Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,778,301 |
T→C |
V283A (GTA→GCA) |
lldD → |
L‑lactate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,778,301 | 0 | T | C | 99.7%
| 1301.5
/ NA
| 382 | V283A (GTA→GCA) | lldD | L‑lactate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (178/203); total (179/203) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 408 total aligned reads displayed.
TCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGTACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGC > NC_000913/3778211‑3778390
|
tCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCAc < 1:6285231/93‑1 (MQ=255)
cGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActctc < 1:4258974/93‑1 (MQ=255)
cGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActctc < 2:4547739/93‑1 (MQ=255)
gATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActctct > 2:4795580/1‑93 (MQ=255)
gATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActctct > 1:4452620/1‑93 (MQ=255)
gATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActctct > 2:2573041/1‑93 (MQ=255)
ggAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGc > 1:5404282/1‑93 (MQ=255)
gAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGcc > 2:2482877/1‑93 (MQ=255)
gAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGcc > 2:2282821/1‑93 (MQ=255)
gAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGcc > 1:2015457/1‑93 (MQ=255)
gAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGcc > 2:316890/1‑93 (MQ=255)
aaGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGccc > 1:2664996/1‑93 (MQ=255)
aaGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGccc > 1:6763788/1‑93 (MQ=255)
aaGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGACGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGccc > 1:510896/1‑93 (MQ=255)
gATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGt > 1:7283349/1‑93 (MQ=255)
gATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGt > 1:5719689/1‑93 (MQ=255)
tGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGc > 2:7651063/1‑93 (MQ=255)
gcgcgATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCAct < 2:375953/93‑1 (MQ=255)
cgATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActgcc < 1:1660188/93‑1 (MQ=255)
cgATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActgcc < 2:5772832/93‑1 (MQ=255)
cgATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGGGCActgac > 2:5150789/1‑91 (MQ=255)
gATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActgcct > 2:4015751/1‑93 (MQ=255)
aTGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActgcctg < 1:1546469/93‑1 (MQ=255)
aTGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActgcctg < 2:4944667/93‑1 (MQ=255)
aTGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActgcctg > 1:1955534/1‑93 (MQ=255)
cAGTACGTTTTGGTGATGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGAGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGACCGTGCActgcctgatt < 2:7833207/93‑4 (MQ=255)
gTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTAtt < 1:6936425/93‑1 (MQ=255)
gTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTAtt > 2:300215/1‑93 (MQ=255)
gTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTAtt > 1:2064197/1‑93 (MQ=255)
gTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTAtt > 2:8647345/1‑93 (MQ=255)
aCGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGc > 1:2533143/1‑93 (MQ=255)
gTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAg < 1:4044488/93‑1 (MQ=255)
ttttGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCTCGTGCACTGCCTGCTATTGCAgt > 1:8209805/1‑92 (MQ=255)
ttttGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGa > 1:852943/1‑93 (MQ=255)
ttttGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGa < 1:7392051/93‑1 (MQ=255)
tttGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGAt < 2:7707161/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGCTGATGGGATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATg < 2:7511272/93‑1 (MQ=255)
tGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGc < 1:1787656/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCgg < 2:1949312/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCgg > 1:4696648/1‑93 (MQ=255)
tGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGt < 1:5483195/93‑1 (MQ=255)
gCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTg > 1:7119003/1‑93 (MQ=255)
gCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTg > 2:8236443/1‑93 (MQ=255)
cTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGa > 2:2639354/1‑93 (MQ=255)
tGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGGGaa > 2:6986116/1‑93 (MQ=255)
gATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGaaa < 2:342899/93‑1 (MQ=255)
gATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGaaa < 1:483687/93‑1 (MQ=255)
aTGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAg > 2:7855413/1‑93 (MQ=255)
tGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAgg < 1:6514763/93‑1 (MQ=255)
ggAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGt < 2:7280297/93‑1 (MQ=255)
ggAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGt < 1:621553/93‑1 (MQ=255)
gtaTTGTGGTTACTGACTATGATGGCCGGCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTg < 2:5643915/91‑1 (MQ=255)
gaTTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCACCTGGAAGGTGCACGCTCTGCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGa < 1:2904889/92‑1 (MQ=255)
aTTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGat > 1:3180901/1‑93 (MQ=255)
ttGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGata < 1:215414/93‑1 (MQ=255)
ttGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGata > 1:5677790/1‑93 (MQ=255)
tgtgGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGatat < 2:4494254/93‑1 (MQ=255)
gtgGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGAtata > 2:3057216/1‑93 (MQ=255)
gtgGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGAtata < 2:4062902/93‑1 (MQ=255)
gtgGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGAtata < 2:6726699/93‑1 (MQ=255)
tCTAACCACGGTTGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCAtt < 1:3339769/93‑1 (MQ=255)
tAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCt > 1:7477139/1‑93 (MQ=255)
tAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCt < 1:3746878/93‑1 (MQ=255)
tAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCt > 2:1411450/1‑93 (MQ=255)
aaCCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTg < 2:5286088/93‑1 (MQ=255)
aaCCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTg > 2:7992979/1‑93 (MQ=255)
aaCCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTg < 2:1630601/93‑1 (MQ=255)
aCCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTgg > 1:8295860/1‑93 (MQ=255)
ccACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGc < 2:7580979/93‑1 (MQ=255)
ccACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGc < 2:6237522/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCgg > 1:1104191/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCgg > 2:4177474/1‑93 (MQ=255)
gTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATa < 2:8119733/93‑1 (MQ=255)
gTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATa < 2:2155122/93‑1 (MQ=255)
ggCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGc > 2:7094011/1‑93 (MQ=255)
ggCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGc < 1:8710269/93‑1 (MQ=255)
ggCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGc < 2:8322784/93‑1 (MQ=255)
gccgccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCg < 2:7356046/93‑1 (MQ=255)
cctccAGCTGGACGGTGCACTTTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCgg < 1:3529817/90‑1 (MQ=255)
cgccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAACGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGa > 1:1876419/1‑93 (MQ=255)
gccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGaa > 1:6374176/1‑93 (MQ=255)
gccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGaa > 2:1694150/1‑93 (MQ=255)
ccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAAt > 1:2341719/1‑93 (MQ=255)
ccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAAt > 2:1072137/1‑93 (MQ=255)
aGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTc < 2:8473353/93‑1 (MQ=255)
aGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTc > 2:8774788/1‑93 (MQ=255)
aGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTc < 1:7762214/93‑1 (MQ=255)
tgtGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCTCTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGTAATTCg < 1:5996942/91‑1 (MQ=255)
gCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCg < 2:3310613/93‑1 (MQ=255)
gCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCg < 1:7905075/93‑1 (MQ=255)
tGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTa > 1:6622360/1‑93 (MQ=255)
ggACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTaa < 2:654705/93‑1 (MQ=255)
ggACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTaa < 2:4251011/93‑1 (MQ=255)
gACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAAc > 2:3605161/1‑93 (MQ=255)
gACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAAc > 2:133333/1‑93 (MQ=255)
ggTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACggg < 1:300215/93‑1 (MQ=255)
ggTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACggg > 1:1282134/1‑93 (MQ=255)
gtgcACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGc < 2:4995656/93‑1 (MQ=255)
gtgcACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGc < 2:2396280/93‑1 (MQ=255)
gtgcACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGc > 1:4843043/1‑93 (MQ=255)
|
TCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGTACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGC > NC_000913/3778211‑3778390
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 208 total aligned reads displayed.
GGATCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGTACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTGA > NC_000913/3778208‑3778394
|
GGATCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGC > SRR4302541.3328568/1‑94 (MQ=60)
GATCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCA > SRR4302541.2138306/1‑94 (MQ=60)
GATCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCA > SRR4302541.7487172/1‑94 (MQ=60)
GATCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCA < SRR4302541.3020698/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCAC > SRR4302541.1971663/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCAC > SRR4302541.3997372/1‑94 (MQ=60)
TCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACT < SRR4302541.6349436/94‑1 (MQ=60)
CCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTC > SRR4302541.6061471/1‑94 (MQ=60)
CCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTC > SRR4302541.6330880/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCT < SRR4302541.4301541/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCT > SRR4302541.4497416/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCT > SRR4302541.8555808/1‑94 (MQ=60)
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GATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTT > SRR4302541.1936271/1‑94 (MQ=60)
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TGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAA < SRR4302541.6927322/94‑1 (MQ=60)
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NNNGNAANTNTGGTTTCNAANNNNGNTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCNCTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAG < SRR4302541.2733818/94‑1 (MQ=60)
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GATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAG < SRR4302541.8232358/94‑1 (MQ=60)
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ATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATA > SRR4302541.5735723/1‑94 (MQ=60)
ATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATA > SRR4302541.2807295/1‑94 (MQ=60)
TTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATAT < SRR4302541.217071/94‑1 (MQ=60)
TTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATAT > SRR4302541.555464/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATA < SRR4302541.2134435/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATA < SRR4302541.125167/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATA > SRR4302541.4854781/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATA > SRR4302541.6288747/1‑94 (MQ=60)
GTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAG > SRR4302541.7148318/1‑94 (MQ=60)
GTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAG < SRR4302541.1913998/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGC < SRR4302541.2351299/94‑1 (MQ=60)
GGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCC < SRR4302541.1622197/94‑1 (MQ=60)
GTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCA < SRR4302541.6030626/94‑1 (MQ=60)
GTGTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCA < SRR4302541.5761557/94‑1 (MQ=60)
TTTCTAGCCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTCCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCAT < SRR4302541.748073/94‑1 (MQ=60)
TCTAACCACGGTTGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTC < SRR4302541.3373180/94‑1 (MQ=60)
CTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCT > SRR4302541.3285033/1‑94 (MQ=60)
CTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCT < SRR4302541.6660855/94‑1 (MQ=60)
CTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCT > SRR4302541.7557126/1‑94 (MQ=60)
TAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCCCTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTG < SRR4302541.5645832/94‑1 (MQ=60)
TAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTG > SRR4302541.8611607/1‑94 (MQ=60)
TAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTG < SRR4302541.3784584/94‑1 (MQ=60)
AACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGG < SRR4302541.2067412/94‑1 (MQ=60)
AACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGG > SRR4302541.8386071/1‑94 (MQ=60)
AACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGG < SRR4302541.5002862/94‑1 (MQ=60)
AACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGAGATATAGCCATTCTGG > SRR4302541.1236723/1‑94 (MQ=60)
CACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGG > SRR4302541.1114537/1‑94 (MQ=60)
CACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGG < SRR4302541.1976937/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGA < SRR4302541.1745213/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGA > SRR4302541.2002715/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGA > SRR4302541.5762807/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGAT < SRR4302541.2075927/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATA > SRR4302541.7766789/1‑94 (MQ=60)
TGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGC > SRR4302541.569571/1‑94 (MQ=60)
GGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCG > SRR4302541.2504777/1‑94 (MQ=60)
GGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCG < SRR4302541.8803464/94‑1 (MQ=60)
GGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCG < SRR4302541.2636714/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGG < SRR4302541.5761014/94‑1 (MQ=60)
CCTCCAGCTGGACGGTGCACTTTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGA < SRR4302541.3565368/94‑1 (MQ=60)
CCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAACGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGA > SRR4302541.1894460/1‑94 (MQ=60)
CCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGA > SRR4302541.7372010/1‑94 (MQ=60)
CCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGA < SRR4302541.4800933/94‑1 (MQ=60)
CGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAA > SRR4302541.6439310/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAAT > SRR4302541.2364464/1‑94 (MQ=60)
CCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATT > SRR4302541.8349213/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTC < SRR4302541.7486016/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTCCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGGGGAATTC > SRR4302541.4142591/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCG < SRR4302541.7844796/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCG < SRR4302541.4601555/94‑1 (MQ=60)
tgTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCTCTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGTAATTCGT < SRR4302541.6058378/92‑1 (MQ=60)
GCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGT < SRR4302541.7992033/94‑1 (MQ=60)
CTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTA > SRR4302541.6690232/1‑94 (MQ=60)
TGTACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAA < SRR4302541.7304663/94‑1 (MQ=60)
TGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAA < SRR4302541.8748380/94‑1 (MQ=60)
TGGACGGTGCACTCTCTTCAGCCAGTGCACTGCCTGCTATTACAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAA < SRR4302541.7925702/94‑1 (MQ=60)
GGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAAC < SRR4302541.7003043/94‑1 (MQ=60)
GACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTTCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACG < SRR4302541.1709421/94‑1 (MQ=60)
GACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGCTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACG < SRR4302541.4129907/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGG < SRR4302541.2014331/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGG > SRR4302541.1294851/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGG > SRR4302541.6486836/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGG < SRR4302541.7425117/94‑1 (MQ=60)
GGTGCACTCTCTTCCGCCCGTNCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTTATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGC < SRR4302541.302848/94‑1 (MQ=60)
GGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGC > SRR4302541.3009018/1‑94 (MQ=60)
GGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGC < SRR4302541.302847/94‑1 (MQ=60)
GGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGC > SRR4302541.4892414/1‑94 (MQ=60)
GGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCAATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGC < SRR4302541.7935020/94‑1 (MQ=60)
GGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGCGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGC > SRR4302541.677009/1‑94 (MQ=60)
GTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCT < SRR4302541.1596238/94‑1 (MQ=60)
GTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCT < SRR4302541.4395581/94‑1 (MQ=60)
TGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTT < SRR4302541.2069397/94‑1 (MQ=60)
TGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTT < SRR4302541.2069398/94‑1 (MQ=60)
TGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTT > SRR4302541.6115903/1‑94 (MQ=60)
GCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTG > SRR4302541.3597393/1‑94 (MQ=60)
GACTCTCTTTCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTGA < SRR4302541.3948758/94‑1 (MQ=60)
CACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTGA > SRR4302541.7921109/1‑94 (MQ=60)
CACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTGA < SRR4302541.1707021/94‑1 (MQ=60)
CACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTGA < SRR4302541.6695389/94‑1 (MQ=60)
|
GGATCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGTACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTGA > NC_000913/3778208‑3778394
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
