Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,059,768 |
A→G |
intergenic (+44/‑58) |
yihM → / → yihN |
hypothetical protein/putative resistance protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,059,768 | 0 | A | G | 100.0%
| 1084.4
/ NA
| 308 | intergenic (+44/‑58) | yihM/yihN | hypothetical protein/putative resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (161/147); total (161/147) |
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
TACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAG > NC_000913/4059678‑4059857
|
tactacAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTg > 2:4680178/1‑93 (MQ=255)
tactacAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTg > 2:2182362/1‑93 (MQ=255)
ctacAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGt < 1:4955200/93‑1 (MQ=255)
tacAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTc < 2:4939094/93‑1 (MQ=255)
acaacaAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCg < 2:5667509/93‑1 (MQ=255)
aacaaATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGt > 2:5422449/1‑93 (MQ=255)
aaaTCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATc > 2:1307482/1‑93 (MQ=255)
aaaTCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATc < 1:3124698/93‑1 (MQ=255)
aaTCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCt > 2:4826122/1‑93 (MQ=255)
aaTCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCt > 2:3314300/1‑93 (MQ=255)
aTCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCtt > 2:6743731/1‑93 (MQ=255)
aTCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCtt > 2:2344470/1‑93 (MQ=255)
cAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTAt < 2:2472030/93‑1 (MQ=255)
aaaCAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTAtt < 2:1505317/93‑1 (MQ=255)
aaaCAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTAtt < 1:3402735/93‑1 (MQ=255)
aaaCAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTAtt > 1:2234618/1‑93 (MQ=255)
aaaCAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTAtt < 2:1223435/93‑1 (MQ=255)
aaCAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTg > 2:892898/1‑93 (MQ=255)
aCAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGc > 2:1124767/1‑93 (MQ=255)
aCAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGc > 2:1480709/1‑93 (MQ=255)
aaGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCt < 1:1694251/93‑1 (MQ=255)
aaGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCt < 1:6182606/93‑1 (MQ=255)
gagGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCttt < 2:2679763/93‑1 (MQ=255)
ggCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTaa < 1:2066752/93‑1 (MQ=255)
cAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTaaaa < 1:278472/93‑1 (MQ=255)
aaaCCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAAc > 2:1874012/1‑93 (MQ=255)
aaaCCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAAc > 1:8485548/1‑93 (MQ=255)
aaCCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACa < 2:3701349/93‑1 (MQ=255)
aaCCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACa < 2:2987921/93‑1 (MQ=255)
aaCCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACa < 2:6949129/93‑1 (MQ=255)
ccATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGt < 1:867087/93‑1 (MQ=255)
aTCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGa > 1:542950/1‑93 (MQ=255)
tcttctGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAt > 1:2652535/1‑93 (MQ=255)
tcttctGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAt > 1:8773245/1‑93 (MQ=255)
cttctGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAtt < 1:7693193/93‑1 (MQ=255)
ttctGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAttt > 1:4056863/1‑93 (MQ=255)
ttctGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAttt > 2:3058222/1‑93 (MQ=255)
tctGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAtttt > 2:1661057/1‑93 (MQ=255)
tctGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAtttt > 1:6065977/1‑93 (MQ=255)
tctGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAtttt < 1:8323410/93‑1 (MQ=255)
gAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTaaa > 2:7067274/1‑93 (MQ=255)
aaCCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTaaaa > 2:8683056/1‑93 (MQ=255)
aaCCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTaaaa < 1:3178766/93‑1 (MQ=255)
aaCCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTaaaa < 1:5783030/93‑1 (MQ=255)
ccACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAAt > 1:5277283/1‑93 (MQ=255)
aCTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCg > 2:2446335/1‑93 (MQ=255)
cTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGc < 1:672322/93‑1 (MQ=255)
taataaGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCt > 2:102672/1‑93 (MQ=255)
aataaGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCtt > 1:2539469/1‑93 (MQ=255)
aataaGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCtt > 1:1377992/1‑93 (MQ=255)
ataaGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTa > 2:8528366/1‑93 (MQ=255)
ataaGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTa > 2:7366775/1‑93 (MQ=255)
taaGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAg > 1:3785517/1‑93 (MQ=255)
taaGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAg < 2:762792/93‑1 (MQ=255)
taaGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAg > 1:6497517/1‑93 (MQ=255)
aaGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAgg < 2:4573821/93‑1 (MQ=255)
aaGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAgg > 2:4295002/1‑93 (MQ=255)
aaGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAgg < 2:2542763/93‑1 (MQ=255)
aGTTATCACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAggg < 2:7840785/93‑1 (MQ=255)
gTTTTAACGCATACGCAGTTAATAAAACGATTCCATATGAGGGGTCGGTATCTTTTTACCTATAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAgggg < 1:482929/93‑1 (MQ=255)
ttttAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAggggt < 2:3560272/93‑2 (MQ=255)
ttttAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGa < 1:585079/93‑1 (MQ=255)
tttAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGAt < 2:2794404/93‑1 (MQ=255)
tAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGt < 2:5939129/93‑1 (MQ=255)
aaCTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGtt > 2:3033533/1‑93 (MQ=255)
aCTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTa < 2:5293028/93‑1 (MQ=255)
cTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTAt > 2:4178161/1‑93 (MQ=255)
cTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTAt < 1:7416192/93‑1 (MQ=255)
cTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTAt < 2:8438109/93‑1 (MQ=255)
cTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCAGATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTAt < 1:1130243/93‑1 (MQ=255)
tCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTAGTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATg < 1:7864243/93‑1 (MQ=255)
cGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCAc < 1:1583126/93‑1 (MQ=255)
gCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACg > 1:555751/1‑93 (MQ=255)
gCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACg > 1:8015643/1‑93 (MQ=255)
cAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGa < 1:7187972/93‑1 (MQ=255)
cAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGa > 1:1204072/1‑93 (MQ=255)
aGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGaa > 1:5195575/1‑93 (MQ=255)
gTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAGAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGaaa > 1:597772/1‑93 (MQ=255)
gTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGaaa > 1:5505015/1‑93 (MQ=255)
gTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGaaa > 1:633697/1‑93 (MQ=255)
gTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGGCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCAAGaaa > 2:1600246/1‑93 (MQ=255)
ttAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGaaaa > 2:6058181/1‑93 (MQ=255)
aataaAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGaaaaaa > 1:6119498/1‑92 (MQ=255)
aataaAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAg > 1:8305285/1‑93 (MQ=255)
ataaAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGa > 2:799339/1‑93 (MQ=255)
aaaaCCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGaaa > 2:4616279/1‑93 (MQ=255)
aaaCCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAAt < 2:5095717/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATg < 2:369699/93‑1 (MQ=255)
aCCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATgg < 1:4265032/93‑1 (MQ=255)
ccATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATggg < 1:1846545/93‑1 (MQ=255)
ccATTCCATATGAGTGCTCGGTTGCTTATTGCCTTAAAAACAGTGATTTTAAAAATCCCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATggg < 2:6609519/93‑1 (MQ=255)
cATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGc > 1:7977106/1‑93 (MQ=255)
aTTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCg > 1:4423578/1‑93 (MQ=255)
aTTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCg > 2:5591223/1‑93 (MQ=255)
ccATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTa > 2:4497792/1‑93 (MQ=255)
cATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTAt < 1:6970496/93‑1 (MQ=255)
cATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTAt > 2:6316245/1‑93 (MQ=255)
atGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTa < 1:1040885/93‑1 (MQ=255)
atGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTa < 1:1477854/93‑1 (MQ=255)
tGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAg > 1:942152/1‑93 (MQ=255)
|
TACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAG > NC_000913/4059678‑4059857
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTC > NC_000913/4059676‑4059859
|
CGTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGT < SRR4302541.8398694/94‑1 (MQ=60)
CGTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGT > SRR4302541.1631453/1‑94 (MQ=60)
CGTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGT < SRR4302541.4134618/94‑1 (MQ=60)
GTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTG < SRR4302541.2160025/94‑1 (MQ=60)
GTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTG < SRR4302541.7507488/94‑1 (MQ=60)
TACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGG > SRR4302541.2027113/1‑94 (MQ=60)
ACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGT < SRR4302541.245135/94‑1 (MQ=60)
ACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGT < SRR4302541.7029179/94‑1 (MQ=60)
CTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTC < SRR4302541.5005875/94‑1 (MQ=60)
CTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTC < SRR4302541.6381236/94‑1 (MQ=60)
TACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCG > SRR4302541.5501018/1‑94 (MQ=60)
TACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCG < SRR4302541.8811742/94‑1 (MQ=60)
AACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTA < SRR4302541.7204930/94‑1 (MQ=60)
AACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTA < SRR4302541.7720552/94‑1 (MQ=60)
AACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTA < SRR4302541.3319000/94‑1 (MQ=60)
AACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTA < SRR4302541.8799079/94‑1 (MQ=60)
CAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATC > SRR4302541.3854300/1‑94 (MQ=60)
AAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCT < SRR4302541.8096100/94‑1 (MQ=60)
AAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCT < SRR4302541.3156300/94‑1 (MQ=60)
ATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTA > SRR4302541.6412713/1‑94 (MQ=60)
ATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTA > SRR4302541.1587811/1‑94 (MQ=60)
CAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATT > SRR4302541.954052/1‑94 (MQ=60)
CAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATT > SRR4302541.2256260/1‑94 (MQ=60)
CAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATT < SRR4302541.923003/94‑1 (MQ=60)
CAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCAATCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATT < SRR4302541.4309107/94‑1 (MQ=60)
AAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTG < SRR4302541.3436692/94‑1 (MQ=60)
AACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGC < SRR4302541.6048623/94‑1 (MQ=60)
ACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCC > SRR4302541.1687402/1‑94 (MQ=60)
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AAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTT > SRR4302541.5301798/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTT < SRR4302541.6245770/94‑1 (MQ=60)
AAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTT < SRR4302541.1710873/94‑1 (MQ=60)
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CAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAAC > SRR4302541.6522982/1‑94 (MQ=60)
CAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAAC < SRR4302541.280825/94‑1 (MQ=60)
AAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACA > SRR4302541.2142219/1‑94 (MQ=60)
AAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACA < SRR4302541.8918364/94‑1 (MQ=60)
ACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGT > SRR4302541.3193649/1‑94 (MQ=60)
ACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGT > SRR4302541.3193650/1‑94 (MQ=60)
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CATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGA < SRR4302541.3763011/94‑1 (MQ=60)
ATCTTCTGAACCACTAATCAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAT > SRR4302541.5883044/1‑94 (MQ=60)
ATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAT > SRR4302541.5883045/1‑94 (MQ=60)
ATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAT > SRR4302541.2678928/1‑94 (MQ=60)
ATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGAT > SRR4302541.8867027/1‑94 (MQ=60)
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TTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTT > SRR4302541.6127923/1‑94 (MQ=60)
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CCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATC > SRR4302541.823352/1‑94 (MQ=60)
CACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCG < SRR4302541.6336313/94‑1 (MQ=60)
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TAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTT > SRR4302541.6717658/1‑94 (MQ=60)
TAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTT < SRR4302541.2566116/94‑1 (MQ=60)
TAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGCTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTT > SRR4302541.6578515/1‑94 (MQ=60)
AACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTA > SRR4302541.8281541/1‑94 (MQ=60)
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CTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATG < SRR4302541.5525708/94‑1 (MQ=60)
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CTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCAGATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATG < SRR4302541.1140926/94‑1 (MQ=60)
TCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTAGTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGC < SRR4302541.7950627/94‑1 (MQ=60)
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ATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTC < SRR4302541.5579568/94‑1 (MQ=60)
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CGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACG > SRR4302541.560986/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACG > SRR4302541.188944/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACG > SRR4302541.8103789/1‑94 (MQ=60)
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CGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACG > SRR4302541.1499176/1‑94 (MQ=60)
GCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGA > SRR4302541.8074096/1‑94 (MQ=60)
GCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGA > SRR4302541.1215771/1‑94 (MQ=60)
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AGTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAA > SRR4302541.5561402/1‑94 (MQ=60)
GTTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAA > SRR4302541.3789346/1‑94 (MQ=60)
TTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAA > SRR4302541.8413311/1‑94 (MQ=60)
TTAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAA < SRR4302541.5958945/94‑1 (MQ=60)
TAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAG < SRR4302541.8451950/94‑1 (MQ=60)
TAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAG > SRR4302541.6819103/1‑94 (MQ=60)
TAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAG > SRR4302541.8395579/1‑94 (MQ=60)
TAATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAA > SRR4302541.6182000/1‑94 (MQ=60)
ATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGTATGTTATGCTCACGAAAAAGAA < SRR4302541.52996/94‑1 (MQ=60)
ATAAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAA < SRR4302541.5062564/94‑1 (MQ=60)
AAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAAT < SRR4302541.127851/94‑1 (MQ=60)
AAAACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAAT > SRR4302541.280352/1‑94 (MQ=60)
AACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGG < SRR4302541.1686119/94‑1 (MQ=60)
AACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGG > SRR4302541.2626013/1‑94 (MQ=60)
ACCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGG < SRR4302541.4307658/94‑1 (MQ=60)
CCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGC < SRR4302541.1122692/94‑1 (MQ=60)
CCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGC < SRR4302541.1864410/94‑1 (MQ=60)
CCATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGC > SRR4302541.8064993/1‑94 (MQ=60)
CATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCG > SRR4302541.4468000/1‑94 (MQ=60)
CATTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCG > SRR4302541.6936714/1‑94 (MQ=60)
CATTCCATATGAGTGGTCGGGATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCG > SRR4302541.7885253/1‑94 (MQ=60)
TTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTT > SRR4302541.3120900/1‑94 (MQ=60)
TTCCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTT > SRR4302541.839079/1‑94 (MQ=60)
CCATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTAT > SRR4302541.7429849/1‑94 (MQ=60)
CATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATT > SRR4302541.8493865/1‑94 (MQ=60)
CATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATT < SRR4302541.7044779/94‑1 (MQ=60)
ATATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTT < SRR4302541.6199732/94‑1 (MQ=60)
TATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTA < SRR4302541.5192479/94‑1 (MQ=60)
TATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTA < SRR4302541.8580344/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAG < SRR4302541.1492357/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAG < SRR4302541.6988983/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAG > SRR4302541.951130/1‑94 (MQ=60)
ATGAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAG < SRR4302541.1050530/94‑1 (MQ=60)
GAGTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTC > SRR4302541.7825445/1‑94 (MQ=60)
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CGTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTC > NC_000913/4059676‑4059859
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
