Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_000913 |
3,573,700 |
+C |
intergenic (+403/+997) |
yhgN → / ← gntK |
hypothetical protein/gluconokinase 2 |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_000913 | 3,573,700 | 1 | . | C | 99.8%
| 1562.4
/ ‑4.3
| 411 | intergenic (+403/+997) | yhgN/gntK | hypothetical protein/gluconokinase 2 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (209/201); total (210/201) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 476 total aligned reads displayed.
TTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACG‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCG > NC_000913/3573605‑3573789
|
ttAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACg < 1:13155867/96‑1 (MQ=255)
aaaCAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgct < 2:136741/96‑3 (MQ=255)
aaaCAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgct > 2:5640332/1‑94 (MQ=255)
aaaCAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAACgct > 1:5501921/1‑94 (MQ=255)
aaaCAGGCTACGGTGGCAGAACCCTCAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgct < 2:9618834/96‑3 (MQ=255)
aCAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgcttc > 1:8523977/1‑92 (MQ=255)
ggCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGcc < 1:6623683/96‑1 (MQ=255)
gatACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGccc < 1:10439051/94‑1 (MQ=255)
gCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgcttc > 1:13372463/1‑88 (MQ=255)
gCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgcttc < 2:13372463/92‑5 (MQ=255)
gCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGccc < 2:8501447/96‑1 (MQ=255)
cTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCa < 2:11458052/96‑1 (MQ=255)
tACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAg > 1:7794179/1‑96 (MQ=255)
aCGGTGGCAGAAGCCTGAATGATGCACACTGCAGCTGTCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCACATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGt < 1:284372/96‑1 (MQ=255)
aCGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGt > 2:5876699/1‑96 (MQ=255)
cGGTGGCAGACCCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTg < 2:6562872/96‑1 (MQ=255)
cGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCCGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTg < 1:5656339/96‑1 (MQ=255)
ggTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCATCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGc < 1:7042022/96‑1 (MQ=255)
ggTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGTAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGc > 1:9150723/1‑96 (MQ=255)
ggTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGc > 2:7721267/1‑96 (MQ=255)
gaggCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGcc > 1:7565591/3‑96 (MQ=255)
gTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGcc > 2:6087637/1‑96 (MQ=255)
ggCAGAACGCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCgg < 2:2483672/96‑1 (MQ=255)
gCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGa > 1:10019263/1‑96 (MQ=255)
aCCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTAc < 2:10568188/96‑1 (MQ=255)
cTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGcc < 2:1413877/96‑1 (MQ=255)
gAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCag > 2:13784324/1‑96 (MQ=255)
aaTGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATTCCGGTGAACGCCTCGCCCAGTGCGGGACCTACGCCaga > 1:6192509/1‑96 (MQ=255)
atgatgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCagag > 1:12806477/1‑96 (MQ=255)
tgatgCGCACTGCAGCTGCCAGCGCGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGTCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGt < 1:10075627/96‑1 (MQ=255)
gatgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTc < 2:11941469/96‑1 (MQ=255)
atgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCa < 2:4756094/96‑1 (MQ=255)
tgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCaa < 2:2841861/96‑1 (MQ=255)
tgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCaa < 1:11552224/96‑1 (MQ=255)
gcACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCa < 2:7565591/96‑1 (MQ=255)
aCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGTCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGc > 1:8120137/1‑96 (MQ=255)
aCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCatc < 1:11814461/96‑3 (MQ=255)
aCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGc > 1:11712218/1‑96 (MQ=255)
aCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGc > 2:1225597/1‑96 (MQ=255)
gCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCAcc < 2:4555141/96‑1 (MQ=255)
aGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTg < 1:2534706/96‑1 (MQ=255)
aGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTg < 2:13741804/96‑1 (MQ=255)
gCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGt > 2:12561217/1‑96 (MQ=255)
cTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGACCAGGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGGGCCGGAGCTATGCCAGAGTCATACAGCAGCTGta > 1:9882623/1‑95 (MQ=255)
tGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGttt > 2:333300/1‑96 (MQ=255)
gCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAATCAGCACCTGTTTg < 1:10938989/96‑1 (MQ=255)
gCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTg > 2:731143/1‑96 (MQ=255)
gCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTg < 1:9666816/96‑1 (MQ=255)
cAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGaa > 2:7975387/1‑96 (MQ=255)
cAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGaa > 2:11568488/1‑96 (MQ=255)
cAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGaa < 2:12806477/96‑1 (MQ=255)
aGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAac < 2:1822177/96‑1 (MQ=255)
aGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAac > 1:13493659/1‑96 (MQ=255)
aGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAac > 1:4028870/1‑96 (MQ=255)
aCGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcg > 2:131035/1‑96 (MQ=255)
gAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGCACAcgcc > 1:4844936/1‑96 (MQ=255)
gAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgcc < 1:14109080/96‑1 (MQ=255)
aaGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgccg < 2:6244779/96‑1 (MQ=255)
aaGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgccg > 1:3065970/1‑96 (MQ=255)
aaGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgccg > 2:12776882/1‑96 (MQ=255)
aaGCAGGTGATAGCAATCGGCAGCCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGCGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgccg < 1:6886527/96‑1 (MQ=255)
aGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgccgg > 2:10389226/1‑95 (MQ=255)
aGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgccgc < 2:5134607/96‑1 (MQ=255)
gCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACgccgcc > 1:12022771/1‑96 (MQ=255)
gCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACgccgcc > 1:5236050/1‑96 (MQ=255)
gCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACgccgcc > 1:8740336/1‑96 (MQ=255)
cAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGCCCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGccgccc < 2:9009997/96‑1 (MQ=255)
cAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGccgccc > 1:9401335/1‑96 (MQ=255)
cAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGccgccc < 2:2221706/96‑1 (MQ=255)
aGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGccgcccg < 2:8606344/96‑1 (MQ=255)
aGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGccgcccg > 2:9362155/1‑96 (MQ=255)
aGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGccgcccg > 2:11711386/1‑96 (MQ=255)
gctAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCAcc > 1:10660228/3‑96 (MQ=255)
gATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTGTGAACACGccgctcgcggc > 1:2050361/1‑93 (MQ=255)
aTAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCa < 2:10767948/96‑1 (MQ=255)
aGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAAt > 1:1902662/1‑96 (MQ=255)
cAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCa < 1:8317365/96‑1 (MQ=255)
aaTCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCAc > 1:7142363/1‑96 (MQ=255)
aaTCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCAc > 2:677964/1‑96 (MQ=255)
tCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACca < 2:8225128/96‑1 (MQ=255)
cGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACcag > 1:13743681/1‑96 (MQ=255)
gCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGTCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACcagca > 1:13038521/1‑96 (MQ=255)
aGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGa > 1:1506854/1‑96 (MQ=255)
aGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGa < 1:1719427/96‑1 (MQ=255)
ggCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGaa > 2:6976621/1‑96 (MQ=255)
cccATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCCCCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATg < 2:1445153/96‑1 (MQ=255)
cccATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATg > 2:3688751/1‑96 (MQ=255)
cccATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATg < 2:1913237/96‑1 (MQ=255)
cccACGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATg < 1:11166647/96‑1 (MQ=255)
ccATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGa < 2:5491874/96‑1 (MQ=255)
aTGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATc > 1:11350366/1‑96 (MQ=255)
gCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATccc > 2:11116942/1‑96 (MQ=255)
gCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATccc > 1:2362579/1‑96 (MQ=255)
ccGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCACCCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATcccc < 1:3552365/96‑1 (MQ=255)
cGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCccg < 1:4666010/96‑1 (MQ=255)
ggTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATccncnn > 1:12352108/1‑94 (MQ=255)
ggTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCccgc < 1:5914139/96‑1 (MQ=255)
gTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCccgcc > 2:10189485/1‑96 (MQ=255)
ttAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTCCGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCccgccg < 2:11311050/96‑1 (MQ=255)
ttAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCccgccg > 2:3836476/1‑96 (MQ=255)
|
TTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACG‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCG > NC_000913/3573605‑3573789
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 270 total aligned reads displayed.
CGCCGTTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CG‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGGTTGCAGCGCG > NC_000913/3573600‑3573800
|
NNNCGTTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CG < SRR4302518.13763364/101‑1 (MQ=60)
CGCCGTTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCCTGCCGGTTAA‑CG < SRR4302518.5875414/101‑1 (MQ=60)
GCCGTTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑NN‑N > SRR4302518.7495001/1‑101 (MQ=60)
CCGTTAACCAGGCTACGGTGGCAGACCCCTGAATCATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGTCCCATGCCGGTTAA‑CG‑CT < SRR4302518.4049610/101‑1 (MQ=60)
CCGTTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CG‑CT > SRR4302518.1142044/1‑101 (MQ=60)
CCGTTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCCCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CG‑CT < SRR4302518.4226229/101‑1 (MQ=60)
NNNTAAACAGGCTACGGTGGCAGAGCCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGctt < SRR4302518.7391326/101‑4 (MQ=60)
NNNTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGcgt < SRR4302518.9823973/101‑4 (MQ=60)
CGTTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGctt > SRR4302518.4102129/1‑98 (MQ=60)
CGTTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CG‑NNN > SRR4302518.10051420/1‑101 (MQ=60)
CGTTAAACAGGCTACGGGGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGGGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAA‑CGctt > SRR4302518.3221637/1‑98 (MQ=60)
NNNAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTC < SRR4302518.8012339/101‑1 (MQ=60)
NNNAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTC < SRR4302518.12194327/101‑1 (MQ=60)
GTTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTC < SRR4302518.2795587/101‑1 (MQ=60)
TTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAA‑CGgttcc > SRR4302518.4102972/1‑96 (MQ=60)
NNNACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGC < SRR4302518.7493703/101‑1 (MQ=60)
nnncaaGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCC < SRR4302518.13091750/95‑1 (MQ=60)
AAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGTCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCC < SRR4302518.4958229/101‑1 (MQ=60)
AAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCC < SRR4302518.6965243/101‑1 (MQ=60)
AAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAA‑CGCTTCGCC > SRR4302518.5781758/1‑101 (MQ=60)
NNNAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCC < SRR4302518.11232687/101‑1 (MQ=60)
NNNGGCTACGGTGGCAGAACCCAGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCTA < SRR4302518.9089591/101‑1 (MQ=60)
ACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCA < SRR4302518.5328127/101‑1 (MQ=60)
CAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑AGATTCGCCCAG > SRR4302518.5429202/1‑101 (MQ=60)
GGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCCGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTG < SRR4302518.5943500/101‑1 (MQ=60)
GGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTG < SRR4302518.1190758/101‑1 (MQ=60)
NNNACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCATCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGC < SRR4302518.7414820/101‑1 (MQ=60)
GCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATTCCGGCTAA‑CGcttccaccccnnn > SRR4302518.9025562/1‑88 (MQ=60)
GCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGcttcagatcgnnn > SRR4302518.13987623/1‑88 (MQ=60)
GCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGC < SRR4302518.3033746/101‑1 (MQ=60)
GCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGACCAGTGC > SRR4302518.1990625/1‑101 (MQ=60)
nnncgtTGGCAGACCCCTGAATGCTGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCC < SRR4302518.8765625/95‑1 (MQ=60)
CTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCCGTTAA‑CGCTTCGCCCAGgnnn > SRR4302518.13604165/1‑97 (MQ=60)
TACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCTATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGACG > SRR4302518.6438511/1‑101 (MQ=60)
TACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGNNN > SRR4302518.8187721/1‑101 (MQ=60)
TACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCCTCGCCCAGTGNNN > SRR4302518.9873254/1‑101 (MQ=60)
ACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCCCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGG < SRR4302518.2929488/101‑1 (MQ=60)
ACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCNNN > SRR4302518.15041601/1‑101 (MQ=60)
ACGGGGGCAGACCCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTTCCGG < SRR4302518.2534237/101‑1 (MQ=60)
CGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATTCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGT > SRR4302518.56436/1‑101 (MQ=60)
GGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGTAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGNNN > SRR4302518.9592105/1‑101 (MQ=60)
GGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCCGGGCCGGAC > SRR4302518.1837734/1‑101 (MQ=60)
GGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGAC > SRR4302518.1505857/1‑101 (MQ=60)
GGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGAC < SRR4302518.5004214/101‑1 (MQ=60)
GGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGNNN > SRR4302518.12511120/1‑101 (MQ=60)
TGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTTGCCCAGGGCCGGACCT > SRR4302518.1802221/1‑101 (MQ=60)
NNNCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCT < SRR4302518.10278447/101‑1 (MQ=60)
GGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTA > SRR4302518.2239247/1‑101 (MQ=60)
GCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCNNN > SRR4302518.10495231/1‑101 (MQ=60)
CAGAACCCTGAATGATGCGCAGTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGGTAGCAATCGGCAGGCCCGTGCAGGCTAA‑CGCCTCGCACAGTGCCGGACCTNNN > SRR4302518.13730690/1‑101 (MQ=60)
CAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGTCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACG < SRR4302518.1454772/101‑1 (MQ=60)
CAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACG > SRR4302518.3169590/1‑101 (MQ=60)
AAGAACCCTGAATGAGGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGGCGGACCTNNN > SRR4302518.11877254/1‑101 (MQ=60)
GAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCC < SRR4302518.2526189/101‑1 (MQ=60)
NNNCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCA < SRR4302518.9848392/101‑1 (MQ=60)
AACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGGCCGACCTACGNNN > SRR4302518.14370954/1‑101 (MQ=60)
AACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGNNN > SRR4302518.10521929/1‑101 (MQ=60)
AACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGCGGTAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGTCGGTCCTACGCCC > SRR4302518.2436129/1‑101 (MQ=60)
ACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCNNN > SRR4302518.8667250/1‑101 (MQ=60)
NNNTGACTGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGA < SRR4302518.10931981/101‑1 (MQ=60)
gtTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCANNN > SRR4302518.12321223/3‑101 (MQ=60)
NNNGAATGATGCGCCCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAG < SRR4302518.10643793/101‑1 (MQ=60)
CCTGAATGATGCGCACTGAAGCTGCCAGCACGAAGCAGGAGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCANNN > SRR4302518.13236713/1‑101 (MQ=60)
NNNAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCGCGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGTCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGT < SRR4302518.10553062/101‑1 (MQ=60)
CTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGT < SRR4302518.7348438/101‑1 (MQ=60)
TGAATGATGCTCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTC < SRR4302518.2044726/101‑1 (MQ=60)
GAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCA < SRR4302518.5644083/101‑1 (MQ=60)
GAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCCACGCCAGAGNNN > SRR4302518.11993732/1‑101 (MQ=60)
GAAGGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGTCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCA < SRR4302518.4372306/101‑1 (MQ=60)
NNNGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAA < SRR4302518.10197224/101‑1 (MQ=60)
AATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATTCCGGTGAA‑CGCCTCGCCCAGTGCGGGACCTACGCCAGAGTCAC > SRR4302518.6508284/1‑101 (MQ=60)
ATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCNNN > SRR4302518.10249794/1‑101 (MQ=60)
ATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTCACGGACCTACGCCAGAGTCNNN > SRR4302518.13402604/1‑101 (MQ=60)
NNNTGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAAGC < SRR4302518.12668387/101‑1 (MQ=60)
GGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCANNN > SRR4302518.11797435/1‑101 (MQ=60)
GATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGGCAACCA > SRR4302518.2000091/1‑101 (MQ=60)
ATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACNNN > SRR4302518.8262408/1‑101 (MQ=60)
ATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAG < SRR4302518.2222304/101‑1 (MQ=60)
NNNGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCATC < SRR4302518.12376602/101‑1 (MQ=60)
NNNACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCAC < SRR4302518.8301345/101‑1 (MQ=60)
CGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGATCCATGCCGGGTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCAC > SRR4302518.5980998/1‑101 (MQ=60)
cctCTGCAGCTGCTGGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGCCCCATGCCGGTTAACCC‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACC < SRR4302518.2833314/98‑1 (MQ=60)
NNNCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACC < SRR4302518.13968390/101‑1 (MQ=60)
GCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACC < SRR4302518.5811611/101‑1 (MQ=60)
NNNTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCTCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTCCGCCAGAGTCAACCAGCACCC < SRR4302518.12298196/101‑1 (MQ=60)
CACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGGGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCANNN > SRR4302518.12724892/1‑101 (MQ=60)
NNNGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTG < SRR4302518.13998193/101‑1 (MQ=60)
CCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTG < SRR4302518.2656640/101‑1 (MQ=60)
CCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTG < SRR4302518.5840802/101‑1 (MQ=60)
ACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGTCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACNNN > SRR4302518.8523203/1‑101 (MQ=60)
ACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACNNN > SRR4302518.12265730/1‑101 (MQ=60)
ACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACNNN > SRR4302518.8781622/1‑101 (MQ=60)
ACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTG < SRR4302518.6110638/101‑1 (MQ=60)
CTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCNNN > SRR4302518.12556453/1‑101 (MQ=60)
NNNAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTT < SRR4302518.9880777/101‑1 (MQ=60)
NNNGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTT < SRR4302518.11048642/101‑1 (MQ=60)
GCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTT < SRR4302518.5299837/101‑1 (MQ=60)
GCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGNNN > SRR4302518.8557275/1‑101 (MQ=60)
GCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGNNN > SRR4302518.14455229/1‑101 (MQ=60)
NNNCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTG < SRR4302518.10132583/101‑1 (MQ=60)
AGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCGGGGCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGGCGGACCTCCTCCATAGTCAACCAGCtccttgttgg > SRR4302518.1638481/1‑91 (MQ=52)
AGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTNNN > SRR4302518.7725440/1‑101 (MQ=60)
GCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAA < SRR4302518.7059804/101‑1 (MQ=60)
GCTGCCAGCACGAAGCAGGGGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGCCAACCAGCACCTGTTTNNN > SRR4302518.8103190/1‑101 (MQ=60)
NNNCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGTCCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAAC < SRR4302518.9801258/101‑1 (MQ=60)
NNNCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAAC < SRR4302518.8967883/101‑1 (MQ=60)
CTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAAC < SRR4302518.5702654/101‑1 (MQ=60)
CTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGGTTGAAC > SRR4302518.1514667/1‑101 (MQ=60)
nnntagaacgcAGCAGGTGATAGCAATCCGCAGCCCCATGCCGGTTAA‑AGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTCCGCCAGAGTCAACCAGCACCCGTTTGAACA < SRR4302518.10797695/90‑1 (MQ=60)
TGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACA > SRR4302518.6473668/1‑101 (MQ=60)
TGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACA < SRR4302518.2673623/101‑1 (MQ=60)
NNNCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACA < SRR4302518.13676691/101‑1 (MQ=60)
NNNAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAC < SRR4302518.11717454/101‑1 (MQ=60)
GCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAC > SRR4302518.6743474/1‑101 (MQ=60)
NNNGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGActctg < SRR4302518.10892506/101‑6 (MQ=60)
NNNGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACG < SRR4302518.7425478/101‑1 (MQ=60)
CCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACNNN > SRR4302518.7566883/1‑101 (MQ=60)
CCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGACAACCAGCACCTGTTTGAACACG > SRR4302518.1874431/1‑101 (MQ=60)
NNNACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCC < SRR4302518.8002707/101‑1 (MQ=60)
NNNACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCC < SRR4302518.14755280/101‑1 (MQ=60)
AGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACNNN > SRR4302518.12860689/1‑101 (MQ=60)
AGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACNNN > SRR4302518.13815462/1‑101 (MQ=60)
AGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACNNN > SRR4302518.14113351/1‑101 (MQ=60)
AGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACNNN > SRR4302518.13608679/1‑101 (MQ=60)
NNNCGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGTCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTTTTTGAACACGCCG < SRR4302518.14070693/101‑1 (MQ=60)
NNNCGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTCTTTGAACACGCCG < SRR4302518.14031252/101‑1 (MQ=60)
NNNCGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGCCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCG < SRR4302518.7423585/101‑1 (MQ=60)
GCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGCCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGCGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCG < SRR4302518.7251737/101‑1 (MQ=60)
CACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATTCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTGCGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCNNN > SRR4302518.8620571/1‑101 (MQ=60)
aggaggaAGGTGAGAGCAATCGGCAGCCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCCGTGCCGGCCCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCC < SRR4302518.3976248/94‑1 (MQ=60)
gatgcatgttgTAGCAATGGGCGGGCCCATGCCTGGTAA‑CGCTTCGCCAAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCCACCAGCACTTGTTTGAACACGCCGCCCC < SRR4302518.1865299/90‑1 (MQ=48)
GAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGCACACGCCGCCCG > SRR4302518.5098157/1‑101 (MQ=60)
AGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCA < SRR4302518.6711999/101‑1 (MQ=60)
ACCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCA > SRR4302518.3682319/1‑101 (MQ=60)
AACAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACtatgcccnnn > SRR4302518.11666608/1‑91 (MQ=60)
nnnggtagtcgcaaccggccgcCCCATGCCGGTTAC‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCAC < SRR4302518.15020086/79‑1 (MQ=60)
GCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGNNN > SRR4302518.9165042/1‑101 (MQ=60)
NNNGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACC < SRR4302518.13796481/101‑1 (MQ=60)
CAGGTGATAGCAATCGGCAGGGCCATTCCGGTTAA‑CGCTTCCCCCATTTCCCGACCTACGCCAGAGTCAACCTGCACCTCTTTGAAgacgctgccaccacc > SRR4302518.1881672/1‑86 (MQ=32)
CAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCNNN > SRR4302518.13136998/1‑101 (MQ=60)
CAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCNNN > SRR4302518.12160927/1‑101 (MQ=60)
CAGGTGATAGCAATCGGCAGCCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCCGACTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGACGCCCGCACC < SRR4302518.5430093/101‑1 (MQ=60)
NNNTGATAGCAATCGGCAGGCCAATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCA < SRR4302518.12156185/101‑1 (MQ=60)
AGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCA < SRR4302518.2124819/101‑1 (MQ=60)
AGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGAGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCA > SRR4302518.7039808/1‑101 (MQ=60)
GCTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTGAACCAGCACCTGTTTGAAGCGGCCGCCCGCACNNN > SRR4302518.10764440/1‑101 (MQ=60)
NTGATAGGACTCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCACCCCGCCCCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAAT < SRR4302518.6281241/101‑1 (MQ=60)
NNNATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAAT < SRR4302518.10059799/101‑1 (MQ=60)
TGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATC > SRR4302518.4313707/1‑101 (MQ=60)
NNNAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCA < SRR4302518.10503751/101‑1 (MQ=60)
NNNAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCA < SRR4302518.8726620/101‑1 (MQ=60)
GCTAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAANNN > SRR4302518.11161209/1‑101 (MQ=60)
GATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTGTGAACACGCCGCTCGCGGCAATCA > SRR4302518.2145270/1‑101 (MQ=60)
NNNGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCTC < SRR4302518.11332298/101‑1 (MQ=60)
GCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGCCCTACGCCAGAGTCAACCAGCCCCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAG < SRR4302518.3421366/101‑1 (MQ=60)
GCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAG < SRR4302518.2538616/101‑1 (MQ=60)
CAATCGGTAGGCCCTTGCCTGTTAA‑CGCTTTGCCCGGTGCTTGACCTACGCCAGAGTCAACCAGAACCTGTTTGAACACGGCGACCGCAACAATCACtcgc > SRR4302518.5055671/1‑97 (MQ=24)
AATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGGGGCAACCAGCACCTTTTTTAACACGCCGCCCGCACCACTCACCAGCA > SRR4302518.6860355/1‑101 (MQ=60)
AATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCANNN > SRR4302518.7518110/1‑101 (MQ=60)
NNNGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCGG < SRR4302518.12413770/101‑1 (MQ=60)
NNNGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAG < SRR4302518.9344107/101‑1 (MQ=60)
NNNGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGG < SRR4302518.14415418/101‑1 (MQ=60)
ACGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGA < SRR4302518.1795794/101‑1 (MQ=60)
CGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCANNN > SRR4302518.14372908/1‑101 (MQ=60)
GGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAAT > SRR4302518.4212626/1‑101 (MQ=60)
nnngtcccacGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATG < SRR4302518.11689501/91‑1 (MQ=60)
NNNGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAAAG < SRR4302518.11124968/101‑1 (MQ=60)
GCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGTCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGANNN > SRR4302518.13642148/1‑101 (MQ=60)
AGGCCCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGAT > SRR4302518.3494839/1‑101 (MQ=60)
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CCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCC < SRR4302518.1590154/101‑1 (MQ=60)
CCATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAAAATGATannn > SRR4302518.9596600/1‑97 (MQ=60)
NNNGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCG < SRR4302518.11978164/101‑1 (MQ=60)
CTTGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCNNN > SRR4302518.11576933/1‑101 (MQ=60)
CATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCG > SRR4302518.2118182/1‑101 (MQ=60)
CATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCG < SRR4302518.4911562/101‑1 (MQ=60)
CATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCG > SRR4302518.5128028/1‑101 (MQ=60)
CTGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGC < SRR4302518.6213923/101‑1 (MQ=60)
ATGCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCNNN > SRR4302518.11882322/1‑101 (MQ=60)
NNNCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGCCCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCC < SRR4302518.10918441/101‑1 (MQ=60)
NNNGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCG < SRR4302518.9287838/101‑1 (MQ=60)
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GCCGGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGNNN > SRR4302518.12246625/1‑101 (MQ=60)
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GGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCncnnnnnnn > SRR4302518.12935117/1‑92 (MQ=60)
GGTTAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGNNN > SRR4302518.8835547/1‑101 (MQ=60)
GTTAA‑CGCTTCGCCAAGTGCCGGACCTACGACAGAGTCAACCAGCCCCTGTTTGACCACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGGTTG < SRR4302518.6015751/101‑1 (MQ=60)
TTAA‑CGCTTCGACCAGTGGCGGTGCTACGCCAGAGCCAAACAGCACCTGTTTGAACACGGCGCCCGCACCAATTACCAGTAGAATAGTCCCCGCCGtgnnn > SRR4302518.13291052/1‑96 (MQ=28)
TAA‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGGTTGCA > SRR4302518.4203865/1‑101 (MQ=60)
AA‑CGCTTCGCCCCGTGGCGGACCCACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCCCCAGCAGAATCATCCCCGCCGGTTGCAG < SRR4302518.6928704/101‑1 (MQ=60)
N‑NN‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGGTTGCAGCG < SRR4302518.7618730/101‑1 (MQ=60)
A‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGGTTGCAGC < SRR4302518.5417173/101‑1 (MQ=60)
A‑CGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGGTTGCAGC < SRR4302518.6682212/101‑1 (MQ=60)
C‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGGTTGCAGCGCG > SRR4302518.1154616/1‑101 (MQ=60)
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CGCCGTTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAA‑CG‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGGTTGCAGCGCG > NC_000913/3573600‑3573800
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |