Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,611,391 |
T→C |
W32R (TGG→CGG) |
nikA → |
periplasmic binding protein for nickel |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,611,391 | 0 | T | C | 97.1%
| 777.1
/ 8.4
| 241 | W32R (TGG→CGG) | nikA | periplasmic binding protein for nickel |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/3); new base C (110/124); total (114/127) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.86e-01 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAA > NC_000913/3611301‑3611480
|
tctcCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGc > 1:1586666/1‑93 (MQ=255)
tctcCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGc > 1:4451450/1‑93 (MQ=255)
ctcCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGcc > 1:1517376/1‑93 (MQ=255)
tcCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCg > 1:1075392/1‑93 (MQ=255)
cacaCTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGt > 1:3367536/1‑93 (MQ=255)
cacaCTCCGCCCCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCCTCTTTTATCGTCCATTCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGt < 2:3321482/93‑1 (MQ=255)
acacTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTg > 1:677489/1‑93 (MQ=255)
cacTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGa < 1:1745564/93‑1 (MQ=255)
ccTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGTCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGaa < 1:1266134/92‑1 (MQ=255)
ccTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGaa < 1:252730/92‑1 (MQ=255)
acTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGaa > 1:5976228/1‑93 (MQ=255)
tCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATg < 1:5365585/93‑1 (MQ=255)
cccgccgCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATg < 1:2430632/92‑1 (MQ=255)
ccgccgCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTTCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGt < 1:5217082/93‑1 (MQ=255)
gccgcACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCg < 2:4016809/93‑1 (MQ=255)
cgcACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCggg > 2:1069656/1‑93 (MQ=255)
gcACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGc > 1:3516118/1‑93 (MQ=255)
cACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCggggc > 1:5558435/1‑91 (MQ=255)
cACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGcc < 1:1653539/93‑1 (MQ=255)
cACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTAGCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGcc < 1:2103256/93‑1 (MQ=255)
aCTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCa > 2:3070687/1‑93 (MQ=255)
ctctATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCAc < 2:2884313/93‑1 (MQ=255)
ctctATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCAc > 1:4985987/1‑93 (MQ=255)
tctATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACt < 1:434445/93‑1 (MQ=255)
ctATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTa < 2:6150490/93‑1 (MQ=255)
tATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTaa > 2:2426427/1‑93 (MQ=255)
tATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTaa > 2:6039778/1‑93 (MQ=255)
tttGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAAc < 2:531100/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAAcc > 2:3812538/1‑93 (MQ=255)
ttGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAAcc < 1:834494/93‑1 (MQ=255)
gctgctGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCa > 2:3743201/1‑93 (MQ=255)
gctgctGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCa > 2:5803639/1‑93 (MQ=255)
gctgGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCt > 2:5202905/1‑93 (MQ=255)
gctgGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCt > 2:1450104/1‑93 (MQ=255)
gctgGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCt > 1:1166976/1‑93 (MQ=255)
gCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTac > 2:3538997/1‑93 (MQ=255)
tgtgCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACg < 1:3903438/93‑1 (MQ=255)
tgtgCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACg > 1:6201782/1‑93 (MQ=255)
tgtgCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACg > 2:6458010/1‑93 (MQ=255)
tgCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGcc > 2:4060751/1‑93 (MQ=255)
tgCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGcc > 1:4150576/1‑93 (MQ=255)
gCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCt < 1:757061/93‑1 (MQ=255)
cGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTa > 1:3082462/1‑93 (MQ=255)
tCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAAc < 1:787626/93‑1 (MQ=255)
tCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAAc < 2:2857891/93‑1 (MQ=255)
tCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAAc > 1:6052517/1‑93 (MQ=255)
ttttATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCa < 1:5895441/93‑1 (MQ=255)
ttttATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCa > 2:2452649/1‑93 (MQ=255)
ttATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGa < 1:3710791/93‑1 (MQ=255)
tATCGTCCATGCCGCTGCGCCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGAt < 1:3773246/93‑1 (MQ=255)
tATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGAt < 1:322038/93‑1 (MQ=255)
aTCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATg < 2:2347750/93‑1 (MQ=255)
cGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGtt < 2:4695462/93‑1 (MQ=255)
cGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGtt < 2:1972072/93‑1 (MQ=255)
gTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTc < 2:4240209/93‑1 (MQ=255)
gTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTc < 2:1275287/93‑1 (MQ=255)
gTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTc > 1:1132034/1‑93 (MQ=255)
tCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCg > 1:5844092/1‑93 (MQ=255)
tCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCg > 1:2634738/1‑93 (MQ=255)
tCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCg < 1:2608650/93‑1 (MQ=255)
tCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCg > 1:1207590/1‑93 (MQ=255)
ccATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGc > 2:6290778/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCa < 1:4215232/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCa < 2:5702888/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCag < 2:4600391/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCag < 1:251753/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCaga < 1:640538/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCaga < 1:4899720/93‑1 (MQ=255)
cGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCagag > 2:1135537/1‑93 (MQ=255)
gCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGc > 2:4214491/1‑93 (MQ=255)
tGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCAt > 2:1889836/1‑93 (MQ=255)
tGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCAt > 1:2393563/1‑93 (MQ=255)
tGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCAt < 2:120799/93‑1 (MQ=255)
gCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATg < 2:2551214/93‑1 (MQ=255)
cAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGttt < 1:2880994/93‑1 (MQ=255)
cAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGttt > 1:5939406/1‑93 (MQ=255)
aGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTa < 1:1450576/93‑1 (MQ=255)
aGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTa > 2:1530367/1‑93 (MQ=255)
aGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTa > 1:2253486/1‑93 (MQ=255)
aGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTa < 2:2003236/93‑1 (MQ=255)
gATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTAt > 2:5572763/1‑93 (MQ=255)
gATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTAt > 2:1292139/1‑93 (MQ=255)
aTGAAATCCCCCCCGCCCGGCGGGTGAATGTCGGGCCACGAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATg < 2:2251382/93‑1 (MQ=255)
aTGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATg < 1:3043455/93‑1 (MQ=255)
tGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGa < 1:5927836/93‑1 (MQ=255)
tGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGa < 2:5060139/93‑1 (MQ=255)
tGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGa < 1:303151/93‑1 (MQ=255)
gAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGaa < 2:4845086/93‑1 (MQ=255)
aaaTCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAAc < 2:1715602/93‑1 (MQ=255)
aTCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAAcct > 1:2219075/1‑92 (MQ=255)
tCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCAt > 2:854438/1‑93 (MQ=255)
caccacCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCAtt < 1:4972263/93‑1 (MQ=255)
caccacCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCAtt < 1:6322323/93‑1 (MQ=255)
ccaccGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTgg < 1:3970597/93‑1 (MQ=255)
ccaccGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTgg > 1:4717624/1‑93 (MQ=255)
ccaccGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTgg < 2:669274/93‑1 (MQ=255)
caccGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGt < 2:4933953/93‑1 (MQ=255)
accGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTg > 2:5863500/1‑93 (MQ=255)
ccGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCTCCTTTACACGCCTAGCCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGa < 2:6092138/93‑1 (MQ=255)
cGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGaa > 1:2820925/1‑93 (MQ=255)
|
CTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAA > NC_000913/3611301‑3611480
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATC > NC_000913/3611298‑3611484
|
CTGCTCTCCACCCTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTGGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCT < SRR4302537.480340/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCCCCAGATGAAATCACCACCGCCC > SRR4302537.1782132/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGCTGAAATCACCACCGCCC > SRR4302537.1507495/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCT < SRR4302537.2244581/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCC < SRR4302537.5222339/94‑1 (MQ=60)
GCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGG < SRR4302537.5919088/94‑1 (MQ=60)
CTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGC > SRR4302537.4199943/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGC > SRR4302537.4482194/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGC > SRR4302537.1597759/1‑94 (MQ=60)
TCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCC > SRR4302537.1527980/1‑94 (MQ=60)
CTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCG > SRR4302537.1082800/1‑94 (MQ=60)
CCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGT > SRR4302537.3391391/1‑94 (MQ=60)
CCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGT > SRR4302537.814301/1‑94 (MQ=60)
CACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTG > SRR4302537.682127/1‑94 (MQ=60)
ACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGA > SRR4302537.2544102/1‑94 (MQ=60)
ACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGA > SRR4302537.1613314/1‑94 (MQ=60)
CACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAA > SRR4302537.6017257/1‑94 (MQ=60)
CACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAA < SRR4302537.1757737/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGTCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAAT < SRR4302537.1274939/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAAT < SRR4302537.4436164/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAAT < SRR4302537.254526/94‑1 (MQ=60)
TCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGACTGT > SRR4302537.1222239/1‑94 (MQ=60)
TCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGT < SRR4302537.3767566/94‑1 (MQ=60)
TCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGT < SRR4302537.5402301/94‑1 (MQ=60)
CCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGT < SRR4302537.2447757/94‑1 (MQ=60)
CCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTTCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTC < SRR4302537.5252959/94‑1 (MQ=60)
CCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTC < SRR4302537.3136907/94‑1 (MQ=60)
CCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTC < SRR4302537.3937199/94‑1 (MQ=60)
GCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGG < SRR4302537.2951118/94‑1 (MQ=60)
GCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGG > SRR4302537.2508805/1‑94 (MQ=60)
CCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGG > SRR4302537.594182/1‑94 (MQ=60)
CGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGC > SRR4302537.3540994/1‑94 (MQ=60)
GCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGGC > SRR4302537.5596415/1‑94 (MQ=60)
GCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCC > SRR4302537.4111557/1‑94 (MQ=60)
CACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCA < SRR4302537.1665129/94‑1 (MQ=60)
CACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCA < SRR4302537.2035600/94‑1 (MQ=60)
CACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCA > SRR4302537.4543116/1‑94 (MQ=60)
CACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTAGCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCA < SRR4302537.2118086/94‑1 (MQ=60)
ACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCAC > SRR4302537.5020351/1‑94 (MQ=60)
CTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACT > SRR4302537.589600/1‑94 (MQ=60)
TCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTA > SRR4302537.1150966/1‑94 (MQ=60)
TCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTA < SRR4302537.4959158/94‑1 (MQ=60)
TCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTA > SRR4302537.6465203/1‑94 (MQ=60)
TCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTA < SRR4302537.437475/94‑1 (MQ=60)
CTATTTGGGCTGCTGTGTTGTTCTTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCTCCAGATGAAATCACCTCCGCCCGGCCGGTGAATGTGGGGCCACTAA < SRR4302537.3971138/94‑1 (MQ=55)
TATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAA > SRR4302537.3752010/1‑94 (MQ=60)
ATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAAC < SRR4302537.6159666/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCC < SRR4302537.840206/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCC > SRR4302537.786135/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCG < SRR4302537.2549679/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCA > SRR4302537.5978701/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGACGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCAC > SRR4302537.6095232/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCAC < SRR4302537.5653499/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACC > SRR4302537.3515309/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCT < SRR4302537.4374139/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCT > SRR4302537.1175089/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTT > SRR4302537.4373879/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTA < SRR4302537.2687549/94‑1 (MQ=60)
TGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTA > SRR4302537.2203138/1‑94 (MQ=60)
GCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACA > SRR4302537.2488414/1‑94 (MQ=60)
GCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAAGCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACA < SRR4302537.3069176/94‑1 (MQ=60)
CTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACAC > SRR4302537.2880561/1‑94 (MQ=60)
CTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACAC > SRR4302537.1655748/1‑94 (MQ=60)
TTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACG > SRR4302537.6244523/1‑94 (MQ=60)
TGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGC < SRR4302537.3930726/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCC > SRR4302537.4179554/1‑94 (MQ=60)
GTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCC > SRR4302537.1109305/1‑94 (MQ=60)
TGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCT > SRR4302537.497210/1‑94 (MQ=60)
GCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTA > SRR4302537.3103931/1‑94 (MQ=60)
GCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTA < SRR4302537.762229/94‑1 (MQ=60)
CGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGTGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAA > SRR4302537.668797/1‑94 (MQ=60)
CGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAA > SRR4302537.2210914/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAAC > SRR4302537.6094092/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAAC > SRR4302537.3230757/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAAC > SRR4302537.1274115/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAAC < SRR4302537.1568125/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACC < SRR4302537.2270729/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACC < SRR4302537.6362942/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACC < SRR4302537.793034/94‑1 (MQ=60)
CTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCA < SRR4302537.5960725/94‑1 (MQ=60)
CTTTTATCGCCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCA < SRR4302537.6002031/94‑1 (MQ=60)
TTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAG > SRR4302537.2642422/1‑94 (MQ=60)
TTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAG < SRR4302537.5935891/94‑1 (MQ=60)
TTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGAT < SRR4302537.3736875/94‑1 (MQ=60)
TCATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGAT < SRR4302537.3052798/94‑1 (MQ=60)
TATCGTCCATGCCGCTGCGCCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATG < SRR4302537.3799734/94‑1 (MQ=60)
TATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATG < SRR4302537.324271/94‑1 (MQ=60)
TATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATG < SRR4302537.256047/94‑1 (MQ=60)
CGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTC > SRR4302537.3674159/1‑94 (MQ=60)
CGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTC > SRR4302537.1139893/1‑94 (MQ=60)
GTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCG > SRR4302537.5884162/1‑94 (MQ=60)
GTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCG > SRR4302537.2653174/1‑94 (MQ=60)
GTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCG > SRR4302537.1215997/1‑94 (MQ=60)
TCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGC < SRR4302537.2626895/94‑1 (MQ=60)
TCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGC < SRR4302537.1504133/94‑1 (MQ=60)
CCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCC > SRR4302537.1139926/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCA > SRR4302537.2249031/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCA < SRR4302537.3842842/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAG < SRR4302537.4244619/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGA < SRR4302537.253543/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAG < SRR4302537.701606/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAG < SRR4302537.4933541/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAG < SRR4302537.644903/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCACCAGATGAAATCCCCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGC < SRR4302537.3279405/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGC > SRR4302537.5094037/1‑94 (MQ=60)
GCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCA < SRR4302537.5115597/94‑1 (MQ=60)
GCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCA < SRR4302537.1200505/94‑1 (MQ=60)
CTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCAT > SRR4302537.2410418/1‑94 (MQ=60)
CTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCAT < SRR4302537.4798931/94‑1 (MQ=60)
TGCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATG < SRR4302537.3055652/94‑1 (MQ=60)
GCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGG < SRR4302537.4087334/94‑1 (MQ=60)
GCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGG < SRR4302537.5019460/94‑1 (MQ=60)
GCACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGG < SRR4302537.1355874/94‑1 (MQ=60)
CACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGT < SRR4302537.609016/94‑1 (MQ=60)
CACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGT < SRR4302537.2851145/94‑1 (MQ=60)
ACCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTT > SRR4302537.4742351/1‑94 (MQ=60)
CCAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTT > SRR4302537.5980172/1‑94 (MQ=60)
CAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTA < SRR4302537.5277106/94‑1 (MQ=60)
CAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTA < SRR4302537.2901214/94‑1 (MQ=60)
CAGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTA > SRR4302537.2269389/1‑94 (MQ=60)
AGATTAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTAT < SRR4302537.1465847/94‑1 (MQ=60)
AGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTAT < SRR4302537.1460683/94‑1 (MQ=60)
AGATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTAT < SRR4302537.6373003/94‑1 (MQ=60)
GATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCAGCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATG < SRR4302537.3495316/94‑1 (MQ=60)
GATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATG < SRR4302537.1773911/94‑1 (MQ=60)
ATGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGA < SRR4302537.3064658/94‑1 (MQ=60)
TGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAA < SRR4302537.5968517/94‑1 (MQ=60)
TGAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAA < SRR4302537.305261/94‑1 (MQ=60)
GAAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAAC > SRR4302537.2423410/1‑94 (MQ=60)
AAATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACC < SRR4302537.6376595/94‑1 (MQ=60)
AATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCT > SRR4302537.2234713/1‑94 (MQ=60)
ATCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCAT < SRR4302537.942165/94‑1 (MQ=60)
TCACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATT < SRR4302537.275679/94‑1 (MQ=60)
CACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTG < SRR4302537.5006535/94‑1 (MQ=60)
CACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTG < SRR4302537.782319/94‑1 (MQ=60)
CACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTG < SRR4302537.6365580/94‑1 (MQ=60)
ACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGG > SRR4302537.4750248/1‑94 (MQ=60)
ACCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGG > SRR4302537.5787874/1‑94 (MQ=60)
CCACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGT < SRR4302537.3998382/94‑1 (MQ=60)
CACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTG < SRR4302537.5333494/94‑1 (MQ=60)
CACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTG < SRR4302537.2294728/94‑1 (MQ=60)
CACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTG > SRR4302537.172893/1‑94 (MQ=60)
ACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGA > SRR4302537.3960037/1‑94 (MQ=60)
ACCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTAGCCCAGAGCATGGTCTATGAACCATTGGTGA > SRR4302537.5572302/1‑94 (MQ=60)
CCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAA < SRR4302537.5996114/94‑1 (MQ=60)
CCGCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAA > SRR4302537.2840646/1‑94 (MQ=60)
GCCCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAAT < SRR4302537.947039/94‑1 (MQ=60)
CCGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATAT > SRR4302537.3623162/1‑94 (MQ=60)
CGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAGCCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATC < SRR4302537.13737/94‑1 (MQ=60)
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ATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATC > NC_000913/3611298‑3611484
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
