Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,778,301 |
T→C |
V283A (GTA→GCA) |
lldD → |
L‑lactate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,778,301 | 0 | T | C | 100.0%
| 896.0
/ NA
| 259 | V283A (GTA→GCA) | lldD | L‑lactate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (127/132); total (127/132) |
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
TCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGTACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGC > NC_000913/3778211‑3778390
|
tCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCAc < 1:6459387/93‑1 (MQ=255)
cTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActc < 2:924288/93‑1 (MQ=255)
tCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActct > 2:3578996/1‑93 (MQ=255)
cGATCCGGAAGATGCGCGCTATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActctc < 1:5733389/93‑1 (MQ=255)
cGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActctc < 2:3707755/93‑1 (MQ=255)
gATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActctct > 1:6216696/1‑93 (MQ=255)
gATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActctct > 1:5557485/1‑93 (MQ=255)
gATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActctct > 2:4462362/1‑93 (MQ=255)
gATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCActctct > 1:2745472/1‑93 (MQ=255)
aTCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCtt > 1:1050422/1‑93 (MQ=255)
aTCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCtt > 1:3986769/1‑93 (MQ=255)
tCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTc < 2:185598/93‑1 (MQ=255)
tCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTc < 1:2115574/93‑1 (MQ=255)
tCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGATGGACGGTGCACTCTCTTc > 1:6344244/1‑93 (MQ=255)
ccGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTcc < 2:4718828/93‑1 (MQ=255)
cGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCg > 1:5353141/1‑93 (MQ=255)
ggAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGc > 2:2347252/1‑93 (MQ=255)
gAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGcc > 1:4614554/1‑93 (MQ=255)
gAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGcc > 2:6024644/1‑93 (MQ=255)
gATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGt > 1:5719129/1‑93 (MQ=255)
aTGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTg < 2:1368014/93‑1 (MQ=255)
gcgATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActgc < 2:1310264/93‑1 (MQ=255)
gATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActgcct < 2:4911274/93‑1 (MQ=255)
gATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActgcct > 1:5165284/1‑93 (MQ=255)
gATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActgcct < 2:5772245/93‑1 (MQ=255)
aTGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActgcctg < 2:5043610/93‑1 (MQ=255)
tGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCActggctgc > 1:2632494/1‑93 (MQ=255)
aGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTAt < 1:2367588/93‑1 (MQ=255)
aGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTAt > 2:3488928/1‑93 (MQ=255)
aGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTAt < 1:969224/93‑1 (MQ=255)
gTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTAtt < 1:5670386/93‑1 (MQ=255)
tACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTg > 1:469505/1‑93 (MQ=255)
aCGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGc < 1:4415967/93‑1 (MQ=255)
cGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGcg > 2:4224540/1‑92 (MQ=255)
cGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCa < 1:4746399/93‑1 (MQ=255)
gTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAg > 1:1857201/1‑93 (MQ=255)
ttttGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGa > 1:5008372/1‑93 (MQ=255)
tttGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGAt < 2:2000013/93‑1 (MQ=255)
tGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGc < 2:2559860/93‑1 (MQ=255)
tGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGc < 2:5871153/93‑1 (MQ=255)
tGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATGGCAGATGc < 1:6264191/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCg < 2:5268595/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCg < 1:5135479/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCgg < 1:2991861/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCgg > 1:1277624/1‑93 (MQ=255)
tGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGt < 1:2834150/93‑1 (MQ=255)
tGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGaa > 1:2017520/1‑93 (MQ=255)
tGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGaa < 1:3209373/93‑1 (MQ=255)
gATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCGCTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGaaa < 2:3294848/93‑1 (MQ=255)
gATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGaaa < 2:570449/93‑1 (MQ=255)
gATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGaaa > 2:1626416/1‑93 (MQ=255)
agggAATTGTGCTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAg < 1:4920671/91‑1 (MQ=255)
aTGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAg > 1:3370356/1‑93 (MQ=255)
aTGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAg < 2:2593051/93‑1 (MQ=255)
ttgAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAgg < 2:6117133/91‑1 (MQ=255)
tGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGTCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAgg < 1:4476831/93‑1 (MQ=255)
tGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAgg > 1:5575894/1‑93 (MQ=255)
aaTTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGa > 2:2779768/1‑93 (MQ=255)
aaTTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGa < 2:1555049/93‑1 (MQ=255)
aTTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGat < 1:6122907/93‑1 (MQ=255)
ttGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGata > 1:117050/1‑93 (MQ=255)
ttGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGata < 2:1653614/93‑1 (MQ=255)
gtgGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGAtata > 2:843131/1‑93 (MQ=255)
ttCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCAt < 2:2976721/93‑1 (MQ=255)
ttCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCAt < 2:3863632/93‑1 (MQ=255)
cTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTc < 1:3096445/93‑1 (MQ=255)
tAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCt > 2:2065068/1‑93 (MQ=255)
tAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCt < 2:2431357/93‑1 (MQ=255)
aaCCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTg > 2:125927/1‑93 (MQ=255)
aCCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTgg > 1:3578430/1‑93 (MQ=255)
ccACGGTGGCCGCTAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGc < 2:2332959/93‑1 (MQ=255)
cACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCg < 2:3892373/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCgg > 1:149905/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCgg < 2:554201/93‑1 (MQ=255)
cGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGa < 1:1681717/93‑1 (MQ=255)
cGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGa < 1:4356832/93‑1 (MQ=255)
ggTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGAt < 1:192040/93‑1 (MQ=255)
ggTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGAt < 2:3014835/93‑1 (MQ=255)
gTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATa > 1:5540093/1‑93 (MQ=255)
gccgccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCg > 2:6321474/1‑93 (MQ=255)
ccgccAGCTGGAGGGTGCGCTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCgg < 2:4091279/93‑1 (MQ=255)
ccgccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCgg < 1:4031207/93‑1 (MQ=255)
cgccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGa > 1:218921/1‑93 (MQ=255)
gccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCGTTCTGGCGGATAGCGGaa < 1:841803/93‑1 (MQ=255)
gccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGaa < 2:4519358/93‑1 (MQ=255)
gccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGaa > 2:23097/1‑93 (MQ=255)
ccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAAt > 2:5437316/1‑93 (MQ=255)
ccAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAAt < 2:1236209/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGGGCGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAAtt < 1:1581312/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAAtt > 1:3023243/1‑93 (MQ=255)
aGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTc < 1:4322779/93‑1 (MQ=255)
aGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTc < 1:692478/93‑1 (MQ=255)
gCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCg > 1:3337857/1‑93 (MQ=255)
gCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCg > 2:112708/1‑93 (MQ=255)
gCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCg > 2:6392099/1‑93 (MQ=255)
tGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTa > 1:5840760/1‑93 (MQ=255)
gACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAAc < 2:4310119/93‑1 (MQ=255)
gACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAAc < 2:3104909/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACg < 2:5937600/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACgg > 1:5290048/1‑93 (MQ=255)
|
TCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGTACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGC > NC_000913/3778211‑3778390
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGTACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTGA > NC_000913/3778210‑3778394
|
ATCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCAC > SRR4302534.3535916/1‑94 (MQ=60)
TCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACT > SRR4302534.1017120/1‑94 (MQ=60)
TCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACT < SRR4302534.3081788/94‑1 (MQ=60)
TCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACT < SRR4302534.6633392/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGGAAGATGCGCGCTATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCT < SRR4302534.5888754/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCT > SRR4302534.959338/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCT > SRR4302534.5275909/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCT > SRR4302534.5707525/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCT > SRR4302534.2817782/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCT > SRR4302534.6385593/1‑94 (MQ=60)
GATCCGGAAGATTCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTTTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCTCTCTCTT > SRR4302534.6646142/1‑94 (MQ=60)
GATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTT < SRR4302534.453401/94‑1 (MQ=60)
GATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTT > SRR4302534.212016/1‑94 (MQ=60)
GATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTT > SRR4302534.5455566/1‑94 (MQ=60)
GATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTT > SRR4302534.520761/1‑94 (MQ=60)
GATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTT > SRR4302534.4093444/1‑94 (MQ=60)
GATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTT < SRR4302534.80898/94‑1 (MQ=60)
GATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTT > SRR4302534.1077621/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTC < SRR4302534.2665070/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGATGGACGGTGCACTCTCTTC > SRR4302534.6515592/1‑94 (MQ=60)
TCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCC > SRR4302534.4656201/1‑94 (MQ=60)
TCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCC > SRR4302534.4711823/1‑94 (MQ=60)
TCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCC < SRR4302534.6596499/94‑1 (MQ=60)
TCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCC < SRR4302534.1367166/94‑1 (MQ=60)
TCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCC < SRR4302534.2171233/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTacc > SRR4302534.1982089/1‑91 (MQ=60)
CCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCG > SRR4302534.5497462/1‑94 (MQ=60)
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GGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGTACGGTGCACTCTCTTCCGCC < SRR4302534.6450899/94‑1 (MQ=60)
GGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCC > SRR4302534.4739778/1‑94 (MQ=60)
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AAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCG < SRR4302534.4120572/94‑1 (MQ=60)
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AGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGT > SRR4302534.5886674/1‑94 (MQ=60)
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TGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCT > SRR4302534.4445842/1‑94 (MQ=60)
GCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTA < SRR4302534.813396/94‑1 (MQ=60)
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AGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATT < SRR4302534.993916/94‑1 (MQ=60)
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TACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGC < SRR4302534.161292/94‑1 (MQ=60)
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GTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGA > SRR4302534.5143747/1‑94 (MQ=60)
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TTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGC > SRR4302534.440531/1‑94 (MQ=60)
TTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGC < SRR4302534.4496651/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCG < SRR4302534.5623051/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATGGCAGATGCG < SRR4302534.6433861/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGG > SRR4302534.1311250/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGG < SRR4302534.5274108/94‑1 (MQ=60)
