Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,278,453 |
T→C |
L38L (TTG→CTG) |
agaW → |
PTS system N‑acetylgalactosameine‑specific IIC component 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,278,453 | 0 | T | C | 99.7%
| 1113.1
/ ‑6.4
| 324 | L38L (TTG→CTG) | agaW | PTS system N‑acetylgalactosameine‑specific IIC component 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (196/127); minor base A (1/0); total (197/127) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
GCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCG > NC_000913/3278363‑3278542
|
gaTTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTgg < 1:4407110/92‑1 (MQ=255)
cATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTgg > 1:5283203/1‑93 (MQ=255)
aTTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCCTATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGt > 1:8511922/1‑93 (MQ=255)
tttGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTc > 2:8352772/1‑93 (MQ=255)
tttGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTc > 1:1866089/1‑93 (MQ=255)
gCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCGCCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCggg > 1:1363065/1‑93 (MQ=255)
gTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCt > 2:1846597/1‑93 (MQ=255)
gTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCt > 1:4977069/1‑93 (MQ=255)
gTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCt < 1:2891538/93‑1 (MQ=255)
ttGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTg > 2:6355284/1‑93 (MQ=255)
ttGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTg < 1:1776478/93‑1 (MQ=255)
ttGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTg < 1:2053177/93‑1 (MQ=255)
tGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTgg > 1:1141812/1‑93 (MQ=255)
aTTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACtt < 2:112807/93‑1 (MQ=255)
aTTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACtt > 2:4521019/1‑93 (MQ=255)
ttATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTg > 1:6803418/1‑93 (MQ=255)
ttATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTg < 2:8537366/93‑1 (MQ=255)
ttATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTg < 1:4470758/93‑1 (MQ=255)
tATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTgg < 2:1742311/93‑1 (MQ=255)
tATCGCAGTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTgg < 1:3329580/93‑1 (MQ=255)
tCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCg > 2:8486015/1‑93 (MQ=255)
cGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGa < 1:102027/93‑1 (MQ=255)
gCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGAt > 1:342282/1‑93 (MQ=255)
gCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGAt > 1:3791207/1‑93 (MQ=255)
gCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGAt < 1:4761698/93‑1 (MQ=255)
gCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGATCGGGCTGGTACTTGGCGAt < 2:7613511/93‑1 (MQ=255)
ccTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCCTATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATc > 2:8109212/1‑93 (MQ=255)
tttATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCtc > 2:1034414/1‑92 (MQ=255)
tttATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTg > 2:2794012/1‑93 (MQ=255)
tttATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTg < 1:5516550/93‑1 (MQ=255)
tttATCACTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTg < 2:676525/93‑1 (MQ=255)
ttATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑c < 1:7002157/93‑1 (MQ=255)
tCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATa > 2:3933300/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATAc > 1:2921311/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGa < 1:2663782/93‑1 (MQ=255)
gCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGaa < 1:4104146/93‑1 (MQ=255)
gCCTGGATATGTTTAACCGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGaa < 1:7327306/93‑1 (MQ=255)
tGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAAttt > 2:4822394/1‑93 (MQ=255)
tGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACAGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAAttt > 1:2370754/1‑93 (MQ=255)
ggATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAAtttt > 1:6054764/1‑93 (MQ=255)
gATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTa > 2:5649821/1‑93 (MQ=255)
gATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTa > 1:2603590/1‑93 (MQ=255)
atatGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTaa < 1:653097/93‑1 (MQ=255)
tatGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAAc > 2:7378113/1‑93 (MQ=255)
tatGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAAc > 1:4871477/1‑93 (MQ=255)
atGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAAcc > 2:6990106/1‑93 (MQ=255)
tGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACcg > 2:4990772/1‑93 (MQ=255)
tGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACcg > 2:4586506/1‑93 (MQ=255)
gTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACcgg > 2:4003725/1‑93 (MQ=255)
gTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACcgg > 2:6508699/1‑93 (MQ=255)
tttAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACcggc > 2:5399141/1‑93 (MQ=255)
tttAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACcggc < 1:4279850/93‑1 (MQ=255)
tttAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACcggc < 1:5090622/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCT‑GTACTTGGCGATCCGCCATA‑CGGGATTTTAACccgcggga > 2:7556020/1‑91 (MQ=255)
cGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTAc < 1:6854386/93‑1 (MQ=255)
ggCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACg > 1:8027700/1‑93 (MQ=255)
cTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTg > 2:2492096/1‑93 (MQ=255)
cTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGACTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTg < 2:5271562/93‑1 (MQ=255)
cccATATGCGCCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTTGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAAc < 2:3028208/93‑1 (MQ=255)
cccATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAAc > 1:1351226/1‑93 (MQ=255)
cATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTg > 2:4853072/1‑93 (MQ=255)
cATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGGACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTg > 2:8296173/1‑93 (MQ=255)
tatGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGgt > 1:7760746/1‑93 (MQ=255)
tatGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGgt > 1:1163255/1‑93 (MQ=255)
tatGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGgt < 2:8518301/93‑1 (MQ=255)
tatGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGgt > 1:6381434/1‑93 (MQ=255)
tatGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGgt < 2:1297596/93‑1 (MQ=255)
atGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGgtg > 2:1643670/1‑93 (MQ=255)
cccGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGa < 1:8752269/92‑1 (MQ=255)
aCCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGa > 2:5540662/1‑93 (MQ=255)
aCCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGa < 1:752409/93‑1 (MQ=255)
ccGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGAt < 1:5811171/93‑1 (MQ=255)
ccGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGAt > 2:7733266/1‑93 (MQ=255)
ccGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGAt > 2:6094096/1‑93 (MQ=255)
cGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATg > 2:5692616/1‑93 (MQ=255)
gCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGTCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATgg < 2:2995227/93‑1 (MQ=255)
gCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATgg > 2:1491257/1‑93 (MQ=255)
gCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATgg < 1:156898/93‑1 (MQ=255)
gCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATgg < 1:5652118/93‑1 (MQ=255)
gCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGCGTGGATgg > 2:3789272/1‑93 (MQ=255)
cGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGc > 2:3462722/1‑93 (MQ=255)
cGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGc > 1:3577787/1‑93 (MQ=255)
cGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGc > 2:3333975/1‑93 (MQ=255)
cGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGc > 2:7907153/1‑93 (MQ=255)
gtggtCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTg > 2:2600910/1‑93 (MQ=255)
tCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCGGGgcc > 2:3267245/1‑93 (MQ=255)
cTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGGCCCg > 1:3720825/1‑93 (MQ=255)
cTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCg < 1:4357714/93‑1 (MQ=255)
tCGGCCCTCTGGTGGGTGTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGc < 2:1880954/93‑1 (MQ=255)
tCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGGCCCGc > 2:1788175/1‑93 (MQ=255)
tCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGGCCCGc > 1:7932310/1‑93 (MQ=255)
tCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGc > 2:4206121/1‑93 (MQ=255)
tCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGc > 2:2130619/1‑93 (MQ=255)
ggCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTg < 1:219783/93‑1 (MQ=255)
ggCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTg > 2:8714281/1‑93 (MQ=255)
gCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTgg > 1:3196744/1‑93 (MQ=255)
gCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTgg > 1:6319354/1‑93 (MQ=255)
gCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCCG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCCCTgg > 1:8290662/1‑93 (MQ=255)
cccGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTggg > 2:5802318/1‑92 (MQ=255)
ccGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGGACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGGCCCCCTggcg > 2:4763249/1‑93 (MQ=255)
|
GCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTG‑CATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCG > NC_000913/3278363‑3278542
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGGCGGGC > NC_000913/3278360‑3278545
|
CAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGC > SRR4302541.6976024/1‑94 (MQ=60)
CAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGC > SRR4302541.4589035/1‑94 (MQ=60)
CAGGCATTTGCGTTGGGAATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGC > SRR4302541.115003/1‑94 (MQ=60)
AGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCT > SRR4302541.4201959/1‑94 (MQ=60)
AGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCT < SRR4302541.3569308/94‑1 (MQ=60)
AGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCT > SRR4302541.391457/1‑94 (MQ=60)
AGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCT > SRR4302541.8862362/1‑94 (MQ=60)
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AGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTAATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCCTATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCT < SRR4302541.7884082/94‑1 (MQ=60)
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GGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAA < SRR4302541.2690268/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAA < SRR4302541.2963274/94‑1 (MQ=60)
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CTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTT > SRR4302541.8518763/1‑94 (MQ=60)
CTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTT > SRR4302541.8081658/1‑94 (MQ=60)
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CGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACG > SRR4302541.8115958/1‑94 (MQ=60)
CCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTG > SRR4302541.2390752/1‑94 (MQ=60)
CCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTG > SRR4302541.7361201/1‑94 (MQ=60)
CCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTG > SRR4302541.7361202/1‑94 (MQ=60)
TAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGA < SRR4302541.8915214/94‑1 (MQ=60)
AACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAA < SRR4302541.969922/94‑1 (MQ=60)
ACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAAC > SRR4302541.8017923/1‑94 (MQ=60)
ACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAAC > SRR4302541.1364580/1‑94 (MQ=60)
CCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACT < SRR4302541.6411276/94‑1 (MQ=60)
CCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACT > SRR4302541.6236351/1‑94 (MQ=60)
CCCATATGCACCGCCCGGTGGTCATCGGACCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCAGGAACT < SRR4302541.7923077/94‑1 (MQ=60)
CCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGAGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTG > SRR4302541.6029591/1‑94 (MQ=60)
CATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGG < SRR4302541.6859947/94‑1 (MQ=60)
ATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATCCCGGAATTTTAGCCGGCGGTCCGCTGGAACTGGG > SRR4302541.1174425/1‑94 (MQ=60)
ATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGT < SRR4302541.2988358/94‑1 (MQ=60)
ATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGT > SRR4302541.6145031/1‑94 (MQ=60)
ATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGT > SRR4302541.7843317/1‑94 (MQ=60)
ATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGT > SRR4302541.1174426/1‑94 (MQ=60)
ATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGT < SRR4302541.5703887/94‑1 (MQ=60)
ATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGT > SRR4302541.6446615/1‑94 (MQ=60)
TATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTG > SRR4302541.6941388/1‑94 (MQ=60)
ATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGT > SRR4302541.7740480/1‑94 (MQ=60)
GCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGG < SRR4302541.8143541/94‑1 (MQ=60)
CACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGA > SRR4302541.3974156/1‑94 (MQ=60)
CACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGA > SRR4302541.751197/1‑94 (MQ=60)
CACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGA > SRR4302541.3656678/1‑94 (MQ=60)
CCCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGAT < SRR4302541.8845897/94‑1 (MQ=60)
ACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGAT < SRR4302541.759510/94‑1 (MQ=60)
ACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGAT > SRR4302541.2250883/1‑94 (MQ=60)
ACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGAT > SRR4302541.4432174/1‑94 (MQ=60)
CCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATG > SRR4302541.1001538/1‑94 (MQ=60)
CCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATG < SRR4302541.5870212/94‑1 (MQ=60)
GCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGG < SRR4302541.5709859/94‑1 (MQ=60)
GCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGG < SRR4302541.158071/94‑1 (MQ=60)
CCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGG < SRR4302541.4512843/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGC > SRR4302541.2177244/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGC > SRR4302541.3614041/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGC > SRR4302541.8778648/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT < SRR4302541.3321356/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑G < SRR4302541.4960136/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑G < SRR4302541.1258043/94‑1 (MQ=60)
GTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GG < SRR4302541.7043023/94‑1 (MQ=60)
GTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GG < SRR4302541.2750686/94‑1 (MQ=60)
GGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCC < SRR4302541.8411322/94‑1 (MQ=60)
GGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCC < SRR4302541.4381521/94‑1 (MQ=60)
GTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCC > SRR4302541.48540/1‑94 (MQ=60)
TCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGGCCC > SRR4302541.3395266/1‑94 (MQ=60)
CCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGCTCTGCATACCCGAATTTTAACCTGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGGCCCC > SRR4302541.6045962/1‑94 (MQ=60)
CCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGGCCCG > SRR4302541.3758326/1‑94 (MQ=60)
CTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGGCCCGC > SRR4302541.8019666/1‑94 (MQ=60)
CTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGC > SRR4302541.4443677/1‑94 (MQ=60)
CTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGC < SRR4302541.4401242/94‑1 (MQ=60)
TCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCT < SRR4302541.5110305/94‑1 (MQ=60)
TCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCT < SRR4302541.5157139/94‑1 (MQ=60)
CGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTG > SRR4302541.5208492/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGG < SRR4302541.3498493/94‑1 (MQ=60)
GGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGG < SRR4302541.221478/94‑1 (MQ=60)
GGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGG > SRR4302541.8380823/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGG > SRR4302541.3229037/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGG > SRR4302541.6383962/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGG > SRR4302541.8663889/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGGGTGGATGGGGGT‑GGGCCCGCTGG > SRR4302541.6534152/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCCGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCCCTGG > SRR4302541.8380824/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCTGGTCGTGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGGC < SRR4302541.3993380/94‑1 (MQ=60)
GCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCTATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGGC < SRR4302541.279749/94‑1 (MQ=60)
GCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGGC > SRR4302541.5949698/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGGCGG > SRR4302541.1442242/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGGCGGGG > SRR4302541.2612147/1‑94 (MQ=60)
|
CAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCT‑GGCCCCGCTGGCGGGC > NC_000913/3278360‑3278545
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
