Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC |
NC_000913 |
3,268,129 |
(C)7→10 |
intergenic (+661/+137) |
b3122 → / ← b3124 |
hypothetical protein/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3268122 | 8 (0.030) | 190 (0.780)
+CCC |
102/164 |
0.8 |
95.9% |
intergenic (+654/+144) |
b3122/b3124 |
hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_000913 |
3268123 = |
8 (0.030) | intergenic (+655/+143) |
b3122/b3124 |
hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
CGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3268031‑3268122
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCG > NC_000913/3268123‑3268213
|||
CGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTC < 1:1038619/93‑1
GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGCGTTTCC < 2:5369189/93‑1
GTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCC < 2:876668/93‑1
TGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCC < 1:6069273/93‑1
TGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCC > 2:5417452/1‑93
tCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCC < 1:2335469/92‑1
GCTCTTACCGCACCCTTTGACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGGTTCCCCCCC > 1:1717981/1‑93
GCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCC > 2:6091262/1‑93
GCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCC > 2:562790/1‑93
CTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCC > 2:1937070/1‑93
CTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCCa < 2:6393740/93‑2
CTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCCa < 2:3029508/93‑2
CTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCAGCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCCa < 1:5062538/93‑2
TTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGGTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGGTTCCCCCCCCaag > 2:4284292/1‑90
TACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCaggc < 1:5212991/93‑5
TACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCCagg < 1:4677583/93‑4
TACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCCagg > 2:5253960/1‑90
TACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCCagg > 2:5084730/1‑90
ACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCCaggc < 2:35055/93‑5
ACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCCaggc > 1:6354399/1‑89
ACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCCaggc > 1:4484468/1‑89
ACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCCaggc < 2:4917176/93‑5
ACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCCaggc > 1:289944/1‑89
CCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGGTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCG > 1:2748889/1‑93
cCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTT < 1:4347644/92‑1
GCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTT > 1:1900668/1‑93
ctCCCTTTGCCCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGTTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTA < 2:1203555/91‑1
CACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTA < 1:4334353/93‑1
CACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTA > 1:5119353/1‑93
CACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTA > 2:691060/1‑93
cCCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTAC < 1:733776/92‑1
ACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTAC > 1:4931463/1‑93
CCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACC < 2:725574/93‑1
CCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCT < 1:1109778/93‑1
CTTTCCCCCTTCCCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTG < 2:450841/93‑1
TTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGG > 1:4017733/1‑93
TCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGgc > 2:5746611/1‑91
TCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCA < 2:5185017/93‑1
cCCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACC < 2:1703681/92‑1
CCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCC > 1:3167340/1‑93
CCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGGTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCGCCC > 2:2670486/1‑93
CCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGGTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCC > 1:2404971/1‑93
CCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCg > 1:5737779/1‑92
CCTTACATGATGCCACATGCGCGGTCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGCGGGGTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCT < 2:1632049/93‑1
CTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTG > 1:664510/1‑93
TTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGC > 2:5704475/1‑93
ACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCC > 2:2695200/1‑93
CCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCT > 2:5751087/1‑93
CTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTA > 2:4852698/1‑93
CTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTA < 1:4155662/93‑1
CTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTCCCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTA < 1:2895819/93‑1
TGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTCCCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTAT < 2:5735772/93‑1
TGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGGTGCACTGGTCGAGGGCTTCGCCCCCCCC‑CGCGTTCCCTGGCACCCTGCCCTtg > 2:6443283/1‑91
GATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATG < 1:2840212/93‑1
ATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGG < 1:162554/93‑1
ATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGG < 2:313874/93‑1
TCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGA > 2:1398167/1‑93
CCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAG < 1:5390325/93‑1
CCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAG > 1:3499904/1‑93
CCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CGCCCCCCCAGGCGTTACGCGGCACCCTGCCCCATAGAGC > 1:2594474/1‑93
CGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCC > 2:5058662/1‑93
CTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCG > 1:5783394/1‑93
CTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCCGCCCTATGGAGCCCG > 2:3260588/1‑93
TGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGA > 1:3612788/1‑93
TGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGA > 2:5889127/1‑93
GCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGAC < 2:4207741/93‑1
CGCGGCCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACT < 1:5547367/93‑1
GCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTT < 2:6010599/93‑1
GCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTAAGGAGCCCGGACTT < 2:6359870/93‑1
GCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACGGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTT < 2:4619786/93‑1
CGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTT > 2:5917745/1‑93
GGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCC > 2:1355232/1‑93
GGCCATCGACGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCC > 2:6320687/1‑93
ATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCC > 1:3667764/1‑93
CGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCT < 1:333270/93‑1
GGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTC < 2:4811280/93‑1
GGCGGTCTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTC < 2:3210919/93‑1
GCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCC > 2:4012996/1‑93
GGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGC > 2:3303013/1‑93
GTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCC > 2:3838122/1‑93
GTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCC > 2:4968836/1‑93
TTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCC > 1:619698/1‑93
GCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTC < 1:2952769/93‑1
TCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTC > 1:495116/1‑93
GTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCG > 1:444470/1‑93
CACTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA > 2:1863737/1‑93
CTGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGG < 1:484736/93‑1
TGGTCGTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGA < 2:6234233/93‑1
GTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACG > 1:937623/1‑93
GTGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACG > 1:877353/1‑93
TGGGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGA < 1:1245386/93‑1
GGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACG > 2:5472714/1‑93
GGTTT‑CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACG > 2:772157/1‑93
gTTCCCCCCCCCCATGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGA < 2:1162239/92‑1
TTCCCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAA < 2:387553/93‑1
tttCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAG < 2:26008/90‑1
ttCCCCCCCCGAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCGATGGAGCCCGGCCTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAG < 2:2372407/91‑1
ttCCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAG > 2:203770/3‑93
tCCCCCCCCGAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGC < 2:1551718/92‑1
CCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCG < 1:4084096/93‑1
|||
CGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3268031‑3268122
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCG > NC_000913/3268123‑3268213
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑T‑‑‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGT > NC_000913/3268036‑3268221
|
CGCTCTTACCGCACCCTTTGACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGGT‑‑T‑‑‑CCCCCCC > SRR4302537.1729969/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑T‑‑‑CCCCCCC < SRR4302537.3630416/94‑1 (MQ=60)
CTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑T‑‑‑CCCCCCCcc < SRR4302537.2940849/94‑3 (MQ=60)
CTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCAGCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑T‑‑‑CCCCCCCccag < SRR4302537.5097388/94‑5 (MQ=60)
TTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑T‑‑‑CCCCCCCccagg < SRR4302537.981451/94‑6 (MQ=60)
TTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑T‑‑‑CCCCCCCccagg < SRR4302537.5896152/94‑6 (MQ=60)
TTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑T‑‑‑CCCCCCCccaag > SRR4302537.4937310/1‑89 (MQ=60)
TACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGC < SRR4302537.4709944/94‑1 (MQ=60)
TACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGC > SRR4302537.4515492/1‑94 (MQ=60)
TACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGC > SRR4302537.6397772/1‑94 (MQ=60)
TACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGC > SRR4302537.291962/1‑94 (MQ=60)
TACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TC‑‑CCCCCCCAGGCG < SRR4302537.5248834/94‑1 (MQ=60)
ACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGGTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCG > SRR4302537.2768063/1‑94 (MQ=60)
CGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTT > SRR4302537.1913868/1‑94 (MQ=60)
CGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTT < SRR4302537.5779879/94‑1 (MQ=60)
CGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTT < SRR4302537.3404812/94‑1 (MQ=60)
GCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTA > SRR4302537.5154633/1‑94 (MQ=60)
CCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTA < SRR4302537.4377776/94‑1 (MQ=60)
CACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTAC > SRR4302537.4965452/1‑94 (MQ=60)
CACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTAC < SRR4302537.4364457/94‑1 (MQ=60)
CCCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACC < SRR4302537.738782/94‑1 (MQ=60)
CCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TC‑‑CCCCCCCAGGCGTTACCTG < SRR4302537.466868/94‑1 (MQ=60)
CCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTG < SRR4302537.1117447/94‑1 (MQ=60)
CTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGG > SRR4302537.4045860/1‑94 (MQ=60)
CACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACC > SRR4302537.5344988/1‑94 (MQ=60)
ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCC > SRR4302537.3189588/1‑94 (MQ=60)
ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGGT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCC > SRR4302537.2421899/1‑94 (MQ=60)
CCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCG > SRR4302537.5777062/1‑94 (MQ=60)
CCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTG > SRR4302537.669037/1‑94 (MQ=60)
CTTACCTTATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGGT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGGTACCTGGCACCCCGC > SRR4302537.5463301/1‑94 (MQ=60)
TACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCC > SRR4302537.1713795/1‑94 (MQ=60)
TACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCC < SRR4302537.3801061/94‑1 (MQ=60)
CCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TC‑‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTAT < SRR4302537.1780556/94‑1 (MQ=60)
CTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTCCC‑‑‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTAT < SRR4302537.2916144/94‑1 (MQ=60)
CTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTAT < SRR4302537.4184682/94‑1 (MQ=60)
CTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTAT > SRR4302537.6494022/1‑94 (MQ=60)
TGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGTTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATG < SRR4302537.2882403/94‑1 (MQ=60)
TGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGGTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGGT‑‑T‑‑‑CCCCCCCcccagcttttccttgtaccctgccctatg > SRR4302537.4664656/1‑65 (MQ=60)
GATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGG < SRR4302537.2860090/94‑1 (MQ=60)
GATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGG < SRR4302537.1580567/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGA > SRR4302537.111588/1‑94 (MQ=60)
ATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGA < SRR4302537.163710/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGA < SRR4302537.4078278/94‑1 (MQ=60)
TCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTTGCACCCCGCCCCATGGAG > SRR4302537.6070707/1‑94 (MQ=60)
TCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAG > SRR4302537.3524666/1‑94 (MQ=60)
CCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCG‑CCCCCCCAGGCGTTACGCGGCACCCTGCCCCATAGAGC > SRR4302537.2612623/1‑94 (MQ=60)
CCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGC > SRR4302537.4922211/1‑94 (MQ=60)
CCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGC < SRR4302537.5427150/94‑1 (MQ=60)
CCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCC < SRR4302537.5153172/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCG > SRR4302537.5823042/1‑94 (MQ=60)
TTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGA > SRR4302537.3638257/1‑94 (MQ=60)
CGCGGCCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTT < SRR4302537.5585243/94‑1 (MQ=60)
GCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCCCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTT < SRR4302537.3639070/94‑1 (MQ=60)
CCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCC < SRR4302537.3097380/94‑1 (MQ=60)
CCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCC > SRR4302537.2174023/1‑94 (MQ=60)
CCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCC > SRR4302537.677249/1‑94 (MQ=60)
CATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCC > SRR4302537.3693577/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TC‑‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCT < SRR4302537.3349723/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTC < SRR4302537.335576/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCC < SRR4302537.2402994/94‑1 (MQ=60)
GCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCG < SRR4302537.4711513/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGC > SRR4302537.2608693/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCC > SRR4302537.623916/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCTCTCTATTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCC < SRR4302537.2782609/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCG < SRR4302537.2798307/94‑1 (MQ=60)
GCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCT < SRR4302537.2973491/94‑1 (MQ=60)
CTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTC > SRR4302537.498524/1‑94 (MQ=60)
CTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTC < SRR4302537.889155/94‑1 (MQ=60)
CTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTC > SRR4302537.820147/1‑94 (MQ=60)
CTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTC > SRR4302537.6178636/1‑94 (MQ=60)
TCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCC > SRR4302537.574970/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCC > SRR4302537.1903603/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCC > SRR4302537.3732171/1‑94 (MQ=60)
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TGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCG > SRR4302537.447557/1‑94 (MQ=60)
GTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA > SRR4302537.429686/1‑94 (MQ=60)
TGCACGGGTCGT‑GGTT‑‑TCCCCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAG < SRR4302537.4437975/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGA < SRR4302537.488058/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGAC < SRR4302537.2919189/94‑1 (MQ=60)
CGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACG > SRR4302537.944088/1‑94 (MQ=60)
CGTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACG > SRR4302537.883387/1‑94 (MQ=60)
GTGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGA > SRR4302537.497740/1‑94 (MQ=60)
TGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGAC < SRR4302537.1254063/94‑1 (MQ=60)
TGGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGAC < SRR4302537.4367125/94‑1 (MQ=60)
GGGTT‑‑TCC‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACG < SRR4302537.4493349/94‑1 (MQ=60)
tgggttcccCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGTACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGAC < SRR4302537.4582224/85‑1 (MQ=60)
tggatttccCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCGCCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGAC < SRR4302537.3155402/85‑1 (MQ=60)
ggggttcccCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGAC < SRR4302537.1158136/85‑1 (MQ=60)
gttttccgcaCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGATCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGA < SRR4302537.6200110/84‑1 (MQ=60)
tccCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCG < SRR4302537.4169260/91‑1 (MQ=60)
ccCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGG < SRR4302537.2731429/92‑1 (MQ=60)
ccCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGG < SRR4302537.4112607/92‑1 (MQ=60)
CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCG > SRR4302537.819554/1‑94 (MQ=60)
CCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGAC < SRR4302537.695793/94‑1 (MQ=60)
CCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCACGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGAC > SRR4302537.4696957/1‑94 (MQ=60)
CCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTG < SRR4302537.2771180/94‑1 (MQ=60)
CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCACGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGgcgcgactga > SRR4302537.1757527/1‑84 (MQ=60)
|
CGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑‑T‑‑‑CCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGT > NC_000913/3268036‑3268221
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