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GTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGT > SRR4302534.3569575/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGATGGAATTGTGGATTCTAATCACGGTGGACGTCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGT > SRR4302534.2107043/1‑94 (MQ=60)
TGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTG < SRR4302534.1256330/94‑1 (MQ=60)
TGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTG < SRR4302534.2908612/94‑1 (MQ=60)
GCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGA < SRR4302534.1655489/94‑1 (MQ=60)
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GATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCCATTGCAGATGCGGTGAAAG > SRR4302534.5869763/1‑94 (MQ=60)
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ATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGG < SRR4302534.1835889/94‑1 (MQ=60)
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TGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGTCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGT < SRR4302534.4597950/94‑1 (MQ=60)
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AATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGAT < SRR4302534.4597314/94‑1 (MQ=60)
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AATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGAT > SRR4302534.5956642/1‑94 (MQ=60)
AATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGAT > SRR4302534.5710904/1‑94 (MQ=60)
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TGTGGCTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATA > SRR4302534.508220/1‑94 (MQ=60)
GTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCA < SRR4302534.527205/94‑1 (MQ=60)
TTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATT > SRR4302534.2274315/1‑94 (MQ=60)
TTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATT < SRR4302534.2049980/94‑1 (MQ=60)
TTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATT < SRR4302534.2934516/94‑1 (MQ=60)
TTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATT < SRR4302534.2825888/94‑1 (MQ=60)
TTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATT < SRR4302534.3094087/94‑1 (MQ=60)
TTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATT > SRR4302534.3338405/1‑94 (MQ=60)
CTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCT < SRR4302534.3177898/94‑1 (MQ=60)
TAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTG > SRR4302534.4952717/1‑94 (MQ=60)
AACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGG > SRR4302534.116399/1‑94 (MQ=60)
AACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGG > SRR4302534.3674681/1‑94 (MQ=60)
AACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGG > SRR4302534.3768349/1‑94 (MQ=60)
AACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGG > SRR4302534.3451888/1‑94 (MQ=60)
CCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCG > SRR4302534.4795566/1‑94 (MQ=60)
CACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGG > SRR4302534.153813/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGAT < SRR4302534.870329/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGAT < SRR4302534.4474403/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGAT < SRR4302534.1725460/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATA < SRR4302534.197063/94‑1 (MQ=60)
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GGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATA > SRR4302534.1865612/1‑94 (MQ=60)
GTGGCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAG > SRR4302534.6183153/1‑94 (MQ=60)
GTGCCCGCCAGCTGGACGGTGCTCTCTCTTCCGCCCGTGCAATGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAACGGTGATATAGCCATTCTGGCTGATAG < SRR4302534.5078934/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGG < SRR4302534.1358837/94‑1 (MQ=60)
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CGCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAA > SRR4302534.2245485/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCGTTCTGGCGGATAGCGGAAT < SRR4302534.863008/94‑1 (MQ=60)
CCAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATT > SRR4302534.3102455/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGGGCGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTC < SRR4302534.1622672/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTC < SRR4302534.1637531/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCG < SRR4302534.4439763/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCG < SRR4302534.709438/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCG > SRR4302534.3427163/1‑94 (MQ=60)
CTGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTA > SRR4302534.5999312/1‑94 (MQ=60)
TGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTGGTAA > SRR4302534.2822497/1‑94 (MQ=60)
TGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAA > SRR4302534.4870505/1‑94 (MQ=60)
TGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAA > SRR4302534.2376072/1‑94 (MQ=60)
TGGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAA > SRR4302534.5332914/1‑94 (MQ=60)
GGACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAAC > SRR4302534.3130712/1‑94 (MQ=60)
GACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACG < SRR4302534.6609101/94‑1 (MQ=60)
GACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACG < SRR4302534.5795141/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGG > SRR4302534.5432837/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCGATTCTGGCGGATAGCGGAATGCGTAACGGG < SRR4302534.6477411/94‑1 (MQ=60)
GGTGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGC > SRR4302534.429729/1‑94 (MQ=60)
TGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTT < SRR4302534.6043753/94‑1 (MQ=60)
TGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTT < SRR4302534.4887746/94‑1 (MQ=60)
TGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTT < SRR4302534.932755/94‑1 (MQ=60)
TGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTT < SRR4302534.985371/94‑1 (MQ=60)
TGCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTT > SRR4302534.56605/1‑94 (MQ=60)
GCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTG < SRR4302534.3794000/94‑1 (MQ=60)
GCACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTG > SRR4302534.40580/1‑94 (MQ=60)
CACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTGA > SRR4302534.1265591/1‑94 (MQ=60)
CACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTGA > SRR4302534.5943204/1‑94 (MQ=60)
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ATCCTCGATCCGGAAGATGCGCGCGATGCAGTACGTTTTGGTGCTGATGGAATTGTGGTTTCTAACCACGGTGGCCGCCAGCTGGACGGTGTACTCTCTTCCGCCCGTGCACTGCCTGCTATTGCAGATGCGGTGAAAGGTGATATAGCCATTCTGGCGGATAGCGGAATTCGTAACGGGCTTGA > NC_000913/3778210‑3778394
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
