgtgGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATcc > 2:3584206/1‑93 (MQ=255)
tgGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCg > 1:5338204/1‑93 (MQ=255)
tgGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCg > 1:3144647/1‑93 (MQ=255)
gggAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCg < 1:6108453/92‑1 (MQ=255)
ggAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCgg > 1:5513591/1‑93 (MQ=255)
tATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATc > 1:5811295/1‑93 (MQ=255)
tGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCaa > 2:5759673/1‑93 (MQ=255)
ggCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCaaa < 2:201833/93‑1 (MQ=255)
gCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAg < 2:803175/93‑1 (MQ=255)
ccAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAgc < 2:2607936/93‑1 (MQ=255)
ccAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAgc < 1:5882238/93‑1 (MQ=255)
aGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAgcgc < 1:4939302/93‑1 (MQ=255)
aGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAgcgc > 1:5605043/1‑93 (MQ=255)
aGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAgcgc < 1:1299172/93‑1 (MQ=255)
|
CATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGC > NC_000913/3925652‑3925831
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAG > NC_000913/3925649‑3925834
|
GACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCC < SRR4302533.3014192/94‑1 (MQ=60)
CCATCGGGGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGC < SRR4302533.942441/94‑1 (MQ=60)
CCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGC > SRR4302533.4909678/1‑94 (MQ=60)
CCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGC > SRR4302533.691869/1‑94 (MQ=60)
CCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGC < SRR4302533.1901822/94‑1 (MQ=60)
ATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTG > SRR4302533.3040684/1‑94 (MQ=60)
CGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTT < SRR4302533.304011/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTC > SRR4302533.2802834/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCG < SRR4302533.1420541/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCG > SRR4302533.557085/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCG < SRR4302533.1347958/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCG < SRR4302533.4949856/94‑1 (MQ=60)
CGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAG < SRR4302533.4301750/94‑1 (MQ=60)
CGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAG > SRR4302533.2723140/1‑94 (MQ=60)
CGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGACAGCCGCTGTTCGCGAG > SRR4302533.2769036/1‑94 (MQ=60)
GGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGC > SRR4302533.5419864/1‑94 (MQ=60)
GGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGA > SRR4302533.3841345/1‑94 (MQ=60)
GGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGA < SRR4302533.1224173/94‑1 (MQ=60)
GGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGA > SRR4302533.6305708/1‑94 (MQ=60)
GGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGA < SRR4302533.75532/94‑1 (MQ=60)
GTATCGGCCTGTCTCGTTTGATTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAG < SRR4302533.4461485/94‑1 (MQ=60)
GTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAG > SRR4302533.3072099/1‑94 (MQ=60)
GTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAG < SRR4302533.5076356/94‑1 (MQ=60)
TATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGC < SRR4302533.3526603/94‑1 (MQ=60)
TATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGC < SRR4302533.307280/94‑1 (MQ=60)
TATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGC < SRR4302533.3843787/94‑1 (MQ=60)
TCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGT > SRR4302533.5525465/1‑94 (MQ=60)
ACGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGT < SRR4302533.3699645/94‑1 (MQ=60)
CGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTC > SRR4302533.541006/1‑94 (MQ=60)
CGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTC < SRR4302533.1893890/94‑1 (MQ=60)
CGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTC > SRR4302533.3042013/1‑94 (MQ=60)
GGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCACCTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCC < SRR4302533.4244474/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCC > SRR4302533.1205119/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCC < SRR4302533.1101444/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCT > SRR4302533.5149418/1‑94 (MQ=60)
CCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCT < SRR4302533.1442239/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCT > SRR4302533.2250565/1‑94 (MQ=60)
CCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCT > SRR4302533.5276684/1‑94 (MQ=60)
CCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCT > SRR4302533.1793949/1‑94 (MQ=60)
CCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCACGAGAGGGTCCCT > SRR4302533.5104629/1‑94 (MQ=60)
CAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTT > SRR4302533.4233437/1‑94 (MQ=60)
AGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTC > SRR4302533.3811486/1‑94 (MQ=60)
GTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCT < SRR4302533.4407330/94‑1 (MQ=60)
GTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCT > SRR4302533.264420/1‑94 (MQ=60)
GTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCT > SRR4302533.3662421/1‑94 (MQ=60)
CTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCT < SRR4302533.2038624/94‑1 (MQ=60)
CTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCT < SRR4302533.3885484/94‑1 (MQ=60)
CTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCT < SRR4302533.93256/94‑1 (MQ=60)
CTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCT < SRR4302533.4610371/94‑1 (MQ=60)
TCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTG > SRR4302533.5825920/1‑94 (MQ=60)
TCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTG < SRR4302533.5225239/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGC > SRR4302533.4311412/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGC > SRR4302533.2242985/1‑94 (MQ=60)
GTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCT > SRR4302533.3317352/1‑94 (MQ=60)
TTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTG > SRR4302533.3740904/1‑94 (MQ=60)
TGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGCGTATGGCCAGACGCTGTTCGCGAGTGCGTCCCTTCTCTGCTGTA > SRR4302533.891212/1‑94 (MQ=60)
TGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTA > SRR4302533.1630800/1‑94 (MQ=60)
TGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTA > SRR4302533.4908689/1‑94 (MQ=60)
GACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAA > SRR4302533.5776667/1‑94 (MQ=60)
GACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCCGCCAGCCTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAA > SRR4302533.245315/1‑94 (MQ=60)
ACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAAT > SRR4302533.117184/1‑94 (MQ=60)
ACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAAT > SRR4302533.2081911/1‑94 (MQ=60)
ACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAAT > SRR4302533.2786706/1‑94 (MQ=60)
ACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGATGCCGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTACT > SRR4302533.2786707/1‑94 (MQ=60)
CTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATA > SRR4302533.3206366/1‑94 (MQ=60)
CTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATA > SRR4302533.2531194/1‑94 (MQ=60)
CTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATA > SRR4302533.3132123/1‑94 (MQ=60)
TATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAA > SRR4302533.4484877/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAAT > SRR4302533.4107799/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATT < SRR4302533.4492345/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATT < SRR4302533.3583301/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGTTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTA < SRR4302533.423299/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTA < SRR4302533.3472589/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTA > SRR4302533.24697/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTAT > SRR4302533.4379926/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTAT > SRR4302533.3917679/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATC > SRR4302533.833419/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATC < SRR4302533.1636668/94‑1 (MQ=60)
CTNCTGCAACTGCCGCATATCGNCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCG < SRR4302533.4765445/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCGAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCG < SRR4302533.6007641/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCG > SRR4302533.1943110/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCG < SRR4302533.4680256/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGC > SRR4302533.160199/1‑94 (MQ=60)
CTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCG < SRR4302533.2958723/94‑1 (MQ=60)
GCACCTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGAGCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCC < SRR4302533.6318599/94‑1 (MQ=60)
GCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCC < SRR4302533.4440677/94‑1 (MQ=60)
CAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCA > SRR4302533.4948691/1‑94 (MQ=60)
CAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCA > SRR4302533.2463417/1‑94 (MQ=60)
AACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAG > SRR4302533.2145621/1‑94 (MQ=60)
CCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCT > SRR4302533.2169949/1‑94 (MQ=60)
CCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCT > SRR4302533.1103501/1‑94 (MQ=60)
GCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGA > SRR4302533.2700712/1‑94 (MQ=60)
GCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGA > SRR4302533.4420045/1‑94 (MQ=60)
CGTATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAG > SRR4302533.5980566/1‑94 (MQ=60)
CATATCGGCCAGGTTCATTGTAGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAG < SRR4302533.3461965/94‑1 (MQ=60)
CATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAG < SRR4302533.2335543/94‑1 (MQ=60)
CATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAG > SRR4302533.2250171/1‑94 (MQ=60)
CATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAG > SRR4302533.6246820/1‑94 (MQ=60)
ATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGC > SRR4302533.214416/1‑94 (MQ=60)
ATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGC > SRR4302533.4188369/1‑94 (MQ=60)
TATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCA > SRR4302533.5084151/1‑94 (MQ=60)
TATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCA < SRR4302533.6141382/94‑1 (MQ=60)
TATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCA > SRR4302533.319532/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCGAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAG < SRR4302533.1281410/94‑1 (MQ=60)
ATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAG < SRR4302533.4201419/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCG < SRR4302533.1259604/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCG < SRR4302533.6271287/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCG > SRR4302533.2754128/1‑94 (MQ=60)
GCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGG < SRR4302533.1102645/94‑1 (MQ=60)
GCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGG > SRR4302533.5882195/1‑94 (MQ=60)
CCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGC > SRR4302533.479899/1‑94 (MQ=60)
CCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGC > SRR4302533.1407034/1‑94 (MQ=60)
CCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGC > SRR4302533.5522406/1‑94 (MQ=60)
CAGTTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCT < SRR4302533.540910/94‑1 (MQ=60)
CAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCT < SRR4302533.1951347/94‑1 (MQ=60)
CAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCT > SRR4302533.242890/1‑94 (MQ=60)
CAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCT > SRR4302533.1432967/1‑94 (MQ=60)
AGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTT > SRR4302533.3221733/1‑94 (MQ=60)
GGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTC > SRR4302533.4102204/1‑94 (MQ=60)
GGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTC < SRR4302533.4686055/94‑1 (MQ=60)
GGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTC < SRR4302533.4164276/94‑1 (MQ=60)
GTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCG < SRR4302533.4285987/94‑1 (MQ=60)
GTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCG < SRR4302533.6270294/94‑1 (MQ=60)
TCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCA > SRR4302533.2559330/1‑94 (MQ=60)
CAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCAT < SRR4302533.4718180/94‑1 (MQ=60)
AGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCGTCGCATC > SRR4302533.2225504/1‑94 (MQ=60)
GTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCC > SRR4302533.2780600/1‑94 (MQ=60)
GTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCC < SRR4302533.5806494/94‑1 (MQ=60)
GTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCC > SRR4302533.1747306/1‑94 (MQ=60)
TGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCC > SRR4302533.4598223/1‑94 (MQ=60)
TGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCC > SRR4302533.6068069/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCG > SRR4302533.5370212/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCG > SRR4302533.807827/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCG > SRR4302533.5890920/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCG > SRR4302533.3163982/1‑94 (MQ=60)
TGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGG > SRR4302533.5546874/1‑94 (MQ=60)
TGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGG < SRR4302533.3879431/94‑1 (MQ=60)
GGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGG < SRR4302533.6145332/94‑1 (MQ=60)
GAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTA > SRR4302533.2673242/1‑94 (MQ=60)
GAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTA > SRR4302533.6208922/1‑94 (MQ=60)
GAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTA < SRR4302533.5232096/94‑1 (MQ=60)
GTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATC > SRR4302533.5846391/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATC > SRR4302533.4075614/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATC > SRR4302533.4168794/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATC < SRR4302533.4742790/94‑1 (MQ=60)
TGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCTGTATCAAA > SRR4302533.5817164/1‑94 (MQ=60)
TGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAA < SRR4302533.4567872/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGGGGCTTCGCATCCCGGCATCAAAG > SRR4302533.573663/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCG < SRR4302533.5917787/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCG > SRR4302533.4161188/1‑94 (MQ=60)
CAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGC > SRR4302533.5638910/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCC < SRR4302533.1306990/94‑1 (MQ=60)
AGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCC < SRR4302533.4969203/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCA < SRR4302533.5382288/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCA > SRR4302533.4788830/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGGTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGCATCAAAGCGCAA > SRR4302533.3785649/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAG > SRR4302533.2792660/1‑94 (MQ=60)
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GACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAG > NC_000913/3925649‑3925834
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
