Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,873,986 |
T→C |
T199A (ACG→GCG) |
yidA ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,873,986 | 0 | T | C | 99.8%
| 1411.0
/ ‑5.3
| 408 | T199A (ACG→GCG) | yidA | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (193/214); total (194/214) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.80e-01 |
Only 100 of 419 total aligned reads displayed.
CAATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGTACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATAC > NC_000913/3873896‑3874075
|
cAATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCAc > 2:572485/1‑93 (MQ=255)
cAATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCAc < 2:5555434/93‑1 (MQ=255)
aaTCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCAcc > 2:1927038/1‑93 (MQ=255)
aTCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCt < 1:7710267/93‑1 (MQ=255)
aTCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATCATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGGCGGCCACTGATTTCACCCCCGCACCt > 1:5524528/1‑93 (MQ=255)
tCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCtt > 1:3396640/1‑93 (MQ=255)
cATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCttt < 1:6687768/93‑1 (MQ=255)
cATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCttt < 1:286410/93‑1 (MQ=255)
aTTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTg < 2:7128708/93‑1 (MQ=255)
tGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGtt < 1:5639775/93‑1 (MQ=255)
gCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTa > 2:2471534/1‑93 (MQ=255)
cGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTaa < 2:894151/93‑1 (MQ=255)
gATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAAc < 1:4597130/93‑1 (MQ=255)
gATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAAc > 1:5172122/1‑93 (MQ=255)
gATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAAc < 2:4026341/93‑1 (MQ=255)
gATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAAc < 2:418867/93‑1 (MQ=255)
atatCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAAcg > 1:165785/1‑93 (MQ=255)
atatCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAAcg > 1:7510819/1‑93 (MQ=255)
tatCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAAcgc < 2:3090983/93‑1 (MQ=255)
atCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAAcgcg > 2:2821387/1‑93 (MQ=255)
tCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGt > 1:2006335/1‑93 (MQ=255)
cGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGtt < 2:1572004/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGttt > 2:1415857/1‑93 (MQ=255)
gTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGttt > 2:1771173/1‑93 (MQ=255)
gTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGttt < 1:4010528/93‑1 (MQ=255)
ttttCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTa > 2:5257247/1‑93 (MQ=255)
tttCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTAt < 1:147213/93‑1 (MQ=255)
ttCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACGCGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATc < 2:2580479/93‑1 (MQ=255)
ccTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGa < 2:7032669/93‑1 (MQ=255)
cTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAg < 2:5090846/93‑1 (MQ=255)
gATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGa < 2:6552045/93‑1 (MQ=255)
tcgccaatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCGCCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGAtt < 1:3688182/93‑1 (MQ=255)
tcgccaatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGAtt < 1:3084183/93‑1 (MQ=255)
cgccaatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGAttt < 1:2139815/93‑1 (MQ=255)
cgccaatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGAttt < 2:6828894/93‑1 (MQ=255)
gccaatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATGCCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCCCCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTc < 1:7295077/93‑1 (MQ=255)
gccaatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTc < 1:6232395/93‑1 (MQ=255)
ccaatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCGCCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCg < 2:4578570/93‑1 (MQ=255)
caatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGa > 1:7780204/1‑93 (MQ=255)
caatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGa < 1:3603173/93‑1 (MQ=255)
aatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAg > 2:7666659/1‑93 (MQ=255)
aatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAg > 2:5418655/1‑93 (MQ=255)
aatcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGGTTATCGAGGATTTCGAg > 2:3270319/1‑93 (MQ=255)
atcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCGCCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAgg > 1:1323196/1‑93 (MQ=255)
atcgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAga > 1:832687/1‑92 (MQ=255)
cgccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGaa < 1:8776794/93‑1 (MQ=255)
gccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAg > 1:2275035/1‑93 (MQ=255)
gccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAg < 2:4876003/93‑1 (MQ=255)
ccaTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGt > 1:4781855/1‑93 (MQ=255)
caTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTa > 2:1662408/1‑93 (MQ=255)
caTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTa > 1:946358/1‑93 (MQ=255)
tGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACg < 1:1857743/93‑1 (MQ=255)
tGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACg < 2:4319500/93‑1 (MQ=255)
tGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACg < 2:4714145/93‑1 (MQ=255)
gATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACgg > 2:6223702/1‑93 (MQ=255)
tttCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGgcg > 1:5019772/1‑93 (MQ=255)
ttcttcCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGgcgc > 1:107956/1‑93 (MQ=255)
tcttcCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCa < 2:3631667/93‑1 (MQ=255)
cttcCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCAc < 2:3511493/93‑1 (MQ=255)
ttcCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTCCGGCGCACt < 2:5819355/93‑1 (MQ=255)
ttcCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACt > 1:6139534/1‑93 (MQ=255)
tcCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCGCCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACtt < 1:6458372/93‑1 (MQ=255)
gTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCa < 1:4390499/93‑1 (MQ=255)
gTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCa < 1:4204317/93‑1 (MQ=255)
gTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCa < 2:8017261/93‑1 (MQ=255)
tttAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAg > 1:4709717/1‑93 (MQ=255)
tAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCCCCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCa < 1:2599965/93‑1 (MQ=255)
tAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCa < 1:4072036/93‑1 (MQ=255)
tACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACgg < 2:2054568/93‑1 (MQ=255)
cTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGtat < 1:3382558/93‑1 (MQ=255)
cTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGtat > 1:7029858/1‑93 (MQ=255)
cTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGtat < 1:1694785/93‑1 (MQ=255)
cTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGtat > 2:1080628/1‑93 (MQ=255)
tAATACGTCGACCAGTGATTTCACCCCAGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGtata < 2:5926237/93‑1 (MQ=255)
tAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGtata > 2:241901/1‑93 (MQ=255)
tAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGtata < 2:4464357/93‑1 (MQ=255)
aaCACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTatat > 2:3772328/1‑93 (MQ=255)
aaCACGTCGGCCAGTGATTTAACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGAACGGCGCAATTTTAAGCACGGGatat > 2:7419448/1‑93 (MQ=255)
aaCACGTAGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTatat > 2:8643738/1‑93 (MQ=255)
tCGGCCAGTGATTTCCCCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTctct < 2:1189878/93‑1 (MQ=255)
gCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTc < 1:4752353/93‑1 (MQ=255)
ccAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCa > 1:8511211/1‑93 (MQ=255)
ccAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCa < 2:8390361/93‑1 (MQ=255)
cAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCAc < 1:3796143/93‑1 (MQ=255)
aGTGCTTTCTCCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGTTTTCGAGGAAGTGCGGCACCCTTTTCCGCACGGTATATTTCTCTTTCACt < 2:6675569/93‑1 (MQ=255)
aGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACt > 2:8210660/1‑93 (MQ=255)
gTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACtt < 2:2713827/93‑1 (MQ=255)
ggATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTc < 2:4887065/92‑1 (MQ=255)
aTTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCt < 2:7283088/93‑1 (MQ=255)
tttCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTg < 1:2456802/93‑1 (MQ=255)
ttCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGc < 2:5622034/93‑1 (MQ=255)
tCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCg < 2:3913911/93‑1 (MQ=255)
tCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCg < 2:2327114/93‑1 (MQ=255)
cACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCgg < 1:5279292/93‑1 (MQ=255)
cccccGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGaa < 2:6078450/93‑1 (MQ=255)
cccGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATa < 2:3196920/93‑1 (MQ=255)
ccGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCCCGGCATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATAc > 2:7579662/1‑93 (MQ=255)
ccGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATAc < 2:2281690/93‑1 (MQ=255)
ccGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATAc > 1:5964041/1‑93 (MQ=255)
ccGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATAc > 2:1008136/1‑93 (MQ=255)
|
CAATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGTACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATAC > NC_000913/3873896‑3874075
