Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,936,574 |
C→T |
A241V (GCC→GTC) |
rbsR → |
RbsR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,936,574 | 0 | C | T | 99.6%
| 789.3
/ NA
| 224 | A241V (GCC→GTC) | rbsR | RbsR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (92/131); total (93/131) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.15e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
TCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGA > NC_000913/3936482‑3936663
|
tCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGGTTTTGGCTCTTCGCCCACAGCTCTCACATCCCCCGCCTCCTCCGGc > 2:373652/1‑93 (MQ=255)
aTGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCt < 2:5607773/93‑1 (MQ=255)
tGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCtt < 2:3588208/93‑1 (MQ=255)
cTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTAc < 2:2009336/93‑1 (MQ=255)
cTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGGTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATTACATCCCCTGCGTCCTCCGTGCGTCTTTAc > 1:6420319/1‑93 (MQ=255)
tATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTAcc < 2:4801994/93‑1 (MQ=255)
aGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGaaa < 1:2698756/93‑1 (MQ=255)
aGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGaaa < 2:2373723/93‑1 (MQ=255)
aCTGGTGATTTTGAATTTGACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGAc < 1:3240412/93‑1 (MQ=255)
tGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGc < 1:1871395/93‑1 (MQ=255)
gTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTa < 2:159726/93‑1 (MQ=255)
gATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATg < 2:5928038/93‑1 (MQ=255)
aTTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATgg < 2:5558457/93‑1 (MQ=255)
ttttGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGTGCCCACTACTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCCGAAATGACGCTATGGc > 2:4469465/1‑93 (MQ=255)
ttttGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGc < 2:3629632/93‑1 (MQ=255)
tttGAATTTAACGGCGGGGTTTTCGCTATGCGCCAACCGCTATCACATCCGCTGCGGCCTCCGGTCGTCTTTTCCCGAAAAGAAGCTATTGCt > 2:136721/1‑93 (MQ=255)
ttGAATTTAACGGCGGGGTTTACGCTATGCGCCCACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCCCCCGGCGTCTTTTTCCGGAATGACGCTATGGCTg > 2:1766078/1‑93 (MQ=255)
gAATTTAACGGCGGGGTTGTCGCTATGCGCCAACCGCTATCACATACGCTGCGTCCTCCGGTCGTCTTTTTCGGAAAAGACGCTATGGCTggt > 2:2578259/1‑91 (MQ=255)
aTTTAACGGCGGGGTTGTCGCTATGCGCCCACCGCTATTACATCCGCTGCGTCCTCCGGTCGTCTTTTTCCGGAATGAAGCTATGGCTggttg > 2:1561217/1‑89 (MQ=255)
tttAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGc < 1:2209060/93‑1 (MQ=255)
tAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGt < 2:2187993/93‑1 (MQ=255)
tAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGt < 1:5774429/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGtt < 1:3846811/93‑1 (MQ=255)
cggcggGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTa < 2:1876368/93‑1 (MQ=255)
cggcggGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTa < 2:3938167/93‑1 (MQ=255)
gcggGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAcc > 1:3801705/1‑93 (MQ=255)
gcggGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAcc > 1:625653/1‑93 (MQ=255)
gcggGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAcc < 2:6412801/93‑1 (MQ=255)
cggGTTTGACGCTATGCGCCAATTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCa < 2:4230508/93‑1 (MQ=255)
cggGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCa > 1:1346243/1‑93 (MQ=255)
gggTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAg > 2:5353442/1‑93 (MQ=255)
ggTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAgg > 1:4456443/1‑93 (MQ=255)
gTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGTCGTTTACCAGGc < 2:1804349/93‑1 (MQ=255)
gTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGc < 2:352126/93‑1 (MQ=255)
gTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGc > 2:5030647/1‑93 (MQ=255)
tttGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACAAGGCg > 1:733724/1‑93 (MQ=255)
ttGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCa > 1:1645959/1‑88 (MQ=255)
ttGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGt < 2:3001652/93‑1 (MQ=255)
gACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGttt > 2:1461483/1‑92 (MQ=255)
gACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTta < 2:909045/93‑1 (MQ=255)
gCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTatat > 1:1090476/1‑93 (MQ=255)
tATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCa > 1:5193311/1‑93 (MQ=255)
tATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCa < 2:4556052/93‑1 (MQ=255)
tATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCa > 1:3376433/1‑93 (MQ=255)
aTGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAg < 1:1800975/93‑1 (MQ=255)
tGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAgg < 1:700106/93‑1 (MQ=255)
tGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAgg < 1:3578015/93‑1 (MQ=255)
gcgcCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGc > 1:5166380/1‑93 (MQ=255)
cgcCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCa < 1:2385431/93‑1 (MQ=255)
gcCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCag > 1:2715687/1‑93 (MQ=255)
ccAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCaga > 1:5522362/1‑93 (MQ=255)
ccAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCaga > 2:3306181/1‑93 (MQ=255)
ccAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCaga < 2:5174853/93‑1 (MQ=255)
cAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCagag > 1:561914/1‑93 (MQ=255)
cAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCagag < 2:4699329/93‑1 (MQ=255)
aaCTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGt > 1:5923022/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGt < 1:3934635/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGtt > 1:1061234/1‑93 (MQ=255)
aCTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGtt > 2:2442620/1‑93 (MQ=255)
tGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTAc > 1:3190889/1‑93 (MQ=255)
tGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTAc > 1:351999/1‑93 (MQ=255)
gCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTTGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCCGGCACAGTTACa > 2:2618337/1‑93 (MQ=255)
cTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAg < 2:4139733/93‑1 (MQ=255)
tATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAgg > 1:2937988/1‑93 (MQ=255)
tATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAgg > 2:2797235/1‑93 (MQ=255)
tATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAgg < 1:6131448/93‑1 (MQ=255)
aTCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGt > 2:2078959/1‑93 (MQ=255)
aTCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGt < 1:3891914/93‑1 (MQ=255)
tCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGtt > 1:3481870/1‑93 (MQ=255)
tCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGtt < 1:3642570/93‑1 (MQ=255)
cacaTCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTc > 1:2839702/1‑93 (MQ=255)
acaTCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTcc < 1:5157587/93‑1 (MQ=255)
acaTCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTcc < 1:4139590/93‑1 (MQ=255)
tCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCa > 2:6238489/1‑93 (MQ=255)
tCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCa > 2:1251657/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAg < 1:3310406/93‑1 (MQ=255)
gCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGa < 2:6033509/93‑1 (MQ=255)
gCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGa > 1:4770880/1‑93 (MQ=255)
ccTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGa < 2:2900423/92‑1 (MQ=255)
cTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGat < 2:6466968/93‑1 (MQ=255)
cTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGat < 2:6430744/93‑1 (MQ=255)
cTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGat > 2:5792549/1‑93 (MQ=255)
tgcgtgcgCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGTCGTTTACCAGACGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGata < 2:2740931/93‑1 (MQ=255)
tGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGata < 2:348804/93‑1 (MQ=255)
cGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATc < 2:6194689/93‑1 (MQ=255)
tCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATcgc < 2:960053/93‑1 (MQ=255)
tCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATcgc < 2:1033125/93‑1 (MQ=255)
tCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATAGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATcgc > 1:4641237/1‑93 (MQ=255)
cTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCgg < 2:1226962/93‑1 (MQ=255)
cTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCgg > 1:2568566/1‑93 (MQ=255)
cTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCgg < 1:2008043/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCggg > 1:608081/1‑92 (MQ=255)
tCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCggg > 1:2071166/1‑92 (MQ=255)
tCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGt < 1:5730558/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGt > 1:4443976/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGt > 1:4389524/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGt < 1:4117076/93‑1 (MQ=255)
cAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTg > 1:3351519/1‑93 (MQ=255)
aGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGTCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGa < 2:3130114/93‑1 (MQ=255)
aGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGa > 1:748451/1‑93 (MQ=255)
|
TCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGA > NC_000913/3936482‑3936663
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGG > NC_000913/3936487‑3936667
|
ATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTT < SRR4302537.2537712/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTT < SRR4302537.2727971/94‑1 (MQ=60)
GCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGGTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATTACATCCCCTGCGTCCTCCGTGCGTCTTTAC > SRR4302537.6463964/1‑94 (MQ=60)
CTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACC < SRR4302537.3456/94‑1 (MQ=60)
GAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGGTTGTTGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCCGGTCGTCTTTTCCTGAA > SRR4302537.4077034/1‑94 (MQ=60)
AGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAAT < SRR4302537.1090158/94‑1 (MQ=60)
AGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAAT < SRR4302537.2717612/94‑1 (MQ=60)
AGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAAT < SRR4302537.4786124/94‑1 (MQ=60)
AGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGGTTGACGGTATGCGCCAACTGCCATCACAATCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTttcggtaaa > SRR4302537.1546517/1‑85 (MQ=60)
GTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATG < SRR4302537.3836151/94‑1 (MQ=60)
CACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGAC < SRR4302537.617069/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTGATTTTGAATTTGACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACG < SRR4302537.3263250/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACG < SRR4302537.3836183/94‑1 (MQ=60)
TGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCT < SRR4302537.4664227/94‑1 (MQ=60)
TGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCT < SRR4302537.3911400/94‑1 (MQ=60)
TGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCT < SRR4302537.1884419/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTA < SRR4302537.3563417/94‑1 (MQ=60)
TGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATG < SRR4302537.5628083/94‑1 (MQ=60)
GATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGG < SRR4302537.73276/94‑1 (MQ=60)
GATTTTGAATTTAACGGCGGGGTTGACGCTATGGGCCCACCGCCATCACATCCCCTGCGTCCCCCCGGCGGCTTTTCCGGAAATGACGCTATGG > SRR4302537.375739/1‑94 (MQ=23)
ATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGC < SRR4302537.5400342/94‑1 (MQ=60)
TTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCT < SRR4302537.3416191/94‑1 (MQ=60)
TGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTT < SRR4302537.918852/94‑1 (MQ=60)
AATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGG < SRR4302537.204366/94‑1 (MQ=60)
ATTTAACGGCGGGTTTGACGGTATGCGCCAACTGCTATCACATCCTCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGC < SRR4302537.3219305/94‑1 (MQ=60)
TTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCG < SRR4302537.2224638/94‑1 (MQ=60)
TTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCG < SRR4302537.3375587/94‑1 (MQ=60)
TAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTT < SRR4302537.5814009/94‑1 (MQ=60)
AACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTT < SRR4302537.3873740/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACC > SRR4302537.6041121/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACC > SRR4302537.3828376/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACC > SRR4302537.629916/1‑94 (MQ=60)
GCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCA > SRR4302537.1355627/1‑94 (MQ=60)
GGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGG > SRR4302537.2205144/1‑94 (MQ=60)
GGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGG > SRR4302537.4487218/1‑94 (MQ=60)
GTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCG > SRR4302537.5775455/1‑94 (MQ=60)
GTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACAAGGCG > SRR4302537.738730/1‑94 (MQ=60)
TTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGacgg > SRR4302537.1657490/1‑90 (MQ=60)
TGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTA > SRR4302537.5676378/1‑94 (MQ=60)
GACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTAT > SRR4302537.5222670/1‑94 (MQ=60)
CGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATAT > SRR4302537.1098004/1‑94 (MQ=60)
CGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATAT > SRR4302537.6382932/1‑94 (MQ=60)
CGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATAT < SRR4302537.4166920/94‑1 (MQ=60)
GCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATC < SRR4302537.1853674/94‑1 (MQ=60)
CTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCA > SRR4302537.5229020/1‑94 (MQ=60)
CTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCA > SRR4302537.2102139/1‑94 (MQ=60)
CTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCA > SRR4302537.3400364/1‑94 (MQ=60)
TATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAG > SRR4302537.4923840/1‑94 (MQ=60)
TATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAG < SRR4302537.596033/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGG < SRR4302537.1813540/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGG < SRR4302537.5522563/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGG < SRR4302537.3700072/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCCAACTCCTATCACATCCGCTGCGTCCCCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGCTAGCGTTTACCAGccgatatataacc > SRR4302537.2740909/1‑81 (MQ=60)
TGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGC > SRR4302537.6179557/1‑94 (MQ=60)
TGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGC > SRR4302537.5201974/1‑94 (MQ=60)
TGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGC < SRR4302537.704895/94‑1 (MQ=60)
TGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGC < SRR4302537.3603240/94‑1 (MQ=60)
CGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAG < SRR4302537.2402235/94‑1 (MQ=60)
CGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAG > SRR4302537.2734651/1‑94 (MQ=60)
GCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA > SRR4302537.5560061/1‑94 (MQ=60)
CCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAG > SRR4302537.565782/1‑94 (MQ=60)
CCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAG < SRR4302537.4224099/94‑1 (MQ=60)
CAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGT > SRR4302537.2786363/1‑94 (MQ=60)
CAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGT > SRR4302537.5963662/1‑94 (MQ=60)
CAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGT > SRR4302537.3119296/1‑94 (MQ=60)
CAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTCCCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGT > SRR4302537.2786364/1‑94 (MQ=60)
AACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTT < SRR4302537.3962132/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTT > SRR4302537.4034265/1‑94 (MQ=60)
AACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTT > SRR4302537.1068555/1‑94 (MQ=60)
AACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTT < SRR4302537.722531/94‑1 (MQ=60)
CTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTAC > SRR4302537.354443/1‑94 (MQ=60)
CTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTAC > SRR4302537.1969426/1‑94 (MQ=60)
CTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTAC > SRR4302537.3213326/1‑94 (MQ=60)
CTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTAC < SRR4302537.3349977/94‑1 (MQ=60)
CTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGACGTCTTTCCCGGAAATGACACTATGGCTGTTGGCCATTACCAGGCGTTATATgcggcagaataac > SRR4302537.312717/1‑81 (MQ=60)
GCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTTCCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAG < SRR4302537.5201701/94‑1 (MQ=60)
GCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAG < SRR4302537.3303521/94‑1 (MQ=60)
GCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAG < SRR4302537.366116/94‑1 (MQ=60)
GCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGAAGAGTTACAG > SRR4302537.1618646/1‑94 (MQ=60)
CTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGG > SRR4302537.2958615/1‑94 (MQ=60)
CTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGG > SRR4302537.6229332/1‑94 (MQ=60)
CTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGG < SRR4302537.1694331/94‑1 (MQ=60)
CTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGG > SRR4302537.746513/1‑94 (MQ=60)
TATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGT < SRR4302537.6173595/94‑1 (MQ=60)
ATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTT > SRR4302537.3506505/1‑94 (MQ=60)
ATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTT < SRR4302537.3919129/94‑1 (MQ=60)
ATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTT > SRR4302537.6478693/1‑94 (MQ=60)
TCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTC < SRR4302537.3668225/94‑1 (MQ=60)
TCACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTC > SRR4302537.2859576/1‑94 (MQ=60)
CACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCC < SRR4302537.365710/94‑1 (MQ=60)
CACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCC < SRR4302537.186323/94‑1 (MQ=60)
ACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCG < SRR4302537.5193128/94‑1 (MQ=60)
ACATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCG < SRR4302537.4168467/94‑1 (MQ=60)
ATCCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCA > SRR4302537.2891495/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATGAGGCAGTGTTACAGGTTCCGCAGG > SRR4302537.3362327/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGG < SRR4302537.6079912/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGG < SRR4302537.3333826/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGA > SRR4302537.1121559/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGA > SRR4302537.4482862/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGA > SRR4302537.4803820/1‑94 (MQ=60)
CTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATA < SRR4302537.4957340/94‑1 (MQ=60)
CTGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATA < SRR4302537.4088245/94‑1 (MQ=60)
TGCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATAT > SRR4302537.4269070/1‑94 (MQ=60)
GCGTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATC < SRR4302537.5749767/94‑1 (MQ=60)
GTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGG > SRR4302537.1481322/1‑94 (MQ=60)
GTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGC > SRR4302537.850457/1‑94 (MQ=60)
GTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGC > SRR4302537.3068362/1‑94 (MQ=60)
GTCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATAGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGC > SRR4302537.4673330/1‑94 (MQ=60)
TCCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCG < SRR4302537.4420444/94‑1 (MQ=60)
CCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGG > SRR4302537.2586561/1‑94 (MQ=60)
CCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGG > SRR4302537.3539355/1‑94 (MQ=60)
CCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGG > SRR4302537.4502908/1‑94 (MQ=60)
CCTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGG > SRR4302537.3932466/1‑94 (MQ=60)
CTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGT < SRR4302537.2304063/94‑1 (MQ=60)
CTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGT > SRR4302537.4474667/1‑94 (MQ=60)
CTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGT > SRR4302537.4419795/1‑94 (MQ=60)
CTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGT < SRR4302537.2022037/94‑1 (MQ=60)
CTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGG > SRR4302537.612239/1‑94 (MQ=60)
CTCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGG > SRR4302537.2085753/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTG < SRR4302537.2632928/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTG > SRR4302537.3375254/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTG < SRR4302537.4145829/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTG < SRR4302537.5769783/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGA > SRR4302537.753556/1‑94 (MQ=60)
AGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGAT > SRR4302537.4239105/1‑94 (MQ=60)
AGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGAT > SRR4302537.751762/1‑94 (MQ=60)
AGGTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGAT > SRR4302537.5811354/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTCTGTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATT < SRR4302537.6183881/94‑1 (MQ=60)
GTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTG < SRR4302537.4720607/94‑1 (MQ=60)
GTCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTG > SRR4302537.4955917/1‑94 (MQ=60)
TCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGG < SRR4302537.707228/94‑1 (MQ=60)
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ATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGG > NC_000913/3936487‑3936667
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
