Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,359,814 |
T→C |
V23A (GTT→GCT) |
yhcA → |
putative chaperone |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,359,814 | 0 | T | C | 99.7%
| 1070.3
/ ‑4.7
| 301 | V23A (GTT→GCT) | yhcA | putative chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (149/151); minor base G (1/0); total (150/151) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
TTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTT > NC_000913/3359724‑3359903
|
ttattaCAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTc > 2:464548/1‑93 (MQ=255)
tattaCAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTcc < 2:3303365/93‑1 (MQ=255)
tattaCAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTcc > 2:122276/1‑93 (MQ=255)
tattaCAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTcc < 1:3119648/93‑1 (MQ=255)
attaCAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCt < 1:4861949/93‑1 (MQ=255)
attaCAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCt < 2:2434254/93‑1 (MQ=255)
aGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAAc > 2:5698931/1‑93 (MQ=255)
ggAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACa > 1:4683210/1‑93 (MQ=255)
ggAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACa > 2:4564317/1‑93 (MQ=255)
aGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATc < 2:4797291/93‑1 (MQ=255)
gTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCa > 2:6153762/1‑93 (MQ=255)
ttttAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAg < 1:1438807/93‑1 (MQ=255)
tttaatttaaATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGt < 1:2879131/93‑1 (MQ=255)
tttaatttaaATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGt < 1:5343270/93‑1 (MQ=255)
tttaatttaaATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGt > 1:4203214/1‑93 (MQ=255)
taatttaaATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTAt < 1:3516330/93‑1 (MQ=255)
aatttaaATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTAtt > 1:5412959/1‑93 (MQ=255)
atttaaATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTg > 2:2914198/1‑93 (MQ=255)
tttaaATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGc > 1:2409543/1‑93 (MQ=255)
taaATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTg < 1:2711462/93‑1 (MQ=255)
aaaTGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTgg > 1:3578373/1‑93 (MQ=255)
aaTGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGt < 1:4305897/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGt > 2:5014563/1‑93 (MQ=255)
cTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTtgat < 1:3217433/93‑1 (MQ=255)
cTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTtgat < 2:3880276/93‑1 (MQ=255)
cAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTtgatga < 2:5285588/93‑1 (MQ=255)
aGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGaa > 2:1681308/1‑93 (MQ=255)
acacATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGaaaa < 1:5790180/93‑1 (MQ=255)
cattacattCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCg < 2:4461332/93‑1 (MQ=255)
cattacattCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCg < 2:2963149/93‑1 (MQ=255)
attacattCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCgt > 2:1190645/1‑93 (MQ=255)
attacattCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCgt < 1:2038135/93‑1 (MQ=255)
attacattCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCgt < 2:5387545/93‑1 (MQ=255)
attacattCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCgt > 2:3155496/1‑93 (MQ=255)
ttacattCACTGTATTTATCACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGGTGATGAAAAGCgtg > 2:5464236/1‑93 (MQ=255)
ttacattCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCgtg < 2:4811544/93‑1 (MQ=255)
acattCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCgtggt > 2:4395230/1‑93 (MQ=255)
acattCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCgtggt < 1:4453287/93‑1 (MQ=255)
acattCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCgtggt > 2:4762465/1‑93 (MQ=255)
ttCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGaa < 2:1067236/93‑1 (MQ=255)
ttCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGaa > 2:5680571/1‑93 (MQ=255)
tCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAg > 2:4062843/1‑93 (MQ=255)
aCTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCt < 1:704524/93‑1 (MQ=255)
aCTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCt > 1:872031/1‑93 (MQ=255)
tGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAg > 1:3928400/1‑93 (MQ=255)
tGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAg < 1:1944476/93‑1 (MQ=255)
gTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGt < 2:3771774/93‑1 (MQ=255)
gTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGt > 1:4104515/1‑93 (MQ=255)
gTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGt > 2:2059459/1‑93 (MQ=255)
tATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGta < 2:2682915/93‑1 (MQ=255)
aTTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtat < 1:1174822/93‑1 (MQ=255)
aTTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtat > 1:2539628/1‑93 (MQ=255)
tttATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtatt > 2:5234322/1‑93 (MQ=255)
tttATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtatt < 2:3986605/93‑1 (MQ=255)
ttATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtatta > 2:279042/1‑93 (MQ=255)
ataACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaat < 1:2129564/93‑1 (MQ=255)
ataACAACATAAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaat < 2:657737/93‑1 (MQ=255)
caacaTCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatatta > 2:1806718/1‑93 (MQ=255)
aacaTCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatattaa > 2:1383355/1‑93 (MQ=255)
aacaTCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatattaa < 1:6393116/93‑1 (MQ=255)
aacaTCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatattaa < 2:1009957/93‑1 (MQ=255)
aTCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGaa > 1:6054538/1‑93 (MQ=255)
aTCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGaa < 2:3937277/93‑1 (MQ=255)
cAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATa > 2:3196867/1‑93 (MQ=255)
aTGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACa > 1:4648203/1‑93 (MQ=255)
aTGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACa > 1:3885849/1‑93 (MQ=255)
aTGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACa > 2:1846031/1‑93 (MQ=255)
tGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTTAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAg < 1:1145920/93‑1 (MQ=255)
tGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAg > 2:2138711/1‑93 (MQ=255)
tGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGAATTAATATTAAGAATACAg < 2:6271584/93‑1 (MQ=255)
gAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAga > 2:5829466/1‑93 (MQ=255)
aaTACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgat < 1:3756534/93‑1 (MQ=255)
aaTACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgat < 1:5751060/93‑1 (MQ=255)
tACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgatga > 1:1869677/1‑93 (MQ=255)
tACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgatga > 2:2303738/1‑93 (MQ=255)
tACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgatga > 2:4216718/1‑93 (MQ=255)
tACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgatga < 1:2196866/93‑1 (MQ=255)
aCCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgatgat > 2:5331937/1‑93 (MQ=255)
ccTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGatc > 1:5995630/1‑93 (MQ=255)
cTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGatca > 1:3261702/1‑93 (MQ=255)
cTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGatca > 2:5524034/1‑93 (MQ=255)
cTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGatca < 2:5106499/93‑1 (MQ=255)
cTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGatca > 1:5648354/1‑93 (MQ=255)
ttAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGatcat > 1:5290852/1‑93 (MQ=255)
ttAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGatcat < 1:1565985/93‑1 (MQ=255)
aGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATcc < 2:4927574/93‑1 (MQ=255)
aGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATcc < 1:5869131/93‑1 (MQ=255)
gCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCt > 1:3171252/1‑93 (MQ=255)
ccACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGCTCATCCtt < 2:6321331/93‑1 (MQ=255)
cacaGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTc > 2:1990977/1‑93 (MQ=255)
cacaGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTc < 1:3323691/93‑1 (MQ=255)
cacaGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTc > 1:6200147/1‑93 (MQ=255)
acaGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCa > 1:4898595/1‑93 (MQ=255)
aGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACTGATGATCATCCTTCAtt < 1:3440276/93‑1 (MQ=255)
aGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCAtt > 2:3641335/1‑93 (MQ=255)
gggATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTg > 1:2799215/1‑93 (MQ=255)
ggATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGc < 1:773415/93‑1 (MQ=255)
gATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCt > 1:165106/1‑93 (MQ=255)
gATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCt < 2:1456797/93‑1 (MQ=255)
aTGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCtt > 1:5533381/1‑93 (MQ=255)
|
TTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTT > NC_000913/3359724‑3359903
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTTACAC > NC_000913/3359721‑3359907
|
TCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGC > SRR4302537.839135/1‑94 (MQ=60)
TCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGC > SRR4302537.4395994/1‑94 (MQ=60)
CATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCT < SRR4302537.3184854/94‑1 (MQ=60)
CATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCT < SRR4302537.694335/94‑1 (MQ=60)
CATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCT < SRR4302537.5538674/94‑1 (MQ=60)
TTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCC > SRR4302537.4329166/1‑94 (MQ=60)
TTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCC < SRR4302537.5631602/94‑1 (MQ=60)
TATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCT < SRR4302537.3141455/94‑1 (MQ=60)
TATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCT < SRR4302537.1252194/94‑1 (MQ=60)
TATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCT < SRR4302537.4569378/94‑1 (MQ=60)
ATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTG > SRR4302537.943396/1‑94 (MQ=60)
ATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTG < SRR4302537.2835275/94‑1 (MQ=60)
ATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTG < SRR4302537.4895489/94‑1 (MQ=60)
TACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAA > SRR4302537.5371673/1‑94 (MQ=60)
AGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACA > SRR4302537.4715605/1‑94 (MQ=60)
GGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACAT < SRR4302537.6183428/94‑1 (MQ=60)
GGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACAT > SRR4302537.359188/1‑94 (MQ=60)
GGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACAT > SRR4302537.2609041/1‑94 (MQ=60)
GAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATC > SRR4302537.4794562/1‑94 (MQ=60)
GAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATC > SRR4302537.4506813/1‑94 (MQ=60)
GTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAG > SRR4302537.5777012/1‑94 (MQ=60)
TTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGT > SRR4302537.4232557/1‑94 (MQ=60)
TTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGT < SRR4302537.1448810/94‑1 (MQ=60)
TTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGGTCCTGAAACATCAGTA > SRR4302537.3666850/1‑94 (MQ=60)
TTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTA < SRR4302537.2899332/94‑1 (MQ=60)
TTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTA < SRR4302537.5379888/94‑1 (MQ=60)
TTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTA < SRR4302537.5666730/94‑1 (MQ=60)
TTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTAT < SRR4302537.618414/94‑1 (MQ=60)
TTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTAT > SRR4302537.3497106/1‑94 (MQ=60)
TAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATT > SRR4302537.5449867/1‑94 (MQ=60)
TAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATT < SRR4302537.4189750/94‑1 (MQ=60)
TAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATT < SRR4302537.3541208/94‑1 (MQ=60)
AATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTG < SRR4302537.1180779/94‑1 (MQ=60)
AATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTG < SRR4302537.3409375/94‑1 (MQ=60)
ATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGC > SRR4302537.2426503/1‑94 (MQ=60)
TTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCT < SRR4302537.2014517/94‑1 (MQ=60)
TTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCT > SRR4302537.741834/1‑94 (MQ=60)
TTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTG < SRR4302537.215990/94‑1 (MQ=60)
TTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTG > SRR4302537.5333781/1‑94 (MQ=60)
TAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGG > SRR4302537.3603601/1‑94 (MQ=60)
TAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGG < SRR4302537.2730401/94‑1 (MQ=60)
AAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGT < SRR4302537.4926252/94‑1 (MQ=60)
AAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGT < SRR4302537.2106565/94‑1 (MQ=60)
AAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGT < SRR4302537.1627470/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTT < SRR4302537.4335830/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTT > SRR4302537.3145741/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGCGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTT > SRR4302537.3764925/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGTGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTG > SRR4302537.1468109/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTG > SRR4302537.6516352/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTG < SRR4302537.153300/94‑1 (MQ=60)
GCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGAT < SRR4302537.3164985/94‑1 (MQ=60)
CTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATG < SRR4302537.3240072/94‑1 (MQ=60)
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CAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAA < SRR4302537.6043935/94‑1 (MQ=60)
CAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAA < SRR4302537.3269180/94‑1 (MQ=60)
AGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAA > SRR4302537.1839226/1‑94 (MQ=60)
GACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAA > SRR4302537.2206217/1‑94 (MQ=60)
ACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAG < SRR4302537.5829883/94‑1 (MQ=60)
ACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCG > SRR4302537.2786105/1‑94 (MQ=60)
CATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGT > SRR4302537.581660/1‑94 (MQ=60)
CATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGT > SRR4302537.2912106/1‑94 (MQ=60)
CATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGT < SRR4302537.4050191/94‑1 (MQ=60)
ATTATATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTG < SRR4302537.3947158/94‑1 (MQ=60)
ATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTG > SRR4302537.5037012/1‑94 (MQ=60)
ATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTG < SRR4302537.2052348/94‑1 (MQ=60)
TTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGG < SRR4302537.2267863/94‑1 (MQ=60)
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TACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGT < SRR4302537.4684586/94‑1 (MQ=60)
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ACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTG > SRR4302537.3453898/1‑94 (MQ=60)
ACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTG < SRR4302537.4484043/94‑1 (MQ=60)
ACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTG > SRR4302537.2300403/1‑94 (MQ=60)
CATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGA < SRR4302537.2499069/94‑1 (MQ=60)
CATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGA < SRR4302537.5435343/94‑1 (MQ=60)
TTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAG < SRR4302537.5569156/94‑1 (MQ=60)
TCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGC < SRR4302537.1703911/94‑1 (MQ=60)
CACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGTCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCT < SRR4302537.3944562/94‑1 (MQ=60)
CACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCT > SRR4302537.878026/1‑94 (MQ=60)
CACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCT < SRR4302537.813822/94‑1 (MQ=60)
ACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTA > SRR4302537.738253/1‑94 (MQ=60)
ACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTA < SRR4302537.709344/94‑1 (MQ=60)
CTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAG > SRR4302537.3955850/1‑94 (MQ=60)
TGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGT < SRR4302537.5995047/94‑1 (MQ=60)
TGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGT > SRR4302537.4133186/1‑94 (MQ=60)
TGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGT < SRR4302537.5991803/94‑1 (MQ=60)
TGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGT < SRR4302537.1957991/94‑1 (MQ=60)
TGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGT > SRR4302537.4333410/1‑94 (MQ=60)
TATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTAT > SRR4302537.2557439/1‑94 (MQ=60)
TATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTAT > SRR4302537.3797464/1‑94 (MQ=60)
ATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATT > SRR4302537.1179511/1‑94 (MQ=60)
ATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATT < SRR4302537.1182992/94‑1 (MQ=60)
ATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATA < SRR4302537.2144546/94‑1 (MQ=60)
AACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAG < SRR4302537.3197779/94‑1 (MQ=60)
AACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAG > SRR4302537.505072/1‑94 (MQ=60)
AACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAG > SRR4302537.1929739/1‑94 (MQ=60)
AACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAG < SRR4302537.6436662/94‑1 (MQ=60)
ACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGA < SRR4302537.2617741/94‑1 (MQ=60)
CATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAA < SRR4302537.4914728/94‑1 (MQ=60)
CATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAA < SRR4302537.783794/94‑1 (MQ=60)
CATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAA > SRR4302537.6096127/1‑94 (MQ=60)
ATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAAT > SRR4302537.209572/1‑94 (MQ=60)
CAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATAC < SRR4302537.4830958/94‑1 (MQ=60)
CAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATAC < SRR4302537.27927/94‑1 (MQ=60)
CAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATAC > SRR4302537.5846398/1‑94 (MQ=60)
AATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACA > SRR4302537.4680339/1‑94 (MQ=60)
AATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACA < SRR4302537.4438099/94‑1 (MQ=60)
AATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACA > SRR4302537.6084771/1‑94 (MQ=60)
AATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACA > SRR4302537.3913033/1‑94 (MQ=60)
ATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAG > SRR4302537.53051/1‑94 (MQ=60)
TGAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTTAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGA < SRR4302537.1153891/94‑1 (MQ=60)
GAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGAT < SRR4302537.3581358/94‑1 (MQ=60)
GAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGAT < SRR4302537.5795478/94‑1 (MQ=60)
GAATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAACGTGGGGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGAT > SRR4302537.1374248/1‑94 (MQ=60)
AATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATG < SRR4302537.3782907/94‑1 (MQ=60)
AATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATG < SRR4302537.5790456/94‑1 (MQ=60)
ATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGA < SRR4302537.3050906/94‑1 (MQ=60)
ATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGA > SRR4302537.636338/1‑94 (MQ=60)
ATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGA > SRR4302537.1882691/1‑94 (MQ=60)
ATACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGA > SRR4302537.3306622/1‑94 (MQ=60)
TACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGAT < SRR4302537.2212345/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATC > SRR4302537.574590/1‑94 (MQ=60)
ACCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATC > SRR4302537.6036806/1‑94 (MQ=60)
CCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCA > SRR4302537.5687011/1‑94 (MQ=60)
CCTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCA > SRR4302537.3284706/1‑94 (MQ=60)
CTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCAT > SRR4302537.5327209/1‑94 (MQ=60)
CTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCAT < SRR4302537.4445478/94‑1 (MQ=60)
CTTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCAT < SRR4302537.902502/94‑1 (MQ=60)
TTAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATC < SRR4302537.1576910/94‑1 (MQ=60)
TAGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCC > SRR4302537.4711689/1‑94 (MQ=60)
AGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCT > SRR4302537.4219757/1‑94 (MQ=60)
AGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCT > SRR4302537.3193534/1‑94 (MQ=60)
AGCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCT < SRR4302537.5909392/94‑1 (MQ=60)
GCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTT < SRR4302537.6448320/94‑1 (MQ=60)
GCCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTT < SRR4302537.3250498/94‑1 (MQ=60)
CCACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTC > SRR4302537.6242878/1‑94 (MQ=60)
CACAGGGATGGCTCCTGAAACATCCGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTACTATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCA > SRR4302537.2822707/1‑94 (MQ=60)
CACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCA > SRR4302537.4932409/1‑94 (MQ=60)
CACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCA < SRR4302537.3347210/94‑1 (MQ=60)
ACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCAT < SRR4302537.5878878/94‑1 (MQ=60)
ACAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCAT > SRR4302537.2465320/1‑94 (MQ=60)
CAGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATT < SRR4302537.5555220/94‑1 (MQ=60)
AGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACTGATGATCATCCTTCATTG < SRR4302537.3464624/94‑1 (MQ=60)
AGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTG > SRR4302537.5408652/1‑94 (MQ=60)
AGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTG > SRR4302537.6353527/1‑94 (MQ=60)
AGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTG > SRR4302537.2818786/1‑94 (MQ=60)
AGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTG < SRR4302537.399691/94‑1 (MQ=60)
AGGGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTG < SRR4302537.3215816/94‑1 (MQ=60)
GGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCT < SRR4302537.778715/94‑1 (MQ=60)
GGATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCT > SRR4302537.166281/1‑94 (MQ=60)
GATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTT < SRR4302537.3324627/94‑1 (MQ=60)
GATGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTT > SRR4302537.5571152/1‑94 (MQ=60)
TGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTTA < SRR4302537.1626033/94‑1 (MQ=60)
TGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTTA < SRR4302537.1963045/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTTAC < SRR4302537.2023271/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTTAC < SRR4302537.2887504/94‑1 (MQ=60)
GCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTTACA < SRR4302537.5410407/94‑1 (MQ=60)
GCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTTACA < SRR4302537.2228762/94‑1 (MQ=60)
CTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTTACAC < SRR4302537.6175720/94‑1 (MQ=60)
CTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTTACAC < SRR4302537.2568812/94‑1 (MQ=60)
CTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTTACAC < SRR4302537.2569396/94‑1 (MQ=60)
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TCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATCCTTCATTGCTTTACAC > NC_000913/3359721‑3359907
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