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTCAATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGTACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATACGCG > NC_000913/3873893‑3874078
|
TTTCACTCATTGCGATATCGTTTTCCTGCTCGCCAATCGCCCTGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGC < SRR4302541.7909489/94‑1 (MQ=60)
ATTCAATCATTGCGATATCGTTTTCCTTATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGC < SRR4302541.6180310/94‑1 (MQ=60)
ATTCAATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGC < SRR4302541.3573101/94‑1 (MQ=60)
ATTCAATCATTGCGATATCGTTTGCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGC < SRR4302541.3573100/94‑1 (MQ=60)
TTCAATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCA < SRR4302541.2022958/94‑1 (MQ=60)
AATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCT > SRR4302541.5870286/1‑94 (MQ=60)
AATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATCATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGGCGGCCACTGATTTCACCCCCGCACCT > SRR4302541.5581084/1‑94 (MQ=60)
ATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTT > SRR4302541.7951491/1‑94 (MQ=60)
ATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTT < SRR4302541.7792268/94‑1 (MQ=60)
ATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTT > SRR4302541.3430525/1‑94 (MQ=60)
TCATTGCGATATCGTTTTCCAGATCGCTAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTT < SRR4302541.4827472/94‑1 (MQ=60)
CATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTG < SRR4302541.288863/94‑1 (MQ=60)
CATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTG < SRR4302541.6757149/94‑1 (MQ=60)
CATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTG > SRR4302541.7137294/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTACTACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGT > SRR4302541.5180757/1‑94 (MQ=60)
TGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTA < SRR4302541.5697430/94‑1 (MQ=60)
TGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTA < SRR4302541.4237667/94‑1 (MQ=60)
GCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAA < SRR4302541.4757962/94‑1 (MQ=60)
GCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAA < SRR4302541.5615487/94‑1 (MQ=60)
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GTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAG > SRR4302541.4757731/1‑94 (MQ=60)
GTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAG < SRR4302541.979161/94‑1 (MQ=60)
GTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAG < SRR4302541.4434414/94‑1 (MQ=60)
GTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAG < SRR4302541.4246119/94‑1 (MQ=60)
TTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGC < SRR4302541.3915604/94‑1 (MQ=60)
TTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCA < SRR4302541.7076265/94‑1 (MQ=60)
TAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCCCCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCAC < SRR4302541.2625997/94‑1 (MQ=60)
TAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCAC > SRR4302541.6211260/1‑94 (MQ=60)
TAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCAC > SRR4302541.2168921/1‑94 (MQ=60)
TAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCAC < SRR4302541.4112221/94‑1 (MQ=60)
AATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCGCCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACG > SRR4302541.8500223/1‑94 (MQ=60)
AATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACG < SRR4302541.6230629/94‑1 (MQ=60)
AATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACG < SRR4302541.6731287/94‑1 (MQ=60)
AATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACG > SRR4302541.3822158/1‑94 (MQ=60)
TACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGT > SRR4302541.7836987/1‑94 (MQ=60)
TACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGT < SRR4302541.4600071/94‑1 (MQ=60)
TACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGT > SRR4302541.7431818/1‑94 (MQ=60)
ACCTAACTCGTCGGCCAGTGCTTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTA < SRR4302541.2196857/94‑1 (MQ=60)
ACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTA < SRR4302541.7472604/94‑1 (MQ=60)
ACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTA > SRR4302541.1180588/1‑94 (MQ=60)
CCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTAT < SRR4302541.1295648/94‑1 (MQ=60)
CCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTAT > SRR4302541.7104600/1‑94 (MQ=60)
CCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTAT > SRR4302541.3812586/1‑94 (MQ=60)
CTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCGCCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATA > SRR4302541.5639568/1‑94 (MQ=60)
CTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATA < SRR4302541.1711413/94‑1 (MQ=60)
CTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATA > SRR4302541.2590502/1‑94 (MQ=60)
CTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATA < SRR4302541.3416278/94‑1 (MQ=60)
TAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATAT > SRR4302541.1435244/1‑94 (MQ=60)
TAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATAT < SRR4302541.3427431/94‑1 (MQ=60)
TAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATAT < SRR4302541.8458561/94‑1 (MQ=60)
TAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATAT < SRR4302541.3427430/94‑1 (MQ=60)
AACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATT > SRR4302541.301792/1‑94 (MQ=60)
AACACGTCGGCCAGAGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTGCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTCTATT > SRR4302541.3200750/1‑94 (MQ=60)
ACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTT > SRR4302541.5454293/1‑94 (MQ=60)
ACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTT > SRR4302541.7256685/1‑94 (MQ=60)
CACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTC > SRR4302541.1631004/1‑94 (MQ=60)
CGGCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTC < SRR4302541.1813111/94‑1 (MQ=60)
GTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCT > SRR4302541.7151279/1‑94 (MQ=60)
GTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCT < SRR4302541.2439473/94‑1 (MQ=60)
GTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCT < SRR4302541.1803938/94‑1 (MQ=60)
GTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCT < SRR4302541.1693004/94‑1 (MQ=60)
TCGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTT < SRR4302541.7964091/94‑1 (MQ=60)
CGGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTT > SRR4302541.8417397/1‑94 (MQ=60)
GGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTC < SRR4302541.5968361/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTC < SRR4302541.3698188/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTC > SRR4302541.3716966/1‑94 (MQ=60)
GGCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTC > SRR4302541.3922803/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCA > SRR4302541.1893228/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCA > SRR4302541.8602841/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCA < SRR4302541.4800911/94‑1 (MQ=60)
CCAGTGATTTCGCCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCAC < SRR4302541.4661208/94‑1 (MQ=60)
CAGTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACT < SRR4302541.3834339/94‑1 (MQ=60)
GTGATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTC > SRR4302541.2386783/1‑94 (MQ=60)
ATTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTG > SRR4302541.4822792/1‑94 (MQ=60)
TTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGC < SRR4302541.518719/94‑1 (MQ=60)
TTTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGC < SRR4302541.2481284/94‑1 (MQ=60)
TTCACCCCCGCGCCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGCACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCG > SRR4302541.3655570/1‑94 (MQ=60)
TTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCG > SRR4302541.6987139/1‑94 (MQ=60)
TTCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCG < SRR4302541.1981274/94‑1 (MQ=60)
TCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGG < SRR4302541.4376128/94‑1 (MQ=60)
TCACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGG < SRR4302541.5466062/94‑1 (MQ=60)
CACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGA > SRR4302541.1398817/1‑94 (MQ=60)
CACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGA < SRR4302541.5333652/94‑1 (MQ=60)
ACCCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCAAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAA > SRR4302541.8906522/1‑94 (MQ=60)
CCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATC > SRR4302541.4695967/1‑94 (MQ=60)
CCCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATA > SRR4302541.5019109/1‑94 (MQ=60)
CCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATAC > SRR4302541.6024833/1‑94 (MQ=60)
CCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATAC < SRR4302541.4074383/94‑1 (MQ=60)
CCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATAC < SRR4302541.3390570/94‑1 (MQ=60)
CCCGCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATAC < SRR4302541.2798363/94‑1 (MQ=60)
GCACCTTTGTTAACTCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCTCTTCCTGCGGAATACGCG < SRR4302541.3570306/94‑1 (MQ=60)
GCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATACGCG < SRR4302541.5055854/94‑1 (MQ=60)
GCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATACGCG < SRR4302541.5055855/94‑1 (MQ=60)
GCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATACGCG < SRR4302541.3570583/94‑1 (MQ=60)
GCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATACGCG > SRR4302541.6256435/1‑94 (MQ=60)
GCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATACGCG < SRR4302541.1366493/94‑1 (MQ=60)
GCACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATACGCG > SRR4302541.2609599/1‑94 (MQ=60)
|
ATTCAATCATTGCGATATCGTTTTCCTGATCGCCAATCGCCATGATTTCTTCCGGTTTAATACCTAACACGTCGGCCAGTGATTTCACCCCCGTACCTTTGTTAACGCGTTTATCGAGGATTTCGAGGAAGTACGGCGCACTTTTCAGCACGGTATATTTCTCTTTCACTTCCTGCGGAATACGCG > NC_000913/3873893‑3874078
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
